6 Cytoskelett/ Intracellulär trafik Flashcards
Intermediära filament typer
Cytoplasmic: Kertins in epithelia
Vimetin & vimetin related in connective tissue.
Neurofilament in nerve cells
Nuclear: Nuclear lamins in all animal cells
Aktinfilament uppbyggnad
G-actin polymeriserar till F-actin dvs aktinfilament:
- Nucleation = 3st G-actin molekyler binder till varandra och bildar nucleus
- Elongation = På båda sidor av nucleus binder nya enstaka G-actin molekyler in
- Steady state = -/+ poler på F-actin (pga. varierande hastighet av påbyggnad på olika ändorna)
Bildning/ nedbrytning regleras av ATP = bindningsstyrkan.
Mikrotubuli uppbyggnad
alfa och beta monomerer som bygger upp protonfilment som sedan bygger upp mikrotubuli “barrel” formen.
Bildning/ nedbrytning regleras av GTP (GTP addition is faster than GTP hydrolysis).
Dynamisk instabilitet
Protonfilaments containing GDP tubulin peel away from the microtubule wall.
-GDP tubulin is released to the cytosol.
GTP hydrolysis => instabilitet => depolymerisation
Stathmin/ Thymosin
Binda subenheter och förhindra polymerisation av mikrotubuli resp. aktinfilament
gamma- TuRC / formin, Arp2/3 komplex
Initiera bildning av mikrotubuli resp. aktinfilment
+TIP
Hjälper växande mikrotubuli att hitta rätt mål
Kinesin -13
Inducera nedbrytning av mikrotubuli
Katanin / gelsolin
Klippa av mikrotubuli resp. aktinfilament
XMAP215, MAPs / tropomyosin
Stabiliserar mikrotubuli resp. aktinfilment
tau & MAP2 / fimbrin, alfa -actinin, filamin
Bunta ihop flera mikrotubuli resp. aktinfilament
Plactin
Binder samman mikrotubuli med intermediära filament
Profilin
Binda subenheter och påskynda polymerisation
Cofilin
Påskynda nedbrytning av aktinfilament
Spectrin, ERM
Binder samma aktinfilament med PM
Capping protein
Binder till aktinfilamentets + pol och förhindrar fortsatt polymerisation
Portransport (cellkärnans membran)
Öppen kanal
Veckade proteiner kan ta sig igenom
Samma joner och pH på båda sidor av membranet
Krävs sorteringssignal (+ laddning)
Translokering (ER, mitokondrie, peroxisomer)
Stängd kanal
Proteinet träs igenom oveckat
Olika joner och pH på olika sidor av membranet
Krävs sorteringssignal
Vesikeltrafik
Effektiv
Krävs sorteringssignal iblans
Coat proteiner ex. Cop I/II eller Clathrin
Sortering av lipider
- Bärarprotein (ineffektivt pga. en lipid åt gången)
- Vesikeltrafik: membran av lipider på vesikeln
- Direkt membrankontakt: flyttar lipid direkt från ex. mitokondrie till ER.
Konstitutiv exocytos
Sker hela tiden, krävs ingen sorteringssignal, ingen Ca2+
Rab
Små G-proteiner som reglerar transporten.
Exocytos mekanism
Coat proteinerna släpper ->
Rab motorprotein: transport utmed mikrotubuli
- Tethering: V-SNARE på vesikeln och T-SNARE på PM och en tethering factor på PM.
- Docking: SNARE proteins binder fast i varandra och Rab till tethering factor.
- Fusion SNARE proteins drar på båda sidor om vesikel membranet och PM så att allt H2O exkluderas och membranet öppnas och frisläpper det exocyterande ämnet.
NSF ATPase
Löser upp SNARE proteins efter fusion
“Kiss and run”
snabbare, enklare process av fusion
Fagocytos
Cellätande (partiklar > 250nm)
Pinocytos
Celldrickande (vätska och lösta partiklar/ molekyler < 100nm)
Fagocytos mekanism
Bakterie med antikroppar på cellytan binder till Fc receptorer på PM ->
- > aktinpolymerisering ->
- > fagosom->
- > inne i cellen en lysosom
Pinocytos mekanism
- AP-2 = binder last, binder samman coat
- Clathrin = skapar stabilitet och form
- Epsin = skapar kurvatur
- Dynamin = klipper lös vesikel
- PIP2 = lipid
