3 Flashcards

1
Q

Surse variabilitate

A

Sursele variabilităţii genetice sunt mutaţiile, recombinările genetice şi migraţiile

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Recombinarea genomică

A

Se realizează în procesul fecundaţiei, prin fuzionarea materialului genetic al celor doi gameţi haploizi de origine diferită, maternă şi paternă

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Recombinarea cromosomială

A

Se realizează prin crossing-over (recombinare intracromosomială) şi disjuncţia cromosomilor în timpul diviziunii meiotice (recombinare intercromosomială).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Crossing-over

A
  • egal, când are loc un schimb reciproc de fragmente cromatidice echivalente genetic şi similare dimensional;
  • inegal, prin decalarea sau nesuprapunerea secvenţelor echivalente, în acest caz între segmentele cromatidice omoloage nu există corespondenţă, ceea ce generează o recombinare nereciprocă - unul dintre cromosomi va avea o duplicaţie a unei gene, iar celălalt o deleţie a aceleiaşi gene
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Recombinarea intragenică

A

Crossing-over-ul inegal se poate realiza în zonele cu gene duplicate, cu segmente nucleotidice similare.Crossing-overul inegal poate determina pierderea funcţiei unui tip de gene sau formarea de gene hibride. Prin crossing-over-ul inegal între o genă funcţională şi o pseudogenă, fragmente din pseudogenă ajung la nivelui genei active, care va avea structură anormală şi funcţie biologică aberantă sau absentă - de exemplu, formarea unei gene hibride între gena 21CYPB (gena activă) şi 21CYPA (pseudogenă).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Polimorfismul cromosomial

A

Polimorfismele cromosomiale vizibile pe cariotip se mai numesc heteromorfisme cromosomiale şi se observă la nivelul heterocromatinei, eucromatinei, situsurilor fragile, cromosomilor marker (care au conţinut exclusiv heterocromatic) sau inversiilor (pericentrice la nivelul cromosomilor 2 şi 10 sau ale braţelor lungi ale cromosomilor 1 şi 9).

Heteromorfsmele heterocromatinei constitutive sunt localizate la nivelul heterocromatinei pericentromerice, braţelor scurte ale cromosomilor acrocentrici, constricţiilor secundare ale cromosomilor 1, 9 şi 16 sau la nivelul braţului lung al cromosomului Y. Heteromorfismele eucromatinei sunt determinate de prezenţa de benzi suplimentare sau de deleţia altora la nivelul diferitelor regiuni şi sunt frecvente la nivelul cromosomilor 2, 5, 8, 9, 11, 15, 16. Unele dintre aceste polimorfisme ale eucromatinei au fost evidenţiate la indivizi cu fenotip normal

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Polimorfismul de inserţie

A

Secvenţele de ADN repetitiv dispersate posedă o structură de transposoni [elemente de ADN instabile, capabile de a migra, de a-şi schimba locul (prin retrotranspoziţie) în diferite regiuni ale genomului]. Transcripţii lor ARN sunt convertiţi în celulă în ADN complementar reinserabil în ADN-ul genomic. Grupele principale de asemenea secvenţe transpozabile prezente la mamifere şi la om sunt LINEs (Long INterspersed Elements) şi SINEs (Short INterspersed Elements) sau secvenţele Alu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Polimorfismul de talie

A

VNTR (variable number of tandem repeats) este reprezentat de variaţia numărului repetiţiilor unei anumite secvenţe (de exemplu, CACACACACACA). Minisateliţii şi microsatelitii reprezintă exemple ale polimorfismului de talie. Minisateliţii reprezintă repetiţii ale unor secvenţe mici (15-500 pb), dispersate în toţi cromosomii, cu excepţia heterosomilor, în situsuri precise. Microsateliţii semnifică repetiţiile unor secvenţe foarte scurte (1-15 nucleotide), deseori formate din două sau trei nucleotide. Analiza minisateliţilor şi microsateliţilor, permite constituirea amprentei genetice a unui anumit individ, lucru permis de polimorfismul foarte înalt al acestor VNTR-uri, peste 10 alele per locus

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Polimorfismul uninucleotidic sau punctiform

A

Modificarea cea mai simplă, single nucleotide polymorphism, SNP, este dată de înlocuirea unei baze azotate cu alta, la fiecare 200-1.000 nucleotide. Sunt cele mai frecvente polimorfisme ale ADN (≈ 1% din genom). Multe SNP-uri sunt situate în regiuni non-codante şi nu au efect fenotipic, iar dacă sunt localizate la nivelul regiunilor reglatoare ale genelor sau la nivelul regiunilor codante pot avea efecte fenotipice.

