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MB - Bloc 1 > 3. Métabolisme microbien > Flashcards

3. Métabolisme microbien Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que le métabolisme ?

A
  • Somme des rxn chimiques se produisant chez un être vivant
  • Rassemble catabolisme et anabolisme
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Q

À quoi sert le métabolisme ?

A

Maintien de l’équilibre énergétique

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3
Q

Qu’est-ce que le catabolisme ?

A
  • Libération d’É
  • Composés orga complexes -> produits + simples
  • Permet accomplissement d’un travail + dégage chaleur
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4
Q

Qu’est-ce que l’anabolisme ?

A
  • Consommation d’É
  • Composés simples –> composés complexes
  • Biosynthèse
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5
Q

Quel processus fournit l’É nécessaire à l’anabolisme ?

A

catabolisme grâce à l’ATP

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6
Q

Le catabolisme dépend-il de l’anabolisme ?

A

Oui

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7
Q

Les sources d’É sont des donneurs ou des receveurs d’électrons ?

A

donneurs

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8
Q

Quelles sont les sources d’énergie dans le métabolisme ?

A

Lumière (photoautotrophe)
Chimie (Orga, inorga)

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9
Q

Citez des sources d’énergie chimie inorganique

A

Eau, sol

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10
Q

Comment se nomment les organismes dont la source d’énergie est chimique organique ?

A

Chimioorganotrophes (ions H+)

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11
Q

Comment se nomment les organismes dont la source d’énergie est chimique inorganique ?

A

Chimiolithotrophes (H2S, nitrate..)

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12
Q

Comment se nomment les organismes dont la source d’énergie est du carbone organique ?

A

Hétérotrophes (chaîne de C)

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13
Q

Comment se nomment les organismes dont la source d’énergie est du carbone inorganique ?

A

Autotrophes (CO2)

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14
Q

Quelles sont les combinaisons de sources d’É possibles pour un métabolisme microbien ?

A
  • Photoautotrophe/photohétérotrophe
  • Autotrophe chimiolithotrophe/chimioorganotrophe
  • Hétérotrophe chimioorganotrophe/chimiolithotrophe
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15
Q

À quoi sert un biocatalyseur ?

A

Augmenter l’É d’une rxn

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16
Q

Les enzymes sont-elles des biocatalyseurs ?

A

Oui

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17
Q

De quel type de composé sont les enzymes ?

A

organiques (protéines)

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18
Q

V ou F ? Une cellule morte peut posséder des enzymes

A

Faux, elles ne sont fabriquées que par la cellule vivante

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19
Q

Les enzymes sont-elles spécifiques ?

A

Oui, hautement. Chaque substrat possède son enzyme associée

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20
Q

Quels sont les types d’enzymes ?

A
  • Exoenzymes
  • Endoenzymes
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21
Q

Décrivez une exoenzyme

A
  • Sécrétée
  • Gram + (+ commun)
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22
Q

Énumerez des exoenzymes

A

Lipase, amylase, maltase, protéase, gélatinase

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23
Q

À quoi servent les exoenzymes ?

A

Permettent l’entrée des gros éléments dans la cellule

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24
Q

Que font les endoenzymes lors de l’anabolisme ?

A

biosynthèse

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25
Q

Que font les endoenzymes lors du catabolisme ?

A

décomposent les nutriments = É

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26
Q

Énumerez des endoenzymes

A

Uréase, catalase

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27
Q

Énumérez les propriétés P&C des enzymes

A
  • Dénaturées par la chaleur
  • Précipitent avec éthanol
  • ø diffusion à travers membranes sélectives
  • Instables
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28
Q

De quoi est constitué l’holoenzyme ?

A
  • Apoenzyme
    -Cofacteur
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29
Q

Qu’est-ce que l’apoenzyme ?

A

Partie protéique de l’holoenzyme

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30
Q

Qu’est-ce que le cofacteur ?

A

Partie ø protéique de l’holoenzyme

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31
Q

Quels sont les types de cofacteurs ?

A
  • Cofacteur (inorga) ion métallique (Cu2+, Mg2+, K+, Fe2+…)
  • Cofacteur organique (coenzyme, liée à l’apoenzyme)
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32
Q

Quelles sont les conditions affectant l’activité enzymatique ?

A
  • [enzyme]
  • [substrat]
  • pH
  • Température
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33
Q

Quelles conditions affectant l’activité enzymatique possèdent un plafond ?

A
  • [enzyme] et [substrat]
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34
Q

En quoi consiste la lutte anti-microbienne des enzymes ?

