1A - Les Biobriques Flashcards
Biobrique
Séquence d’ADN qui code pour une fonction biologique.
Ne peut être divisé en en unités fonctionnelles plus petites.
Biobrique standard
Séquence d’ADN qui respecte des normes
Partie composite
Unité fonctionnelle d’ADN qui comprend 2 parties ou plus qui sont assemblées ensemble
Assemblage
Processus que l’on va mettre en oeuvre pour associer 2 ou plusieurs biobriques ensembles.
Registry
Base de donnée qui possède des échantillons de parties biologiques spécifiques. Les échantillons sont des copies physiques des parties biologiques maintenu et propagé dans des plasmides.
Plasmides (définition général)
ADN circulaire double brin de quelques milliers de paire de base.
Anatomie plasmide dans registry
Divisé en 2 parties :
- la biobrique
- le squelette :
* Préfixe et suffixe pour contenir la biobrique
(que 4 sites de restrictions)
* Origine de réplication
* Résistance aux antibiotiques
Problème sites de restrictions et résolution problème
Génère cicatrice qui poser problème pour le fonctionnement du système synthétique. Pour créer le moins de problème sans l’enlever, on fait en sorte qu’elle code pour un linker peptidique inoffensif sérine-glycine
Plusieurs types de plasmides
Selon ce que l’on veut faire :
- assemblage
- opération
- mesure
- Transport (stockage physique dans la registry)
Exemples différents types de parties
- Promoteur
- RBS
- Terminateurs (arrêt traduction)
- Domaines protéiques (étiquette de dégradation, étiquette de signalisation, étiquette de clivage, étiquette d’affinité pour purification)
Nomenclature vecteur : pSB♯X♯
- pSB : plasmid Synthetic Biology
- Le premier chiffre (♯) correspond à l’origine de réplication
- La lettre X identifie le marqueur de résistance de l’antibiotique
- Le dernier chiffre (♯) est le numéro de la version pour différencier les implémentations faites sur un vecteur donné
- A la fin, le nom de la biobrique
