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Génétique moléculaire II > 2,6 > Flashcards

2,6 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que la recombinaison homologue ?

A

peut être définie comme un échange de segments homologues entre deux molécules d’ADN

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2
Q

Quand est-ce que la recombinaison chez les eucaryotes se produit ?

A

dans la méiose, puisque les eucaryotes se reproduisent de façon asexué la production des gamètes haploides et est responsable de la plus grande partie de la variation génétique dautre circontance mais lui plus courant méiose gamète

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3
Q

que provoque la recombinaison homologue chez les bactéries

A

Comme il possède un chromosome, la recombinaison peut également aboutir à de nouvelles combinaisons d’allèles lors de la conjugaison, la transduction et la transformation

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4
Q

Quel est le rôle (but) majeur de la recombinaison ?

A

Il faut se rappeler que la recombinaison joue un rôle majeur dans la réparation des cassures bicaténaires et le redémarrage des fourches de réplication bloquées

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5
Q

Que mène la recombinaison ?

A

La recombinaison homologue mène à l’échange réciproque de marqueurs sur les duplex parentaux

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6
Q

Que décrit le modèle holliday pour la recombinaison homologue ?

A

Il décrit la recombinaison entre des duplex d’ADN homologues

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7
Q
  • Processus pour régénérer les molécules d’ADN et donc terminer l’échange génétique est appelé résolution. La résolution peut être obtenue de deux manières,
A

soit par clivage de la jonction de Holliday, soit (chez les eucaryotes) par un processus de « dissolution

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8
Q

Qu’est-ce que la structure d’Holliday ?

A

C’est un intermédiaire de la reombinaison

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9
Q

Qu’est-ce que provoque l’invasion et quel est son but ?

A

L’invasion de brin est une étape clé précoce de la recombination homologue, engendrant une jonction de Holliday qui peut migrer le long de l’ADN Cette migration augmente la longueur de l’ADN échangé

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10
Q

Quels sont les étapes de la formation de la structure de Holliday ?

A
  1. allignement de deux duplex homologue
  2. Par l’endonucléase , il y a cassure d’un brin de chaque molécule d’ADN
  3. Hélicase et ssB vont déplacer le brin (pour aller rejoindre l’autre section)
  4. Par ADN ligase , échange de brin et formation de la structure holliday
  5. Migration + jonction
    = obtention de la forme chi = structure 3D
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11
Q

que fait la jonction de holliday ?

A

Elle complète l’échange génétique

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12
Q

Combien de site peuvent coupées pendant la résolution ? Qu’est-ce qui en obtient

A

Deux paires alternatives de sites peuvent être coupées pendant la résolution, donnant deux classes de produits

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13
Q

Quelle effet a la nature des brins sur l’ADN coupés ?

A

La nature des brins d’ADN coupés lors de la résolution a un impact majeur sur la quantité d’ADN échangée entre les deux molécules d’ADN

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14
Q

Que fait la recombinaison entre deux ADN circulaire chez les molécules comportant un chromosome circulaire ?

A

La recombinaison entre deux ADN duplex circulaires conduit à la formation de deux cercles de la taille originelle ou d’un seul cercle composite (dimère) , une structure en 8

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15
Q

Qu’est-ce que les bactéries possède pour éliminer les dimères ?

A

Les bactéries possèdent un système de recombinaison site-spécifique pour éliminer les dimères

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16
Q

Que provoque les produits non croisé ?

A

Des patchs

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17
Q

Expiquer les étapes de la résolution ?

A

Partir de la structure holliday , forme chi

endonucléase coupe = formation des deux ADN duplex recombinant , portant une partie croisé (cross-over) et une non. croisé (patch)

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18
Q

Structure ki c’est quoi ?

A

Structure ki résultant du traitement avec une enzyme de restriction, résulte d’une manipulation de laboratoire , dans le but de mieux comprendre et de voir la structure en 8

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19
Q

3 combien il y a-t-il de voie chez de recombinaison chez E.coli ?

A

les voies RecBCD, RecE et RecF

20
Q

En quoi les 3 mécanismes de recombinaison chez e.coli sont similaire ?

A

Ces voies font appel à des mécanismes similaires et partagent plusieurs enzymes dont RecA

21
Q

Quel est a voie majeur de recombinaison chez E,,coli ?

A

RecBCD est la voie majeure de recombinaison homologue;

21
Q

Quel est a voie majeur de recombinaison chez E,,coli ?

A

RecBCD est la voie majeure de recombinaison homologue;

22
Q

Quel est le rôle de L’hélicase/nucléase RecBCD

A

aménage les molécules d’ADN cassées pour la recombinaison

23
Q

Le complexe RecBCD est composé de combine de sous unité et les nommez ?

A

trois sous-unités possédant les activités suivantes :
activité nucléase dégradant l’ADN (RecB)
activité hélicase 3’5’ (RecB)
activité hélicase 5’3’ (RecD)

24
Q

les activité de RecBCD sont contrôler par quoi ?

