3. Métabolisme microbien Flashcards
1
Q
Qu’est-ce que le métabolisme ?
A
- Somme des rxn chimiques se produisant chez un être vivant
- Rassemble catabolisme et anabolisme
2
Q
À quoi sert le métabolisme ?
A
Maintien de l’équilibre énergétique
3
Q
Qu’est-ce que le catabolisme ?
A
- Libération d’É
- Composés orga complexes -> produits + simples
- Permet accomplissement d’un travail + dégage chaleur
4
Q
Qu’est-ce que l’anabolisme ?
A
- Consommation d’É
- Composés simples –> composés complexes
- Biosynthèse
5
Q
Quel processus fournit l’É nécessaire à l’anabolisme ?
A
catabolisme grâce à l’ATP
6
Q
Le catabolisme dépend-il de l’anabolisme ?
A
Oui
7
Q
Les sources d’É sont des donneurs ou des receveurs d’électrons ?
A
donneurs
8
Q
Quelles sont les sources d’énergie dans le métabolisme ?
A
Lumière (photoautotrophe)
Chimie (Orga, inorga)
9
Q
Citez des sources d’énergie chimie inorganique
A
Eau, sol
10
Q
Comment se nomment les organismes dont la source d’énergie est chimique organique ?
A
Chimioorganotrophes (ions H+)
11
Q
Comment se nomment les organismes dont la source d’énergie est chimique inorganique ?
A
Chimiolithotrophes (H2S, nitrate..)
12
Q
Comment se nomment les organismes dont la source d’énergie est du carbone organique ?
A
Hétérotrophes (chaîne de C)
13
Q
Comment se nomment les organismes dont la source d’énergie est du carbone inorganique ?
A
Autotrophes (CO2)
14
Q
Quelles sont les combinaisons de sources d’É possibles pour un métabolisme microbien ?
A
- Photoautotrophe/photohétérotrophe
- Autotrophe chimiolithotrophe/chimioorganotrophe
- Hétérotrophe chimioorganotrophe/chimiolithotrophe
15
Q
À quoi sert un biocatalyseur ?
A
Augmenter l’É d’une rxn
16
Q
Les enzymes sont-elles des biocatalyseurs ?
A
Oui
17
Q
De quel type de composé sont les enzymes ?
A
organiques (protéines)
18
Q
V ou F ? Une cellule morte peut posséder des enzymes
A
Faux, elles ne sont fabriquées que par la cellule vivante
19
Q
Les enzymes sont-elles spécifiques ?
A
Oui, hautement. Chaque substrat possède son enzyme associée
20
Q
Quels sont les types d’enzymes ?
A
- Exoenzymes
- Endoenzymes
21
Q
Décrivez une exoenzyme
A
- Sécrétée
- Gram + (+ commun)
22
Q
Énumerez des exoenzymes
A
Lipase, amylase, maltase, protéase, gélatinase
23
Q
À quoi servent les exoenzymes ?
A
Permettent l’entrée des gros éléments dans la cellule
24
Q
Que font les endoenzymes lors de l’anabolisme ?
A
biosynthèse
25
Que font les endoenzymes lors du catabolisme ?
décomposent les nutriments = É
26
Énumerez des endoenzymes
Uréase, catalase
27
Énumérez les propriétés P&C des enzymes
- Dénaturées par la chaleur
- Précipitent avec éthanol
- ø diffusion à travers membranes sélectives
- Instables
28
De quoi est constitué l'holoenzyme ?
- Apoenzyme
-Cofacteur
29
Qu'est-ce que l'apoenzyme ?
Partie protéique de l'holoenzyme
30
Qu'est-ce que le cofacteur ?
Partie ø protéique de l'holoenzyme
31
Quels sont les types de cofacteurs ?
- Cofacteur (inorga) ion métallique (Cu2+, Mg2+, K+, Fe2+...)
- Cofacteur organique (coenzyme, liée à l'apoenzyme)
32
Quelles sont les conditions affectant l'activité enzymatique ?
- [enzyme]
- [substrat]
- pH
- Température
33
Quelles conditions affectant l'activité enzymatique possèdent un plafond ?
