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Génétique moléculaire II > 2,4 > Flashcards

2,4 Flashcards

1
Q

Quelles sont les différences entre la réplication chez les eucaryotes et procaryotes ?

A

-Période de réplication durant le cycle cellulaire
-Nature des protéines de réplication
-Nombre de réplicons
-Régulation de l’initiation de la réplication
-Le problème de la réplication des extrémités des chromosomes linéaires

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Q

Comment se nomme la phase durant lequel les cellule seucaryote font la réplication de leur ADN

A

la phase S

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3
Q

Le cycle cellulaire des eucaryotes comportent combien de phases distinctes ?

A

4 phases distinctes

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4
Q

Quels sont les phases du cycles cellulaires ?

A

G1: Permet le rassemblement de tout les métabolites pour fabriquer de l’ADN (cette phase est longue , dans le but d’éviter les erreurs par la suite) Fin la phase de G1, on va sélectionner le cycle de réplication qu’on veut activer (pas tout les origines qui vont être activié)

G2: phase à laquelle elle fait sa vie de cellule ce à laquelle elle fait une fonction spécifique

G0: ne fais pas vraiment partie du cycle , mais c’est la phase de dormance, certain type de cellule n’ont pas besoin de toujours être en réplication ex : cellule de peau (pas applicable a tous)

S: phase de réplication

M: mitose : pas en même temps que la réplication ce qui est différent chez les procaryotes

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5
Q

La réplication de l’ADN doit être coordonnée avec quoi ? et dans quel but

A

avec la mitose dans le but que chaque chromosome soit complètement répliqué

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6
Q

Quelle sont les points de contrôle?

A

Les périodes précédant immédiatement l’entrée dans les phases S et M sont des points de contrôle importants du cycle cellulaire

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7
Q

À quoi servent les points de contrôle ?

A

C’est à l’un de ces points que le cycle cellulaire s’arrête si les gènes critiques intervenant dans le contrôle du cycle cellulaire sont mutés ou si l’ADN est très endommagé

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8
Q

Quelle est la conséquence de la réplication incomplète de l’ADN eucaryotique

A

un break

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9
Q

Quels sont les 3 adn polymérase et quelle sont leur rôle fonction

A

pol alpha : primase , possède 4 sous-unités , 2 réplicase et 2 polymérase
Delta: s’occupe de la synthèse de fragment d’okasaki (brin retardé)
eptilun: S’occupe du brin avancé
Caractéristique : possessive et fidèle
exception : pol gamma est situé dans les mitochondrie,

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10
Q

Ou est-ce que les 3 adn pol exerce leur fonction ?

A

sur la fourche de réplication

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11
Q

delta et eptilone sont

A

des réplicases

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12
Q

Qu’est-ce que possède delta et eptilone ?

A

une protéine accessoire pcna servant d’accessoire pour retenir l’enzyme sur la matrice ce qui lui permet d’être processive

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13
Q

Vria ou faux Le complexe ADN polymérase a/primase n’a qu’une faible processvité (100-200nt)

A

vrai

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14
Q

Adn pol alpha synthétise ou les amorces D’ARn

A

synthétise les amorces d’ARN au début du brin avancé et au commencement de chaque fragment d’Okazaki

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15
Q

Quels sont les caractéristiques de la protéines PCNA

A

C’est trimère en forme d’anneau autour de l’ADN

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16
Q

Qu’est-ce qui diffère l’amorçage de la synthèse d’ADN est différent chez les bactéries et les eucaryotes?

A

Puisque le complexe Pol alpha primase est peu processif, il ne peut allonger l’amorce qu’il synthétise que d’environ 30 nt d’ADN

Ce complexe doit donc être remplacé par l’ADN polymérase  ou 

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17
Q

Le ADN polymérase eucaryotique ne possède pas de

A

D’activité exonucléase, elle ne peuvent pas enlever les amorce ARN

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18
Q

Quelles enzyme permet d’effectué le mécanisme exnucléase

A

Deux enzymes, RNAse H et FEN-1 (flap endonucléase), enlèvent ces amorces

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19
Q

Quels sont les particularités des chromosomes eucaryotes ?

A

sont linéaire , pas tous mais la. pluspart , possède plusieurs réplicons

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20
Q

Qu’est-ce qu’un réplicon?

