4 - Pyruvatoxidation, citronsyrecyklus, glyoxylatcyklus Flashcards
Hvad er produktet?
Hvad hedder enzymet, og hvilken type reaktioner er der tale om?
Enzymet hedder Aconitase, og der sker først en dehydrering hvorefter en rehydrering finder sted!
Hvilken type reaktion finder sted?
Det er en oxidativ dekarboxylering!
Hvilke reaktanter og biprodukter mangler?
Der mangler et CoA-SH og et NAD+ som reaktanter
NADH mangler som biprodukt
Hvilken reaktant?
Hvilken type Phosphorylering?
Subtrat-niveau Phosphorylering
Tegn produktet
Produktet har trans-isomerase, og der er sket en dehydrogenering
Tegn intermediæren
Hvad ville produktet være, hvis der havde været tale om cis-Fumarate?
Fumarase er stereospecifikt, og katalysere kun trans-formen.
Hvor mange CO2 frigives i TCA?
2
Hvor mange ATP, får man ud af citronsyrecyklusen
Man får det der svarer til 20 ATP ud af citronsyrecyklusen
(2.5 pr. NADH, 1.5 pr. FADH2)
Hvad er produktet af denne reaktion?
Er denne reaktion reversibel (Hint: Delta-G=29,7 kJ/mol)?
Hvorfor?
Produktet er Oxaloacetate
Reaktionen er reversibel pga, den lave koncentration af Oxaloacetete. Dette skyldes at Citrat syntase reaktionen er meget negativ
Hvordan gendannes oxaloacetat hvis intermediærene i citronsyre cyklus pruges som precursor molekyler?
Ved anaplerotiske reaktioner hvor oxaloacetat syntetiseres ud fra pyruvat eller PEP (phosphoenolpyruvate)
Hvilke 4 typer faktorer regulerer enzymaktiviteten?
Mængden af enzym, lokaliseringen af enzymet, allosteriske faktorer og kovalent modificering.
En cofaktor er en ikke-protein del af et enzym der er nødvendig for enzymets funktion, men hvad er forskellen på et coenzym og en prostetisk gruppe?
Coenzym: løst bundet cofaktor (diffunderer mellem forskellige enzymer) – fx CoA, NAD+
Prostetisk gruppe: stærkt bundet cofaktor (diffunderer ikke væk) – fx FAD
Her er figren af PDH. Hvad er kompleksets fulde navn?
Pyruvat dehydrogenase komplekset
PDH syntetiserer acetyl-CoA ud fra pyruvat.
Hvilke allosteriske faktorer reguleres PDH af? Hvilke hæmmer enzymkomplexet? Hvilke fremmer?
Hæmmere: ATP, acetyl-CoA, NADH, fede syrer
Fremmere: AMP, CoA, NAD+, (Ca++)
Hvordan kan en acetylgruppe binde sig til et lipoate?
(Lipoate er en fem-ledet ring med en svolvbro)
Lipoate skal først på reduceret form, hvorefter en acetylgruppe kan binde sig til svolvatomet.
Hvor mange elektroner afgives i citronsyrecyklus?
Hvor mange NADH dannes? Hvor mange FADH2?
8 elektroner afgives i citronsyrecyklus per acetyl-CoA oxideret.
Der dannes 3 NADH og 1 FADH2. De kan hver bære to elektroner.
Hvad er nettoreaktionen af Pyruvat oxidering
Pyruvat + CoA + NAD+ → acetyl-CoA + CO2 + NADH
Hvilke organisme har glyoxyatcyklussen og hvilken funktion har denne pathway?
Glyoxylatcyklussen findes i planter. Pathwayens funktion er at syntetisere pyruvat ud fra acetyl-CoA.
(en funktion der ikke findes i mennesker)
Hvilket sukker dannes i glyoxylatcyklussen ud fra acetyl-CoA?
Succinat
Hvor finder Glykolysen, PDH og citronsyrecyklusen sted?
Glykolysen finder sted i cytosolen, hvorefter pyruvat bliver transporteret ind i mitokondriernes matrix, hvor PDH og citronsyrecyklusen finder sted.
Hvorfor kan pattedyr ikke omdanne fedt til sukker?
Mangel på glyoxylat cyklus som danner pyruvat ud fra acetyl-CoA (som dannes fra fedtsyrer)
Hvilke af følgende stoffer kan frit diffundere gennem mitokondriets indre membran uden hjælp fra et transportprotein
ATP, H+, Pyruvat, HPO4 og/eller Citrate
Ingen af disse kan diffundere gennem den inderste membran uden hjælp, dog kan de alle diffundere gennem den yderste.
Hvilket intermediat kan succinat fra glyoxylatcyklussen omdannes til for at kunne indgå i gluconeogenesen?
Oxaloacetat
Nævn de 5 PDH (pyruvat dehydrogenase) cofaktorer.
TTP, lipoate, FAD, CoA-SH og NAD+ (som reduceret til NADH)
And his name is…
JOHN CENA!
Hvilken størrelse C enheder kan planter danne i glyoxylat cyklussen?
Glyoxylatcyklussen kan danne C4 enheder.