- [enzyme] et [substrat]
34
En quoi consiste la lutte anti-microbienne des enzymes ?
Diminution du taux de rxn enzymatique par certains inhibiteurs
35
Qu'est-ce qu'un inhibiteur compétitif ?
- mm site actif pour les 2 substrats
- mm forme+structure chimique que substrat
- ø rxn et formation de produit
36
Qu'est-ce que le sulfanilamide ?
Agit sur enzyme de synthèse de acide folique essentielle aux BACT
*substrat pas le mm chez l'humain donc contrôle de l'infection possible
37
Qu'est-ce qu'un inhibiteur ø compétitif ?
- Provoque inhibition allostérique
- Liaison du site allostérique (fluorure agit sur Ca+Mg liés aux enzymes = ø carie)
38
V ou F ? le milieu bactérien ne varie que très rarement
Faux
39
V ou F ? Dans une mm BACT, les enzymes varient selon des conditions
Vrai
40
Qu'est-ce qu'une enzyme constitutive ?
TJRS produite par la cellule (glycolyse)
41
Qu'est-ce qu'une enzyme inductive ?
Produite en présence d'un substrat (= inducteur) précis
42
À quoi sert la régulation enzymatique ?
Contrôle du métabolisme + adaptation au milieu
43
V ou F ? La BACT possède un système nerveux
Faux
44
Quels sont les 2 types de contrôle que peut utiliser la régulation enzymatique ?
Contrôle direct
Contrôle génétique
45
Décrivez le contrôle direct par la régulation enzymatique
- Action sur l'enzyme
- Modification [substrat] [R]
- [coenzymes]
- [cofacteurs]
-ligand lie l'enzyme (ø méca cat.)
- rétro-inhibition
-ligand = produit final
-inhib. de voie métabolique
en présence du ligand
46
Décrivez le contrôle génétique par la régulation enzymatique (général)
- Synthèse d'enzyme répression/induction
- Action sur gènes de l'opéron
47
Décrivez le contrôle génétique par la régulation enzymatique (spécifique) avec les opérons répressibles
opérons TJRS actifs
action d'un corépresseur
complexe actif fixe le g.opérateur = ø ARNm = ø enzyme
48
Décrivez le contrôle génétique par la régulation enzymatique (spécifique) avec les opérons inductibles
opérons TJRS inactifs
action d'un inducteur
inactive répresseur = ARNm = enzyme
49
Qu'est-ce qu'un promoteur ?
site de l'ADN sur lequel l'ARNpol se lie avant de commencer la transcription
50
Qu'est-ce qu'un opérateur ?
site de l'ADN permettant la régulatin des gènes (donc accès à ADN pour ARNpol)
51
Qu'est-ce qu'un opéron ?
Ensemble gènes + promoteur + opérateur
52
Que sont les gènes régulateurs ?
gènes en amont du promoteur codant pour les enzymes de régulation
53
Qu'est-ce qu'un répresseur ?
protéine qui lie l'opérateur = ø lecture par ARNpol
54
Sous quelle forme est le répresseur (opéron répressible) ?
inactive
55
Qu'est-ce que le co-répresseur ?
lie répresseur --> devient actif --> bloque synthèse enzymes codées
56
Sous quelle forme est le répresseur (opéron inductible) ?
active
57
Qu'est-ce que l'inducteur ?
inactive le répresseur en s'y attachant
58
Quel phénomène indique qu'un anuon peroxyde est toxique ?
Production de peroxyde d'hydrogène par les BACT lors de la respiration en aérobie
59
Qu'est-ce qui caractérise la catalase/peroxydase ?
BACT aérobies et anaérobies facultatives ont enzyme qui détruit le peroxyde d'hydrogène
60
Comment est visualisée la catalase ?
Sur la lame par la présence de bulles lors de l'ajout de H2O2
61
Quelle est la formule de la catalase + ?
BACT + H2O2 -->(catalase) H2O + O2 (bulles)
62
Quelle est la formule de la catalase - ?
