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Capítulo 3, Lehninger > 3.1 Aminoácidos > Flashcards

3.1 Aminoácidos Flashcards

1
Q

¿Cuáles son los aminoácidos apolares alifáticos?

A
  1. Glicina
  2. Alanina
  3. Prolina
  4. Valina
  5. Leucina
  6. Isoleucina
  7. Metionina
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Q

¿Cuáles son los aminoácidos aromáticos?

A
  1. Fenilalanina
  2. Tirosina
  3. Triptófano
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3
Q

¿Cuáles son los aminoácidos polares sin carga?

A
  1. Serina
  2. Treonina
  3. Cisteína
  4. Asparagina
  5. Glutamina
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4
Q

¿Cuáles son los aminoácidos cargados positivamente?

A
  1. Lisina
  2. Histidina
  3. Arginina
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5
Q

¿Cuáles son los aminoácidos cargados negativamente?

A
  1. Aspartato
  2. Glutamato
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6
Q

¿Cuales son los componentes de la estructura de un aminoácido?

A
  1. Grupo carboxilo
  2. Grupo amino
  3. Hidrógeno
  4. Grupo R
  5. Carbono alfa
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7
Q

Los aminoácidos son los…

A

Monómeros de las proteínas

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8
Q

Los 20 aminoácidos estándar que constituyen las proteínas son

A

α-aminoácidos, por presentar un carbono α

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9
Q

¿Cuál es el componente que le otorga a cada aminoácido la solubilidad en el agua?

A

Los grupo R varían en tamaño, estructura y carga eléctrica.

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10
Q

Cada aminoácido tiene un estereoisómero, excepto la glicina, estos reciben el nombre de…

A

Enantiómeros, son estereoisómeros, imágenes especulares pero que no son superponibles entre sí.

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11
Q

La configuración absoluta de aminoácidos y glúcidos sencillos

A

Es el sistema D, L

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12
Q

¿Por qué la configuración absoluta, que está basada en el azúcar simple gliceraldehído, es usada para la configurar a los aminoácidos?

A

Porque el grupo ALDEHÍDO puede convertirse en un grupo carboxilo mediante su oxidación.

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13
Q

Los estereoisómeros que tienen una configuración relacionada con el L-gliceraldehído…

A

Se designan como L.

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14
Q

Los estereoisómeros que tienen una configuración relacionada con el D-gliceraldehído

A

Se designan como D.

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15
Q

¿Qué determina la clasificación de los grupos R de los aminoácidos?

A

La clasificación de los aminoácidos depende la polaridad del grupo R, o su tendencia a interaccionar con el agua a pH biológico.

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16
Q

¿Qué significa que un aminoácido sea L-aminoácido?

A

L-aminoácidos son aquellos aminoácidos que tienen el grupo α-amino a la Izquierda.

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17
Q

¿Qué significa que un aminoácido sea D-aminoácido?

A

D-aminoácidos son aquellos aminoácidos que tienen el grupo α-amino a la Derecha.

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18
Q

Todos los aminoácidos de las proteínas son…

A

L-estereoisómeros

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19
Q

¿Por qué se forman o producen únicamente aminoácidos L-estereoisómeros?

A

Las células son capaces de sintetizar específicamente los estereoisómeros L esto gracias a que los centros activos de las enzimas son asimétricos, lo que implica que las reacciones que catalizan sean ESTEREOESPECÍFICAS.

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20
Q

¿Qué característica le confieren a las proteínas los aminoácidos con la cadena lateral apolar alifática?

A

La cadena lateral de estos aminoácidos tienden a agruparse entre sí en las proteínas ESTABILIZANDO las estructuras proteicas a través de la formación de interacciones hidrofóbicas. También la cadena lateral de prolina le confiere rigidez a las estructuras proteicas.

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21
Q

Las cadenas laterales de los aminoácidos aromáticos son…

A

Son relativamente apolares (hidrofóbicos) por lo que participan en la formación de interacciones hidrofóbicas en las estructuras proteicas

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22
Q

Tirosina gracias al grupo hidroxilo de la cadena lateral puede…

A

Formar puente de hidrógeno

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23
Q

Ordene de mayor a menor en polaridad a los aminoácidos aromáticos

A

Tirosina y triptófano son más polares que fenilalanina

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24
Q

Los aminoácidos aromáticos gracias a la cadena lateral pueden…

A

Absorber luz ultravioleta, triptófano y tirosina en mucho mayor grado que fenilalanina. Pero sobretodo el triptófano.

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25
Q

¿A qué longitud de onda absorben el triptófano y tirosina?

A

A una longitud de onda de 280 nm.

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26
Q

La absorción de la luz se puede medir con un…

A

Espectrofotometro

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27
Q

La espectrofotometría se utiliza para…

A

Detectar e identificar moléculas y medir su concentración en solución.