A

Un réplicon est une région d’un chromosome ou d’une molécule d’ADN qui est répliquée par une seule origine

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21
Q

combien d’origine de réplication sont requise ?

A

De multiples origines sont requises pour que les chromosomes puissent être répliqués complètement en un temps raisonnable

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22
Q

Vrai ou faux la quantité d’ADN des bactérie est plus grande que celles des eucaryotes

A

Faux c’est le contraire

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23
Q

vrai ou faux La polymérase eucaryotique synthétise l’ADN à une vitesse d’environ 50 nt/sec, soit 20 fois plus lentement que Pol III chez E. coli

A

vrai

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24
Q

vrai ou faux Dans ces conditions, la réplication d’un chromosome eucaryotique typique à partir d’une seule origine prendrait plus d’un mois

A

vrai

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25
Q

le nombre de réplicons varie selon ?

A

dépend de l’espèce et peut varier au cours de la croissance et du développement d’un eucaryote multicellulai

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26
Q

Est-ce que les zones des régions d’un chromosome ne sont pas toutes répliquées en même temps

A

vrai

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27
Q

Comment sont répliqué les régions d’un chromosome ?

A

Elles sont répliquées par groupe de 20 à 80 réplicons adjacents ( puisque trop gros)
Les différents groupes de réplicons sont activés séquentiellement au cours de la phase S jusqu’à ce que le chromosome soit complètement répliqué
Pendant ce processus, les réplicons qui ont déjà terminé leur réplication peuvent être distingués des autres

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28
Q

Pour que chaque chromosome soit entièrement répliqué durant la phase S … doivent être répliqué

A

les origines de réplication

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29
Q

Qu’est-ce qui arrive si les origines de réplication ne sont pas activées ?

A

qui ne sont pas activées sont répliquées passivement par une fourche de réplication provenant d’une origine voisine Même si certaines origines ne sont pas utilisées pour une ronde de réplication donnée, toutes les origines doivent être inactivées après leur réplication jusqu’à la prochaine ronde de division cellulaire (un X indique une origine inactivée

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30
Q

L’initation comporte combien d’étape de réplication dans le cycle cellulaire? quelles sont ces étapes

A

La sélection des origines durant la phase G1 (avant la phase S)
Cette étape mène à la formation d’un complexe préréplicatif (pré-RC) à chaque origine (sur chaque origine activé)
L’activation des origines durant la phase S
Le complexe pré-RC déjà associé à l’origine est amené à initier la réplication

31
Q

le complexe orc est composé de combien de protéine et elle s’associe avec quoi ?

A

6 et avec l’origine et elle y reste associé tout au long du cycle cellulaire

32
Q

Qu’est-ce que orc recrute?

A

recrute deux chargeurs d’hélicase, Cdc6 et Cdt1

33
Q

c’est quoi les étapes de formation du complexe pré-rc durant la phase g1?

A

1-liaison du orc avec origine
2- orc recrute recrute deux chargeurs d’hélicase, Cdc6 et Cdt1
3- le complexe Mcm2-7, qui est probablement l’hélicase fonctionnant à la fourche de réplication, est recruté

Au terme de cette étape, il n’y a ni séparation des brins, ni recrutement d’ADN polymérases

34
Q

L’activation des pré-RC durant la phase S conduit à quoi

A

l’assemblage des fourches de réplication

35
Q

Quelles sont les étapes qui suivent l’activation du complexe pré-rc

A

Les pré-RC sont activés par deux protéines kinases, Cdk et Ddk (inactives en G1)
Ces kinases phosphorylent les pré-RC et d’autres protéines de réplication, ce qui conduit à l’assemblage de protéines de réplication additionnelles (incluant les trois ADN polymérases et autres protéines nécessaires à leur recrutement et à l’initiation de la réplication). Pol  et  s’associent avant Pol /primase
Seulement une partie des protéines assemblées deviendront des composantes du réplisome Cdc6 et Cdt1 sont libérées ou dégradées

36
Q

Quelle est e role des kinases cycline-dépendante (cdks)?