A

Les activités de RecBCD sont contrôlées par les sites chi (points chauds de recombinaison). RecC (et non RecD) reconnaît les sites chi (8 nt de longueur et présents en 1009 copies dans le génome)

25
Q

Que fait RecBCD?

A

génère des extensions d’ADN simple-brin se terminant en 3’-OH par une séquence chi et de plus, interagit avec RecA, permettant le dépôt de cette protéine sur le brin invasif. Si de l’ADN étranger dépourvu de séquence chi pénètre dans la bactérie, il sera entièrement dégradé par RecBCD

26
Q

Quels sont les étapes de RecBCD?

A

1.RecBCD se lie à l’extrémité droite (extrmité) et elle découpe de la molécule

  1. se déplace le long de l’ADN grâce à ses deux activités hélicase [RecD, qui se déplace rapidement sur le brin avec l’extrémité 5’ (brin inférieur) et RecB, qui se déplace lentement sur l’autre brin]
  2. L’activité nucléase de RecBCD coupe fréquemment chacun des brins pendant le déroulement de l’ADN

4.Dès que RecBCD a dépassé le site chi, elle ne coupe plus le brin parcouru dans le sens 3’5’ (à cause de l’inactivation de RecD du changement de conformation du complexe). Mais l’autre brin est coupé encore plus souvent qu’avant le passage du site chi

27
Q

Quel est le rôle de RecA ?

A

participe à l’invasion du brin donneur, à l’appariement des séquences homologues et à la formation de la structure de Holliday

28
Q

Quel sont les étapes fait par RECA

A

ssDNA : brin simple brin (présinaptique). Et rec A va si attacher et va aller se trouver un brin double pour d’attacher va scanne et trouver et scanne un brin de base min15 pb, elle a capable de faire ça puisqu’elle a un scan de plusieurs base

29
Q

Comment est la structure de l’ADN dans le filament Rec A

A

La structure de l’ADN dans le filament de RecA est fortement étirée (s’attache de facon covalente)
Un pas de 5,1 Å au lieu de 3,4 Å dans l’ADN-B
6 monomères/tour et 3 nt/monomère

30
Q

Quels sont le rôle des protéines Ruv ?

A

Les protéines Ruv catalysent la migration de la jonction de Holliday et la résolution des structures de Holliday

31
Q

que font Ruv a et ruv b

A

RuvA et RuvB catalysent la migration de la jonction de Holliday en présence d’AT

32
Q

que fait ruv C

A

RuvC est la résolvase qui coupe la jonction de Holliday à deux sites opposés

32
Q

que fait ruv C

A

RuvC est la résolvase qui coupe la jonction de Holliday à deux sites opposés

33
Q

sur quoi vont s’arrêter ruv a et ruvb

A

La migration de la jonction s’arrête préférentiellement à la séquence 5’-A/T-T-T-G/C-3’

34
Q

Comment fonctionne l’action de ruv a et b

A

4 copies de RuvA se lient directement à la jonction de Holliday, formant ainsi un noyau auquel s’attachent deux anneaux RuvB, chacun constitué de 6 protéines
La structure qui en résulte agit comme un moteur moléculaire. Les anneaux RuvB, doués d’une activité ATPase, font pénétrer les deux ADN duplex dans le complexe RuvAB, ce qui sépare les brins d’ADN et assure l’extrusion de deux hétéroduplex double-brin du complexe

35
Q

que fait la La résolvase RuvC en action

A

Elle coupe la séquence 5’-A/T TT G/C-3’ entre les 3e et 4e positions

36
Q

que fait la La résolvase RuvC en action

A

Elle coupe la séquence 5’-A/T TT G/C-3’ entre les 3e et 4e positions

37
Q

Rad51 et Dcm1 sont des homolgues de

A

recA

38
Q

Spo11 et Dcm1 sont exprimées spécifiquement durant

A

la méiose

39
Q

Vrai ou faux Le complexe MRX (Mre11, Rad50, Xrs2) n’est pas homologue à RecBCD même si ces deux complexes ont des fonctions analogues.

A

vrai

40
Q

Comment agit spo11

A

Spo11 va venir s’attacher a ses site spo 11 présent dans le génome eucaryote , rejoint par mrx

41
Q

Décrire le mécanisme de la coupure par Spo11

A

Spo11 est un dimère

Le groupement OH d’une tyrosine de chaque sous- unité attaque l’ADN pour former une liaison covalente protéine-ADN

42
Q

De nombreuses protéines fonctionnent ensemble pour effectuer la recombinaison méiotique

A

Elles fonctionnent dans le cadre de grands complexes protéines-ADN, appelés foyers de recombinaison (obserever lorsque couplé anticorps)
Des protéines variées sont impliquées avec Rad51 dans la recombinaison et la réparation des cassures bicaténaires (Rad52, Rad59, et BRCA2)

43
Q

Chez la levure, Rad52 et Rad59 permettent quoi ?

A

Chez la levure, Rad52 et Rad59 permettent l’assemblage des filaments ADN-Rad51 et stimulent l’appariement de molécules complémentaires. Ce rôle est équivalent à celui de RecBCD chez les bactéries et BRCA2 chez l’humain

Génétique moléculaire II (7 decks)

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