10- La traduction de l'ARN et le code génétique Flashcards
Combien existe-t-il de combinaisons possibles de nucléotides entre l’anticodon de ARNt et le codon de l’ARNm?
444=64 combinaisons possibles.
Quels sont les 3 codons stop?
UAA
UAG
UGA
Combien de codons codent pour des acides aminés?
61
Vrai ou Faux. Plusieurs acides aminés sont codés par plus d’un codon.
Vrai. On peut donc dire que le code génétique est dégénéré.
Nommez les AA aillant 1 codon.
Met, Trp
Nommez les AA aillant 6 codons
Arg, Leu, Ser
Nommez les AA aillant 4 codons
Val, Pro, Thr, Ala, Gly
Nommez les AA aillant 3 codons
Ile
Nommez les AA aillant 2 codons
Phe, Tyr, His, Gln, Asn, Lys, Asp, Glu, Cys
Vrai ou Faux. Les 5 acides aminées qui sont encodés par 4 codons sont 2 fois dégénérés.
Faux. Ils sont 4 fois dégénérés.
Vrai ou Faux. Lorsque les 2 premiers nucléotides sont identiques, le 3e peut souvent être n’importe lequel.
Vrai pour des acides aminés codant pour 4 codons.
Faux pour des AA codant pour 1,2,3 ou 6 codons.
Que sont les acides aminés codants pour les codons où il y a une pyrimidine (C ou U) en 2e position?
Hydrophobes, sauf pour la sérine et la théonine
Dans la plupart des cas, quand une purine (____, ____) est en position 2 sur le codon, les acides aminés seront ____.
(A, G)
polaires
Comment peut-il y avoir 40 ARNt pour 61 codons seulement?
Il n’y a pas assez d’ARNt pour tous les codons. Ainsi, l’hypothèse émise est l’ appariement bancal.
Pourquoi est-ce la base 34 qui subit l’appariement bancal et pas les bases 35 ou 36?
Car les bases 35 et 36 sont emprisonnées. En effet, il y a un empilement de bases de 34 à 37. C’est pourquoi la base 34 tolère mieux l’appariement bancal.
- La base 34 a ainsi plus de liberté dans l’espace.
- Elle peut lier le même ARNt avec des codons différents.
Décrivez l’appariement canonique (Watson-Crick)
- Entre les paires de bases en position 35 et 36 de l’ARNt et le codon de l’ARNm
- Pyrimidine avec une purine (U+A, A+U, C+G ou G+C)
Décrivez l’appariement non-canonique (appariement bancal)
- Interactions entre nucléotides distinct des appariements de base classique de type Watson-Crick
- Seulement pour la base en position 34.
Nommez les appariements possibles selon le concept de l’appariement bancal. (5 possibilités)
G avec U ou C
C avec G
A avec U
U avec A ou G
I avec A, U ou C
Vrai ou Faux. Les appariement tolérés dans le modèle bancal sont ceux qui conservent une distance entre deux riboses similaire à celle existant dans les appariement standards.
vrai
Vrai ou Faux. L’inosine n’est pas seulement présente dans l’ARNt.
faux
Comment se forme une inosine?
- Par désamination de l’adénine par l’ADAR.
- Modification post-transcriptionnelle.
Avec quel acide aminé est ce que l’inosine ne peut pas s’apparier ?
avec la guanine
Vrai ou Faux. Grâce à l’inosine en première position de l’anticodon, un seul ARNt peut lier 3 codons différents.
vrai
La base 34 correspond à la ____e position de l’anticodon (5’ vers 3’). La base 34 correspond à la ____e position du codon (5’ vers 3’).
1e
3e
Donnez tous les types d’appariement bancal. Pourquoi ces appariements sont tolérés?
Ces appariements sont tolérés, car ils conservent la même distance qu’un appariement A:U ou G : C
U:G
U:A
I:C I:U I:A G:C
Expliquez l’empilement aromatique des nucléotides.
- Les bases 35 et 36 sont toutes deux encadrées par 37 et 34. Elles ont moins de liberté.
- La base 34 en 5’ tolère mieux l’appariement bancal puisqu’elle n’est pas encadrée.
Nommez les trois règles gouvernant le code génétique.
- Les codons sont lus de l’extrémité 5’ vers 3’.
- Les codons ne se chevauchent pas et le message ne contient aucun espace.
- Le message est traduit dans un cadre de lecture fixe imposé par le codon d’initiation et la fin est imposée par le codon stop.
Nommez les trois types de mutations ponctuelles qui altèrent le code génétique.
- Faux sens
- Non sens (stop)
- Par décalage du code de lecture
Décrire ce qu’est un faux sens + nommez exemple
changement d’un AA pour un autre. Ex. Anémie falciforme
Décrire ce qu’est un non sens (stop)
Création d’un codon de terminaison (ARNm dégradé).
Décrire ce qu’est un décalage du code de lecture
Délétion ou insertion de bases. Si on ajoute 3 bases, il n’y a pas tant de problème, parce qu’on va avoir un AA de plus qui n’est généralement pas trop problématique. Mais quand on ajoute 1 ou 2 bases, ça décale le cadre de lecture.
Vrai ou Faux. La mutation silencieuse ne modifie pas l’acide aminé qui sera ultimement ajouté dans la protéine.
Vrai. Les bases modifiés ne changent pas l’AA qui sera ajouté.
Vrai ou Faux. Le code génétique est presque universel.
vrai
Vrai ou Faux. La traduction est un des processus les plus conservés parmi les organismes et les plus coûteux en énergie pour la cellule.
Vrai. Jusqu’à 80% de l’énergie cellulaire des bactéries en croissance est consacrée à la synthèse des protéines.
À quoi servent les aminoacyl-ARNt synthétases?
À charger le bon AA sur les ARNt spécifiques à un codon.
Vrai ou Faux. Il y a beaucoup moins d’aminoacyl-ARNt synthétases qu’il y a d’acides aminés.
Faux. Il y en a autant parce qu’ils sont spécifiques à chaque AA (20 AA, donc 20 aminoacyl-ARNt synthétase).
Décrivez l’acteur principal de la traduction.
Le ribosome est une machinerie de plusieurs MDa. Il est composé de protéines et d’ARN.
Rôles des ribosomes
- Place l’ARNm au bon endroit et place par le fait même l’ARNt au bon endroit. On peut dire qu’il coordonne la reconnaissance de l’ARNm par chaque ARNt.
- Catalyse la formation des liens peptidiques.
Qu’est-ce que le cadre de lecture ouvert?
C’est une partie d’un cadre de lecture susceptible d’être traduit en protéine ou en peptide. C’est une suite de codons comprenant le codon start et le codons stop, généralement UAA, UAG ou UGA.
Vrai ou Faux. Chez les eucaryotes, le cadre de lecture ouvert mène à la formation d’un polypeptide.
Faux. C’est chez les procaryotes! Chez les eucaryotes, il peut y avoir plus d’une protéine par ARNm.
Vrai ou Faux. Les codons ne se chevauchent pas.
Vrai
Le codon d’initiation 5’-AUG-3’ code pour quel AA?
La méthionine.
En absence d’un codon d’initiation, ____ cadres de lecture sont possibles.
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