4

Question 1

como son la secuencias regulatoira en promotores

Answer 1

cis-acting y se localizan upstream, contiene una timidin quinasa
Los llamamos “boxes” que controlan la transcripcion de genes proximos

Question 2

cuantas bases tiene los enhancers

Answer 2

miles, hay usa 72bp repetidas

Question 3

q hace el enhancer

Answer 3

permite la union de proteinas reguladoras de la transcricion especificas

Question 4

proceso de TADs

Answer 4

• lso insulators marcan la frontera
• de este modo interaccionan los enhancer y los promotores
• las conesinas lo mantienen fijados
• Las CTCF se uenne en varios sitios son proteinas reguladoras de la organizacion del genoma en vertebrados
• El TFIIIC contribuye con el CTCF y la cohesina para establecer las uniones de los TAD

Question 5

q tecnica se usa para los TADs

Answer 5

se usa la tecnica 3C en la que nos indica los puntos de interaccion entre dos sitios del genoma

Question 6

quienes aseguran que la mayoria de las enfermedades asociada a variaciones de secuencias estan en secuencias no codificantes del ADN

Answer 6

Genome-wide association studies (GWAS)

Question 7

q ebfermedades estasn asociadas con fallos en los TADs

Answer 7

• Polidactilia
• B-talasemia
• Leucemia

Question 8

tecnicas para detectar los activadores transcripcionales

Answer 8

• Electrophoretic- mobility shift assay
• Chromatin immunoprecipitation
  -ADN-affinity chromatography

Question 9

ELectrkphoretic - mobility shift assay

Answer 9

• Priemero hacemso la electroforesis del ADN (vemos donde queda la banda)
• cogemso las proteinas y hacemos la electroforesis
• si corre menos es que se han unido
• puede seguir apareciendo la otra porque no todo el ADN se une

Question 10

inmunoprecipitacion de cromatina

Answer 10

• añadimos formaldehido que hara todas las uniones mucho mas fuertes a la vez que fragmanta la cromatina
• metemos anticuerpo especificos para las proteinas
• eñ anticuerpo se unira al factor
• ailamos el complejo
• para verlo en su conjunto utilicimaos PCR
• para un analisis mas exaustivo del genoma con microrayos y secuenciacion masiva

Question 11

cromatografia de afinidad al ADN

Answer 11

Si conocemos la zona de ADN (GC box)
- le añadimos bits de agarosa en la columna de cromatografia
- Añadimos las proteinas y las que reconozcan al ADN se uniran (SP1 se une a GC)
- el resto sale = trow throught
- añadimos u tampon con sal = se separa el ADN y las proteinas

Question 12

q tienen los zinc fingers

Answer 12

cisteina e histidina

Question 13

ejemplo de tener dedos de zinc

Answer 13

receptores de hormonas esteroideas

Question 14

quien tiene homodminios de proeines importantes en el control de la expresion durante el desarrollo embrionario

Answer 14

heliz-turn-helix

Question 15

cuantas leucinas hay en las cremalleras de leucina

Answer 15

4-5

Question 16

q aa tienen los cremalleras de leucina en su zona de union

Answer 16

arginina y lisina

Question 17

dimerizaciones de MAX

Answer 17

• MYC - MAX: activan
  -MAD - MAX: reprimen

Question 18

q es lo que se fosforila en la CDt para inicia rla transcricion

Answer 18

serina 5

Question 19

inhibirdores d ela elingacion

Answer 19

• NELF
• DSIF

Question 20

quien inhibe a los factores inhibidores de elongacion

Answer 20

• la P.TEFb: Positive transcription elongaticon factor . b fosforila los otros
  Es reclutada por c-Myc

Question 21

cuantos aminoacidos tienen las hsitonas

Answer 21

de 102 a 135

Question 22

q cantidad de las histonas son lisina y arginina

Answer 22

1/5

Question 23

modificacion en aa para la regulacion positiva

Answer 23

• metilacion = lisina y arginina
• acetilacion = lisina
  fosforilacion = serina
  a la lisina se le puede unir ubiquitina y SUMO

Question 24

modificacion de aa para regulacion negativa

Answer 24

metilacion lys 9 y 27
ayuda a reprimir y por tamto heterocromatina

Question 25

quienes no tiene nucleosomas

Answer 25

los enhancers y promotores
por trimetilacion o monometilacion de la lys 4 de la histona 3

Question 26

donde se metila principalmente el ADN em epigenetica

Answer 26

Las citosinas sobre la guanina
La secuencia de metilacion es CpG

Question 27

que gen esat metilado durante el desarrollo de las celulas masculinas germinales

Answer 27

el H19, tiene un long noncoding que se asocia con factores remodeladores de cromatina
inactivan el cromosoma X