Транслация Flashcards

1
Q

Какво представлява транслацията? Как се осъществява най-просто процеса?

A

Процес на синтез на белтък върху молекула иРНК. Осъществява се чрез разпознаване на кодоните иРНК от антикодоните на аминоацил-тРНК.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Защо механизмът на протичането на транслацията е толкова усложнен? Каква ключова характеристика/функция спомага за същетаването на двата процеса?

A

Липса на структурно сходство между нуклеотидната структура на иРНК и полипептидната на белтъка. За съчетаването им в хода на транслацията задължително са необходими адапторните функции на тРНК.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Кои са основните необходими фактори за протичане на транслацията?

A

иРНК матрица; 20 алфа-аминокиселини; тРНК;

Рибозоми; Ензими; Регулаторни белтъци; АТФ/ГТФ

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

В каква посока се движи рибозомата по дължината на матричната иРНК-молекула в процеса на транслация? Какво е характерно за свързването на иРНК с рибозомата?

A

Посока 5‘-3‘ и превежда полинуклеотидната последователност в полипептидната верига посредством адапторната тРНК. Свързването е обратимо и изисква определена концентрация на Mg2+.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Къде се разполага иРНК спрямо рибозомата? Колко иРНК-нуклеотида се поместват?

A

В една бразда на рибозомната повърхност на границата между двете субединици, като се поместват около 35 иРНК-нуклеотида.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Какво се случва с 3’-края на тРНК след процеса на транскрипцията?

A

Присъединява последователността ЦЦА и се подменят около 10% от нормалните бази с минорни;

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Къде се свързва пренасяната АК и чрез каква връзка в процеса на транслация? Между кои групи възника връзката? Кой комплекс се образува ?

A

Към 3‘ чрез ковалентна естерна (аминоацилна) връзка, която възниква между СО- на АК и рибозата на последния А нуклеотид на 3‘-края на тРНК с участие на енергия от АТФ; Образува се комплексът аминоацил-тРНК

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Кое позволява на някои АК да се пренасят от повече тРНК?

A

Изродеността (синонимността) на генетичния код

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

От какво са играздени рибозомите?

A

Немембранни органели, к-си от рРНК и белтъци; малка и голяма субединица.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Какво е характерно за рибозомите при прокариоти? Колко е коефициентът на седиментация? Какво е съотношението между рРНК и разнообразните белтъци?

A

Коефициент на седиментация 70S, като голяма субединица 50S (5S, 23S, рРНК + 34 БМ) и малка субединица 30S (16S рРНК+21 БМ) общо съотношение 60% рРНК и 40% белтък;

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Какво е характерно за рибозомите при еукариоти? Колко е коефициентът на седиментация? Какво е съотношението между рРНК и разнообразните белтъци?

A

Коефициент на седиментация 80S, голяма субединица 60S (5S, 5,8S 28S рРНК + 49 БМ), малка
40S (18S рРНК + 33 БМ), съотношение 50% рРНК и 50% белтък

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Как са разположени рибозомите в клетката? Как могат да съществуват рибозомите? Какво се случва с мембранните рибозоми при токсично увредени или раково трансформирани клетки? А какво се случва с броят на свободните?

A

Поединично или по повече на брой върху една молекула иРНК-полирибозомен комплекс. Свободно в цитоплазмата или прикрепени към вътреклетъчните мембрани. Мембранните рибозоми намаляват. При канцерогенезата се увеличава броят на свободните рибозоми.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Коя е структурата към която са свързани рибозомните частици в хода на транслацията?

A

При прокариоти-иРНК, а при еукариотите-мембраните на едноплазматичния ретикулум.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Кои са 2та участъка, които се оформят на рибозомната повърхност? Какво се осъществява в тези функционални участъци и какво е характерно за тях?

A

А-участък (акцепторен, аминоацилов)-постъпва всяка новопристигаща тРНК, носеща АК;
П-участък (донорен, пептидилов)-отделя се всяка тРНК, която вече е предала своята АК към нарастващия полипептид:Осъществява се кодон-антикодоновата връзка между иРНК и тРНК при транслацията.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Къде постъпва първата тРНК, носеща началната АК при транслацията?

A

Директно в П-участъка.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Какво е характерно за митохондриалните и хлоропластичните рибозоми?

A

Те притежават собствени рибозоми (70S), които осъществяват собствен белтъчен синтез.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Кои са 2 от ключовите ензими на транслацията?

