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BIO 1157 > 6- Le noyau > Flashcards

6- Le noyau Flashcards

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1
Q

Qu’est-ce qui est responsable pour le mouvement dans le cytoplasme des cellules eucaryotes et comment?

A

Les moteurs protéiques, en circulant le long de filaments.

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Q

Quel est le rôle du noyau?

A

Protège et séquestre l’ADN, ce qui évite des collision avec les protéines moteurs ou les cargos qu’elles traînent.

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Q

Où se fait la transcription?

A

Dans le noyau

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4
Q

Quelles sont les étapes de la transcription?

A

gène —> ARN pré-messager —> ARN messager

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Q

Pourquoi est-ce que la transcription doit être faite dans le noyau?

A

L’ARNm doit subir plusieurs étapes de maturation avant d’être traduit en protéine. Le noyau empêche la traduction précoce (avant que l’ARNm est prêt).

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6
Q

Comment est-ce que le noyau empêche la traduction précoce des ARNm?

A

En contrôlant leur sortie vers le cytoplasme.

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7
Q

Où est-ce que se passe la traduction (ARNm —> protéine)?

A

Dans le cytoplasme

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8
Q

Pour quelles deux raisons est-ce que les procaryotes n’ont pas de noyau?

A
  1. Cytoplasme des bactéries ne possèdent pas de moteurs protéiques, donc noyau ne doit pas protéger l’ADN
  2. L’ADN des bactéries est majoritairement sans introns: la transcription et la traduction ont lieu simultanément dans le cytoplasme. Alors, le noyau ne doit pas contrôler la sortie des ARNm.
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9
Q

Comment s’appelle la forme la plus condensée de ADN?

A

Chromosomes mitotiques

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10
Q

De quoi sont faits les chromosomes mitotiques?

A

Chromatine

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11
Q

C’est quoi le chromatine?

A

gros complexes d’ADN et de protéines

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12
Q

Quelles sont les deux façons qu’on peut mieux distinguer les chromosomes mitotiques?

A
  1. En utilisant différents colorants (Giemsa) qui est un patron caractéristique de bandes
  2. En utilisant des sondes fluorescentes complémentaires à des séquences spécifiques.
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13
Q

Vrai ou faux: Il y a que des gènes sur les chromosomes.

A

Faux: séquences d’ADN régulatrices, exons, introns

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14
Q

Quel est le rôle des séquences régulatrices d’ADN?

A

Elles contrôlent la transcription du gène (quand et combien il faut faire de protéines)

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15
Q

À peu près, combien de paires de bases contient le génome humain?

A

3 milliards

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16
Q

Qu’est-ce qui permet d’analyser des séquences similaires en comparant l’ADN de plusieurs organismes différents?

A

Les séquences codants et régulatrices sont très conservées.
(on partage 89% de notre ADN avec une souris)

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17
Q

Un BLAST (Basic Local Alignment SearchTool) permet de faire quoi?

A

Il permet d’aligner les séquences d’ADN, en nucléotides et mêmes d’aligner les séquences des protéines, en acides aminés.

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18
Q

C’est quoi une séquence consensus?

A

C’est la séquence conservée. Elle est composée des acides aminés ou nucléotides qui occupent une position donnée le plus fréquemment (où se trouve le % de mêmes nucléotides).

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19
Q

Quelle est le pourcentage de la composition du génome nucléaire humain qui contient des gènes codant pour des protéines?

A

1.5% (séquences uniques)

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20
Q

C’est quoi des transposons et quel est leur pourcentage de la composition du génome nucléaire humain?

A

Des séquences non-codant répétées dont la majorité sont mobiles (peuvent changer de places dans le génome), 50%

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21
Q

Pourquoi est-ce que les transposons sont capables de se déplacer de manière autonome?

A

Ils ont tout se qui est besoin dans leur séquences pour se déplacer.

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22
Q

En plus des transposons, l’ADN répétitif comporte quoi d’autre et quelle est leur caractéristique?

A
  1. des duplications de segments chromosomiques
  2. des séquences simples de 2-6 pb, répétées jusqu’à 100 fois
    Les deux cas, il s’agit des séquences non mobiles.
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23
Q

Pourquoi est-ce qu’il y a des duplication de segments chromosomiques dans l’ADN répétitif?

A

Cela se passe à cause d’un «crossing over» inégal durant la méiose.
*crossing over permet le mélange de deux chromosomes

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24
Q

Où se trouvent les séquences simples?

A

Dans les centromères et les télomères

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25
Q

Vrai ou faux: La densité de gènes diminuent avec une augmentation de complexité du organisme

A

Vrai (E.coli a 57 gènes dans la même fenêtre, vs humain qui a seulement 2 gènes)

26
Q

Que permet le ENCODE?

A

Il répertorie tous les éléments de l’ADN et vise à identifier la fonction de chacune des bases du génome.

27
Q

Chez les bactéries, on a principalement des séquences codant pour des _______.

A

Protéines.

28
Q

Pourquoi est-ce que le compactage de l’ADN est problématique?

A

À cause des groupements P chargés négativement (accumulation de la charge du même type)

29
Q

Quelle est la solution pour favoriser le compactage de 2 mètres d’ADN dans un noyau de 10-50 micromètres?

A

En ajoutant des protéines avec des charges positives. Pour cette raison, les protéines constituent la moitié de la masse moléculaire d’un chromosome eucaryote.

30
Q

Quelles sont les deux niveaux de compaction observés en interphase?

A

Fibres condensées de >30 mm (région non transcrite)
Fibres étendues ~ 10 nm (région active pour la transcription - perles sur un fil)

31
Q

À quoi correspond la structure ressemblant à des perles sur un fil et qu’est-ce que c’est?