Studiul polimorfismelor în cadrul geneticii populaţionale s-a concretizat prin proiectul HapMap care a avut ca obiectiv identificarea majorităţii SNP-urilor genomului uman (~10 milioane), responsabile de variabilitatea genetică. Aceste variante genetice tind să fie apropiate unele de altele şi să fie moştenite împreună, formând diverse haplotipuri. Studiul SNP-urilor permite identificarea genelor de susceptibilitate pentru bolile multifactoriale, prin studiul fenomenelor de înlănţuire sau de asociere a haplotipurilor. Prin studiul polimorfismelor genetice s-au determinat semnăturile genetice ale diferitelor populaţii (de exemplu, din India sau Europa), permiţând astfel descifrarea evoluţiei speciei umane sau a migraţiilor populaţionale.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Mutaţii spontane

A

Apar in mod natural.sunt tranziţiile ceto-enol şi imino-amino din bazele azotate. Acestea determină modificarea semnificaţiei bazelor fie prin tranziţie purină-purină; pirimidină-pirimidină , fie prin transversie purină-pirimidină ;pirimidină-purină

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Mutaţiile induse

A

a. Factorii mutageni fizici sunt radiaţii ionizante (ce includ radiaţiile electromagnetice cu lungime de undă foarte scurtă - X şi g) şi particulele cu energie mare (particule a, b şi neutronii).

Dozele limită individuale sunt exprimate în mrem/an/gonadă, fiindcă sunt mai importante efectele radiaţiilor asupra celulelor germinale decât asupra celulelor somatice. Doza gonadică a radiaţiilor se exprimă prin cantitatea primită în 30 de ani (această perioadă corespunde unei generaţii). Pentru indivizi sau populaţii, sursele de iradiere sunt:

  • naturale - iradierea cosmică, radiaţiile g ale pământului şi radiaţiile UV solare;
  • antropice (artificiale) - iradierea medicală, profesională, scăpările radioactive (accidentele nucleare) şi altele.

-b. Factori mutageni chimici

Factorii chimici mutageni sunt: alchilanţii, antibioticele, analogii şi heterologii bazelor azotate purinice şi pirimidinice, hidroxili, derivaţi ai acridinei, citostaticele etc. Mutaţiile induse de factorii chimici pot avea loc prin următoarele mecanisme:

  • deleţii de baze azotate, chiar de codoni, mai rar de gene;
  • adiţii de baze azotate;
  • inversii de baze azotate, ceea ce conduce la restructurări genice;
  • tranziţii - substituţia unei purine cu o altă purină sau a unei pirimidine cu o altă pirimidină;
  • transversii - o bază purinică este înlocuită cu una pirimidinică;
  • împerecheri neobişnuite C-T, G-A;
  • blocaje totale sau parţiale de ADN, împiedicând trecerea ADN-ului dublu catenar în ADN monocatenar şi sinteza de ADN şi ARNm;
  • dezaminarea bazelor azotate;
  • rupturi cromosomiale - afectează regiuni mai mult sau mai puţin extinse din macromoleculele de ADN, gene şi subunităţile ale genei.

Efectul mutagenilor chimici depinde de: structura substanţelor chimice, doza administrată şi de particularităţile genetico-metabolice ale individului

-c. Factori mutageni biologici sunt consideraţi virusurile și transposonii - au mobilitate crescută în conditii de stres provocat de mediu, vârsta maternă şi paternă avansată, boli materne. Transposonii sunt reprezentaţi de fragmente de ADN repetitiv ce au capacitatea de a-şi schimba locul în genom. Din această categorie fac parte secvenţele Line1 şi Alu. Ele se pot insera atât în regiunile informaţionale (exoni), non-informaţionale (introni), cât la nivelul regiunilor reglatoare (promotorul) ale genei şi să determine modificări ale structurii şi funcţiei biologice a acesteia. Se pare că virusurile produc leziuni ale materialului genetic datorită unei afinităţi speciale a acestora pentru celulele aflate în diviziune. Virusurile acţionează asupra materialului genetic promovând anomalii prin formarea de lacune cromosomiale şi situsuri fragile ce facilitează fragmentarea şi remanierile cromosomiale. Virusurile îşi pot insera promotorul în proximitatea promotorului unor gene şi să declanşeze activitatea genică. De exemplu, unele adenovirusuri, Epstein-Barr şi Papilomavirusuri umane, prin inserţia promotorului adiacent unei protooncogene determină transformarea acesteia în oncogenă. Majoritatea virusurilor au efect teratogen. Aşa este cazul virusului rubeolei (Rubella virus), virusului infecţiilor citomegalice (Cytomegalovirus), virusului herpetic (Herpes simplex), virusului varicelei (Herpes zoster) etc. Efect teratogen au şi unii paraziţi precum: Toxoplasma gondi, Treponema palidum

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Heterosis

A

Creşterea vitalităţii şi a fertilităţii la heterozigoti

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Anomaliile cromosomiale echilibrate

A

Translocaţiile reciproce, inversiile, inserţiile.