A

Аминоацил-тРНК-синтетаза и Пептидилтрансфераза

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Какво е характерно за Аминоацил-тРНК-синтетазите? Пример за силата и спечифичността на ензима. Какво се предполага относно силата на синтетазите? Определено количеството на кои йони изискват за действието си синтетазите?

A

Извършват свързването на АК със съответните им тРНК. Всяка АК има своя собствена аминоацил-тРНК-синтетаза. Синтетазата, присъединяваща изолевцин към неговата тРНК има 100 пъти по-силен афинитет към него, отколкото към валин. Те разпознават малки разлики в пространствения строеж на тРНК. Магнезий

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Какво е характерно за пептидилтрансферазата? Какво всъщност представлява ензима структурно? Къде се разполага и коя е ензимната част?

A

Осъществява пептидната връзка между АК в синтезиращия се полипептид при участие на енергия. Комплкес от белтъци и 23S рРНК и съотверно 28S рРНК при еукариотите. В голямата субединица, ензимната функция се изпълнява от самата 23S рРНК или 28S рРНК (рибозим).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Кои са някои от регулаторните белтъци, които подпомагат протичането на отделните етапи от транслацията?

A
  • иницииращи фактори; IF1 до IF6;
  • елонгиращи фактори; EF-Tu и EF-G (транслоказа);
  • терминиращи фактори; RF1,2,3 при прокариоти и eRF при еукариоти;
21
Q

В колко етапа протича транслацията?

A

2-хиалоплазмен и рибозомален;

22
Q

Какво е характерно за хиалоплазмения етап на транслацията? В колко стадия протича той? Кой е основния действащ ензим? Необходима ли е АТФ/ГТФ енергия?

A

Свободните АК в келтката се активират от енергията на АТФ и се свързват със съответните им тРНК; В 2 стадия:
1-Активиране на –СООН групата на АК при свързване с АТФ до аминоациладенилат, в който се включва макроенергията. Процестът се катализира от аминоацил-тРНК-синтетазата задължително при определена концентрация на Mg 2+;
2.Прехвърляне на активирана АК (аминоациладенилата) върху специфична за нея тРНК-адаптор, при участие на аминоацил-тРНК-синтетазата. Получава се аминоацил-тРНК.

23
Q

В какъв вид всяка АК може да се включи в белтъчния синтез?

A

След получаване на аминоацил-тРНК.

24
Q

С какво се обособява стадия на инициация на рибозомалния етап на транслацията, освен че е начален? Кои са необходими фактори за протичането?

A

Двете рибозомни субединици; Молекула иРНК; Формилметионин-тРНК при прокариоти; Иницииращи фактори IL1,2, 3 ГТФ като източник на енергия;

25
Q

Какво се случва с рибозомата в стадия на инициация на рибозомалния етап на транслацията?

A

Разпада се на двете си субчасти 50S и 30S при участие на белтъчен иницииращ фактор IF 3

26
Q

Какво се случва с малката субединица на рибозомата в началото на инициацията? Какво се случва с иРНК? Коя част от иРНК е ключова за еукариотите?

A

Осъществява с молекулата на иРНК благодарение на иницииращия фактор IF 3; иРНК разполага своя кодон в нейния П-участък, като в това разпознаване играе огромна роля шапката на иРНК при еукариотите;

27
Q

Какво е значението на иницииращия фактор IF 3 в стадия на инициация на рибозомалния етап от транслацията?

A

разделя рибозомата на 2те ѝ субединици; Осъществява се контакт на 30S малката субединица с иРНК;

28
Q

С кой антикодон формилметиониновата-тРНК се присъединява към кодона на иРНК? А кой е кодона на иРНК? Какво стабилизира връзката кодон-антикодон? Кой комплекс се формира? Какво е значението на иницииращия фактор IF 1?

A

УАЦ-антикодон към кодона АУГ на иРНК;
От енергията на ГТФ, който се явява като кофактор на белтъчния фактор IF 2; Инициаторния комплекс иРНК+30S рибозома+ф-мет-тРНК. Факторът IF 1 в този процес има стабилизираща функция и значение за отстраняването на ГДФ и заместването му отново с ГТФ.

29
Q

Къде постъпва началната формилметионинова-тРНК? Каква е специфичната функционална способност на формилметиониновата-тРНК? На какво се основава тази способност?

A

В П-рибозомния участък. Разпознава точно стартовия АУГ кодон. Неговото различаване от е възможно поради близостта му до една специфична нуклеотидна последователност на Шайн-Далгарно.