A

Diminution du taux de rxn enzymatique par certains inhibiteurs

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35
Q

Qu’est-ce qu’un inhibiteur compétitif ?

A
  • mm site actif pour les 2 substrats
  • mm forme+structure chimique que substrat
  • ø rxn et formation de produit
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36
Q

Qu’est-ce que le sulfanilamide ?

A

Agit sur enzyme de synthèse de acide folique essentielle aux BACT
*substrat pas le mm chez l’humain donc contrôle de l’infection possible

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37
Q

Qu’est-ce qu’un inhibiteur ø compétitif ?

A
  • Provoque inhibition allostérique
  • Liaison du site allostérique (fluorure agit sur Ca+Mg liés aux enzymes = ø carie)
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38
Q

V ou F ? le milieu bactérien ne varie que très rarement

A

Faux

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39
Q

V ou F ? Dans une mm BACT, les enzymes varient selon des conditions

A

Vrai

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40
Q

Qu’est-ce qu’une enzyme constitutive ?

A

TJRS produite par la cellule (glycolyse)

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41
Q

Qu’est-ce qu’une enzyme inductive ?

A

Produite en présence d’un substrat (= inducteur) précis

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42
Q

À quoi sert la régulation enzymatique ?

A

Contrôle du métabolisme + adaptation au milieu

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43
Q

V ou F ? La BACT possède un système nerveux

A

Faux

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44
Q

Quels sont les 2 types de contrôle que peut utiliser la régulation enzymatique ?

A

Contrôle direct
Contrôle génétique

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45
Q

Décrivez le contrôle direct par la régulation enzymatique

A
  • Action sur l’enzyme
  • Modification [substrat] [R]
    - [coenzymes]
    - [cofacteurs]
    -ligand lie l’enzyme (ø méca cat.)
    - rétro-inhibition
    -ligand = produit final
    -inhib. de voie métabolique
    en présence du ligand
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46
Q

Décrivez le contrôle génétique par la régulation enzymatique (général)

A
  • Synthèse d’enzyme répression/induction
  • Action sur gènes de l’opéron
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47
Q

Décrivez le contrôle génétique par la régulation enzymatique (spécifique) avec les opérons répressibles

A

opérons TJRS actifs
action d’un corépresseur
complexe actif fixe le g.opérateur = ø ARNm = ø enzyme

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48
Q

Décrivez le contrôle génétique par la régulation enzymatique (spécifique) avec les opérons inductibles

A

opérons TJRS inactifs
action d’un inducteur
inactive répresseur = ARNm = enzyme

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49
Q

Qu’est-ce qu’un promoteur ?

A

site de l’ADN sur lequel l’ARNpol se lie avant de commencer la transcription

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50
Q

Qu’est-ce qu’un opérateur ?

A

site de l’ADN permettant la régulatin des gènes (donc accès à ADN pour ARNpol)

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51
Q

Qu’est-ce qu’un opéron ?

A

Ensemble gènes + promoteur + opérateur

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52
Q

Que sont les gènes régulateurs ?

A

gènes en amont du promoteur codant pour les enzymes de régulation

53
Q

Qu’est-ce qu’un répresseur ?

A

protéine qui lie l’opérateur = ø lecture par ARNpol

54
Q

Sous quelle forme est le répresseur (opéron répressible) ?

A

inactive

55
Q

Qu’est-ce que le co-répresseur ?

A

lie répresseur –> devient actif –> bloque synthèse enzymes codées

56
Q

Sous quelle forme est le répresseur (opéron inductible) ?

A

active

57
Q

Qu’est-ce que l’inducteur ?

A

inactive le répresseur en s’y attachant

58
Q

Quel phénomène indique qu’un anuon peroxyde est toxique ?

A

Production de peroxyde d’hydrogène par les BACT lors de la respiration en aérobie

59
Q

Qu’est-ce qui caractérise la catalase/peroxydase ?

A

BACT aérobies et anaérobies facultatives ont enzyme qui détruit le peroxyde d’hydrogène

60
Q

Comment est visualisée la catalase ?

A

Sur la lame par la présence de bulles lors de l’ajout de H2O2

61
Q

Quelle est la formule de la catalase + ?

A

BACT + H2O2 –>(catalase) H2O + O2 (bulles)

62
Q

Quelle est la formule de la catalase - ?

A

BACT + H2O2 –> (øcatalase) H2O + O2 (bulles)

63
Q

De quoi fait partie l’enzyme cytochrome oxydase ?

