שיעור 12 Flashcards
Bence Jones proteins
חלבונים שמופרשים לשתן ויוצרים נקודות התרככות של העצמות, בהמשך קישרו בין החלבונים הללו לסרטן הדם של תאי B
מסתבר שחלבונים אלה הם השרשראות הקלות של הנוגדנים
השרשרת הקלה של נוגדן יכולה להיות אחת מהשתיים: קאפה או למדה (השמות על שם החוקרים שמצאו את הקשר בין החלבונים הללו לבין סרטן הדם)
אם מריצים דוגמאות מהסרום או מהפלזמה בגל נטיבי (הפרדה על פי גודל ללא דנטורציה) רואים שהחלבון הדומיננטי ביותר בסרום הוא
אלבומין
כמו כן יש גן אלפא בטא וגמא גלובולינים שהם חלבוני גלובולין (שבהם נכללים הנוגדנים)
הבדל בהרצה בג’ל בין סרום של אדם חולה בסרטן הדם לבין אדם בריא
ניתן לראות שאצל אדם בריא הסימון של גמא גלובולין (IgG) הוא מאוד מרווח, כלומר אין מופע חד של החלבון, מה שמעיד על רב גוניות מאוד גדולה של הנוגדנים
לעומת זאת לאדם שחולה בסרטן הדם מופיע בנד מאוד חד כלומר הרב גוניות
שנצפתה בסרום הנורמלי מתכנסת לרב גוניות מצומצמת בקרב חולים
bi-valent
היכולת לקשור שני אפיטופים בו זמנית. לפני ביקוע היכולת של נוגדן לקשור אתר מטרה בפורמט המונומרי שלו היא bi valent
N-terminus
החלק הוריאבילי של הנוגדן
גליקוזילציה של נוגדנים
נוגדנים עוברים גליקוזילציה מה שמאוד חשוב לפונקציה של הנוגדן
אחרי התרגום יש הוספה של שיירים סוגריים שמתווספים לאזור הCh2
החיבור קורה באתר הN linked glycosylation של הנוגדן
הסוכר שנוסף מאוד חשוב לפונקציה של הנוגדן ובעיקר לפעילות הביולוגית של הנוגדן
ללא האזור הזה הeffector function שלו יורד
חשיבות נוספת: הסוכר הידרופילי כך שהוא מעלה את המסיסות של הנוגדן . לכן במקום שהנוגדנים ישקעו הם יותר מסיסים בנוזל הדם מה שמקל על תנועתם
ציסטאינים בנוגדן
אם נעבור על העמדות של הציסטאינים גם בשרשרת הקלה וגם בכבדה נראה שהמרחק בין הם הוא בערך 60 חומצות אמינו
וזה מייצר לופים בנוגדן
הלופ הזה נקרא Ig דומיין
Ig domain
הלופ שנוצר בנוגדן כתוצאה מקישור 2 ציסטאינים
Hinge
מה שמפריד בין הFAB לבין ה FC
Immunoglobulin fold
ייצוב הלולאה על ידי קשר דיסולפידי ויצירה של שתי וערב בתוך הIg דומיין עצמו
קיפול מיוחד שקשה לתאר כאן אהל ייחודי למולקולות במערכת החיסון
מבנה מאוד יציב
מדובר בחביות בטא שמחוברות שתי וערב או משהו כזה
immunoglobulin superfamily
משפחה דל מולקולות שכולם מכילות את ה immunoglobulin domain שזה הIg דומיין .
HV - Hyper variable
אזורים בשרשראות הנוגדנים המכונים אזורים חמים - אזורים בהם יש רב גוניות גדולה
נקרא גם CDR
Frame work
האזור עם פחות גיוון בשרשרת (קלה או כבדה)
גם בקלה וגם בכבדה יש 4 אזורי FW ו3 אזורי HV
הHV הוא האוזר המחברים בין הבטא שיטס שדיברנו עליהם קודם
והFR מייצב סטרוקטורלית ומאפשר את השינוי בHV ללא פגיעה בפונקציונליות
יש שני אלמנטים מרכזיים שמייצרים את האינטראקציה החזקה בין הנוגדן לאנטיגן
- הרכב חומצות האמינו - האינטראקציות הכימיות שיחזקו את הקשר
- מורפולוגיה - איך הטופוגרפיה של אזור הקישור תראה
איזוטיפ הנוגדן נקבע אך ורק על ידי השרשרת הכבדה
J chain
פפטיד היודע לייצר קשרים דיסולפידיים נוספים בין שתי יחידות בסיס
יש את זה בנוגדני igA וIgM