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Microbiologie (MCB1013) > 2. Détection des micro-organismes > Flashcards

2. Détection des micro-organismes Flashcards

1
Q

Identifie 1 à 7 svp :)

A
  1. Coque
  2. Bacille
  3. Coccobacille
  4. Bacille fusiforme
  5. Vibrion
  6. Spirillon
  7. Spirochète
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2
Q

Les colorations requièrent souvent un chauffage de l’échantillon, afin de détruire les membranes. Comment appelle-t-on cette étape ?

A

Fixation

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3
Q

2 exemple de coloration simple (1 colorant)

A
  • Encre de chine
  • Bleu de méthylène
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4
Q

Identifie le type de coloration simple

A

Bleu de méthylène

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5
Q

Identifie le type de coloration simple

A

Encre de chine –» N’entre pas dans les cellules, mais crée plutôt un fond

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6
Q

Quel type de coloration utilise la méthode Ziehl-Neelsen ?

A

Coloration acido-alcoolo-résistante
(acid-fast stain) –» utilisé pour les bactéries qui résistent à la décoloration par une mixture d’acide et d’alcool.

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7
Q

Avec la coloration acido-alcoolo-résistante, les bactéries acid fast retiennent quelle couleur ?

A

Rouge

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8
Q

Avec la coloration acido-alcoolo-résistante, les bactéries non acid fast retiennent quelle couleur ?

A

Bleu

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9
Q

Identifie le type de coloration

A

Acido-alcoolo-résistante

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10
Q

Quel type de coloration est le plus utilisé des protocoles de coloration microbienne ?

A

Gram

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11
Q

La coloration Gram permet de séparer les bactéries en 2 groupes, quel terme décrit cela ?

A

Coloration différentielle

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12
Q

Dans la coloration de Gram, les Gram POSITIFS sont colorés en quelle couleur?

A

Mauve

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13
Q

Dans la coloration de Gram, les Gram NÉGATIFS sont colorés en quelle couleur?

A

Rose

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14
Q

Qu’est-ce qui donne la couleur rose au Gram NÉGATIF?

A

Le safranine

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15
Q

Décris cette coloration

A

Gram
- Bacilles gram négative (rose)
- Coques gram positive (violet)

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16
Q

C’est quoi ça bibou ?

A

Coloration gram d’une ponction lombaire (liquide céphalo-rachidien) d’un pt atteint d’une ménigite

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17
Q

C’est quoi ça ?

A

Coloration gram de staphylococcus aureas (dans un écoulement de plaie)

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18
Q

Quels sont les paramètres possibles pour l’identification par culture en conditions spécifiques ?

A
  • Source de Carbone (C)
  • Source d’É
  • Produit de fermentation
  • Température optimales de croissance
  • Milieu anaérobique vs aérobique
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19
Q

2 milieux de cultures expérimentaux

A
  • Liquide
  • Semi-solide
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20
Q

Qu’est-ce qui différencie un milieu de culture minimal vs un milieu de culture complexe?

A

Milieu de culture minimal –»offre des nutriments SPÉCIFIQUES que les bacteries pourraient avoir besoin

Milieu complexe –» Offre TOUT ce dont la bactérie pourrait avoir besoin –» donc pas optimal pour distinguer les bactéries vu que bcp d’entre elle pourrait proliférer dans ces milieux

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21
Q

Toutes les bactéries pathogéniques sont _____________.

A

Hétérotrophes

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22
Q

Comment on appelle ça quand la présence d’oxygène requise ?

A

Aérobie obligatoire

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23
Q

Comment on appelle ça quand l’absence d’oxygène est requise ?

A

Anaérobie obligatoire

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24
Q

Comment on appelle ça quand la bactérie peut se développer avec ou sans oxygène ?

A

Anaérobie facultative

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25
Q

Quoi les 3 facteurs de croissance synthétisé par les bactéries?

A
  • AA
  • Vitamines
  • Purine/pyrimidines
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26
Q

V ou F

E. coli nécessite un milieu complexe pour la synthèse des facteurs de croissance

A

Faux,

(elle est capable de synthétiser tous les facteurs de croissance, donc pas besoin de la mettre dans un milieu avec tous les nutriments qu’il lui faut

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27
Q

V ou F

Pour certaines bactéries, on n’a pas encore mis au point des méthodes de croissance efficace

A

Vrai

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28
Q

3 étapes pour la détermination du type respiratoire d’une souche bactérienne

A
  1. Création milieu semi-solide (avec gradient en O2)
  2. Ensemencement
  3. Observation
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29
Q

A :
B :
C :
D :

A

A : aéro-anaérobie
B : aérobie stricte
C : micro-aérophile
D : anaérobie stricte

t’as dead !