A

chaîne de transport d’é impliqués dans respiration

64
Q

Qu’est-ce que l’oxydase ?

A

Oxydation du transporteur d’é (cytochrome c) en réduisant l’O2 en H2O

65
Q

Que veut dire le changement de couleur (incolore –> violet) lors de l’oxydase ?

A

cytochrome c oxydé a réduit un R en forme oxydée

66
Q

Qu’est-ce que la gélatinase ?

A

Enzyme extracellulaire –> liquéfaction de la gélatine en AA qui peuvent entrer dans BACT

67
Q

Quelle type de gélatine est utilisée lors de la gélatinase ?

A

Gélatine nutritive avec extraits de boeuf, peptones & gélatine
** ø Agar

68
Q

V ou F ? Il est nécessaire de refroidir les tubes de gélatinase après incubation

A

Vrai

69
Q

Qu’est-ce qui indique une gélatinase + ?

A

le milieu reste liquide mm après réfrigération

70
Q

Qu’est-ce qui indique une gélatinase - ?

A

le milieu reste gélifié mm après réfrigération

71
Q

Définissez le catabolisme

A

production d’É en anaérobie

72
Q

Quel types de BACT font de la glycolyse ?

A

hétérotrophes

73
Q

La glycolyse nécessite-t-elle de l’O2 ?

A

Non

74
Q

Quels sont les produits de la glycolyse ?

A

acide lactique OU
éthanol + 2 ATP

75
Q

Qu’est-ce que la voie pentoses-phosphates ?

A

Voie parallèle à la glycolyse

76
Q

Que fait la voie pentoses-phosphates ?

A

Dégrade les sucres à 5 C

77
Q

Quels sont les produits de la voie pentoses-phosphates ?

A

Sucres phosphatés à 5C/6C
Fructose-6P avec ribulose-5P

78
Q

Dans quel processus la voie pentoses-phosphates est-elle très importante ?

A

Biosynthèse

79
Q

V ou F ? La voie pentoses-phosphates est aérobique dans toutes les cellules

A

Faux, anabolique

80
Q

Qu’est-ce que la voie d’Entner-Doudoroff ?

A

Alternative à la glycolyse

81
Q

Quel type de BACT est utilisé dans la voie d’Entner-Doudoroff ?

A

Gram -

82
Q

Quel type de substances peuvent intégrer une chaîne de transport d’é (catabolisme) ?

A

inorganiques (NO2, H2, H2S, ions ferreux, sulfure..)

83
Q

Quelles BACT se retrouvent oxydées dans une chaîne de transport d’é ?

A

BACT chimiolitotrophes

84
Q

V ou F ? La fermentation nécessite une chaîne d’é

A

Faux

85
Q

Quel type de molécule fait office d’accepteur final d’é dans la fermentation ?

A

organique

86
Q

De quelle substance part la fermentation ?

A

acide pyruvique

87
Q

De quoi dépend le produit final de la fermentation ?

A

MO
substrat
enzymes présentes et actives

88
Q

Quels sont les 2 types de fermentation ?

A

lactique
alcoolique

89
Q

Combien d’ATP utilise la fermentation ?

A

2 ATP

90
Q

En quoi consiste la fermentation lactique ?

A

Réduction directe de l’acide pyruvique en acide lactique

91
Q

Que peut-on observer quand il y a absence de dégagement de CO2 dans la fermentation lactique ?

A

absence de bulles

92
Q

Que permet la fermentation lactique (vie courante) ?

A

formation yogourt + fromage à partir du lait

93
Q

Qu’est-ce qu’une BACT homofermentaire ?

A

BACT qui produit que de l’acide lactique lors de la fermentation du glucose

94
Q

Nommez 2 BACT homofermentaires

A

Streptococcus et Lactobacillus

95
Q

En quoi consiste la fermentation alcoolique ?

A

Conversion de l’acide pyruvique en acétaldéhyde + CO2, puis en éthanol

96
Q

Quels types de MO procèdent à de la fermentation alcoolique ?

A

BACT + levures

97
Q

Quels sont les déchets engendrés par la fermentation alcoolique ?

A

Alcool + CO2

98
Q

Qu’est-ce qu’un MO hétérofermentaire ?

A

MO produisant acide lactique + autre acide/alcool

99
Q

Quelle voie utilise un MO hétérofermentaire ?

A

voie pentoses-phosphates

100
Q

En quoi consiste la technique des bouillons sucrés ?

