3 - Regulering af kulhydratstofskiftet Flashcards
Hvad er homeostasis?
Opretholdelsen af konstante koncentrationer i biologiske systemer.
Hvad er distinktionen mellem metabolisk regulering og metabolisk kontrol?
Reguleringens funktion er at holde homeostase af koncentrationen af for eksempel metabolitter, hvorimod metabolisk kontrol er en proces, der ændrer metabolismens out-put.
Hvad er en transkriptionsfaktor?
Et protein, der hvis det aktiveres, kan aktivere eller deaktivere transkriptionen af et en gen ved at binde sig tæt ved genets promotor.
Hvad er rapid turnover?
Syntese af et protein umiddelbart efterfulgt af en nedbrydning af proteinet.
Hvilken metabolit virker på FBPase-1 ved feed-forward regulering?
Citrat.
Hvad er en sekundær metabolit?
En metabolit, der ikke bliver omsat, men stadig tjener en funktion i metabolismen. Som for eksempel fruktose-2,6-bisphosphat (regulatorisk molekyle).
Hvad er en fordel ved at have sekundære metabolitter?
Niveauet af sekundære metabolitter kan reguleres uden at ændre koncentrationen af primære metabolitter og derved forhindre at de forstyrrer andre pathways.
Hvordan kan inddelingen af cellen med membraner regulere enzymaktivitet?
Et enzym kan adskilles fra dets substrat, hvilket hindrer den enzymkatalyserede reaktion. Transport af substrat over de intracellulære membraner kan derfor være en begrænsende faktor i nogle reaktioner
Hvad er isoenzymer?
Enzymer, der katalyserer den samme reaktion, men som tjener til forskellige funktioner og derfor har forskellige aktiviteter, Km-konstanter, aminosyresekvens og lokalitet.
Hvad betyder en allosterisk effektor typisk for enzymkatalyseret reaktions kinetik?
Effektoren vil typisk ændre en hyperbolsk kurve til en sigmoid kurve eller omvendt. (Fra sigmoid til hyperbolsk).
Hvad er den mest udbredte kovalente modifikation i reguleringen af enzymer og proteiners aktivitet?
Fosforylering og defosforylering
Hvad kalder man enzymer, der katalyserer defosforyleringen af fosforylerede proteiner?
Phosphoprotein phosphataser
Hvad betyder reaktionsbrøken, Q, for en reaktion som phosphoryleringen af fruktose-6-phosphat til fruktose-1,6-bisphosphat, og hvilket enzym katalyserer reaktionen?
Reaktionsbrøken er under fysiologiske forhold meget mindre end ligevægtskonstanten, K, hvilket betyder at reaktionen kan forløbe exergonisk. Reaktionen er katalyseret af phosphofructokinase- 1 (PFK-1).
Hvorfor er det, at ændringen i cellens AMP-niveau er en mere sensitiv indikator for en celles energiforbrug end cellens ATP-niveau?
Der er en højere koncentration af ATP i en celle end af AMP. Når ATP hydrolyseres til ADP under en celles arbejde, kan 2 ADP omdannes til ATP og AMP, hvilket katalyseres af adenylat kinase. Dette resulterer i en meget højere relativ stigning i niveauet af AMP end det relative fald i niveauet af ATP.
Hvilken funktion har AMP-aktiveret protein kinase (AMPK)?
AMPK regulerer en række enzymers aktiviter ved fosforylering under en stigning i koncentrationen af AMP.
Hvad udtrykker flux-kontrol-koefficienten, C?
C er et udtryk for effekten af et enzyms koncentration på en pathways metaboliske flux.
Hvad udtrykker elasticitetskoefficienten, ε?
Elasticitetskoefficienten udtrykker et enzyms evne til at reagere på ændringer i metabolitkoncentrationer eller regulatormolekyler.
Hvor findes hexokinase IV, og hvad er fordelen ved det?
Dens kinetik afspejler leverens funktion: når glukosekoncentrationen er lav fosforyleres glukose i mindre grad og frigives derfor til blodet. Når glukose derimod er høj fosforyleres glukose i højere grad og indgår i leverens metabolisme.
Ved hvilke enzymer reguleres glukoneogenesen og hvad reguleres de af?
Glukoneogenesen reguleres ved pyruvat carboxylase (aktiveres af acetyl-CoA og inhiberes af ADP) og FBPase-1 (inhiberes primært af fruktose-2,6-bisfosfat og AMP og aktiveres af Citrat).
Hvad betyder den allosteriske effektor, fruktose-2,6-bisfosfat, for substrat-cyklussen mellem glukolyse og glukoneogenese?
Da fruktose-2,6-bisfosfat henholdsvist aktiverer og inhiberer FBK-1 og FBPase-1 minimeres substrate-cycling.
Hvilken rolle har fruktose-2,6-bisfosfat i reguleringen af glukolysen og glukoneogenese?
Fruktose 2,6-bisfosfat inhibere FBPase-1 og aktiverer PFK-1 og medfører en netto glukolyse.
Hvilken del af det dobbelte enzym PFK-2:FBPase-2 henholdsvist nedbryder og synteserer fruktose2,6-bisfosfat?
PFK-2 synteserer, FBPase-2 defosforylerer.
Hvad betyder en defosforylering af det bifunktionelle enzym PFK-2/FBPase-2?
Defosforylering aktiverer PFK-2- delen og inhiberer FBPase-2-delen af enzymet, hvilket øger glukolysen og inhiberer glukoneogenese ved at stimulere syntesen af fruktose-2,6-fosfat.
Hvad er substratet for glykogensyntase?
Substratet er et sukkernukleotid, UDP-glukose.
Hvordan dannes UDP-glukose?
Glukose 6 fosfat omdannes til glukose-1-fosfat, kondenseres med UTP for at danne UDP-glukose og PPi (pyrofosfat)
Hvilken ende af glukogenmolekylet påsættes glukose?
Den ikke-reducerende ende.
Hvilken rolle har glykogenin?
Den virker som primer for 1,4-alpha-glykogensyntasen, ved at katalysere påsættelsen af de syv første glukosemolekyler.
Hvad er et andet navn for amylo-(1-4) til (1-6)-transglykosylase?
Glykosyl(4-6) transferase.