A

Le nucléosome, la structure de base de la chromatine et le premier niveau de compaction.

32
Q

Combien de paires de bases s’enroulent autour des nucléosomes?

A

146 pb

33
Q

Combien d’histones composent chaque nucléosome?

A

8 histones (4 types différents, deux de chaque type)

34
Q

Quels sont les 4 types d’histones qui composent chaque nucléosome?

A

H2A, H2B, H3, H4
*deux fois chaque type

35
Q

Comment s’appelle le cinquième histone et quel est son rôle?

A

H1 (ne fait pas partie du nucléosome) stabilise l’ADN sortant des nucléosomes et permet leur empilement en fibre de 30 nm.

36
Q

Quelles sont les deux régions bien distinctes des 4 histones?

A

Une queue N-terminale variable
Une partie C-terminale conservée

37
Q

Que permet la queue N-terminale variable des histones?

A

La régulation de la liaison de l’histone avec l’ADN

38
Q

Que permet la partie C-terminale conservée des histones?

A

L’assemblage du nucléosome

39
Q

Les queues N d’histones sortent du nucléosome et peuvent être modifiées par des enzymes. Cela permet quoi?

A

Permet de réguler le passage d’euchromatine en hétérochromatine et vice versa, H1 n’est pas suffisant. Cela influence le niveau de transcription.

40
Q

Quelles sont les 4 modifications que les histones peuvent subir?

A
  1. Acétylation
  2. Phosphorylation
  3. Méthylation
  4. Ubiquitination
41
Q

Que fait l’acétylation?

A

Elle cache la charge positive sur les lysines des histones et donc il y a une perte d’interaction avec l’ADN chargé négativement. Cela mène à une perte des liens ioniques et alors l’ADN se détache. Cette modification favorise la décondensation.

42
Q

Que fait la modification par phosphorylation?

A

Le P ajouté sur les sérines et il va neutraliser une charge positive voisine de la lysine ou d’arginine. Le P peut aussi augmenter l’effet de répulsion de l’ADN, en ajoutant des charges négatives. La phosphorylation favorise la décondensation.

43
Q

Que font les modifications de méthylation et ubiquitination?

A

L’ajout de ces groupements rend l’histone compatible à d’autres protéines. Alors, créé une plateforme de recrutement pour les autres, qui permet les changements de configuration de la queue N, la rendant complémentaire à d’autres protéines ou d’autres possibilités avec interaction protéine-protéine.

44
Q

C’est quoi de l’euchromatine?

A

L’ADN en fibres de 11 nm (pas trop condensé) peut être transcrit en ARN.

45
Q

L’hétérochromatine?

A

L’ADN en fibres de 30 nm (ADN non transcrit)

46
Q

Quelles protéines permet de faire des boucles avec l’hétérochromatine?

A

Protéines Sir (silent information regulator, une condensation de plus)

47
Q

De l’ADN plus condensée implique quoi?

A

Moins accessible aux protéines lors de la transcription, réplication et recombinaison

48
Q

Comment s’appelle la section du noyau qui apparaît plus sombre au microscope MET?

A

Le nucléole est fibrillaire au centre et plus granuleux en périphérie

49
Q

Quelle est la fonction de la zone fibrillaire du nucléole?

A

La zone de transcription des ARN ribosomaux, à partir de 200 gènes arrangés en tandem.

50
Q

Quelle est la fonction de la zone granuleuse du nucléole?

A

Le site d’assemblage des sous-unités ribosomales (ARNr + protéines)

51
Q

Vrai ou faux: le nucléole est délimité par une membrane

A

Faux (n’est pas)

52
Q

À quoi sert le ribosome, et où?

A

Sert à la traduction de l’ARNm en protéine dans le cytoplasme

53
Q

Où sont les deux sous-unités du ribosome formés?

A

Sont formés séparément dans le noyau (près du nucléole)

54
Q

Qu’est-ce que les deux sous-unités du ribosome s’assemblent?

A

Uniquement lors de la traduction

55
Q

Quels sont les 4 sites d’un ribosome?

A
  1. site de liaison pour l’ARNm
  2. site de liaison de l’amino-acyl-ARNt (site A), qui fixe la molécule d’ARNt entrante portant un acide aminé.
  3. Site peptidyl-ARNt (site P) qui fixe la molécule d’ARNt liée à l’extrémité en croissance de la chaîne polypeptidique
  4. site de sortie pour l’amino-acyl-ARNt (site E)
56
Q

Vrai ou faux: l’ARNr et protéines ribosomales passent par les mêmes étapes

A

FAUX

57
Q

Quelles sont les six étapes de la biogenèse des ribosomes?

A
  1. Transcription des composants (ARNr, ARNm codant pour les protéines ribosomales (RP) et les facteurs d’assemblage (AF) et snoRNA)
  2. Traitement (épissage des pré-ARNr)
  3. Modification des pré-ARN, RP et AF
  4. Assemblage des sous-unités en périphérie du nucléole (importation nucléaire de RP et d’AF)
  5. Transport: exportation de pré-ribosomes vers le cytoplasme
  6. Contrôle de la qualité et la surveillance
58
Q

Les sites spécialisés se forment où?

A

À l’intérieur du noyau

59
Q

C’est quoi des snRNPs (snurps)?

A

Des complexes ARN-protéines qui aide à épissés les ARNm durant leur maturation. Ils sont utilisés pour lier les séquences spécifiques aux extrémités des introns (permet de les enlever)

60
Q

Que font les snoRNPs (snorps’)

A

Coupe et modifie les ARNr précurseurs durant leur maturation.

61
Q

Où sont les snRNPs assemblés/recyclés?

A

Dans les corps de Cajal, une région dans le noyau.

BIO 1157 (4 decks)

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