Nu sunt însoţite de pierdere sau câştig de material genetic şi nu determină modificări fenotipice purtătorilor (dar aceştia pot avea dereglări ale reproducerii)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Anomaliile cromosomiale neechilibrate

A

Deleţiile, duplicaţiile, isocromosomi, cromosomi inelari.

Pierdere sau câştig de material genetic şi anomalii de dozaj genic ce determină naşterea unor descendenţi cu fenotipuri morbide

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Bolile mitocondriale

A

Afectează în principal acele structuri care sunt mari consumatoare de energie cum ar fi muşchii, nervii sau glandele endocrine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Deleţiile extinse care implică câteva Mb

A

Cri du chat, Prader-Willi, Angelman sau Wiliams.

17
Q

Inserţiile

A

Pot fi reprezentate şi de transpoziţiile unor secvenţe formate din ADN înalt repetitiv (familiile L1 şi Alu). Transpoziţia constă în schimbarea poziţiei unei secvenţe ADN de la un locus la altul. Astfel de inserţii au fost identificate la pacienţii cu hemofilie A sau B şi neurofibromatoză tip I.

18
Q

Conversie genică

A

Mutaţii produse prin crossing-over inegal ,conversia genei 21-hidroxilazei active (21CYPB) în pseudogena 21CYPA

19
Q

Mutaţii letale

A

Mutaţiile care se produc la nivelul genelor esenţiale. Ele produc moartea organismelor. În boala Tay-Sachs deficienţa hexosaminidazei A cauzează moartea copiilor la vârsta de 3-4 ani.

20
Q

Mutaţii dinamice (instabile)

A
    • Cauzate de repetarea de zeci, până la sute sau mii de ori, a unor triplete (mai rar quadruplete) de nucleotide din structura unei gene. Acest fenomen se numeşte amplificarea sau expansiunea tripletelor.

Exemple de mutaţii dinamice: expansiunea tripletului CAG de la nivelul genei HTT duce la formarea la nivelul produsului genic a insulelor poliglutamice în coreea Huntington; expansiunea tripletului CGG de la nivelul regiunii netranscriptibile a genei FRM1 în sindromul X fragil; expansiunea tripletului CTG din regiunea 3’ a genei DMPK în distrofia miotonică Steinert.

21
Q

Mutațiile cu câștig de funcție

A

Sunt mai rar întâlnite. Ele sunt obligatoriu mutații cu sens greșit sau mutații în secvențele reglatoare și nu sunt mutații non-sens sau mutații ce antrenează schimbarea cadrului de citire. În acest caz trebuie făcută distincția între o alelă hipermorfă și una neomorfă.

22
Q

Alelă hipermorfă

A

Poate conduce la creșterea nivelului de expresie a unei gene normale sau poate amplifica funcția normală a unei proteine. Un exemplu îl reprezintă creșterea cantității de proteină datorită unei duplicații genice în boala Charcot Marie Tooth tipul 1A (CMT), unde nivelul crescut al proteinei PMP22 produce o mielinogeneză anormală. Cantitatea de proteină sintetizată este proporțională cu numărul de copii al genei, 3 copii ale genei cresc procentul de proteină PMP22 la 150% (Figura 3.1).

Figura 3.1. Cantitatea de proteină PMP22 în funcție de numărul de copii al genei

Sinteza unei proteine hiperactive a fost observată în diferitele mutații ale genei care codifică receptorul FGFR3 (receptorul tip 3 pentru factorul de creștere fibroblastică), responsabile de apariția condrodisplaziilor (hipocondroplazie, acondroplazie și nanism tanatofor). În cazul acondroplaziei, boală caracterizată prin hipostatură disproporționată, substituția unui singur aminoacid în structura FGFR3 determină o activare permanentă a acestui receptor, chiar în absența ligandului.

