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10- Compartiments cellulaire part 3 Flashcards

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1
Q

Le trafic vésiculaire comprend quoi?

A
  1. Le chargement d’une cargaison dans le site de bourgeonnement
  2. La formation de vésicules à partir d’une membrane donneuse
  3. La fusion de ces vésicues avec une membrane cible.
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Q

Comment s’appelle les trois types de vésicules et elles sont recouvertes par quoi?

A

Toutes recouvertes par trois protéines différentes, selon leur endroit dans la cellule et où elles se dirigent.
Clathrin
COPI
COPII

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3
Q

De quoi sont formé les vésicules COP-II et où sont ils acheminées?

A

Formées à partir du RER et sont acheminées vers le Golgi

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4
Q

Par quoi est activée la Sar1 (GTPase monomérique)?

A

Par une GEP de la membrane du RER.

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Q

À quoi correspond l’activation de la Sar1?

A

Son insertion dans la membrane grâce à une hélice alpha-amphiphile.

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6
Q

Que font les protéines Sec23/24?

A

Elles lient Sar1-GTP et un récepteur de cargaison. Elles forment l’intérieur du manteau protéiques des vésicules COP-II

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7
Q

Que forme l’extérieur des vésicules COP-II?

A

L’extérieur des vésicules sont les protéines Sec13/31 qui se lient par-dessus Sec23/24. Elles sont courbées et leur forme détermine le diamètre de la vésicule. (*Le plus de Sec13/31, le plus grand devient la vésicule)

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8
Q

Que doivent faire les COP-II lorsque ils ont bourgeonné du RER?

A

Elles doivent fusionner à une membrane cible.

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9
Q

Quelles sont les deux protéines qui sont utilisées pour le ciblage des COP-II aux membranes cibles?

A

Rabs (GTPase de type RAS)
SNAREs (protéine de fusion
*Les deux travaillent ensemble pour sélectionner la bonne membrane

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10
Q

Que fait la Rab-GTP lorsqu’elle est activée par un GEP membranaire situé sur la membrane donneuse de vésicule?

A

La Rab-GTP s’insère dans la membrane de COP-II (la vésicule). Alors, elle se retrouve sur la membrane cible (acceptrice de la vésicule).

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11
Q

Vrai ou faux: Il y a environ 60 Rabs et leurs récepteurs spécifiques dans une cellule animale

A

Vrai (varie selon leur destination)

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12
Q

Les Rabs et les SNAREs participent au ciblage de quelles autres vésicules?

A

COP-I et clathrine

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13
Q

C’est quoi les SNAREs?

A

Des protéines membranaires qui se trouvent sous forme de paires complémentaires.

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14
Q

Quelles sont les deux types de SNAREs?

A

v-SNARE
t-SNARE

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15
Q

Où se trouve la v-SNARE?

A

Sur la membrane de la vésicule.

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16
Q

Où se trouve la t-SNARE?

A

Inséré dans la membrane cible.

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17
Q

Quelle est la caractéristique de la liaison entre les v-SNARE et les t-SNARE?

A

Leur liaison est tellement forte que l’eau entre les membranes est explusée. Sans eau, les 2 couches externes de chaque membranes fusionnent.

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18
Q

Qu’est-ce qu’il faut faire lorsque la vésicule a fusionné avec la membrane cible?

A

Il faut dissocier la paire de SNAREs.

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19
Q

Qu’est-ce qui est nécessité pour dissocier les deux SNAREs et pourquoi?

A

L’énergie de l’hydrolyse de l’ATP car la liaison entre ces deux protéines est tellement forte.

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20
Q

Avec quelle Golgi fusionnent les vésicules COP-II?

A

Le cis-Golgi

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21
Q

Comment est-ce que la partie des protéines retournent au RER?

A

Via les vésicules COP-I

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22
Q

Où vont les autres protéines qui ne retournent pas au RER?

