4 - Les concepts de l'espèce Flashcards
Comparer la systémique fondamentale et la systémique appliquée.
La systémique fondamentale sert plutôt à analyser les unités reconnues historiquement, reconnaître des liens de parenté et comprendre des patrons. La systémique appliquée permet d’estimer la biodiversité, caractériser la démographie, reconnaître els espèces vulnérables et menacées, planifier les aires de conservation et l’élevage en captivité.
Nommer des critères de reconnaissances pratiques versus théorique des espèces.
Pratique: Morphologique, comportemental et reproductif
Théorique: Génétique, géographique et temporel.
Qu’est-ce qu’une espèce pour Platon?
Animal, végétal ou minéral.
Qu’est-ce que l’essentialisme?
Les espèces sont des types d’organismes, on reconnait des discontinuités dans la nature, il existe un échantillon type ou un référent pour chaque espèce et il y a une variabilité née ou jugée accidentelle.
Qu’est-ce que le nominalisme?
Les espèces sont seulement des noms pour des besoins pratiques! ce n’est pas réel, seulement des unités théoriques qui évoluent. Il y a des individus et des populations, mais pas d’espèces. Seulement des continuums.
Distinguer les deux grandes catégories de concepts de l’espèce.
Celles basées sur les processus biologiques qui sont responsables de cette évolution (PROCESSUS). Évolutif, écologique, biologique
Celles basées sur les moyens opérationnels de reconnaissance (PATRONS). phénétique, phylogénétique et monophylétique.
Qu’est-ce que le concept évolutif de l’espèce? Sur quoi ce concept est-il basé?
Lorsqu’un lignée évolue de manière séparée des autres et a ses propres rôles et tendances évolutives. Elle maintient son identités dans différentes entités à travers le temps et l’espace.
Il est basé sur les processus biologiques.
Nommer les forces et les faiblesse du concept évolutif de l’espèce. Sur quoi ce concept est-il basé?
Forces: Il y a des organismes asexués et sexués, il y a une dimension temporelle et les entités ont une origine, une dimension et une fin.
Faiblesse: Difficulté de définir un rôle, un destin ou une tendance historique.
Basé sur les processus biologiques.
Qu’est-ce que le concept écologique de l’espèce? Sur quoi ce concept est-il basé?
Les lignées occupent une zone adaptative minimalement différente des autres lignées et évoluent séparément. Un ensemble d’organismes occupant une seule niche. Suppose que les miches écologiques dans la nature occupent des discrètes avec des lacunes entre-elles.
Basé sur les processus biologiques.
En quoi est-ce que le concept écologique de l’espèce est utilisé?
En microbiologie. On peut créer la niche écologique qui permet à une seule espèce d’y vivre
Quelles sont les forces et faiblesses du concept écologique de l’espèce? Sur quoi ce concept est-il basé?
Force: Favorise une approche écosystémique.
Faiblesses: Suppose que les différences de caractères sont le résultat des adaptations, très lié au concept de niche écologique qui lui est vague, pas de dimension évolutive et vaguement lié à la génétique.
Ce concept est basé sur les processus biologiques.
Qu’est-ce que le concept biologique de l’espèce? Sur quoi ce concept est-il basé?
Un groupe de population interfécondes, plus ou moins reproductivement isolés les uns des autres, système de fertilisation communs.
basé sur les processus biologiques.
Nommer des forces et des faiblesses du concept biologique de l’espèce. Sur quoi ce concept est-il basé?
Forces: prend en compte le présent et le futur, respecte la génétique de la population, empirique et non ambiguë, perspective conceptuelle importante pour la spéciation.
Faiblesses: Difficile de déterminer la fécondité, non applicable aux espèces asexuées, fossiles, éteintes, en anneaux, aux population isolées géographiquement, l’hybridation est fréquente chez les plantes et ne tient pas en considération l’histoire évolutive.
Basé sur les processus biologiques.
Qu’est-ce que le concept phénétique de l’espèce? Sur quoi ce concept est-il basé?