BACT + H2O2 --> (øcatalase) H2O + O2 (bulles)
63
De quoi fait partie l'enzyme cytochrome oxydase ?
chaîne de transport d'é impliqués dans respiration
64
Qu'est-ce que l'oxydase ?
Oxydation du transporteur d'é (cytochrome c) en réduisant l'O2 en H2O
65
Que veut dire le changement de couleur (incolore --> violet) lors de l'oxydase ?
cytochrome c oxydé a réduit un R en forme oxydée
66
Qu'est-ce que la gélatinase ?
Enzyme extracellulaire --> liquéfaction de la gélatine en AA qui peuvent entrer dans BACT
67
Quelle type de gélatine est utilisée lors de la gélatinase ?
Gélatine nutritive avec extraits de boeuf, peptones & gélatine
** ø Agar
68
V ou F ? Il est nécessaire de refroidir les tubes de gélatinase après incubation
Vrai
69
Qu'est-ce qui indique une gélatinase + ?
le milieu reste liquide mm après réfrigération
70
Qu'est-ce qui indique une gélatinase - ?
le milieu reste gélifié mm après réfrigération
71
Définissez le catabolisme
production d'É en anaérobie
72
Quel types de BACT font de la glycolyse ?
hétérotrophes
73
La glycolyse nécessite-t-elle de l'O2 ?
Non
74
Quels sont les produits de la glycolyse ?
acide lactique OU
éthanol + 2 ATP
75
Qu'est-ce que la voie pentoses-phosphates ?
Voie parallèle à la glycolyse
76
Que fait la voie pentoses-phosphates ?
Dégrade les sucres à 5 C
77
Quels sont les produits de la voie pentoses-phosphates ?
Sucres phosphatés à 5C/6C
Fructose-6P avec ribulose-5P
78
Dans quel processus la voie pentoses-phosphates est-elle très importante ?
Biosynthèse
79
V ou F ? La voie pentoses-phosphates est aérobique dans toutes les cellules
Faux, anabolique
80
Qu'est-ce que la voie d'Entner-Doudoroff ?
Alternative à la glycolyse
81
Quel type de BACT est utilisé dans la voie d'Entner-Doudoroff ?
Gram -
82
Quel type de substances peuvent intégrer une chaîne de transport d'é (catabolisme) ?
inorganiques (NO2, H2, H2S, ions ferreux, sulfure..)
83
Quelles BACT se retrouvent oxydées dans une chaîne de transport d'é ?
BACT chimiolitotrophes
84
V ou F ? La fermentation nécessite une chaîne d'é
Faux
85
Quel type de molécule fait office d'accepteur final d'é dans la fermentation ?
organique
86
De quelle substance part la fermentation ?
acide pyruvique
87
De quoi dépend le produit final de la fermentation ?
MO
substrat
enzymes présentes et actives
88
Quels sont les 2 types de fermentation ?
lactique
alcoolique
89
Combien d'ATP utilise la fermentation ?
2 ATP
90
En quoi consiste la fermentation lactique ?
Réduction directe de l'acide pyruvique en acide lactique
91
Que peut-on observer quand il y a absence de dégagement de CO2 dans la fermentation lactique ?
absence de bulles
92
Que permet la fermentation lactique (vie courante) ?
formation yogourt + fromage à partir du lait
93
Qu'est-ce qu'une BACT homofermentaire ?
BACT qui produit que de l'acide lactique lors de la fermentation du glucose
94
Nommez 2 BACT homofermentaires
Streptococcus et Lactobacillus
95
En quoi consiste la fermentation alcoolique ?
Conversion de l'acide pyruvique en acétaldéhyde + CO2, puis en éthanol
96
Quels types de MO procèdent à de la fermentation alcoolique ?
BACT + levures
97
Quels sont les déchets engendrés par la fermentation alcoolique ?
Alcool + CO2
98
Qu'est-ce qu'un MO hétérofermentaire ?
MO produisant acide lactique + autre acide/alcool
99
Quelle voie utilise un MO hétérofermentaire ?
voie pentoses-phosphates
100
En quoi consiste la technique des bouillons sucrés ?
glucide à étudier --> eau peptonée (pH~alcalin) + indicateur pH
101
Exemples de glucides utilisés dans la technique de bouillons sucrés ?
