שיעור 3 Flashcards
from RNA to protein
חומצת אמינו
the building blocks of proteins
כמה נוקלאוטידים מקודדים חומצת אמינו 1?
3
נכון או לא נכון
למיטוכונדריה דנא משלו והוא שונה ממה שאנחנו מכירים
נכון
יש 3 מסגרות קריאה אפשריות
מהי מסגרת הקריאה הנכונה
מסגרת הקריאה הנכונה מתחילה ב
met
ומסתיימת ב
stop
קודון
tRNA
מולקולות אשר מתאמות בין קודון הרנא לחומצת האמינו המתאימה
transfer RNAs
על ה
tRNA
יש רצף שנקרא אנטי קודון
במרכזו בערך
וקצה ה3 שלו קושר את החומצה האמינית
המבנה המיוחד שלו הוא מבנה שניוני של רנא
היכן tRNA מסונתז
בגרעינון
wobble base pairing
ה
tRNA
גמיש לשינויים לעמדה השלישית בקודון
בעמדה השלישית הוא יוצר קשר יחיד ולכן הוא יכול להיקשר לקודונים שונים
aminoacyl - tRNA synthesase
האנזים שמחבר את החומצה האמינית ל
tRNA
הספציפי
התהליך דורש
atp
מתרחש בציטופלזמה
AUG
start codon
רק פה הריבוזום יכול להתחיל לסנתז
כיווניות של חלבון
N terminal end == 5’ end of DNA
C terminal end == 3’ end of DNA
מהו הקשר שבין חומצות האמינו
קשר פפטידי
קשר קוולנטי בין קבוצת הקרבוקסיל של
חומצה אמינית אחת ובין קבוצת האמינו
של חומצה אמינית שנייה
הריבוזום בנוי מ
rRNAs
היכן יכולים להיות ריבוזומים
או צפים בציטופלזמה
או ב
rough ER
איפה מסונתזים חלבונים טרנסממברנליים
rough ER
חלבון טרנסממברנלי חייב להיות מסונתז בממברנה
ואחכ מגיע לממברנת התא על ידי וסיקולות
היכן נוצר הריבוזום עצמו
הגרעינון
בית החרושת ליצירת ריבוזומים
שתי היחידות של הריבוזום מסונתזות בגרעינון
ומתחברות בציטופלזמה
איך מתחיל התרגום מבחינת מבנה הריבוזום
קודם כל היחידה הקטנה מתחברת ל
mRNA
ואחכ מגיעה היחידה הגדולה
the 4 binding sites of the ribosome
one site for mRNA
3 sites for tRNAs:
A site - tRNA with AA
P site - tRNA att. to AA att. to the peptide chain
E site - Exit site of tRNA
elongation factors
חלבונים שמגיעים לריבוזום
עוזרים לתווף את התהליך את המהירות שלו ומבצעים בקרת איכות
כמה אנרגיה צריך להוספת חומצה אמינית אחת
4
מולקולות אנרגיה סהכ
2 ATP
2 GTP
the ribosome is composed of rRNA and proteins
what is the role of each one
2/3 rRNA and 1/3 proteins
rRNA-
position tRNAs
help catalytic activity
ribosomal proteins-
stabilize
start codon
AUG
החומצה האימינית היא מתיונין
תמיד יהיה בתחילת כל חלבון שנוצר ואחכ יורד
eIFs
eukaryotic initiation factors
מרכיב חיוני בתהליך ההתחלה של תרגום חלבונים. הם מסייעים
בזיהוי קודון ההתחלה
בהכנת האמרנא
ובקישור הריבוזום
מתחילים מה 5 קאפ
בפרוקרוטים אין 5 קאפ
איך הריבוזום יודע מאיפה להתחיל לחפש את ה סטארט קודון
בפרוקריוטים יש את רצף שיין-דלגרנו
שזה רצף שמתחבר לרצף קומפלמנטרי ב
rRNA
של היחידה הקטנה
וכך מתחיל התהליך משם
release factors
חלבונים שמתחברים לריבוזום שקשר סטופ קודון
גורם לריבוזום לקשור מים לפפטיד במקום חומצה אמינית נוספת
הפפטיד משחרר את קצה הקרבוקסיל
ועוזב את הריבוזום והולך לציטופלזמה
הריבוזום מתפרק למרכיביו
התהליך הסתיים
chaperones
חלבונים שהתפקיד שלהם זה להבטיח התקפלות
נכונה של חלבונים
משפחת ה
Heat shock protein
(צ׳פרונים)
HSP 70
תפקידם לעזור להציל חלבונים מדנטורציה מחום
מזהה איזורים הידרופוביים וקושר אותם בצורה טובה
יכולים לעבוד כשהחלבון עוד בריבוזום
HSP 60
ממש גדולים, מזכירים חביות
יוכלים להכניס אליהם חלבונים ולהיסגר וליצור סביבה הידרופובית
בסביבה הזאת החלבון מתקפל בצורה נכונה
דורש הרבה אנרגיה
החלבון חייב להשתחרר מהריבוזם בשביל זה
proteasome
חלבונים שאף פעם יתקפלו נכון והצפרונים לא עוזרים
ילכו לדגרדציה
על ידי פרוטאוזום
הורסים חלבונים שמסומנים ביוביקויטין