A

Elles poursuivent leur route vers la région médiane-Golgi, puis le trans-Golgi.

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23
Q

Que subissent les protéines dans la région médiane-Golgi?

A

Elles subissent une maturation de leurs sucres.

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24
Q

Qu’est-ce qui arrive au protéines dans le trans-Golgi?

A

Les protéines sont triées et emballées pour leur destination finale.

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25
Q

Quelles sont les deux destinations finales des protéines?

A

Endosome/lysosome et la membrane plasmique

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26
Q

Quelle vésicule transporte les protéines destinées aux endosomes?

A

Clathrine

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27
Q

Quelle vésicule transporte les protéines destinées à la membrane plasmique?

A

COP-I

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28
Q

Vrai ou faux: Certaines vésicules bourgeonnent continuellement à partir du Golgi.

A

Vrai

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29
Q

Quelle est la différence entre les COP-I et les COP-II?

A

Les COP-I utilisent les protéines de recouvrement différentes. Leur formation commence par l’activation ARF1, au lieu de SAR1 (différente GTPase).

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30
Q

Dans le cis-Golgi, où et comment se forment les manteaux de COP-I?

A

Ils se forment autour des protéines transmembranaires auant la séquence KKXX en C-terminale (K = lysine).

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31
Q

Quel récepteur fait partie de ces protéines transmembranaires?

A

KDEL

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32
Q

Vrai ou faux: Le retour de lipides et des protéines KKXX KDEL du cis-Golgi au RE est constitutif (continuel).

A

Vrai.

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33
Q

Le retour de lipides et des protéines KKXX et KDEL du cis-Golgi au RE nécessite quoi?

A

Il a besoin de Rab-snares appropriées.

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34
Q

Est-ce que le RE trie les protéines?

A

Non, c’est pourquoi le cis-Golgi s’en occupe. Il fait du qualité-contrôle avec du sucre mais ne trie et n’envoye pas les protéines à leur destination.

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35
Q

Quels sont les deux modèles qui tentent à expliquer le mécanisme de transport des protéines à travers les différentes citernes et vésicules du Golgi?

A
  1. Modèle de transport de vésicules
  2. Modèle de maturation des citernes
    *le mélange des deux modèles est possible.
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36
Q

Que dit le modèle de transport de vésicules?

A

Les citernes restent statiques, les protéines voyagent d’une citerne à l’autre via les vésicules (antérograde et rétrograde).

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37
Q

Que dit le modèle de maturation des citernes?

A

Maturation graduelle des citernes et des protéines qu’elle contiennent (antérograde). Le transport rétrograde se fait par vésicules. La citerne se déplace et relâche les vésicules.

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38
Q

De quoi est responsable la matrice extra-golgienne?

A

Elle est responsable de l’intégrité structurale du Golgi et elle aide au transport et positionne le Golgi dans la cellule.

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39
Q

Comment s’appellent les protéines qui composent la matrice extra-golgienne?

A

Golgines qui sont associées aux membranes du Golgi, du côté cytoplasmique.

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40
Q

Que font les golgines?

A

Elles s’allongent et forment un filet qui exclut la majorité des organites. Il faut s’organiser et retenir toutes les citernes et les vésicules.

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41
Q

Quelle est la structure des golgines?

A

Elles sont des protéines coiled-coil, une super hélice.

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42
Q

Vrai ou faux: Les golgines se retrouvent chez tous les eucaryotes.

A

Vrai

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43
Q

Comment est-ce que les golgines s’insèrent dans la membrane du Golgi?

A

Via leur C-terminal et l’extrémité N-terminale, qui peut se retrouver beaucoup plus loin dans le cytoplasme.

44
Q

Qu’est-ce qui permet la flexibilité des golgines?

A

Le fait que la structure en super hélice est interrompue par endroits.

45
Q

Vrai ou faux: Les golgines sont recrutées à des citernes spécifiques et pêchent des vésicules spécifiques dans le cytoplasme.