A

régulent de manière stricte la formation et l’activation des pré-RC (son des chargeurs d’hélicas)

Une forte activité Cdk est requise pour activer les pré-RC existants
Une forte activité Cdk inhibe la formation de nouveaux
pré-RC

37
Q

qu’est-ce qui arrive une faible activité de csk amène sur la formation des nouvaux pré-rc

A

amène la formation de nouveaux pré-RC, mais ne permet pas d’activer l’initiation de la réplication

38
Q

Explique l’activité de CDK selon le cycle cellulaire

A

En G1, l’activité Cdk est faible; ainsi de nouveaux complexes pré-RC peuvent être formés mais ne peuvent pas être activés

Durant la phase S, la forte activité Cdk déclenche l’initiation de la réplication, mais prévient la formation de nouveaux pré-RC sur l’ADN nouvellement répliqué

39
Q

Quelles sont les étapes du processus d’assemblage des nucléosomes après la réplication de l’ADN

A

La molécule d’ADN nouvellement répliquée doit rapidement être compactée en nucléosomes

De plus, les modifications qui étaient présentes sur les histones parentales doivent être transmises aux molécules-filles pour la conservation de l’identité de la cellule

40
Q

les queues peuvent être modifiées à divers position qu’est-ce que sa engendre ?

A

Ces modifications altèrent la fonction des nucléosomes; les effets observés dépendent à la fois du site et du type de modifications

41
Q

Qu’arrive-t-il aux histones au cours de la réplication de chaque chromosome ?

A

Chaque tétramère H3-H4 est transféré au hasard sur l’un ou l’autre des chromosomes-fils
Un tétramère H3-H4 devra donc être nouvellement synthétisé sur le chromosome-fils qui n’a pas hérité d’un tétramère parental
Par contre, tous les dimères H2A-H2B sont libérés de l’ADN pour entrer dans le ‘pool’ disponible pour la formation de nouveaux nucléosomes

42
Q

Des facteurs protéiques sont requis pour assembler les nucléosomes sur les chromosomes nouvellement répliqués

A

Après le passage de la fourche de réplication, des facteurs protéiques appelés chaperones des histones escortent les tétramères H3-H4 libres (CAF-1 et RCAF) et les dimères H2A- H2B (NAP-1) vers les sites d’ADN nouvellement synthétisé
Ces facteurs transfèrent les histones à l’ADN
Pour que les facteurs CAF-1 puissent diriger l’assemblage des nucléosomes, l’ADN-cible doit être en cours de réplication. Ces facteurs s’associent avec le pcna

43
Q

Qu’est ce que la distribution des tétramères h3-h4 fait

A

la réplication facilite la propagation du profil parental des modifications d’histones

44
Q

Commment fonctione les histones

A

Les chromosomes nouvellement répliqués qui ont hérité de tétramères H3-H4 parentaux portent les mêmes modifications que les chromosomes parentaux
Ces modifications permettent le recrutement des enzymes qui ajoutent les mêmes modifications sur les tétramères nouvellement synthétisés présents sur les nucléosomes voisins

45
Q

Qu’est-ce que la transcriptase inverse ?

A

Cette enzyme possède une activité ADN polymérase dépendante de l’ARN
Cette dernière activité permet la synthèse d’ADN dans le sens 5’3’ en utilisant une matrice d’ARN avec amorce
On trouve les transcriptases réverses dans les rétrovirus, des virus eucaryotiques dont le génome est sous forme d’ARN simple-brin ( ce mute très bien)
Grâce à la transcriptase réverse, le génome des rétrovirus peut être converti en ADN double-brin

46
Q

Qu’est-ce qu’elle utilise la transcriptase inverse pour convertir le génome d’un rétrovirus

A

La transcriptase réverse utilise ses trois activités enzymatiques pour convertir le génome d’un rétrovirus en ADN double-brin

47
Q

La transcriptase réverse ne possède pas de

A

de fonction exonucléase de correction (3’5’)
Elle fait donc des erreurs
Ceci explique la capacité d’évolution très grande des rétrovirus, de même que la difficulté de mettre au point une thérapie anti-VIH efficace sur des temps assez longs

48
Q

La réplication des extrémités des chromosomes linéaires soulève une difficulté C’est quoi ?

