2. slayt

Question 1

PCR’da neden Thermus aquaticus’dan izole edilen Taq pol kullanılır?

Answer 1

PCR reaksiyonunda çok yüksek sıcaklıklara çıkıldığı için kaplıcalarda yaşayan enzimleri ısıya dayanıklı bir türün polimeraz enzimi seçilmiştir.

Question 2

Çift aktiviteli enzime bir örnek söyle.

Answer 2

Genellikle E.Coli’Den alınan DNA Pol I hem polimeraz hem de 5’–>3’ aktivitesiyle örnek verilebilir.

Question 3

Alkalin fosfatazın görevi nedir?

Answer 3

DNA’nın 5’ ucundan fosfat grubu uzaklaştırır.

Question 4

Polinükleotit kinaz?

Answer 4

Alkalin fosfatazın aksine 5’ ucuna fosfat grubu ekler.

Question 5

Terminal deoksinükleotidil transferaz?

Answer 5

DNA molekülünün 3’ ucuna bir veya daha fazla deoksinükleotit ekler.

Question 6

Kaç tip restriksiyon endonükleaz vardır?

Answer 6

3 tip restriksiyon endonükleaz vardır ve tip I ve III oldukça karmaşık ve genetik mühendisliğinde oldukça sınırlı rollere sahiptir.

Question 7

Gen klonlamada hangi rest. endonükleaz kullanılmaktadır?

Answer 7

tip III

Question 8

EcoRI resti. endonükleazının adlandırılmasını açıkla.

Answer 8

E=Escherichia (cins) co=Coli (tür) R=RY13 (suş veya varyant) I=first identified (keşif sırası)

Question 9

Tip II restiriksiyon endonükleazların ana özelliği nedir?

Answer 9

Her bir enzimin DNA molekülünü kestiği spesifik bir tanıma dizisine sahip olmasıdır.
Enzim bu tanıma dizisi içinden DNA’nın iki ipliğini özgül bir kesim kalıbı oluşturacak şekilde keser.

Question 10

DNA’nın iki zincirinden de 5’–>3’ yönünde okunduğunda aynı diziyi veren nükleotit dizilerine ne denir?

Answer 10

Palindromik tekrarlar.

Question 11

Tanıma dizilerinin çoğu palindromiktir.
Doğru/yanlış?

Answer 11

Doğru

Question 12

Küt uçlara örnek ver.

Answer 12

PvuII, AluI, EcoV.

Question 13

Yapışkan uçlara örnek ver.

Answer 13

EcoRI, BamHI, HindIII, Sau3A.

Question 14

Restriksiyon parçalarının büyüklüğü nasıl hesaplanır? Örneğin 3 bazdan oluşan bir tanıma dizisi olan bir nükleotit dizisinde restriksiyon parçalarının büyüklüğü nedir?

Answer 14

Enzimin DNA’yı ne kadar sıklıkta kestiğine göre hesaplanır. 4 üzeri 3=64’den 64 baz çiftinde bir kesim olduğunu söyleyebiliriz.

Question 15

DNA molekülünün büyüklüğünün hesaplanması için kullanılan formül nedir?

Answer 15

D=a-b(logM)
D: hareket edilen mesafe
a ve b:elektroforeze göre değişen sbtler
M: moleküler kütle

Question 16

Elektroforezde DNA ladder nedir ve ne için kullanılmaktadır?

Answer 16

DNA ladder, belirli boyutlarda (baz çiftleri) DNA fragmanları içeren ve jel elektroforezinde referans olarak kullanılan bir karışımdır. Bu merdiven, örnek DNA’nın boyutlarını karşılaştırarak tahmin etmenize yardımcı olur.