A

Vrai

46
Q

Quelle est la caractéristique des golgines qui leur permet de pêcher des vésicules spécifiques?

A

Différentes types de golgines dont la plupart peut lier les protéines d’identité vésiculaire (Rab, Arf etc).

47
Q

Vrai ou faux: plusieurs types de golgine sont exprimé sur la mitochondrie à la fois.

A

Faux, un type à la fois

48
Q

Comment se fait la modification sur la golgine pour qu’elle soit exprimée sur la mitochondrie?

A

Par l’ajout du signal d’insertion pour la membrane externe de la mitochondrie.

49
Q

Qu’est-ce qui est le but de envoyer des golgines à la mitochondrie?

A

Pour analyser de ce qui a abouti à la surface de la mitochondrie (le type de vésicule et ce qu’elle contient pour étudier la spécificité)

50
Q

Pourquoi choisir la mitochondrie comme organite cible?

A

Elle ne receptionne pas pour des vésicules, alors les vésicules qui arrivent sont uniquement du Golgi.

51
Q

À quoi peut mener l’attachement d’une vésicule ou d’une citerne à la golgine?

A
  1. Fusion membranaire (certaines golgines interagissent avec les SNAREs)
  2. Une stabilisation de la matrice extern du Golgi (empilement des citernes)
52
Q

Quelle est la caractéristique des protéines qui arrivent au Golgi?

A

Ils arrivent ayant une glycosylation fournie par le RER et ont toutes la même unité préformée liée au Asns et composée de N-acétylglucosamine et de mannose.

53
Q

Comment est-ce que différentes enzymes golgiennes travaillent sur l’unité des protéines arrivant?

A

De façon séquentielle (une enzyme après l’autre) pour former une unité de sucre différente. Chaque produit est reconnu comme le substrat pour la prochaine enzyme.

54
Q

C’est quoi la tomographie immunoélectronique?

A

La localisation de l’enzyme mannosidase I (ManI) par les anticoprs couplés aux particules d’or, puis modélisation de l’appareil de golgi en 3D. Cela permet de voir que le Golgi est formé de plusieurs compartiments ayant des activités enzymatiques différentes.

55
Q

C’est quoi le ciblage en terme de la maturation des sucres?

A

Un moyen de signaler le leu d’appartenance de la protéine lors du tri dans le trans-Golgi.

56
Q

Que permet le ciblage?

A

À augmenter la solubilité de la protéine, ce qui aide au repliement en milieu aqueux.

57
Q

C’est quoi la couche protectrice?

A

Une couche résistante aux protéases, ce qui est très utile pour les constituants du lysosome.

58
Q

Que permet la couche protectrice?

A

L’adhérence intercellulaire et au substrat (jonctions, glycocalyx) et la signalisation intercellulaire.

59
Q

Quelles sont les deux possibilités à partir du trans-Golgi?

A
  1. Vers la membrane plasmique
  2. Vers les endosomes-lysosomes
60
Q

Comment est-ce que les protéines voyagent du trans-golgi à la membrane plasmique?

A

Par des vésicules COP-I ayant des Rabs et SNAREs appropriées. Les protéines-cargo sont ciblées par un sucre complexe.

61
Q

Comment est-ce que les protéines voyagent du trans-golgi aux endosomes-lysosomes?

A

Par des vésicules de clathrine ayant des Rabs et SNAREs appropriées. Les protéines-cargo sont ciblées par un sucre riche en mannose phosphaté.

62
Q

Comment s’appellent les deux voies qui existent pour des vésicules sécrétoires?

A

Voies constitutives (sont toujours là et vont se répéter) et des voies contrôlées

63
Q

Quelle est le deuxième cas pour les protéines qui voyagent à la membrane plasmique?

