הגרעין והכרומוזומים

Question 1

הטרוכרומטין

Answer 1

כרומטין דחוס

Question 2

אאוכרומטין

Answer 2

כרומטין פתוח

Question 3

לאיזה סוג כרומטין נקשרת הלמינה הגרעינית?

Answer 3

להטרוכומטין

דוחס את הכרומוזומים

Question 4

איזה זנבות של היסטוני הליבה עושים אינטראקציה עם הדנ”א?

Answer 4

זנבות אמיניים
עשירים בח”א חיוביות
(ליזין, ארגינין)

Question 5

איזה חלבונים נמצאים על הנוקליאוזום?

Answer 5

היסטוני הליבה
היסטון H1
חלבוני SMC=
שהם ATPase

Question 6

מי זה
קלציניורין
ואיפה ומתי הוא פועל?

Answer 6

בשפעול תאי T
קלציניורין הוא פוספטאז 
משופעל ע"י ריכוז יוני סידן גבוה
הוא מסיר את הזרמן 
מ- NFAT
ובכך חוסם את שייר ה-NES
נחשף סיגנל NLS
והוא משפעל שעתוק גנים

Question 7

האם יש רק סיגנל
NLS
אחד?

Answer 7

לא
יש מגוון רחב של חלבוני אימפורטין שמזהים סיגנלי 
NLS
שונים
המשותף לכולם הוא ריבוי ח"א חיוביות

Question 8

מה הוא קצב העברת המול’ ב-NPC?

Answer 8

עד 1000 מול’ בשניה

Question 9

האם היסטונים צריך סיגנל

NLS?

Answer 9

כן…

רק חלבונים מתחת ל-40 קילודלתון יכולים להכנס בלי

Question 10

מה זה
SHEDDING
ומי פועל בתהליך כזה?

Answer 10

כאשר אזור שפונה לציטוזול משתחרר אליו
למשל:
פקטור השעתוק SREBP
פוגש פרוטאז בגולג’י שמשחרר אותו והוא נודד לגרעין

Question 11

מה הפואנטה של שיטת
3C
?

Answer 11

אפשר לראות שם את המבנה של כרומטידות באופן של לולאות כך שאזורים מרוחקים יחסית מבחינת רצף, מתקרבים זה לזה.

Question 12

מה הפואנטה של שיטת

FRET?

Answer 12

לראות אם חלבונים נמצאים קרובים אחד לשני

בתהליך זה, הכרומופור התורם (donor), מעורר על ידי בליעת אור (פוטון) לרמת אנרגיה גבוהה יותר, אך אינו פולט אור. במקום זאת, מתקיים מעבר אנרגיה באמצעות צימוד דיפול דיפול אל רמת העירור בכרומופור המקבל (acceptor). כתוצאה מכך, המקבל פולט אור (פלואורסצנציה).

היעילות של העברת אנרגיה זו עומדת ביחס הפוך לחזקה ה-6 של המרחק בין התורם למקבל, מה שהופך את FRET לתהליך רגיש מאוד לשינויים קטנים במרחק.

Question 13

מה הפואנטה של שיטת
פוטובליצ’ינג
?

Answer 13

מדידת קצב הדיפוזיה הלתרליתשל פוספוליפידים ע”ג הממברנה

Question 14

באיזה שלב מייצרים את ההיסטונים?

Answer 14

שלב S

מייצר אותם סמוך לשכפול

Question 15

האם יכול להיות שכפול ושעתוק בו”ז?

Answer 15

כן
אין מניעה…
סיכוי נמוך שהם יתחרו על אותו אתר.

Question 16

לאיזה היסטון יש אפיניות גבוהה יותר לדנ”א?

Answer 16

H3+H4

Question 17

איזה היסטון קדום אבולוציונית יותר?

Answer 17

H3+H4
בחיידקים אין היסטונים
אבל בארכיאה יש והם 
histone like
הומולוגיים ל
H3-H4

Question 18

מי הזוגות של ההיסטונים?

Answer 18

H3-H4

H2A-H2B

Question 19

האם היסטונים הם חלבונים מזהי רצף?

Answer 19

לא.. אין להם רצף מסוים 
שהם אפיניים אליו
אבל יש להם העדפה קלה לדינוקליאוטידים מסוג AT
AA\AT\TT
מעדיפים לקשור אותם דרך התעלה הקטנה

Question 20

דרך איזו תעלה ההיסטון נקשר?

Answer 20

התעלה הקטנה

נקשר לשלד

Question 21

במולקולרית:
מה זה קומפלקס CRC?
מה הוא עושה?
תני שם של CRC מפורסם

Answer 21

chromatin remodeling complex
הוא עוזר לנוקליאוזומים לעשות סליידינג
דרוש ATP!!!
הכי מפורסם: SWS-NF

Question 22

איזנה כוחות צריך לנתק כדי להזיז נוקליאוזומים?

Answer 22

אינטרקציות אלקטרוסטטיות

Question 23

כל כמה זמן מתרחש תהליך החלפת נוקליאוזומים (החלפת חלבון\ היסטון\ הנוקליאוסום כולו)?