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28
Q

Con un paso óptico fijo…

A

La absorbancia (A) es directamente proporcional a la concentración de la molécula absorbente presente en solución.

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29
Q

Un aminoácido particular dentro de los aminoácidos con grupo R polares sin carga es la

A

Cisteína, esto debido a que el grupo sulfhidrilo que presenta se oxida fácilmente formando un aminoácido dimérico unido covalentemente llamado CISTINA, en el cual los dos aminoácidos están unidos por un enlace disulfuro.

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30
Q

¿Cuál es la importancia de la formación de cistina en la estructura de las proteínas?

A

La formación del enlace disulfuro en las proteínias le entrega estabilización, y además los residuos de cistina son fuertemente apolares (o hidrofóbicos), lo que de nuevo permite formar interacciones hidrofóbicas que estabilizan la estructura de la proteína.

31
Q

Asparagina y glutamina se pueden hidrolizar a

A

Aspartato y glutamato, mediante el cambio de pH.

32
Q

Los grupos R cargados positivamente (básicos) a pH 7,0

A

Son aquellos cuando el grupo R lleva un grupo básico (amino), de tal modo que a pH neutro, tienen carga eléctrica positiva (toma H+).

33
Q

La histidina es el único aminoácido que…

A

Es el único aminoácido que tiene un grupo R ionizable con un pka próximo a la neutralidad. Puede estar o no cargada positivamente a pH 7,0.

34
Q

Los residuos His participan…

A

Participan de muchas reacciones enzimáticas ya que actúan como dadores/aceptores de protones.

35
Q
A
36
Q

Los grupos R cargados negativamente (ácidos) a pH 7,0

A

Son aquellos que el grupo R lleva un grupo ácido (carboxilo), de manera que a pH neutro, tienen carga negativa, ya que ese grupo desprende H+.

37
Q

Los aminoácidos tienen la capacidad de …

A

Actuar como ÁCIDOS y BASES. Esto es debido a que los grupos amino y carboxilo de los aminoácidos, junto con los grupos R ionizables de algunos aminoácidos tienen la capacidad de actuar como ácidos y bases DÉBILES.
Los aminoácidos que pueden actuar

38
Q

¿Qué es un ácido?

A

Un ácido es aquella especie que DA/ENTREGA protones.

39
Q

¿Qué es una base?

A

Una base es aquella especie que RECIBE/ACEPTA protones

40
Q

¿Cuáles son los aminoácidos ácidos?

A

Los aminoácidos ácidos son aquellos que tienen un grupo R ácido (CARBOXILO), que a pH 7,0 este entrega su protón, por lo que tiene carga negativa, ya que ese grupo desprende H+.

41
Q

¿Cuáles son los aminoácidos básicos?

A

Los aminoácidos básicos son aquellos que tienen un grupo R básico (AMINO), que a pH 7,0 recibe un protón por lo que se encuentra cargado positivamente.

42
Q

¿Qué es un zwitterion o ion dipolar?

A

Un zwitterion es un compuesto químico eléctricamente neutro, pero que tiene cargas formales positivas y negativas sobre átomos diferentes. Los zwitteriones son especies polares y usualmente presentan una elevada solubilidad en agua y bastante baja en muchos disolventes orgánicos de carácter apolar.
Los zwitteriones son moléculas que contienen grupos ácidos y grupos básicos (y son, por tanto, anfóteras) existiendo como iones dipolares en ciertos intervalos de pH.

43
Q

¿Cómo es la forma zwitteriónica de los aminoácidos?

A

A pH 7,0, los aminoácidos que no tienen un grupo R ionizable, el grupo amino se encuentra con su protón, NH3+, y el grupo carboxilo se encuentra ionizado, COO-.

44
Q

Defina “Par ácido-base conjugado”

A

La molécula dadora de protón y su aceptor del protón forman lo que se conoce como par ácido-base conjugado.

45
Q

¿De qué se caracterizan los ácidos débiles?

A

Los ácidos débiles se caracterizan por NO estar completamente ionizados al disolverse en agua.

46
Q

Defina “constante de equilibrio”

A

La constante de equilibrio (Keq) en contexto de ácidos y bases, es la tendencia de cualquier ácido a perder su protón y formar su base conjugada. Esto también se suele denominar constante de ionización o constantes de ácidos de disociación (Ka)

47
Q

¿Para qué sirve la titulación?

A

La titulación se utiliza para determinar la concentración de un ácido en una disolución ácida.

48
Q

La curva de titulación permite determinar…

A

La concentración y pKa del ácido.

49
Q

Los ácidos fuertes se caracterizan por…

A

Cuanto más fuerte el ácido, mayor es la tendencia a perder su protón, por lo tanto tienen un valor de pKa menor.

50
Q

Los grupos amino protonado, carboxilo protonado y los grupos fosfato de los nucleótidos funcionan como

A

Funcionan como ácidos débiles.

51
Q
A
52
Q

¿Qué pasa con los grupos ionizables que se encuentran dentro de las proteínas, lejos del agua?