23
Q

Alelă neomorfă

A

Este o alelă ce codifică o proteină a cărei funcție este diferită de cea a unei proteine normale. Acest fenomen este destul de frecvent întâlnit în cadrul mutațiilor somatice asociate cancerelor, dar mult mai rar în cazul bolilor ereditare. Un exemplu clasic este cazul mutației cu sens greșit p.Met358Arg (alela Pittsburg) din gena care codifică α1-antitripsina (α1-AT). În mod normal α1-AT inhibă elastaza leucocitară, în schimb alela Pittsburg își pierde proprietățile antielastazice și acționează asupra trombinei. În consecință, pacienții purtători ai acestei mutații prezintă un sindrom hemoragipar. Un caz particular de câștig de funcție prin apariția unor proprietăți toxice caracterizează boala Huntington, afecțiune neurodegenerativă cu progresie rapidă. Amplificarea secvenței CAG conduce la expansiunea secvenţei poliglutaminice din structura huntingtinei, ceea ce este echivalentul unei mutații cu câștig de funcție. Huntingtina mutantă pare să fie cauza acumulării unor agregate în citoplasma și nucleii neuronilor de la nivelul neostriatului, cu modificări consecutive ale receptorilor exprimați la acest nivel, care în final, conduc la moartea neuronilor, în special a celor GABA-ergici.

Mutațiile care conduc la formarea genelor himere reprezintă o categorie aparte a mutațiilor cu câștig de funcție. Unele rearanjamente cromosomiale pot crea o genă-hibrid prin fuzionarea exonilor a două gene care în mod normal sunt localizate în loci diferiți la nivelul genomului. Aceste gene himere pot dobândi proprietăți noi. Astfel gena MLL situată pe cromosomul 11q23 poate forma gene himere cu mai mult de 30 de parteneri în celulele leucemice. De asemenea, gena ABL situată pe cromosomul 9q34.1 formează o genă himeră cu partenera sa gena BCR situată pe cromosomul 22q11.2 în cazul leucemiei granulocitare (mieloide) cronice. Gena himeră BCR-ABL este rezultatul unei translocații reciproce între cromosomii 9 și 22, consecința fiind apariția unei tirozin-kianze cu activitate continuă, ce determină proliferarea necontrolată a celulelor stem hematopoietice (Figura 3.2). Studiul acestor rearanjamente cromosomiale a permis identificarea genelor himere și a fost la originea descoperirii de noi oncogene. Analiza moleculară și identificarea oncogenelor himere sunt utile pentru aprecierea prognosticului și a tratamentului în special în cazul leucemiilor.

24
Q

Consecinţele mutațiilor cu efect dominant negativ

A

Această situație se află la frontiera dintre mutațiile ce antrenează o pierdere a funcției și cele ce antrenează un câștig de funcție. O mutație cu efect dominant negativ conduce la formarea unei proteine nefuncționale, dar care anihilează/abolește în egală măsură funcția proteinei produsă de alela normală. Asemenea mutații caracterizează genele care codifică proteine de structură sau capabile de a forma homo sau heterodimeri. Ele antrenează modificări conformaționale care distrug funcția proteinei normale. Un exemplu în acest sens sunt mutațiile responsabile de osteogeneza imperfectă, care interesează genele ce codifică lanțurile α1 (COL1A1) și α2 (COL1A2) ale colagenului de tip 1. Astfel, o mutație afectând structura unui lanț de colagen, prin deleția unuia sau mai multor exoni, exercită în stare heterozigotă un efect mai sever (dominant) decât o pierdere totală a expresiei (mutație recesivă), deoarece ea împiedică asamblarea corectă a subunităților lanțurilor normale de colagen. De altfel, o mutație nonsens în gena COL1A1 va fi transmisă recesiv (heterozigoții au 50% din proteina normală având fenotipul indemn), în timp ce o mutație cu sens greșit are un efect dominant negativ având doar 1/4 din lanțul normal de colagen

25
Q

Consecințele mutațiilor în timp şi/sau la distanță

A

În unele cazuri mutațiile genice pot avea consecințe la distanță în ceeace privește expresia sau funcționarea altor gene. Un exemplu este cazul mutațiilor ce implică genele sistemului de reparație a ADN (MMR - mismatch repair), responsabile pentru predispoziția pentru cancerul colorectal non-polipozic. Persoanele predispuse prezintă o mutație germinală heterozigotă a genei care codifică o proteină a sistemului MMR. În etapa inițială a progresiei tumorale are loc inactivarea somatică a copiei normale a genei de predispoziție, cu apariția unui fenotip mutator. Acesta va favoriza acumularea de mutații la nivelul secvențelor repetitive a unor gene (factorul de creștere tumorală β tip 2 sau gena Bax), deschizând astfel calea procesului de oncogeneză