A

Elles sont emmagasinées dans des vésicules qui attendent un signal avant de fusionner à la membrane plasmique (ex. GLUT et insuline)

64
Q

C’est quoi une réaction allergique?

A

Dégranulation du mastocyte, ce qui est l’exocytose des vésicules contenant l’histamine.

65
Q

C’est un retrait de membranes?

A

Le processus de concentrer les protéines cargo des vésicules ayant quitté le trans-Golgi en une seule vésicule.

66
Q

De quoi sont faites les membranes récupérées?

A

De la clathrine, qui est recyclé par la cellule.

67
Q

Chez les vertébrés, où se retrouve le Golgi?

A

Adjacent au MTOC. Il s’attache aux microtubules et au MTOC directement.

68
Q

Comment est-ce que le Golgi fait pour se déplacer?

A

Il s’accroche à la dynéine.

69
Q

Quelle protéine participe au positionnement du Golgi?

A

Golgines

70
Q

Chez les plantes et les mycètes, comment est-ce que le Golgi se positionne et se déplace?

A

Grâce à l’interaction de sa matrice (extra-golgienne) avec l’actine-F et la myosine.

71
Q

Quel modèle explique le déplacement du Golgi chez les plantes et mycètes?

A

Dock, Pluck and Go. Le golgi va chercher les vésicules du RER nouvellement formées.

72
Q

Durant la mitose, que fait la phosphorylation des protéines de la matrice extra-golgienne (golgines)?

A

Elle bloque la voie de sécrétion et défait les citernes en petites vésiculesé

73
Q

Durant la mitose, comment est-ce que le Golgi est distribué entre les cellules filles?

A

Par des petits paquets, de façon égale.

74
Q

La distribution des petits paquets de Golgi se distribuent à l’aide de quoi entre les cellules filles?

A

À l’aide du fuseau mitotique et les dynéines.

75
Q

Quelle est la particularité du même processus durant la mitose, durant l’apoptose?

A

La voie de sécrétion est bloquée et le golgi est fragmenté de façon similaire. IRRÉVERSIBLE

76
Q

Comment s’appellent les enzymes qui détachent et dégradent les protéines de la matrice extra-golgienne?

A

Les caspases (des enzymes protéolytiques)

77
Q

C’est quoi le rôle du lysosome?

A

C’est le site intracellulaire de digestion

78
Q

Comment est-ce que les protéines se rendent aux endosomes?

A

Des vésicules de clathrine partent à partir du Golgi (contiennet les hydrolases acides) ou à partir de la membrane plasmique (endocytose) et sont acheminées vers des compartiments intermédiaires, les endosomes.

79
Q

Comment est-ce que l’endosome se transforme en lysosome?

A

L’endosome devient de plus en plus acide et accumule les hydrolases acides.

80
Q

Comment est-ce que l’endosome devient de plus en plus acide?

A

Grâce à l’activité de la pompe ATPase de type V (nécessite d’énergie + permet de garder le pH acide)

81
Q

Comment est-ce que l’endosome accumule les hydrolases acides?

A

Par fusion avec des vésicules contenant ces enzymes.

82
Q

Comment s’appelle l’étiquette sur les protéines dans le Golgi destinées au lysosome-endosome

A

Mannose-6-phosphate (M6P)

83
Q

Qu’est-ce qui permet les histones d’être chargés +vement?

A

Ils ont plusieurs acides aminés basiques

84
Q

Vrai ou faux: le pH du noyau est plus petit que celui du cytoplasme.

A

Faux, pH du noyau est plus grand que celui du cytoplasme (de 0,2 à 0,5)

85
Q

Par quelles deux réactions en série synthétisent le mannose-6-phosphate?

A
  1. Une phosphotransférase lie a région signale de la (future) protéine lysosomale et transfère un GlcNAc-P (N-acétylglucosamine phosphatée) sur un mannose.
  2. Une hydrolase enlève le GlcNAc et ne grade que le phosphate
86
Q

Grâce à quoi est-ce que les vésicules de clathrine se forment autour de leur cargaison?

