6- Le noyau I Flashcards

1
Q

Pour quelles raisons (2) les cellules procaryotes n’ont pas besoin de noyau

A
  1. Pas de protéines motrices qui voyagent dans le cytoplasme, donc il ne peut pas avoir de collisions entre elles et l’ADN.
  2. L’ADN n’a pas d’introns, donc la transcription et la traduction se font en même temps dans le cytoplasme.
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2
Q

Quels sont les rôles (2) du noyau dans les cellules eucaryotes ?

A
  1. Protéger et séquestrer l’ADN pour éviter les collisions avec les protéines motrices.
  2. Empêcher la traduction des ARNm avant leur complète maturation en bloquant leur sortie vers le cytoplasme.
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3
Q

Quelles techniques (2) peut-on utiliser pour distinguer les chromosomes mitotiques ?

A
  1. Des colorants pouvant s’attacher aux régions des chromosomes riches en A-T ou en C-G.
  2. Des sondes fluorescentes complémentaires à des séquences spécifiques.
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4
Q

Définition des chromosomes mitotiques ?

A

Gros complexes d’ADN et de protéines.

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5
Q

Comment les colorants nous permettent de distinguer les chromosomes entre eux ?

A

Chaque chromosomes est coloré selon un patron caractéristique de bandes. Les chromosomes homologues ont le même patron de bandes.

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6
Q

Qu’est-ce qu’un karyotype nous permet de remarquer ?

A

Une ou des mutation(s) importantes sur les chromosomes.

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7
Q

Qu’est-ce qui se trouvent sur les chromosomes ?

A

L’information génétique sous forme de gènes dispersés parmi des segments non codants, répétitifs ou non.

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8
Q

Qu’est-ce qu’une séquence codante ?

A

Une séquence qui code pour une structure protéique.

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9
Q

Qu’est-ce qu’une séquence conservée ?

A

Une séquence qui a survécu l’évolution, donc qu’on trouve chez plusieurs espèces (ex : l’humain partage 89% de son génome avec la souris).

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10
Q

Qu’est-ce qu’une séquence régulatrice ?

A

Une séquence qui régule l’endroit, la quantité et le moment de l’expression des gènes.

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11
Q

Quelle type de séquence est le plus souvent conservé ?

A

Les séquences codantes et régulatrices.

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12
Q

Qu’est-ce qu’une BLAST ?

A

L’alignement de séquences d’ADN en nucléotides de plusieurs espèces différentes.

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13
Q

Quelle est une utilité d’un BLAST ?

A

Il permet d’observer l’évolution d’un gène à travers les espèces.

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14
Q

Quelles sont deux utilités de GenBank ?

A

Il permet d’harmoniser des noms des gènes et d’y déposer les nouveaux gènes trouvés.

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15
Q

Qu’est-ce qu’une séquence consensus ?

A

C’est la séquence conservée qu’on retrouve le plus fréquemment entre les espèces.

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16
Q

Qu’est-ce qu’un transposon ?

A

Une séquence non codante répétée qui code pour ses propres enzymes lui permettant de changer de place dans le génome.

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17
Q

Quel est le pourcentage de gènes codant pour des protéines ?

A

1,5 %

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18
Q

Qu’est-ce qu’une séquence unique ?

A

Une séquence non codante qui ne se répète pas.

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19
Q

Qu’est-ce que l’enjambement (crossing over) ?

A

Un échange de segment(s) entre deux chromosomes homologues lors de la méiose.

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20
Q

Qu’est-ce qu’un microsatellite et où peut-on les trouver ?

A

Des séquences simples non mobile de 2 à 6 paires de bases (pb), répétées jusqu’à 100x. Ils se trouvent dans les centromères et les télomères.

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21
Q

Qu’est-ce que la densité génique ?

A

Le nombre de gènes par le nombre de paires de bases (pb).

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22
Q

Comment peut-on reconnaître la complexité d’une espèce à parti de son matériel génétique ?

A

Plus une espèces est complexe, plus sa densité génique sera faible (peu de gènes dans un grand nombre de pb).

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23
Q

Quel est le but du ENCODE (ENCyclopedia Of DNA Elements) ?

A

Il veut identifier la fonction de chaque base du génome (ATCG).

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24
Q

Pour quel type de structures l’ADN des bactéries code principalement ?

A

Pour des protéines.

25
Q

Quelle est la longueur réelle de l’ADN humain ?

A

2 mètres.

26
Q

Quel et le diamètre du noyau cellulaire ?

A

10 à 50 microns.

27
Q

Les protéines impliquées dans le compactage de l’ADN sont de quelle charge ? Pourquoi ?

A

Elles sont de charge positives pour balancer les charges négatives de l’ADN provenant des nombreux groupements phosphate.

28
Q

Combien de niveau de structure sont impliqué dans le compactage de l’ADN ?

A

3.

29
Q

Quelles sont les deux types de fibres observables au premier niveau de compaction de l’ADN ?

A
  1. Les fibres condensées (hétérochromatine, 30nm) = les nucléosomes.
  2. Les fibres étendues (euchromatine, 10nm) = brin d’ADN reliant deux nucléosomes qui est disponible pour la transcription.
30
Q

Pourquoi seulement les fibres étendues (euchromatine) peuvent être transcrites ?

