4 - Pyruvatoxidation, citronsyrecyklus, glyoxylatcyklus

Question 1

Hvad er produktet?

Answer 1

Question 2

Hvad hedder enzymet, og hvilken type reaktioner er der tale om?

Answer 2

Enzymet hedder Aconitase, og der sker først en dehydrering hvorefter en rehydrering finder sted!

Question 3

Hvilken type reaktion finder sted?

Answer 3

Det er en oxidativ dekarboxylering!

Question 4

Hvilke reaktanter og biprodukter mangler?

Answer 4

Der mangler et CoA-SH og et NAD+ som reaktanter

NADH mangler som biprodukt

Question 5

Hvilken reaktant?
Hvilken type Phosphorylering?

Answer 5

Subtrat-niveau Phosphorylering

Question 6

Tegn produktet

Answer 6

Produktet har trans-isomerase, og der er sket en dehydrogenering

Question 7

Tegn intermediæren

Hvad ville produktet være, hvis der havde været tale om cis-Fumarate?

Answer 7

Fumarase er stereospecifikt, og katalysere kun trans-formen.

Question 8

Hvor mange CO₂ frigives i TCA?

Answer 8

2

Question 9

Hvor mange ATP, får man ud af citronsyrecyklusen

Answer 9

Man får det der svarer til 20 ATP ud af citronsyrecyklusen

(2.5 pr. NADH, 1.5 pr. FADH2)

Question 10

Hvad er produktet af denne reaktion?
Er denne reaktion reversibel (Hint: Delta-G=29,7 kJ/mol)?
Hvorfor?

Answer 10

Produktet er Oxaloacetate

Reaktionen er reversibel pga, den lave koncentration af Oxaloacetete. Dette skyldes at Citrat syntase reaktionen er meget negativ

Question 11

Hvordan gendannes oxaloacetat hvis intermediærene i citronsyre cyklus pruges som precursor molekyler?

Answer 11

Ved anaplerotiske reaktioner hvor oxaloacetat syntetiseres ud fra pyruvat eller PEP (phosphoenolpyruvate)

Question 12

Hvilke 4 typer faktorer regulerer enzymaktiviteten?

Answer 12

Mængden af enzym, lokaliseringen af enzymet, allosteriske faktorer og kovalent modificering.

Question 13

En cofaktor er en ikke-protein del af et enzym der er nødvendig for enzymets funktion, men hvad er forskellen på et coenzym og en prostetisk gruppe?

Answer 13

Coenzym: løst bundet cofaktor (diffunderer mellem forskellige enzymer) – fx CoA, NAD+

Prostetisk gruppe: stærkt bundet cofaktor (diffunderer ikke væk) – fx FAD

Question 14

Her er figren af PDH. Hvad er kompleksets fulde navn?

Answer 14

Pyruvat dehydrogenase komplekset

Question 15

PDH syntetiserer acetyl-CoA ud fra pyruvat.

Hvilke allosteriske faktorer reguleres PDH af? Hvilke hæmmer enzymkomplexet? Hvilke fremmer?

Answer 15

Hæmmere: ATP, acetyl-CoA, NADH, fede syrer

Fremmere: AMP, CoA, NAD+, (Ca++)

Question 16

Hvordan kan en acetylgruppe binde sig til et lipoate?

(Lipoate er en fem-ledet ring med en svolvbro)

Answer 16

Lipoate skal først på reduceret form, hvorefter en acetylgruppe kan binde sig til svolvatomet.

Question 17

Hvor mange elektroner afgives i citronsyrecyklus?

Hvor mange NADH dannes? Hvor mange FADH₂?

Answer 17

8 elektroner afgives i citronsyrecyklus per acetyl-CoA oxideret.

Der dannes 3 NADH og 1 FADH_2. De kan hver bære to elektroner.

Question 18

Hvad er nettoreaktionen af Pyruvat oxidering

Answer 18

Pyruvat + CoA + NAD+ → acetyl-CoA + CO2 + NADH

Question 19

Hvilke organisme har glyoxyatcyklussen og hvilken funktion har denne pathway?

Answer 19

Glyoxylatcyklussen findes i planter. Pathwayens funktion er at syntetisere pyruvat ud fra acetyl-CoA.

(en funktion der ikke findes i mennesker)

Question 20

Hvilket sukker dannes i glyoxylatcyklussen ud fra acetyl-CoA?

Answer 20

Succinat

Question 21

Hvor finder Glykolysen, PDH og citronsyrecyklusen sted?

Answer 21

Glykolysen finder sted i cytosolen, hvorefter pyruvat bliver transporteret ind i mitokondriernes matrix, hvor PDH og citronsyrecyklusen finder sted.

Question 22

Hvorfor kan pattedyr ikke omdanne fedt til sukker?

Answer 22

Mangel på glyoxylat cyklus som danner pyruvat ud fra acetyl-CoA (som dannes fra fedtsyrer)

Question 23

Hvilke af følgende stoffer kan frit diffundere gennem mitokondriets indre membran uden hjælp fra et transportprotein

ATP, H⁺, Pyruvat, HPO₄ og/eller Citrate

Answer 23

Ingen af disse kan diffundere gennem den inderste membran uden hjælp, dog kan de alle diffundere gennem den yderste.

Question 24

Hvilket intermediat kan succinat fra glyoxylatcyklussen omdannes til for at kunne indgå i gluconeogenesen?

Answer 24

Oxaloacetat

Question 25

Nævn de 5 PDH (pyruvat dehydrogenase) cofaktorer.

Answer 25

TTP, lipoate, FAD, CoA-SH og NAD+ (som reduceret til NADH)

Question 26

And his name is…

Answer 26

JOHN CENA!

Question 27

Hvilken størrelse C enheder kan planter danne i glyoxylat cyklussen?

Answer 27

Glyoxylatcyklussen kan danne C4 enheder.