A

Adaptines. Ils lient le récepteur membranaire du M6P d’un côté, puis la clathrine de l’autre.

87
Q

Comment s’appelle une unité de clathrine?

A

Une triskèle

88
Q

De quoi est composée une triskèle?

A

3 grosses protéines (chaînes loudres) et 3 petites (chaînes légères).

89
Q

Décrit la structure d’une triskèle?

A

Chaque triskèle est courbée et leur chevauchement forme un manteau épais sur une sphère. La vésicule finale ressemble à un panier d’osier.

90
Q

Quelle enzyme est nécessaire pour faire un pincement final et détacher la vésicule de la membrane donneuse?

A

Une dynamine (GTPase)

91
Q

La dynamine se tord grâce à quoi?

A

Grâce à l’énergie libérée par l’hydrolyse du GTP

92
Q

Qu’est-ce qui permet de recycler la clathrine et d’exposer les Rabs et SNAREs?

A

Les vésicules détachées perdent leur manteau de clathrine.

93
Q

Vrai ou faux: Le transport des hydrolases acides est bidirectionnel.

A

Faux, unidirectionnel

94
Q

Vrai ou faux: Le récepteur de M6P ne fonctionne pas au pH acide.

A

Vrai, un bas pH pour devenir lysosome.
La cargaison se détache et le récepteur est recyclé vers le Golgi

95
Q

Que fait une phosphatase au M6P dans le lysosome?

A

Elle enlève le P attaché (la cargaison perd le signal reconnu par le récepteur)

96
Q

C’es quoi l’endosome?

A

Une station qui reçoit les vésicules de clathrine du Golgi ET de la membrane plasmique.

97
Q

Quels sont les rôles de l’endosome?

A

Il fait le tri des molécules qu’ils reçoivent à partir des vésicules de clathrine. Il recycle les récepteurs (les retournent soit vers le Golgi, soit vers la membrane plasmique) avant que la digestion ne commence.

98
Q

C’est quoi l’endocytose?

A

Vésicules en provenance de la membrane plasmique

99
Q

C’est quoi la pinocytose?

A

L’ingestion de molécules solubles. Elle utilise les puits recouverts comme intermédiaires dans la formation des vésicules de clathrine.

100
Q

C’est quoi l’endocytose par récepteurs?

A

Elle profite de la pinocytose grâce à l’utilisation des adaptines.

101
Q

L’ingestion de grosses particules (phagocytose) nécessite quoi?

A

La formation de pseudopodes qui entourent la proie.

102
Q

Comment se fait la phagocytose?

A

La cellule contracte (avec actine et myosine) d’un côté et le cytoplasme est projeté de l’autre côté (région de formation des pseudopodes).

103
Q

Qu’est-ce qui donne une direction au mouvement du cytoplasme projeté (création du pseaudopode)?

A

Les filaments d’actine, qui forme un filet rigide.

104
Q

Quelles sont les 3 façons de dégération?

A

L’endocytose, phagocytose et l’autophagie.

105
Q

C’est quoi l’autophagie?

A

La mitochondrie construit une vésicule à partir du REL et se mange elle-même.

106
Q

Quelles sont les différences de l’endosome chez les plantes?

A
  1. Pas de lysosomes
  2. Autophagie a eu lieu de la même façon mais la vacuole prend la place du lysosome
  3. Pas de phagocytose.
107
Q

Quelles sont les fonctions des vacuoles?

A
  1. Remplace le lysosome
  2. Entrepôt des molécules anti-microbes et anti herbivores
  3. Cellules le plus grande taille sans produire plus de cytoplasme
  4. Canne à sucre et bettrave
  5. Recherche pharmaceutique
  6. Vin: arôme, acidité, texture
  7. Excrétion interne
  8. Légumineuses (protein storage)

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