3 Flashcards

1
Q

cual es el paso mas importante en la regulación de la expresoin genética?

A

La transcripcion

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2
Q

quien encuentra el sitio de inicio de transcrpcion ?

A

la subunidad sigma (procariotad)

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3
Q

que tienen en comun los promoteres

A

secuencias en posicion -10 y -35que se encuentran en la upstream

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4
Q

cuantos pares de bases se desenroscan por la polimerasa cuando se abre el complejo promotor

A

12-14

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5
Q

cuando se va sigma

A

despues de añadir 10 nucleotidos

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6
Q

cuando empiezza a salir la cola cuantas bases estan unidas al adn dentro de la pol

A

8-9

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7
Q

medicamento que inhibe la polimerasa bacteirana

A

Rifampicina, para terapia antituberculosis

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8
Q

cuantas subunidades tiene la pol en eucariotats
cuantas conservadas
cuantas relacionanadas con la pol bacteriana

A

12-17
9
5

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9
Q

roger. D.Kornberg

A

bases moleculares de la transcripicon eukariotica

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10
Q

q transcribe pol 2

A

ARNm, miARN, lncARN(long coding)
Las dos ultimas intervienen en la expresion de genes en eukariotas

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11
Q

q transcribe pol 3

A

ARNt y ARNr 5S
tambien pueden snARN (small nuclear) y scARN (small cytoplasmic ARN)

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12
Q

q transcribe pol 1

A

ARNr 28, 18, 5,8

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13
Q

q porcentaje de los genes tienen factores de transcripcion

A

10%

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14
Q

donde se localiza la TATAA box

A

a 25-30n, corresponde a la -10 de bacterias

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15
Q

donde se une la TFIIB

A

A la BRE, se localiza a 35n

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16
Q

que hay mas alla de la TATAA

A

Inr, DCE, MTE, DPE
se localizan downstream

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17
Q

union de los factores de transcripcion

A
  • Union de la TFIID (tiene TBP=union a TATAy TAF=union al resto)
  • Union de TFIIB a BRE
  • Union de TFIIF y todos juntos traen la pol II
  • Union TFIIE
  • Union de TFIIH que tiene una quinasa que fosforila la CDT y helicasas=XPB y XPD
    Como dice Maria David Busca Foca Entonces Huye
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18
Q

cuantas subunidades riene el mediador?

A

20

19
Q

q otras cosas se unen a la CTD que ayuda a la eloongacion?

A
  • Factores Remodeladores de cromatina
  • Proteinas procesadores de ARNm
20
Q

quien inhibe la pol II

A

la alfa amanitin

21
Q

q enlace hay en la guaosina del 5´

A

enlace 5´-5´
metilamos la guanosina y la ribosa

22
Q

cuando se une la cap

A

despues de 20-30 nucleotidos

23
Q

proceso de poliadeninacion

A
  • Tenemos un hexanucleoptido conservado : AAUAAA
  • Hay un sitio CA donde va a comenzar
  • cuando eso quitamos un sitio GU-rich o U-rich
  • llega una poli A polimerasa y va añadiendo A
24
Q

experimento de transcripcion en polimerasa de bacteriofago

A
  • plasmido con dos exones y en medio un intron y un promotor para la ARN polimerasa
  • se corta al final de los dos = ADN lineal
  • la polimerasa lo lee y nos da un preARNm (seguimos teniendo el intron)
  • se hicieron estractos nucleares y ahora los intrones se eliminaban
25
Q

proceso splicing

A
  • en el 5´hya un GU
  • un branch point = A, su OH ataca el 5´ y lo rompe= larriat
  • nos queda un OH en el 5´ quie atacara el 3´=AG y sale todo
  • luego el larriat se alinea y se degrada en ek nucleo
    TODO JUNTO FORMA EL SPLICEOSOMA
26
Q

Small nuclear ribonucleoproteinas (snARN) que participa en el splicing

A

1,2,4,5 y 6
son compeljos de 6 a10 proteinas.
4 y 6 van juntos

27
Q

funcion de las ribonucleoproteinas en el splicing

A
  • U1 se une al 5´
  • U2 se une al branch
  • despues se une el resto y acabaran saliendo 1 y 4 y el resto ayudan en la excision
    Para que se unan el 1 y 2 hay unos SR en 5´y 3´, para q 2 se una al lariat al lado se pega el U2AF
28
Q

q esa el alternative splicing

A

combienacion de exones

29
Q

cuantas proteinas suele dar 1 gen

A

6

30
Q

de que depende el alternative splicing

A

de especifidad tisular y signos extracelulares

31
Q

alternative splicing en moscas

A
  • Machos: U2AF reconoce 3´y encuenrta un codon de parada = no funcional
  • Hermbra: Proteina SXL y se bloquea la union de la UAG
32
Q

problemas por distrofina

A
  • Distrofia de duchenne: ausente
  • Distrofia de Beckers: anormal
33
Q

terapia distrofina

A

Exon Skipping Therapy
Con duchenese eliminan exones de 48 a 50
- bloquea el splicing

34
Q

alteracion de codificacion de proteinas por deaminacion

A

Apolipoproteina B100 = hugado
B48= intestino, un nuevo stop

35
Q

como se degrada el ARNm

A
  • Recorta la poli-A (nucleasas que vienen desde la 3´)
  • Luegoo se quita la cap con nucleasas que vienen del 5´
36
Q

sintesis de 28, 18 y 5,8

A

todo viene de uno que luego cortamos
- primero hay un promotor
- hay dos factores de transcripcion: UBF (Upstream binding factor) y SL1 (selective factor 1)
El orden es UBF - SL1 y Pol 1
- Luego cortamos, 1º separamos el 18 y el 28 y 5,8 se cortan pero siguen uniods por puentes de hiudrogeno

37
Q

que factores de transcripcion se unene al promotor de la ARN pol 1

A
  • UBF (Upstream binding factor)
  • SL1 (selective factor 1)
38
Q

sintesis del 5S

A
  • TFIIIA
  • TFIIIC
  • TFIIIB
  • Pol III
    esdta dentro NO upstream
39
Q

sintesis ARNt

A
  • TFIIIC
  • TFIIIB
  • Pol III
    se genera un preARNt
    Hay una robocima: ARNasa P ribocima
    añadimos CCA
40
Q

Sidney Altman y Thomas R.Cech

A

Descubrimiento de las propiedades cataliticas del ARN

41
Q

q porcentaje de bases son modificadas en el ARNt

A

El 10%

42
Q

quienes pueden transcribir el mall nuclear ARN (snARN) y el semall cytoplasmic (scARN)

A

la pol II y la pol III

43
Q

Síntesis del U6 snARN

A
  • SNAP
  • TFIIIB
  • Pol III