2 Flashcards
de donde sale la energia de unio del nuevo nucleotido a la hebra en formacio
hidrolisis de PP que se libera
que se hizo en la E.Coli para ver como era el proceso de repliccion
crecieron en presencia de timidina radiactiva para permitir una autoradiografia
cuantos nucleotidos añade la primasa al primer
3-10
en Eucariotas quien elimina el primer
una ARNasa H (exonucleasa 5´ a 3´)
en procariotas quien elimina el primer
LA pol1 lo quita u añade los que correspondesw
como se llama en bacterias el espacio que queda al quitar el primer
nick
en eucariotas quien llena el hueco que deja la salida del primer
pol delta
nombre de la porteina que ancla las polierasas a la hebra molde
PCNA
Sliding-clamb protein
nombre de proteina que carga el PCNA
RFC
Clambp loading protein
usa ATP para abrir la pinza
las helicasas se unen a una o a las dos hjebras
a una
cuantas subunidades tiene el anillo de helicasa
7
como se llamanlas SSB en eucatiotas
RPA
tipos ded topoisomerasas
- 1: no gasta ATP: tiene tirosina que se unen covalentemente cambiando un enlace fosfodiester por uno fosfotirosina
- 2 gasta aTP: corta una hebra y la une a ambos extremos, ahora se abre y deja salir la otra, se vuelve a unir y ya estan separadas
medicamento que inhibe las topoisomerasa de procariotas
ADN girasa
que tipos de histonmas se van del todo y cuales no
H3 y 4 se distribuyen a las hebras aleatoriamente
H2A y B se van
Luego incorporamos todas con chaperonas
frecuencia de mutaciones
1 por cada 10^9
corrreciones de mutaciones
- complementariedad de bases: poner la correcta deja el fallo en 10^2
- la union del nucleotido corrercto produce cambios en la polimerasaque hace que una mas
- Proofreading: tenemos exonucleasas que hidroliza de 3´a5´(esto solo lo tienen delta, opsilon y pol III) = fallos a 10^7
cuantos pares de bases tiene un ori
245bp
cuantos origenes de replicacion tienen una celula humana
30000
q separacion hya entre cada ori
de 50 a 300kb
q es un ARS
Autonomously Replicating Sequences
donde se une el ORC
experimento ARS
sin ARS los plasmidos se acababan perdiendo a menos que se convinara con el genoma (poco comun), en cuanto se lo ponemos se replica y se transmite
ORC
Origin of Replication Complex = complejo de 6 subunidades
proceso union del ORC al ARS
- Union del ORC
- se unen Cdt 1 y Cdc6
- union MCM2-7 helicase
- seunen otras, entre ellas una Cdc 45 y la GINS que permiten la union de una CDK = cyclin Dependent Kinase
helicasa usada como biomarcador para cancer
Mcm5
cuantas bases hay en el overhand
150-200 bases
Blackburn, Greider y Szostak
Nobel por descubrimiento de como los cromosomas son protegidos por los telomeros y la telomerasa
cuantos nucleotidos pierde un telomero en cada division?
100-200
como se llama la enfermedad de envejecimiento prematuro
Dyskeratosis congenita
como se llama los cambios por insercion y deleccion queno hacen stop
Frameshift
SNP
Single Nucleotide Polymorphisms
daños endogenos
- depurinacion (mas abundante)
- depirimidacon
- deaminacion: C-U A-I
dañps quimicos o medianbientales
- dimeros timidina(tambien C), saturacion 5´ y 6´= anillo ciclobutano. por UV
- Alquilacion. metil o etil, O6mG-T. Por quimicos o radiacion
- Reaccion con carcionoma. union covalente a G = distorison de la helice
Bloom´s Syndrome
- Fallo en helicasas
- Retraso de crecimiento y precisposicion a cancer
Werner´s Syndrome
- Fallos en Helicasas y exonocleasas
- REtraso del crecimiento y predisposicion al cancer
- envejecimiento prematuro y progeria
tipos de reparacion del ADN
- Inversion directa del ADN dañado
- reparacion por excision
- reparacion de rotura de doble hebra
reparaciones por inversion directa
- fotoreactivacion: fotoliasa que pilla energia de luz visible = rompe el cuclobutano
- reparacion de O6 metilguanina:O6 metilguanina metil transferasa (tiene Cys en su centro activo)
reparaciones por excision
- excisoin de bases: ADN glicosilasa = rotura del enlace N-glucosidico = AP - AP endonucleasa detecta y fosfodiesterasa corta. Nos vale para deaminacion, alquilaciones o basesdañadas por oxidacion o por ionizacion
- excision de nucleotidos: para dimeros T
- Mismatch repair
proceso exxcision de nucleotidos
- XPC detecta
- metemos XPS y TFIIH (XPB y XPD= helicasas) + RPA
- Metemos 5 XPF + ERCC1 y en 3 XPG= endonucleasa
Xeroderma pigmentosum
- hipersensible a UV
Cockayne´s syndrome
- microencefalia
- dificultad para ganar peso y bajitos
- sensibilidad a luz
- cambiamos XPA por CDB y luego mete,os CDA
Mismatch repair procariotas
- viejas metilacion en A
- Mut S = reconoce
- MutH= corta
- MutL= junto con S hace complejo con helicasa y exonuxleasa
Mismatch repair en eucariotas
- Mut S= MSH
- Mut L= MLH
- Mut H= X
- la nmueva tienen trozos de cadena sencilla
Mutaciones en estas= HNPCC= Cancer colorectal Hereditario No Poliposo
q pasa si sigue fallando despues de que pasen los procesos de reoaracion
cambiamos la pol por una pol V: atraviesa el erros= poco fiable (no exonuclea de 3 a 5), cuando pasa el error volvemos a la anterior
tipos de reparacion por rotura de doble hebra
- Non-homologous end joining (NHEJ)= rompe donde a roto= poco fiable = trasnlocacion y fusion telomerica
- Homologous recombination (HR) = tiene que seguir unido a la cromatida hermana
Homologous Recombination
- Hay fallo
- metemos exonucleasas para crear un 3´ overhand- RecA en bacterias y Rad 51 en eucariotas (induciran filamentos para unon)
- este es reactivo y busca la cadena comp`lementaria de la cromatida hermana.
- cortamos y arreglado (por ahi hay un holiday junction)
mutaciones relacionadas con mismatch repair de homologous recombination
- BRCA2 es la que recluta a Rad 51
- mutaciones en esta = mutacion en oncogener y represores= cancer de pecho
recombinacion homologa en mitosis
- hay un nick
- cortamos
- hacemos 3´overhand arriba
- sube el de abajo = cortamos
- la de abajo queda cortada peor no pasa na porwur es lagging
recomninacion homologa en meiosis
- Spo11 atrae Mre11 nucleasa
- cortamos en una y overhands
- atacamos a hermanas y cuando se unen cortamos
Reorganuizacion de ADN
cambiamos el orden como para anticuerpos
amplificacion de ADN
= muchas copias= muchas proteinas= cancer