A

Elles ne sont pas complètement compactées, donc l’ADN est assez libéré pour accueillir la machinerie transcriptionnelle.

31
Q

Qu’est-ce qu’un nucléosome ?

A

La structure de base de la chromatine faisant partie du 1er niveau de compaction de l’ADN. Ce sont des bobines composés de 8 histones auxquelles s’enroulent l’ADN (double brin).

32
Q

Combien de paire de bases sont comprises dans un nucléosome ?

A

146 pb.

33
Q

Quel est le rôle de l’histone H1 ?

A

Elle stabilise l’ADN sortant des nucléosomes qui les relient ensemble. Elle permet la formation des fibres de chromatine condensées (30nm).

34
Q

Quels types d’histones sont impliqués dans la formation des nucléosomes et combien ?

A

2 histones de chaque type. H2A, H2B, H3 et H4.

35
Q

Est-ce que l’histone H1 fait partie des nucléosomes ?

A

NON!

36
Q

Quelles sont les deux parties des histones nucléosomiques et quel est leur rôle ?

A
  1. La queue N-terminale variable : permet la régulation de la liaison de l’histone avec l’ADN (passage d’euchromatine en hétérochromatine).
  2. La partie C-terminale conservée : permet l’assemblage du nucléosome.
37
Q

L’assemblage des histones est régi par quel phénomène ?

A

L’autocomplémentarité entre la partie C-terminale des histones.

38
Q

Quelle est la particularité de la queue N-terminale des histones et où se trouve-t-elle ?

A

Elle sort des nucléosomes et peut être modifiée par des enzymes.

39
Q

Quelles sont les 4 modifications possibles des histones ?

A

Acétylation
Phosphorylation
Méthylation
Ubiquitination

40
Q

Qu’est-ce que l’acétylation des histones et à quoi sert-elle ?

A

L’ajout d’un groupement acétyle sur les résidus Lys des histones cache leur charge +. Elle cause une perte des liens ioniques entre l’ADN et les histones, ce qui réduit la condensation de l’ADN et rend celle-ci disponible pour la transcription.

41
Q

À quoi sert la méthylation et l’ubiquitination ?

A

Elles rendent les histones compatibles à d’autres protéines.

42
Q

À quel niveau de structure correspond l’euchromatine ?

A

1er.

43
Q

À quel niveau de structure correspond l’hétérochromatine ?

A

2e.

44
Q

Quelle(s) modification(s) les histones doivent porter pour se lier aux protéines Sir ?

A

Méthylation ou ubiquitination.

45
Q

À quoi sert les protéines Sir (silent information regulator).

A

Elles servent dans la condensation de l’hétérochromatine (niveau tertiaire).

46
Q

Quelle partie des histones se lie aux protéines Sir ?

A

Les queues N-terminales.

47
Q

Quelle est la largeur d’un chromosome entier ?

A

1 400 nm (700 nm par branche).

48
Q

Pourquoi le nucléole apparaît plus sombre en microscopie électronique ?

A

La présence de plusieurs protéines.

49
Q

Quelles sont les deux zones du nucléole et quel est leur rôle ?

A
  1. Zone fibrillaire (au centre) : zone de transcription des ARNr (ribosomaux).
  2. Zone granuleuse (en périphérie) : site d’assemblage des sous-unités ribosomales (ARNr + protéines).
50
Q

Est-ce que le nucléole a une membrane ?

A

NON !

51
Q

À quel moment s’assemble les parties du ribosome ?

A

Au moment de la traduction.

52
Q

Quel est le rôle du ribosome ?

A

Il traduit les ARNm (messager) en protéines.

53
Q

Combien de sous-unités composent le ribosome et de quoi sont-elles faites ?

A

2 sous-unités faites d’ARNr et de protéines ribosomales.

54
Q

Quelles sont les six étapes de la biogénèse des ribosomes ?

A

TrEATS
1. Transcription des composants : ARNr, ARMm des protéines ribosomales + des facteurs d’assemblage.
2. Épissage des pré-ARNr.
3. Modification des pré-ARNr, des PR et des FA.
4. Assemblage des sous-unités (importation nucléaire des PR et des FA).
5. Transport : exportation des sous-unités vers le cytoplasme.
6. Surveillance et contrôle qualité.

55
Q

Quelle est la particularité de l’étape 3 dans la biogénèse des ribosomes ?

A

Les PR et les FA sont traduits et formés (structure tertiaire) dans le cytoplasme, c-à-d que les ARNm sortent du noyaux, puis les PR et le FA nouvellement formés entrent dans le noyau pour poursuivre l’étape 4.

56
Q

Que sont les snRNPs et les snoRNPs ?

A

Des complexes ARN-protéines impliqués dans la maturation des ARN.
snRNP : lie des séquences spécifiques aux extrémités des introns pour les enlever lors de l’épissage des ARNm.
snoRNP : modifie et coupe les ARNr.

57
Q

À quoi servent les corps de Cajal ?

A

À assembler et recycler les snRNPs.

58
Q

À quoi servent les 4 sites de liaison des ribosomes dans la traduction ?

A
  1. Liaison de l’ARNm.
  2. Site A : fixe l’ARNt entrant avec un acide aminé.
  3. Site P : fixe l’ARNt lié à la chaîne polypeptidique grandissante.
  4. Site E : site de sortie de l’ARNt libre (sans acide aminé).