Answer 23

נפוץ
מחליפים את כל ההיסטונים בגנום כל שעתיים
(לא ברור למה)
אבל זה לא אומר שמייצרים מחדש

Question 24

איזה חלבונים מסייעים בתהליך החלפת נוקליאוזומים (החלפת חלבון\ היסטון\ הנוקליאוסום כולו)?

Answer 24

CRC
chromatin remodeling complex

histone chaperons

Question 25

האם בהכרח כל ה histone chaperons מתשמשים ב-ATP?

Answer 25

לא תמיד..

Question 26

האם היסטון H1 | עושה אינטראקציה עם הדנ"א?

Answer 26

כן! | כחלק מההיסטונים.

Question 27

האם ההיסטון H1 | עובר מודיפיקציות כלשהן?

Answer 27

``` כמעט ולא אבל כן ראינו למשל שהאנזים PKA יודע לזרחן אותו ```

Question 28

מי ההיסטון הכי גדול מבין ההיסטונים?

Answer 28

H1

Question 29

האם היסטון H1 | עושה אינטרקציה ישירה עם היסטוני הליבה?

Answer 29

לא

Question 30

האם להיסטון H1 | יש מוטיב היסטון?

Answer 30

כן | ואפילו פעמים כי הוא גדול

Question 31

מי אחראי ליצירת הסיב 30 ננומטר? ואיך נראה הסיב?

Answer 31

``` מראה זיגזג היסטון H1 יוצר הצלבה (לכן הוא בעיקר) אבל גם ההיסטונים (בעיקר H3+H4) מעורבים באינטרקציה ```

Question 32

באיזה מצב נמצא רוב הכרומטין בגרעין? הטרו\ אאו האם זה דינמי?

Answer 32

``` 90% מהכרומטין במצב של אאוכרומטין = מצב פתוח, קל לשעתק 10% מהכרומטין במצב של הטרוכרומטין דחיסה גבוהה, לא אמור לבטא גנים. כמובן שזה כן דינמי, יכול להיות תלוי בסיגנלים ```

Question 33

אילו אזורים בגנום הם הטרוכרומטין מוחלט?

Answer 33

צנטרומרים טלומרים לא משועתקים, סגורים לחלוטין ומכילים כמויות של חלבונים שדוחסים אותם

Question 34

האם דגם הורשת האאו'\ הטרו כרומטין הוא מורש?

Answer 34

כן התאים יודעים להוריש לתאי הבת שלהם את ה PATTERN של

Question 35

מה זה | position effect?

Answer 35

כאשר ההטרוכרומטין, כמו מגיפה משתלט על אאו'

Question 36

מה זה | position effect varigation?

Answer 36

כאשר המודיפיקציות של הכרומטין מורשות לדור הבא

Question 37

האם האאו' יכול להדביק הטרוכרומטין?

Answer 37

לפי הספר לא.. | גם להיות הטרוכרומטין דורש חלבונים ומודיפיקציות

Question 38

איפה נמצא המידע לרצף להיות אאוכרומטין?

Answer 38

לפי מיקומו ברצף

Question 39

על אילו ח"א אפשר לעשות זרחון כחלק מהמודיפיקציות בזנבות ההיסטונים?

Answer 39

סרין ותראונין | אבל לא על טירוזין!!!

Question 40

האם אפשר | לעשות זרחון על טירוזין כחלק מהמודיפיקציות בזנבות ים?ההיסטונים?

Answer 40

לא | רק על סרין ותראונין

Question 41

איפה בהיסטון אפשר לעשות מודיפיקציות?

Answer 41

הרבה אפשרויות על הזנב של ההיסטון = יש הרבה וריאביוליות נדיר אבל אפשרי = מודיפיקציות על ליבת ההיסטון

Question 42

לאילו היסטוני ליבה יש ואריאנטים?

Answer 42

H3 H2 ׂ H4- אין לו!!!

Question 43

לאיזה היסטון ליבה אין ואריאנטים?

Answer 43

H4

Question 44

איזה ואריאנטים יש להיסטון H3?

Answer 44

H3 H3.3 CENP-A

Question 45

מה עושה H3.3?

Answer 45

``` ואריאנט של H3 הוא: ימצא באאוכרומטין ויגביר שעתוק (למשל בגנים שמשועתקים כל הזמן... כמו house keeping genes) ```

Question 46

מה עושה CENP-A?

Answer 46

``` ואריאנט של H3 הוא: מזכיר את שמו CENP=CENTROMERE נמצא בצנטרומר אחראי על תפקודו ועל הרכבת הקינטוכור ```

Question 47

איזה ואריאנטים יש ל-H2?

Answer 47

H2AX H2AZ macroH2A

Question 48

מה עושה macroH2A?

Answer 48

``` השתקת שעתוק, השתקת כרומוזום X (למדנו שיש lnc ששמו Xist נודד ומדביק X לא פעיל ובעצם הוא מגביר חלבונים כמו macroH2A) ```