2,2

Question 1

Qu’elle est l’ADN polymérase a être identifié chez E.coli

Answer 1

ADN polymérase 1

Question 2

Nomme moi les caractéristique de la polymérase 1

Answer 2

• monomère
  -928aa ou 103kDa
  -assez fidèle
  c’est une enzyme progressive : ce qui veut dire qu’elle me copie que 20 nt et plus de la matrice sans la quitté (moyenne)

Question 3

Qu’est-ce le degré de possessivité d’une ADN polymérase

Answer 3

Elle peut être défini comme étant le nombre moyen de nucléotides que l’enzyme ajoute à chaque fois qu’elle se lié à une jonction

Question 4

Quel est le deuxième rôle de l’ADN polymérase 1

Answer 4

à la capacité de corriger ses erreurs , possède une activité exonucléase 3’ vers 5’

Question 5

Qu’est-ce qui explique la grande fidélité de l’ADN pol 1

Answer 5

seulement 3% des nt correctement incorporés sont excisé, son activité exonucléase lui permet donc sa grande fidélité

Question 6

Qu’est-ce que fait la fonciton exonucléase 5’ vers 3’

Answer 6

Permet à pol 1 de se lier à un site de coupure simple-brin sur l’ADN duplex

Question 7

Expliquez la fonction exonucléase de pol 1

Answer 7

Pol I coupe l’ADN près de la cassure en libérant soit des mononucléotides ou des oligonucléotides (jusqu’à 10 nt)
Il faut noter que l’activité exonucléase 3’5’ n’enlève que des mononucléotides

Question 8

Est-ce que la fonction de la pol 1 est situé sur le même site actif ?

Answer 8

Non , la fonction polymérase et exonucléase ont chacun leur site différent

Question 9

ou est localisé le site actif de la polymérase

Answer 9

il est localisé dans la partie inférieur de la forme de la pince (palm)

Question 10

Pol I a une fonction physiologique dans la réparation de l’ADN, expliquez l’expérience qui a mener à cette affirmation

Answer 10

Clairns et De Lucia ont isolé un mutant de pol I d’E.coli possédant moins de 1% de l’activité

Ce mutant se multiplie a une vitesse comparable à la souche sauvage démontrant aisin que pol 1 n’est pas une réplicase

Question 11

Pourquoi le mutant décourvert de pol 1 indique que celui-ci joue un rôle dans la réparation de l’ADN

Answer 11

Ce même mutant est très sensible aux rayons UV et aux agents mutagènes chimiques

Question 12

pol 1 catalyse le déplacement de quoi ?

Answer 12

d’une cassure simple-brin

Question 13

à quoi sert la réaction de déplacement d’une cassure

Answer 13

sert à introduire des nucléotides radioactifs dans de l’ADN in vitro dans le but de préparer des sondes moléculaires

Question 14

Quelle est la fonction physiologique de l’exonucléase

Answer 14

enlève les amorces ARN , comble aussi les trous- simple brin qui en résults

Question 15

quel rôle de la pol 1 qui est indispensable pour la réplication de l’ADN chez e coli

Answer 15

exonucléase

Question 16

ADN pol 1 est beaucoup plus … que pol 3

Answer 16

abondante chez e coli

Question 17

quel sont les autre pol chez e coli

Answer 17

1 ,2 ,3,4 5

Question 18

qu’est-ce que pol 3

Answer 18

c’est un gros complexe enzymatique composé de 10 sous-unités différentes et ayant une masse de 900kda dans sa forme complète holoenzyme

Question 19

combien il y a -t-il de sous-unité chez pol 3 et de composante de dimérisation, attache dimérique, chargeur

Answer 19

3 , alpha têta et gamma
1 composante (thêta)
1 attache bêta
1 chargeur complexe n ) qui permet de placer les sous- unités bêta sur l’ADN

Question 20

quels sont les 3 étapes de l’holoenzymes (son assemblage)

Answer 20

Le complexe n transfère la sous-unité b à la matrice portant l’amorce
Le centre catalytique de Pol III s’associe avec la sous-unité b sur l’ADN
Un dimère t se lie au centre catalytique de la polymérase, permettant à un autre centre catalytique de s’associer
À noter que l’holoenzyme est assymétrique car elle n’a qu’un complexe

Question 21

qu’est-ce que la forme du dimère b selon sa forme en anneau fermé apporte à l’ADN

Answer 21

elle permet à l’holoenzyme de glisser le long de l’ADN tout en y restant accroché

Question 22

le dimère b a un minimum … avec ADN

Answer 22

intéraction

Question 23

la strcuture du dimère explique quoi

Answer 23

la grande processivité de l’holoenzyme (elle est augmenté par l’attache dimérique de B)

Question 24

le chargement de l’attache b est couplé avec quoi ?

Answer 24

la liaison et l’hydrolyse de l’ATP

Question 25

qu’est-ce qui diffère pol 1 de pol 3

Answer 25

Contrairement à Pol I, l’holoenzyme Pol III ne peut pas dérouler le duplex d’ADN

Question 26

qu’est-ce que la DNAB

Answer 26

DnaB et la protéine affine de l’ADN simple- brin (SSB pour « single-stranded binding protein ») collaborent au déroulement de l’ADN, créant la fourche de réplication
Cette activité est couplée à l’hydrolyse de l’ATP

Question 27

DNAB est une

Answer 27

hélicase elle sépare les brins de l’ADN duplex en se déplaçant le long de la matrice du brin retardé dans le sens 5’3’ en hydrolysant l’ATP

Question 28

que fait le ssb

Answer 28

SSB se lie aux brins séparés par l’hélicase pour prévenir leur réappariement

Question 29

nomme moi deux autre hélicase et comment se déplace -t-elle?

Answer 29

Deux autres hélicases, les protéines Rep et PriA, interviennent dans la réplication de plusieurs ADN de phages de E. coli
Elles se déplacent le long de l’ADN dans le sens 3’5’ au prix de l’hydrolyse de l’ATP

Question 30

que fait l’ADN ligase

Answer 30

L’ADN ligase soude les cassures simple-brin entre
les fragments d’Okazaki adjacents, de même que la cassure simple-brin signalant la fin de la réplication du brin avancé d’un ADN circulaire

Question 31

la réaction de la ligase se fait en combien d’étape

Answer 31

Cette réaction se déroule en trois étapes et l’énergie requise est fournie soit par le NAD soit par l’ATP
Elles se déplacent le long de l’ADN dans le sens 3’5’ au prix de l’hydrolyse de l’ATP , sens contraire nécessite de l’ATP