L’ensemble d’organismes qui se ressemblent plus qu’ils ressemblent à n’importe quel autre. Plus petit groupe morphométrique multidimensionnel reconnaissable.
Basé sur les patrons, moyens opérationnels de reconnaissance.
Qu’est-ce que le concept phylogénétique de l’espèce? Sur quoi ce concept est-il basé?
Le plus petit ensemble d’organismes s’auto perpétuant qui ont un ensemble de caractères uniques. Ont un patron d’ancêtres et descendants phylogénétiques. Plus petite population (sexué) ou lignée (asexué) que l’on peut diagnostiquer par une combinaison unique d’états de caractères. Basé sur les patrons observables, les moyens opérationnels de reconnaissance et les processus biologiques???
Quelles sont les forces et les faiblesses du concept phénétique de l’espèce? Sur quoi ce concept est-il basé?
Forces: Méthodologiquement facile, sexué et asexué, s’applique aux espèces éteintes.
Faiblesses: Présence d’individus intermédiaires, la morphologie peut être trompeuse sur l’espèce.
Basé sur les patrons observables, les moyens opérationnels de reconnaissance.
Quelles sont les forces et les faiblesses du concept phylogénétique de l’espèce? Sur quoi ce concept est-il basé?
Forces: Dimension évolutive claire, prends en considération la phylogénie des organismes, utilise des critères de reconnaissance micro ou macro, s’applique aux fossiles et sexué et asexué.
Faiblesses: Peu d’sp assez connues pour valider les différents critères, déconnecté de la génétique, utilisation du “plus petit”.
Basé sur les patrons observables, les moyens opérationnels de reconnaissance.
Qu’est-ce que le concept monophylétique de l’espèce? Sur quoi ce concept est-il basé?
Groupe d’individus possédant une apomorphie unique. Plus petit groupe monophylétique reconnaissable de la hiérarchie.
basé sur un patron observable, les moyens opérationnels de reconnaissance.
Quelles sont les forces et les faiblesses du concept monophylétique de l’espèce? Sur quoi ce concept est-il basé?
Forces: tient en considération la phylogénie, micro ou macro, fossiles et sexué et asexué.
Faiblesses: Peu sont suffisamment connues pour permettre de valider la présence d’un caractère unique dérivé, pas de génétique des population.
Basé sur les patrons observables, les moyens opérationnels de reconnaissance.
Nommer des méthodes de délimitation d’espèces basées sur les caractères.
L’évaluation morphologique initiale, le barcoding et l’automatic barcoding gap discovery (ABGD)
Qu’est-ce que l’évaluation morphologique initale?
Délimitation d’espèces basées sur les caractères morphologiques.
Qu’est-ce que le barcoding?
Séquençage de gènes diagnostiques pour chaque règne. repose sur l’hypothèse que les distances génétiques au sein d’une espèce sont plus petites qu’entre les espèces.
Qu’est-ce que l’automatic barcoding gap discovery?
Permet d’identifier les limites entre les espèces en identifiant les lacunes entre les distances bimodales qui correspond aux limites entre les espèces.
Sur quoi est basé la Generalized Mixed Yule Coalescent (GMYC)?
La phylogénie
Comment fonctionne la Generalized Mixed, Yule Coalescent?
À chaque noeud d’un arbre, il peut y avoir de la divergence (spéciation de YULE) ou de la coalescence (plus fréquent). On impose une limite entre la divergence inter et intra sp qui permet de déterminer les sp.
Qu’est-ce qu’une ACP?
Une analyse de composante principale. Méthode statistique multivariée tenant en considération la totalité des données morphologiques.
Dans quel ordre les tests suivants seraient effectués afin de faire une délimitation intégrative de l’espèce? GMYC, ABGD, IMA, concordance avec distribution géographique.
IMA, ABGD, GMYC, concordance avec distribution géographique.
Expliquer une situation où le choix du concept de l’espèce est important.
Lors de la planification d’aires de conservation, l’estimation de la biodiversité.