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30
Q

Exemple de 5 sources d’échantillons

A
  • Liquide céphalo-rachidien
  • Échantillons cutantés
  • Lavages broncho-alvéolaires
  • Ongles
  • Crachats
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31
Q

Les échantillons sont typiquent divisés pour détecter la présence d’espèces spécifiques de quoi ? (3)

A
  • Bactéries
  • Mycètes (mycobactéries)
  • Mycoses
32
Q

Comment appelle-t-on les géloses utilisées pour l’identification d’une espèce?

A

Gélose API

33
Q

Identifie de gauche à droite les 4 truc truc de pétris

A
  • Géolse sorbitol-MacConkey (E. coli)
  • Gélose XLD (Samonella/Shigella)
  • Gélose CIN (Yersinia enterocolitica)
  • CAMPY (C. jejuni)
34
Q

C’est quoi ce truc ?

A

Hémocultures
(détection précoce de bactéries dans le sang, fait de manière stérile)

35
Q

Quelle est l’espèce qu’on cherche principalement à détecter avec la détection des mycobactéries ?

A

M. tuberculosis

36
Q

Quels sont les 2 milieux spécifiques à M. tuberculosis ?

A
  • Gruft
  • Jensen
37
Q

Quel est le résultat attendu pour la coloration gram (tuberculosis) ?

A

Négative (absence de coloration)

38
Q

Quel est le résultat attendu pour la coloration acido-alcoolo-résistante (tuberculosis) ?

A

Positive

39
Q

2 tests de susceptibilités aux antibiotiques

A
  • Test de diffusion
  • E-test pour la concentreation minimale inhibitrice –» Concentration minimale nécessaire pour inhiber la croissance bactérienne
40
Q

Quel est la fonction des antibiogrammes ? (test de susceptibilité)

A

Aider au choix du traitement et l’identification

41
Q

Qui suis-je ?
Autre test de susceptibilité aux antibiotiques. (dilution)

A

Méthode de dilution en bouillon –» Détection sur la base de la turbidité (passage de la lumière) –» les cellules de bactérie bloque le passage de la lumière

42
Q

Quel est l’unité de mesure pour les antibiogrammes automatisés ?

A

Densité optique

43
Q

3 façon de faire la classification/id des micro-organismes par phénotypage

A

-Microscopie
- Test biochimique
- Génotypage

44
Q

4 types de tests biochimiques (analyses)

A
  • Analyse des AA
  • Analyse des lipides totaux
  • Analyse des protéines (spectrométrie de masse
  • Analyse des caractéristiques des enzymes
45
Q

2 tests biochimies pour le diagnostic de s. aureus

A
  • Test de catalase
  • Test de coagulase
46
Q

Explique le test de catalase

A

Permet de dégrader des réactifs oxygènes toxiques. S. aureus exprimes des qt importantes de la catalase ce qui contribue à sa résistance à la phagocytose. Des bulles vont apparaître à cause de la catalase.

47
Q

Explique le test de coagulase

A

Sépare S. aureus (+) de staphylocoques non pathogéniques (-).

s. aureus porte la coagulase à sa surface (coagulation)

48
Q

Explique le système API

A

Système de culutre miniaturisé permettant d’id les espèces bactériennes sur la base de leurs propriétés :
(capacité de pousser dans milieux contenants certaines sources de nutriments / présences de certaines enzymes)

49
Q

Voir diapo 25-26

A

pas envie de faire une flash

50
Q

Génotypage c’est l’analyse des …

A

ARNs et ADNs

51
Q

Quand on utilise l’ADN ou l’ARN en diagnostic, c’est quoi les 2 étapes ?

A

a) Amplification de régions spécifiques de l’ADN

b) Détermination de la séquence (id + précise)

52
Q

Qu’est-ce qui permet l’amplification exponentielle de fragments d’ADN ?

A

La réaction de polymérisation en chaîne (PCR)

on veut amplifier une région entre 2 sites qu’ils soient proches

53
Q

PCR

Les fragments d’ADN résultants de la réaction peuvent être (3) :

A
  • Directement visualisé
  • Séquencés
  • Clonés
54
Q

Comment ça s’appelle quand on passe de l’ARN à l’ADN en laboratoire par l’utilisation de la PCR ?

A

Réverse-transcrit

55
Q

Qu’est-ce qu’on utilise quand on veut quantifier les génomes microbiens par PCR quantitative ?

A

Fluorescence

56
Q

Voir diapo 31 je comprends pas honnêtement

A
57
Q

Quelle amorce émet de la fluorescence ?