Adonitol, arabinose, glucose, inositol, lactose, melibiose, rhamnose, sorbitol, saccharose
102
Que produira la fermentation d'un sucre lors de la technique de bouillons sucrés ?
Production d'acide = changement de couleur
103
Que signifie un tube de Durham rouge ?
ø inoculé
104
Que signifie un tube de Durham orange ?
inoculé + glucides - DONC ø fermenté
105
Que signifie un tube de Durham jaune ?
glucides + et gaz - DONC fermentation lactique
106
Que signifie un tube de Durham jaune + bulles?
glucides + et gaz + DONC fermentation alcoolique
107
Comment se produit le catabolisme par la chaîne de transporteur d'é ?
synthèse ATP par phosphorylation oxydative (++++ATP)
108
Que produit le catabolisme par le cycle de Krebs ?
- Forme ATP + coenzymes réduits par formation + utilisation de l'acétyl-CoA
- Forme précurseurs des AA, purines et pyrimidines
109
V ou F ? Le cycle de Krebs peut seulement faire du catabolisme
Faux, cycle de Krebs = amphibolique
110
V ou F ? BACT peuvent utiliser lipides/protéines comme source d'É
Vrai
111
Quels enzymes sont utilisées lors du catabolisme des lipides/protéines et que font-elles ?
Lipase, peptidase, protéase
permettent entrée de grosses molécules
112
Quel est le but du catabolisme des lipides/protéines ?
Obtenir acétyl-CoA
113
Quel type de BACT produisent de l'É par photosynthèse ?
BACT photolitotrophes
114
Quelle est la source d'É des BACT photolitotrophes ?
lumière
115
Quelle est la source de C des BACT photolitotrophes ?
CO2
116
Quel processus permet la transformation du CO2 en glucides ?
photosynthèse
117
V ou F ? La production d'É par photosynthèse ne nécessite que peu d'ATP et peu de réducteurs
Faux
+++ATP
++réducteurs (eau, H2S, H2S2, O3..)
118
À quelles fins est utilisée l'É produite par anabolisme ?
Biosynthèse
Prod de chaleur
Mobilité (10% É dépensée)
Transport nutriments
119
En quoi consiste la translocation de groupes ?
Transfo chimique de la mol. à transporter (glucose, fractose, mannose) pour l'emmagasiner
120
Quelles molécules peuvent bénéficier du transport actif ?
Sucres
AA
Peptides
Nucléosides
Ions
121
Que signifie un métabolisme amphibolique ?
Il va dans les 2 sens
122
Décrivez la relation entre la température et la vitesse d'une rxn enzymatique
jusqu'à un certain point : T+ = vrxn +
(substrats heurtent sites actifs + souvent) MAIS
au-délà du plafond, vrxn - brusquement (enzyme bouge tlm que toutes les liaisons brisent = dénaturation de l'enzyme
123
Que provoquerait trop de chaleur sur une chaîne polypeptidique ?
La chaleur peut altérer la chaîne (trop = site actif ø fonctionne)
124
Décrivez la relation entre vmax et Toptimale
vmax = Toptimale = conversion R (substrat)-->P est + rapide et nb max de collisions sans dénaturer
125
En quoi la [substrat] influence la vitesse de la rxn enzymatique ?
augmentation substrat = + substrat occupe sites actifs des molécules enzymatiques
126
V ou F ? On ne peut augmenter la vitesse d'une rxn enzymatique en ajoutant du substrat à une [enzyme] fixe
Vrai --> enzyme saturée :
[substrat] suffisante pour occuper tous les sites actifs
127
Une cellule peut-elle trouver un moyen de continuer à augmenter la vitesse de sa rxn enzymatique ?
Oui, en augmentant le nb d'enzymes
128
Que signifie le pH optimal d'une enzyme ?
Le pH où son activité est maximale
129
Qu'est-ce que le pH ([protons]) influence ?
interactions entre AA avec charges opposées
