Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

molekularna genetika 2. parc. > 13. > Flashcards

13. Flashcards

1
Q

transformacija

A

prijenos DNA bez
posrednika i bez fizičkog
kontakta stanice-donora i
stanice-recipijenta
• primanje DNA iz okoline

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

transdukcija

A

prijenos DNA pomoću
bakteriofaga

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

konjugacija

A

prijenos DNA fizičkim
kontaktom stanice-donora
i stanice-recipijenta

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

što su kompetentne stanice

A

“kompetentne stanice” – stanice koje mogu primiti DNA iz okoline
• prirodna kompetentnost
• inducirana kompetentnost (laboratorijski postupci: CaCl2
,
elektroporacija; genetičko inženjerstvo)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

faze transformacije:

A

vezanje DNA na površinu stanice
• ulazak DNA u stanicu
• stabilizacija egzogene DNA
replikacija kružne DNA i ekspresija gena (plazmidi)
cirkularizacija i samostalna replikacija (linearni fragmenti)
integracija (ugradnja) egzogene DNA u bakterijski kromosom
uključuje genetičku rekombinaciju

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

vrste transdukcije

A

opća – prijenos bilo kojeg gena
(nakon litičkog puta)
• specijalizirana – uvijek se prenose isti geni
(indukcijom litičkog puta u lizogenim bakterijama)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

eksperiment transdukcije

A

donorski soj inficirati i lizirati pomoću faga
• nastalim fagima inficirati recipijentni soj
• selekcionirati transduktante

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

transducirajući fag

A

sadrži dio DNA bakterije donora

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Kako se integrira genom faga u bakterijin

A

mjesno-specifična rekombinacija između attP i attB

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

uvjeti za konjugaciju HTG

A

zahtjeva prisutnost „muških” i „ženskih” stanica
• muške stanice (donori) imaju F-faktor
• ženske stanice (recipijenti) nemaju F-faktor

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

što je F-faktor

A

omogućava konjugacijski prijenos DNA -(“fertility factor”

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

što je F-faktor

A

plazmid (F-plazmid)
• dvolančana kružna DNA
• može se samostalno replicirati i prenositi iz
stanice-donor u stanicu-recipijent
• ~100 kb (94,5 kb); 1-2 molekule u stanici;
(pravilno se nasljeđuje)
• sadrži
• ishodište replikacije – oriV (RepF1)
• ishodište prijenosa DNA – oriT
• sekvencije kojih ima i u kromosomu E.coli
• insercijske sekvencije (dvije IS3 i jednu IS2)
• transpozon Tn1000
• gene neophodne za konjugacijski prijenos DNA (geni tra)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

što sadrži F-faktor

A

ishodište replikacije – oriV (RepF1)
• ishodište prijenosa DNA – oriT
• sekvencije kojih ima i u kromosomu E.coli
• insercijske sekvencije (dvije IS3 i jednu IS2)
• transpozon Tn1000
• gene neophodne za konjugacijski prijenos DNA (geni tra)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

geni tra

A

gene neophodne za konjugacijski prijenos DNA

~25 gena koji čine 1/3 F-faktora
• uloga:
• sinteza i izgradnja F-pilusa
• kontakt između konjugirajućih stanica
• replikacija F-faktora tijekom prijenosa u stanicu -recipijent
• zbližavanje stanica i prijenos DNA
• inkompatibilnost s površinom drugih muških stanica

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

R-faktori

A

R – “resistance”)
• klinički izolati (rezistencija na antibiotike i teške metale (do 9 antibiotika i 3 metala)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

F-pilus

A

sintetiziraju ga samo stanice koje imaju F-faktor (konjugacijski plazmid)
• obično dugačak 2-3 μm

17
Q

F-pilus nakon ostvarivanja kontakta sa stanicom-recipijent

A

depolimerizacija i skraćivanje pilusa
• približavanje stanica
• stanice se “stabiliziraju” zahvaljujući proteinima na površini stanica