A

Presentan un pKa o pKa aparente diferente al pKa que tendrían en disolución.

53
Q

¿Qué son los tampones biológicos?

A

Los tampones biológicos son mezclas de ácidos débiles y sus bases conjugadas.

54
Q

¿Qué es un tampón o buffer?

A

Un tampón o buffer son sistemas acuosas que tienden a resistir cambios en su pH cuando se añaden pequeñas cantidades de ácido (H) o base (OH-). Y un sistema acuosa consiste de un ácido débil (dador de protones) y su base conjugada (aceptor de protones). En la región tamponente la concentración del ácido y su base conjugada en la misma.

55
Q

La forma de la curva de titulación de cualquier ácido débil está expresada por…

A

La ecuación de Henderson-Hasselbalch.

56
Q

Ecuación Henderson-Hasselbalch

A

pH = pKa + log [A-]/[HA]

57
Q

¿Por qué el pKa de un ácido débil es igual al pH de la solución en el punto medio de la titulación?

A

En el punto medio de la titulación la concentración de [HA] = [A-], por lo que el log es igual a 1, quedando con la igualdad del pH y pKa.

58
Q

Dentro de los tampones biológicos se encuentran …

A

Hay aminoácidos que sus cadenas laterales o grupos son ácidos débiles o ácidos.
Un ejemplo de esto es la HISTIDINA.

59
Q

Las proteínas que presentan His tienen la capacidad…

A

Tienen la capacidad de tamponar de manera eficiente a un pH cercano a 7,0, ya que al añadir ya sea H+ u OH-, tiene como resultado un pequeño cambio en el cociente de las concentraciones relativas del ácido débil y su anión, y por tanto esto genera un pequeño cambio en el pH.

60
Q

¿Qué los aminoácidos sean anfotéricos que significa?

A

Que los aminoácidos sean anfotéricos significa que presenten en un su estructura tanto grupos ácido, grupo AMINO, como grupos básicos, grupo CARBOXILO, por lo que tienen propiedades ácidas y básicas.

61
Q

Explique la titulación de un aminoácido, que no tiene
un grupo R ionizable, en presencia de una disolución ácida.

A

En una disolución ácida, el COO- se protona a COOH, y el aminoácido tiene carga total positiva. A medida que aumenta el pH, el COOH pierde su protón ∼ de pH = 2, a este punto se le conoce como pKa1 primera constante de disociación ácida. A medida que se eleva más el pH, el NH3+ pierde su protón ∼ a pH 9-10, a este punto se le conoce como pKa2. Por sobre este pH la molécula tiene carga total negativa.

62
Q

¿Qué carga total tiene un aminoácido en una disolución ácida?

A

POSITIVA
NH3+, COOH

63
Q

¿Qué carga total tiene un aminoácido en una disolución básica?

A

NEGATIVA
NH2, COO-

64
Q

¿Cómo se denomina a aquel pH en el cual el aminoácido se encuentra en su forma zwitterion?

A

pH isoeléctrico o punto isoeléctrico (pI)

65
Q

Los aminoácidos NEUTROS, son aquellos que no tienen grupos R ionizables, estos tienen un pI

A

El pI de los aminoácidos neutros es entre 5,0-6,3

66
Q

En los aminoácidos ÁCIDOS, el ácido aspártico y el ácido glutámico, es necesario considerar el grupo R ionizable para calcular el pI, pero en promedio su pI es

A

El pI de los aminoácidos ÁCIDOS se encuentra alrededor de pI = 3,0

67
Q

En los aminoácidos BÁSICOS, la lisina, la arginina y para la histidina, es necesario considerar el grupo R ionizable para calcular el pI estos varían pero…

A

Lisina pI = 9.7
Arginina pI = 10.8
Histidina pI = 7.6

68
Q

A diferencia de lisina e histidina que su último pKa está asociado a la disociación del protón del grupo amino, la arginina

A

En la arginina su último pKa es la disociación del protón del grupo R.

69
Q

Cada aminoácido tiene una curva de titulación…

A

Característica

70
Q

El cambio en los valores de los pKa se debe a

A

Los cambios en los pKa se debe a las interacciones intermoleculares. Efectos similares pueden ser causados por grupos químicos que están posicionados en las cercanías de un grupo ionizable, por ejemplo, en el centro activo de una enzimas.

71
Q

El pKa de cualquier grupo funcional está fuertemente afectado por su ENTORNO QUÍMICO, un fenómeno que a veces es utilizado en los centros activos de las enzimas para…

A

Promover mecanismos de reacción adaptados que dependen de los valores modificados de los pKa de grupos dadores/aceptoresde protones de residuos específicos.

72
Q

¿Qué aminoácido tiene capacidad tamponante a pH neutro?

A

HISTIDINA

73
Q
A
74
Q
A

Capítulo 3, Lehninger (3 decks)

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