4 Flashcards
como son la secuencias regulatoira en promotores
cis-acting y se localizan upstream, contiene una timidin quinasa
Los llamamos “boxes” que controlan la transcripcion de genes proximos
cuantas bases tiene los enhancers
miles, hay usa 72bp repetidas
q hace el enhancer
permite la union de proteinas reguladoras de la transcricion especificas
proceso de TADs
- lso insulators marcan la frontera
- de este modo interaccionan los enhancer y los promotores
- las conesinas lo mantienen fijados
- Las CTCF se uenne en varios sitios son proteinas reguladoras de la organizacion del genoma en vertebrados
- El TFIIIC contribuye con el CTCF y la cohesina para establecer las uniones de los TAD
q tecnica se usa para los TADs
se usa la tecnica 3C en la que nos indica los puntos de interaccion entre dos sitios del genoma
quienes aseguran que la mayoria de las enfermedades asociada a variaciones de secuencias estan en secuencias no codificantes del ADN
Genome-wide association studies (GWAS)
q ebfermedades estasn asociadas con fallos en los TADs
- Polidactilia
- B-talasemia
- Leucemia
tecnicas para detectar los activadores transcripcionales
- Electrophoretic- mobility shift assay
- Chromatin immunoprecipitation
-ADN-affinity chromatography
ELectrkphoretic - mobility shift assay
- Priemero hacemso la electroforesis del ADN (vemos donde queda la banda)
- cogemso las proteinas y hacemos la electroforesis
- si corre menos es que se han unido
- puede seguir apareciendo la otra porque no todo el ADN se une
inmunoprecipitacion de cromatina
- añadimos formaldehido que hara todas las uniones mucho mas fuertes a la vez que fragmanta la cromatina
- metemos anticuerpo especificos para las proteinas
- eñ anticuerpo se unira al factor
- ailamos el complejo
- para verlo en su conjunto utilicimaos PCR
- para un analisis mas exaustivo del genoma con microrayos y secuenciacion masiva
cromatografia de afinidad al ADN
Si conocemos la zona de ADN (GC box)
- le añadimos bits de agarosa en la columna de cromatografia
- Añadimos las proteinas y las que reconozcan al ADN se uniran (SP1 se une a GC)
- el resto sale = trow throught
- añadimos u tampon con sal = se separa el ADN y las proteinas
q tienen los zinc fingers
cisteina e histidina
ejemplo de tener dedos de zinc
receptores de hormonas esteroideas
quien tiene homodminios de proeines importantes en el control de la expresion durante el desarrollo embrionario
heliz-turn-helix
cuantas leucinas hay en las cremalleras de leucina
4-5
q aa tienen los cremalleras de leucina en su zona de union
arginina y lisina
dimerizaciones de MAX
- MYC - MAX: activan
-MAD - MAX: reprimen
q es lo que se fosforila en la CDt para inicia rla transcricion
serina 5
inhibirdores d ela elingacion
- NELF
- DSIF
quien inhibe a los factores inhibidores de elongacion
- la P.TEFb: Positive transcription elongaticon factor . b fosforila los otros
Es reclutada por c-Myc
cuantos aminoacidos tienen las hsitonas
de 102 a 135
q cantidad de las histonas son lisina y arginina
1/5
modificacion en aa para la regulacion positiva
- metilacion = lisina y arginina
- acetilacion = lisina
fosforilacion = serina
a la lisina se le puede unir ubiquitina y SUMO
modificacion de aa para regulacion negativa
metilacion lys 9 y 27
ayuda a reprimir y por tamto heterocromatina
quienes no tiene nucleosomas
los enhancers y promotores
por trimetilacion o monometilacion de la lys 4 de la histona 3
donde se metila principalmente el ADN em epigenetica
Las citosinas sobre la guanina
La secuencia de metilacion es CpG
que gen esat metilado durante el desarrollo de las celulas masculinas germinales
el H19, tiene un long noncoding que se asocia con factores remodeladores de cromatina
inactivan el cromosoma X