A

La réplication des extrémités des chromosomes linéaires soulève une difficulté
L’extrémité 5’ du brin retardé ne peut pas être complètement répliquée
Pourquoi ? La dernière amorce d’ARN à l’extrémité 5’ de ce brin ne peut pas être remplacée par de l’ADN
Une solution moléculaire a été développée très tôt au cours de l’évolution pour contourner ce problème

La dernière amorce d’ARN à l’extrémité 5’ de ce brin ne peut pas être remplacée par de l’ADN : puisque L’ADN pol ajoute des brin a son extrémité 3’ oh , donc impossible d’ajouter un brin a 5’ doc il y a un gap de perte informaiton

49
Q

Qu’est-ce que sa engendre le racoursissement des télomères

A

Le racoussisement des tlomètes est prévue et il a perte d’information lorsqu perte de télomère

50
Q

Que contiennent les séquences de télomères et que sont-ils ?

A

Les extrémités des chromosomes linéaires des eucaryotes (télomères) ont des structures uniques

Les séquences des télomères contiennent de nombreuses répétitions en tandem d’une courte séquence

51
Q

Les télomères varient selon les espèces , mais possèdes un unité de répétition suit le patron de répétition

A

5’-T1-4A0-1G1-8-3’ (séquence très riche en c et g)

52
Q

Le nombre de copie de la répétition dans ADN télomérique peut varier selon

A

le tissus, l’espèces , d’un chromosome à l”autre

53
Q

que portent les télomères à leur extrémité 3’

A

À leur extrémité 3’, les télomères portent une extension simple-brin qui est riche en G

54
Q

Chez l’humain les télomères sont protégés par quoi ?

A

Par un complexe de six protéine appelé Shelterine

55
Q

Pourquoi est-il important que les extrémités des chromosomes soient ainsi coiffées ?

A

Si elles ne le sont pas, les extrémités sont identifiées comme de l’ADN endommagé et soumises à la réparation d’ADN

56
Q

Que font les bases G dans les séquences simple brin des télomères?

A

Les bases G dans les séquences simple-brin de télomères s’associent pour former des quartettes de G

57
Q

Comment la formation de quartette pourrait être formé ?

A

Puisqu’il y a plus d’un G dans une répétition, plus d’un quartette pourrait être formé si d’autres G s’associent

Les quartettes de G pourraient s’empiler les uns sur les autres d’une manière hélicale (+ que 4 répétition)

58
Q

que forment les séquences télométrique au bout du chromosome ?

A

Les séquences télomériques forment des boucles T au bout du chromosome Les séquences télomériques forment des boucles T au bout du chromosome pour protégé la séquence 3’

59
Q

Comment sont formé les boucle T

A

L’ADN simple-brin envahit la région bicaténaire, en formant une double hélice avec le brin complémentaire et en déplaçant l’autre brin

60
Q

Qu’est -ce qui facilite la formation des boucles T

A

Les protéines liées aux télomères facilitent la formation des boucles T

Les protéines TRF1 et TRF2 des complexes Shelterine induisent le repliement des télomères

61
Q

comment le problème de racourcissement des extrémités de chromosomes est solutionné?

A

par la synthèse des télomères par la télomérase

La majorité de l’ADN télomérique est synthétisé de manière normale durant la réplication de l’ADN
Cependant, les télomères peuvent être allongés par un mécanisme de synthèse indépendant qui est catalysé par la télomérase
La télomérase de Tetrahymena ajoute des répétitions en tandem de TTGGGG à l’extrémité 3’-OH de n’importe quel oligonucléotide télomérique riche en G, en l’absence de toute matrice

62
Q

La télomérase est quoi ?

A

une ribonucléoprotéine
Elle fonctionne comme une transcriptase réverse
La composante protéique de la télomérase fournit l’activité catalytique de la transcriptase réverse, tandis que la composante d’ARN sert de matrice pour chaque étape d’élongation

Les télomères sont fabriqués par la télomérase durant la phase S
Quand on réplique l’ADN on réplique aussi la séquence de télomère qui va avoir chez ADN fille

63
Q

De quel façon la télomérase synthétise l’ADN

A

de manière discontinue

64
Q

Comment la télomérase allonge le brin des télomère?

A

La télomérase n’allonge que le brin des télomères se terminant par un 3’-OH

65
Q

Qu’advient-il de l’autre brin du télomère ?