18
Q

Konjugacijski prijenos DNA koraci

A

počinje na oriT (cis-djelujuća sekvencija,
bogata A:T parovima baza, dugačka 100 pb)
• zasijecanje (“nikiranje”, pojava
jednolančanog loma) oriT iza 60og pb
• u stanici-donor – sinteza
komplementarnog (vodećeg) lanca
mehanizmom “kotrljajućeg kruga”
• 5’-kraj kroz pilus ulazi u stanicu recipijent
gdje se odmah sintetizira komplementarni
(zaostajući) lanac

19
Q

Opiši „Muške” i „ženske” stanice pri konjugaciji

A

ženske stanice (recipijenti)
• nemaju F-plazmid (ne sintetiziraju F-pilus)
• označavaju se kao F–
• muške stanice (donori)
• imaju F-plazmid i sintetiziraju F-pilus
• mogu biti F+
, Hfr i F’

20
Q

F + stanica

A

u njoj kromosom i samostalni F-Faktor

21
Q

Hfr stanica

A

F-faktor integriran u kromosom

22
Q

F ‘ stanica

A

kromosom samostalno a F-Faktor integriran u kromosomalnu DNA

23
Q

Kako nastaje Hfr-stanica?

A

F-plazmid sadrži insercijske sekvencije
(dvije IS3 i jednu IS2) i transpozon Tn1000
• kromosom E. coli sadrži 2 do 5 kopija
IS2 i IS3 te više Tn1000
• homolognom rekombinacijom
može nastati više različitih Hfr-sojeva

24
Q

Kako nastaje F’-stanica?

A

homolognom rekombinacijom
• „pogrešnim” izrezivanjem F-plazmida
iz genoma Hfr-stanice

stanica može biti diploid za neki alel
• jedan alel u kromosomu, a drugi na F-plzmidu
• dominantne i recesivne mutacije
• istraživanje esencijalnih gena

25
Q

Šta je Genetičko mapiranje gena

A

procjena relativnog položaja gena i njihove udaljenosti na temelju
učestalosti genetičke rekombinacije
• bliski geni češće se prenose (nasljeđuju) zajedno
• genetičke mape gena

26
Q

načini mapiranje gena prokariota

A

konjugacija
• transdukcija

27
Q

Mapiranje gena konjugacijom

A

konjugacija Hfr i F–
• količina prenesene DNA proporcionalna je trajanju konjugacije
• prijenos DNA započinje od oriT
• za prijenos cijelog genoma potrebno je oko 100 minuta

pomiješati Hfr i F– stanice
• Hfr: divlji tip (a+, b+, c+, . . . ) osjetljiv na antibiotik (npr. streptomicin)
• F–: mutant (a-, b-, c-, . . . ) rezistentan na antibiotik (npr. streptomicin)
• prekidati konjugaciju u vremenskim intervalima i nacjepljivati na podloge na kojima mogu rasti samo rekombinanti (konjuganti)
• npr.: na podlozi s antibiotikom bez triptofana može rasti samo recipijent (donor je osjetljiv na antibiotik) koji je od donora primio
gen/gene/operon za biosintezu triptofana

28
Q

Mapiranje gena transdukcijom

A

procjena udaljenosti i redoslijeda jako bliskih gena bliskih gena, koji se ne mogu točno mapirati konjugacijom
• bliski geni češće se prenose (nasljeđuju) zajedno

selekcija transduktanata na jedan od markera (a+, b+
ili c+)
• provjera genotipa transduktanata i izračunavanje udjela transduktanata koji su osim selekcioniranog naslijedili i neselekcionirane markere (samo jedan ili oba)
• u slučaju prikazanog redoslijeda gena i ako su transduktanti selekcionirani kao a+, manje vjerojatni događaj bi bio transduktant genotipa a+ b– c+ jer su za to potrebne 4 recipročne izmjene

molekularna genetika 2. parc. (7 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions