3 Flashcards
cual es el paso mas importante en la regulación de la expresoin genética?
La transcripcion
quien encuentra el sitio de inicio de transcrpcion ?
la subunidad sigma (procariotad)
que tienen en comun los promoteres
secuencias en posicion -10 y -35que se encuentran en la upstream
cuantos pares de bases se desenroscan por la polimerasa cuando se abre el complejo promotor
12-14
cuando se va sigma
despues de añadir 10 nucleotidos
cuando empiezza a salir la cola cuantas bases estan unidas al adn dentro de la pol
8-9
medicamento que inhibe la polimerasa bacteirana
Rifampicina, para terapia antituberculosis
cuantas subunidades tiene la pol en eucariotats
cuantas conservadas
cuantas relacionanadas con la pol bacteriana
12-17
9
5
roger. D.Kornberg
bases moleculares de la transcripicon eukariotica
q transcribe pol 2
ARNm, miARN, lncARN(long coding)
Las dos ultimas intervienen en la expresion de genes en eukariotas
q transcribe pol 3
ARNt y ARNr 5S
tambien pueden snARN (small nuclear) y scARN (small cytoplasmic ARN)
q transcribe pol 1
ARNr 28, 18, 5,8
q porcentaje de los genes tienen factores de transcripcion
10%
donde se localiza la TATAA box
a 25-30n, corresponde a la -10 de bacterias
donde se une la TFIIB
A la BRE, se localiza a 35n
que hay mas alla de la TATAA
Inr, DCE, MTE, DPE
se localizan downstream
union de los factores de transcripcion
- Union de la TFIID (tiene TBP=union a TATAy TAF=union al resto)
- Union de TFIIB a BRE
- Union de TFIIF y todos juntos traen la pol II
- Union TFIIE
- Union de TFIIH que tiene una quinasa que fosforila la CDT y helicasas=XPB y XPD
Como dice Maria David Busca Foca Entonces Huye
cuantas subunidades riene el mediador?
20
q otras cosas se unen a la CTD que ayuda a la eloongacion?
- Factores Remodeladores de cromatina
- Proteinas procesadores de ARNm
quien inhibe la pol II
la alfa amanitin
q enlace hay en la guaosina del 5´
enlace 5´-5´
metilamos la guanosina y la ribosa
cuando se une la cap
despues de 20-30 nucleotidos
proceso de poliadeninacion
- Tenemos un hexanucleoptido conservado : AAUAAA
- Hay un sitio CA donde va a comenzar
- cuando eso quitamos un sitio GU-rich o U-rich
- llega una poli A polimerasa y va añadiendo A
experimento de transcripcion en polimerasa de bacteriofago
- plasmido con dos exones y en medio un intron y un promotor para la ARN polimerasa
- se corta al final de los dos = ADN lineal
- la polimerasa lo lee y nos da un preARNm (seguimos teniendo el intron)
- se hicieron estractos nucleares y ahora los intrones se eliminaban
proceso splicing
- en el 5´hya un GU
- un branch point = A, su OH ataca el 5´ y lo rompe= larriat
- nos queda un OH en el 5´ quie atacara el 3´=AG y sale todo
- luego el larriat se alinea y se degrada en ek nucleo
TODO JUNTO FORMA EL SPLICEOSOMA
Small nuclear ribonucleoproteinas (snARN) que participa en el splicing
1,2,4,5 y 6
son compeljos de 6 a10 proteinas.
4 y 6 van juntos
funcion de las ribonucleoproteinas en el splicing
- U1 se une al 5´
- U2 se une al branch
- despues se une el resto y acabaran saliendo 1 y 4 y el resto ayudan en la excision
Para que se unan el 1 y 2 hay unos SR en 5´y 3´, para q 2 se una al lariat al lado se pega el U2AF
q esa el alternative splicing
combienacion de exones
cuantas proteinas suele dar 1 gen
6
de que depende el alternative splicing
de especifidad tisular y signos extracelulares
alternative splicing en moscas
- Machos: U2AF reconoce 3´y encuenrta un codon de parada = no funcional
- Hermbra: Proteina SXL y se bloquea la union de la UAG
problemas por distrofina
- Distrofia de duchenne: ausente
- Distrofia de Beckers: anormal
terapia distrofina
Exon Skipping Therapy
Con duchenese eliminan exones de 48 a 50
- bloquea el splicing
alteracion de codificacion de proteinas por deaminacion
Apolipoproteina B100 = hugado
B48= intestino, un nuevo stop
como se degrada el ARNm
- Recorta la poli-A (nucleasas que vienen desde la 3´)
- Luegoo se quita la cap con nucleasas que vienen del 5´
sintesis de 28, 18 y 5,8
todo viene de uno que luego cortamos
- primero hay un promotor
- hay dos factores de transcripcion: UBF (Upstream binding factor) y SL1 (selective factor 1)
El orden es UBF - SL1 y Pol 1
- Luego cortamos, 1º separamos el 18 y el 28 y 5,8 se cortan pero siguen uniods por puentes de hiudrogeno
que factores de transcripcion se unene al promotor de la ARN pol 1
- UBF (Upstream binding factor)
- SL1 (selective factor 1)
sintesis del 5S
- TFIIIA
- TFIIIC
- TFIIIB
- Pol III
esdta dentro NO upstream
sintesis ARNt
- TFIIIC
- TFIIIB
- Pol III
se genera un preARNt
Hay una robocima: ARNasa P ribocima
añadimos CCA
Sidney Altman y Thomas R.Cech
Descubrimiento de las propiedades cataliticas del ARN
q porcentaje de bases son modificadas en el ARNt
El 10%
quienes pueden transcribir el mall nuclear ARN (snARN) y el semall cytoplasmic (scARN)
la pol II y la pol III
Síntesis del U6 snARN
- SNAP
- TFIIIB
- Pol III