A

glucide à étudier –> eau peptonée (pH~alcalin) + indicateur pH

101
Q

Exemples de glucides utilisés dans la technique de bouillons sucrés ?

A

Adonitol, arabinose, glucose, inositol, lactose, melibiose, rhamnose, sorbitol, saccharose

102
Q

Que produira la fermentation d’un sucre lors de la technique de bouillons sucrés ?

A

Production d’acide = changement de couleur

103
Q

Que signifie un tube de Durham rouge ?

A

ø inoculé

104
Q

Que signifie un tube de Durham orange ?

A

inoculé + glucides - DONC ø fermenté

105
Q

Que signifie un tube de Durham jaune ?

A

glucides + et gaz - DONC fermentation lactique

106
Q

Que signifie un tube de Durham jaune + bulles?

A

glucides + et gaz + DONC fermentation alcoolique

107
Q

Comment se produit le catabolisme par la chaîne de transporteur d’é ?

A

synthèse ATP par phosphorylation oxydative (++++ATP)

108
Q

Que produit le catabolisme par le cycle de Krebs ?

A
  • Forme ATP + coenzymes réduits par formation + utilisation de l’acétyl-CoA
  • Forme précurseurs des AA, purines et pyrimidines
109
Q

V ou F ? Le cycle de Krebs peut seulement faire du catabolisme

A

Faux, cycle de Krebs = amphibolique

110
Q

V ou F ? BACT peuvent utiliser lipides/protéines comme source d’É

A

Vrai

111
Q

Quels enzymes sont utilisées lors du catabolisme des lipides/protéines et que font-elles ?

A

Lipase, peptidase, protéase
permettent entrée de grosses molécules

112
Q

Quel est le but du catabolisme des lipides/protéines ?

A

Obtenir acétyl-CoA

113
Q

Quel type de BACT produisent de l’É par photosynthèse ?

A

BACT photolitotrophes

114
Q

Quelle est la source d’É des BACT photolitotrophes ?

A

lumière

115
Q

Quelle est la source de C des BACT photolitotrophes ?

A

CO2

116
Q

Quel processus permet la transformation du CO2 en glucides ?

A

photosynthèse

117
Q

V ou F ? La production d’É par photosynthèse ne nécessite que peu d’ATP et peu de réducteurs

A

Faux
+++ATP
++réducteurs (eau, H2S, H2S2, O3..)

118
Q

À quelles fins est utilisée l’É produite par anabolisme ?

A

Biosynthèse
Prod de chaleur
Mobilité (10% É dépensée)
Transport nutriments

119
Q

En quoi consiste la translocation de groupes ?

A

Transfo chimique de la mol. à transporter (glucose, fractose, mannose) pour l’emmagasiner

120
Q

Quelles molécules peuvent bénéficier du transport actif ?

A

Sucres
AA
Peptides
Nucléosides
Ions

121
Q

Que signifie un métabolisme amphibolique ?

A

Il va dans les 2 sens

122
Q

Décrivez la relation entre la température et la vitesse d’une rxn enzymatique

A

jusqu’à un certain point : T+ = vrxn +
(substrats heurtent sites actifs + souvent) MAIS
au-délà du plafond, vrxn - brusquement (enzyme bouge tlm que toutes les liaisons brisent = dénaturation de l’enzyme

123
Q

Que provoquerait trop de chaleur sur une chaîne polypeptidique ?

A

La chaleur peut altérer la chaîne (trop = site actif ø fonctionne)

124
Q

Décrivez la relation entre vmax et Toptimale

A

vmax = Toptimale = conversion R (substrat)–>P est + rapide et nb max de collisions sans dénaturer

125
Q

En quoi la [substrat] influence la vitesse de la rxn enzymatique ?

A

augmentation substrat = + substrat occupe sites actifs des molécules enzymatiques

126
Q

V ou F ? On ne peut augmenter la vitesse d’une rxn enzymatique en ajoutant du substrat à une [enzyme] fixe

A

Vrai –> enzyme saturée :
[substrat] suffisante pour occuper tous les sites actifs

127
Q

Une cellule peut-elle trouver un moyen de continuer à augmenter la vitesse de sa rxn enzymatique ?

A

Oui, en augmentant le nb d’enzymes

128
Q

Que signifie le pH optimal d’une enzyme ?

A

Le pH où son activité est maximale

129
Q

Qu’est-ce que le pH ([protons]) influence ?

A

interactions entre AA avec charges opposées

MB - Bloc 1 (6 decks)

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