A

3e amorce

58
Q

On peut utiliser la phylogénétique à quelle fin ? (géographie)

A

Analyser la circulation des souches d’un virus/bactérie jusqu’à l’échelle mondiale

59
Q

On peut utilser la phylogénétique à quelle autre fin que la circulation des souches ?

A

Datation d’une épidémie

60
Q

On peut utilser la phylogénétique à quelle autre fin que la circulation des souches et la datation ?

A

Analyser les patrons de transmission

exemple : homosexuels, femme straight

61
Q

Qu’est-ce qu’un protéine et quelles sont ses (4) fonctions ?

A

**Chaîne d’AA de taille variable qui : **
- Forme la structure
- Enzymes
- Communication moléculaire
- Défenses cellulaires

62
Q

Explique la nature antigénique des protéines

A

Les anticorps sont généralement dirigés contre des protéines de micro-organismes

Hormones c’est des protéines ! trop wow

63
Q

Quelle technique on utilise pour la détection d’antigène ou d’anticorps ?

A

Western blotting

64
Q

Les 6 étapes du western blotting

A
  1. Séparation des protéines
  2. Transfert de protéines séparées sur membrane
  3. Blocage de la membrane par solution protéique
  4. Détection par l’anticorps primaire spécifique à la protéine d’intérêt ou l’antigène
  5. Révélation de la protéine liée par un anticorps secondaire marqué par fluorescence
65
Q

Nom de la technique qui effectue la détection de la réponse immune spécifique (anticorps)

A

ELISA

66
Q

Étape de ELISA pour la détection D’ANTICORPS

A
  1. Antigènes sont collés au fond
  2. Mettre les anticorps primaires du sérum
  3. Liaison antigène et anticorps (+lavage)
  4. Mettre anticorps secondaire (+lavage)
  5. Liaison de l’anti-anticorps + anticorps
  6. Coloration
67
Q

Étape de ELISA pour la détection d’ANTIGÈNE

A
  1. Anticorps primaire attachée à une phase solide
  2. Antigène est ajouté
  3. Anticorps secondaire détecte l’antigène lié
68
Q

Les toxo IgG et toxo IgM sont des test qui permettent de savoir si on a quelle maladie ?

A

Toxoplasmose

69
Q

À l’origine, on utilisait les tests de détection rapide pour quelle pathologie et son parasite ?

A

Paludisme (malaria)
et son parasite Plasmodium falciparum

70
Q

Comment on fait le test rapide pour le plasmodium ?

A
  1. Trempe une bandelette couverte d’anticorps anti-Plasmodium dans du sang hémolysé
  2. Trempe dans une solution de liposomes contenant un colorant rose qui se lie aux antigènes de Plasmodium
71
Q

Qui est moins sévère entre le Plasmodium falciparum et le Plasmodium vivax ?

A

Vivax

72
Q

Explique l’immunofluorescence

A

L’immunofluorescence est une technique qui utilise des anticorps marqués par un fluorochrome pour détecter des antigènes dans des échantillons biologiques. Le fluorochrome émet une lumière visible lorsqu’il est exposé à une source de lumière spécifique, ce qui permet de visualiser l’antigène.

73
Q

C’est quoi ce graphique ?

A

Séquence d’apparition des marqueurs de l’infection, et fenêtres de dépistage

74
Q

C’est quoi les 2 objectifs d’amélioration des tests du VIH (nouveau test de dépistage) ?

A
  • Dépistage + précoce
  • Dépister VIH-1 et VH-2 dans la même réaction
75
Q

Décris les 4 générations de tests de dépistage immunologiques

A

1re : Détection anticorps IgG avec protéines entière
2e : Détection anticorps IgG avec protéines pas entière
3e : Détection anticorps IgM et IgG sans anticorps second
4e : Détection anticorps IgG et IgM et antigène

76
Q

Explique le test VIDAS

A
  1. Étape de capture :
    - L’anticorps de capture est fixé sur une phase solide (comme une barre de réaction ou une microparticule).
    - L’échantillon contenant l’antigène cible (ou l’anticorps à détecter, selon le test) est ajouté.
    - L’antigène présent dans l’échantillon va se lier à l’anticorps de capture fixé sur le support solide, formant ainsi la première partie du “sandwich”.
  2. Étape de détection (indirecte) :
    - Après la première étape, un anticorps secondaire (spécifique de l’antigène) est ajouté.
    - Cet anticorps secondaire n’est pas marqué directement, mais va se lier au complexe anticorps-antigène formé lors de l’étape de capture.
    - Ensuite, un anticorps marqué (porteur d’une enzyme ou d’un fluorochrome) est ajouté. Il se lie à l’anticorps secondaire, formant la deuxième partie du sandwich.

Microbiologie (MCB1013) (4 decks)

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