שחזור פילוגנטי Flashcards
פילוגנזה
מדע שמשמחזר את היחסים בין ארגניזמים.
סיסטמטיקה
התחום שחוקר גיוון- דיפרטיפיקציה של אורגניזמים, כיום ובעבר, גם של מובנים. מנסה להבין איך הם מתפזלים. תהליך התפצלות כולל גנטיקה של אוכלוסייב והיברידיזציה וכל הרמות בתוך הגנום.
taxonomy
מחקר שמתעסק באיך לתת שמות לאורגניזמים.
הראשון שעשה הוא לינאוס. היה דתי וחשב שהסדר יעזור להבין את אלוהם. הוא שינה את שם מי תאור של החייה לשתי מילים. הראשון הגנוס( הסוג- באלכסון עם אות גדולה ראשון) והשני זה השם של הסוג הספציפי( תמיד מתחיל באות קטנה וזה נקראה גם epithet)
הרמות של הטקסונומי
1) ממלכה
2) מערכה
3) מחלקה
4) סדרה
5) משפחה
6) סוג
7) מין
a taxonomic unit at any level of the hierarchy is called a taxon.
קלסיפיקציה בעבר ואז לםי דארווין
בעבק לינאוס עשה את זה לפי תכונות משותפת שנתנו לכל הרמות. לדוגמה מאפיין של משפחה של פרחים זה כול הפרחים בצורת סירה. אבל דארווין הביא את הרעיון של סלקציה, וכך שאם יש להם דברים דומים אז הם כנראה באים מי אב קודמו משותף.
עצים פילוגנטיים
החלק מסוף זה עלים, והקשרים בדרך זה ענפים, והשושלת הקדמונית היא השורש.
a node is where lineages diverge.
התפצלות יותר ימינית היא יותר חדשה מפחינת זמן.
ענפיים יכולים להסתובב וזה היה אותו עץ.
העץ תלוי במה שהחוקר שם בו.
פוליטומי
לא יודעים מי יותר קרוב למי
מה ניתן ולא ניתן ללמוד מעצים פילוגנטיים
לא ניתן:
1) עצים פילוגנטיים מראים תבנית של שושלות אך הם לא נותנים אינפורמצחה על דמיון מורפולוגי
2) עצים פילוגנטיים לא מצבעים על הזמן הו מינים מתפתחים או כמ שינוים קורים בשושולת (בענף אחד)
3) אסור להניח כי מין מתפצל ממה שקרוב אליו בציור.
מה כן ניתן:
1) הם היפותזות, לא יודעים אם הם נכונות לגמרי
2) אפשר להשוות עצים כדי להחליט מה יותר סביר ביחס להיפותזות אחרות.
איך עושים עצים פילוגנטיים
מחפשים מאפיינים כדי לעשות קלסיפיקציה. יכולים להיות מולוקולריים, אוקולוגיים אך התכונה שלהם היא שהולם צריכים להיות הומולוגי.
מכינים טבלה של התכונות עם 0 ו1 כאשר 1 זה שיש לו את התכונה.
הרוב היום מתבססות על מאפיינים מולקולריים.
*חשוב לזכור את הדוגמה של הדבים ושל הציפורים.
כל מה שמיוחד מהטבלה לפרט אחד לא מעניין. אם יש קונפליקטים אז משתמשים בשיטת הקלדיסטית.
homology
מאפיין קדומוני
לדוגמה להשוות בין יד של בן אדם לכנף של ציפור לסנפיר של כלב ים. הם כולם עושים אותו דבר, אי אפשר להשוות אותם לדוגמה עם כנף של זבוב
two structures are considered homologous when they are inherited from a common ancestor which possessed the structure.
אנולגי
תכונות שלא באים מאותו מקור ואין להם אותן תכונות. אי אפשר להשוות ביניהם.
השיטה הקלדיסטית
חסרונות והיתרונות
משתמשים כדי לשחזר את הקשר האבולוציוני. שיטה של הינג. שיטה רק למאפיינים מורפולוגיים. מתשמתשים לדוגמא על מובנים.
שמה אורגוניזמים על בסיס ירידת נפיצות. מחפש אורגניזמים עם אב קודמון משותף.
התרונות: לכל הקבוצות אמור להיות סינפומרפי, אמורה להסיר אי הסכמה של קונפליקטים על ידי חזרה אחורה.
חסרונות: קשה למצוא מאפיינים, קשה להבדיל מין מאפיינים קדמונים וחדשניים, הבדיקה לא תמיד אובייקטיביות.
clade
קבוצה מונופילטית, יש להם אב קדמון משותף.
paraphyletic
קבוצה לא מונופילטיות,קבוצה פרפילטיות. היא כוללת רק חלק מי הצעצים של האב קודמון המשותף.
polyphyletic
קבוצה ששמה יחד אורגניזמים שבאות משושולות אבולוציוניות שונות.