A

La télomérase ne contrôle pas le nombre de répétitions

La télomérase synthétise les répétitions individuelles qui sont ajoutées aux extrémités des chromosomes, mais ne contrôle pas leur nombre

Les protéines liant les télomères jouent ce rôle

66
Q

Comment le Modèle de la régulation de la longueur des télomères fonctionne?

A

Les protéines liant la partie bicaténaire des télomères ou les protéines les liant agissent comme inhibiteurs faibles de la télomérase vont la pousser pour sortir

Le nombre de protéines liant les télomères dépend de la longueur des télomères. Lorsque le nombre de copies est élevé, lʼextrémité 3ʼ des télomères nʼest pas accessible à la télomérase

67
Q

La drosophile et certains autres insectes n’utilisent pas la télomérase pour allonger leurs télomères, ils utilisent quoi ?

A

Chez la drosophile, deux éléments transposables sont ajoutés aux extrémités des chromosomes pour maintenir leur longueur

Chez d’autres insectes, c’est la recombinaison qui prévient le raccourcissement des chromosomes

Les insecter et virus , sont capable d’utiliser es éléments transponsable (morceau ADN. Vont venir s’installer dans les télomères , elle a un système qui dt ou s’insérer dans le télomère pourne pas que sa vienne fucl le tout )

68
Q

Vrai ou faux La longueur des télomères est en corrélation avec le veillissement chez les organismes multicellulaires

A

vrai Contrairement aux cellules germinales, les cellules somatiques des eucaryotes multicellulaires n’ont pas d’activité télomérase (ou très peu)
Les chromosomes des cellules somatiques sont graduellement raccourcis à leur extrémité, ce qui peut conduire à une perte d’information génétique après plusieurs divisions cellulaires
On pense que la perte d’activité télomérase par les cellules somatiques est la cause du viellissement chez les organismes multicellulaires
Les observations appuyant cette hypothèse sont de nature corrélative et ne démontrent pas directement que la perte d’activité télomérase entraîne le viellissement

69
Q

Quelles sont les observation qui appuie l’hypothèse que la longueur des télomères est en corrélation avec le vieillissement ?

A

Les cellules somatiques de mammifères en culture ont une durée de vie limitée. Dans des expériences avec des fibroblastes humains, une corrélation a été observée entre la longueur des télomères au début de la culture et le nombre de divisions cellulaires précédant la sénescence

Les fibroblastes prélevés sur des individus atteints de la maladie ‘progeria’ (caractérisée par le vieillissement rapide et prématuré) ont des télomères courts et leur capacité de croître en culture est réduite

Les cellules de sperme provenant de donneurs âgés de 19 à 68 ans ont des télomères dont la longueur ne fluctue pas selon l’âge

Les cellules qui acquièrent une capacité illimitée de prolifération en culture (cellules cancéreuses) possèdent une activité télomérase + active et des télomères de longueur constante

70
Q

Est-ce qu’un accroissement de la longueur de nos télomères nous apporterait une jeunesse éternelle ?

A

Une étude récente suggère qu’il serait peut-être possible de retarder la sénescence des cellules en augmentant l’activité télomérase de nos cellules

71
Q

Est-ce que les cellules cancéreuse ont une activité télomérase ?

A

80-90 % des tumeurs cancéreuses expriment une activité télomérase
Cependant, l’activité télomérase n’est pas seule responsable de la transformation d’une cellule normale en cellule cancéreuse

72
Q

Comment Chez les mammifères, l’ADN mitochondrial (15 kb) est répliqué ?

A

en formant des boucles D

73
Q

Comment la formation des boucles D fonctionne ?

A

Les origines pour répliquer les brins complémentaires ne sont pas situées au même locus et ne sont pas activées simultanément. L’origine sur le brin H est d’abord activée
Le brin L nouvellement synthétisé déplace le brin L parental, ce qui forme une boucle par déplacement ou boucle D

Après avoir parcouru une distance équivalente au 2/3 du génome, la polymérase atteint l’origine sur le brin L; la synthèse du brin H est alors amorcée
Lorsque la synthèse du brin L est complétée, celle du brin H n’est complétée qu’au tiers

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