30
Q

Къде се намира нуклеотидната последователност на Шайн-Далгарно? Защо е ключова? Къде може да бъде открита?

A

Близо до 5‘-края на кодиращата област на траснлацията. Тази последователност улеснява свързването на иРНК към 16S рРНК на малката рибозомна субединица ,така че стартовия кодон да е в подходяща позиция спрямо рибозомата. Еукариотите НЕ съдържат последователността Шайн-Далгарно.

31
Q

Кои други последователности освен (АУГ) тРНК при прокариотите може да разпознава?

A

В редки случаи кодоните ГУГ и УУГ.

32
Q

Какво се присъединява към инициаторния комлекс (иРНК+30S рибозома+ф-мет-тРНК)?

A

Голямата рибозомна субединица и едновременно с това се отстраняват и 3те иницииращи белтъчни фактора IF 1,2,3, както и ГДФ.

33
Q

С какво се характеризира елонгацията при процеса транслация?

A

Постепенно нарастване на синтезиращата се полипептидна верига, като това винаги става с нейния –Nh2 край чрез присъединяване на АК към –СООН края ѝ.

34
Q

Какво се случва в края на инициацият с П-участъка и А-участъка?

A

В края на инициацията Р-участъкът е зает от фенилметионин-тРНК докато А-участъкът е свободен и в него се разполага втория кодон на иРНК, следващ след кодона АУГ.

35
Q

Какво постъпва в А-участъка на рибозомата в стадия на елонгация при транслацията? С какво се поспомага връзката кодон-антикодон?

A

Втората поредна АК, носена от нейната тРНК (АК2-тРНК). Кодон-антикодоновата връзка към иРНК става за сметка на енергия от ГТФ, който е кофактор на елонгиращия белтък EF-Tu

36
Q

Каква връзка се формира между формилметионина и АК2 и кой ензим участва във формирането ѝ? Какво се случва с 1вата АК-формилметионин? А какво се случва с формилметиониновата-тРНК?

A

Пептидна връзка с участие на пептидил-трансферазата. Той остава прикачен към АК2-тРНК на А-участъка. Едновременно или малко преди това от П-участъка на рибозомата се отделя формилметиониновата тРНК като се скъсява връзката ѝ с кодона АУГ. Енергията, освободена при това скъсване, се използва за изграждането на пептидната връзка. От рибозомата се отстраняват фактора EF-Tu ГДФ.

37
Q

Каква реакцип катализира белтъчния фактор EF-G, наречен транслоказа с участие на енергия от ГТФ? Какъв е смисълът на тази транслокация?

A

Траснлокацията на рибозомата, която се придвижва с 1 кодон надясно в посока 5‘-3‘ на иРНК. При това втората тРНК, носеща дипептида, се премества от А- в П-рибозомния участък.
По този начин А-участъка се освобождава, а белтъчния фактор EF-G и ГДФ се отделят от рибозомата. В освободеният участък се установява третият пореден кодон на иРНК към който постъпва третата АК3-Трнк.

38
Q

От коя структура се носи нарастващия полипептид?

A

Винаги от последната пристигнала тРНК, като формилметионинът остава в най-отдалечения външен край на белтъчната верига.

39
Q

За присъединяването на една АК колко енергия е необходима ? Кои са съответните макроергични връзки?

A

4ри макроергични връзки:

  • 2 АТФ за активирането и свързването на аминокислеината в АА-тРНК;
  • 1 ГТФ-връзка за осъществяването на връзката кодон-антикодон на всяка АА-тРНК с иРНК в стадиите елонгация и инициация;
  • 1 ГТФ-връзка за транслокацията на нарастващия пептид от А в П-рибозомния участък на елонгацията;
40
Q

Кога настъпва последния стадий на рибозомалния етап на транслацията?

A

Процеса завършва когато в А-участъка на рибозомата постъпи някой от 3те терминиращи (стоп) кодона на иРНК:УАГ, УАА, УГА.

41
Q

Какво са кодоните на иРНК:УАГ, УАА, УГА? От кои фактори се разпознават при прокариотите?

A

Те представляват терминторен сигнал, тъй като за тях НЕ съществува тРНК със съответстващите им антикодони. При прокариотите кодоните на УАА и УАГ се разпознават от белтъчния фактор RF1, а кодоните УАА и УГА от RF2.

42
Q

Какво се случва в случаите когато при полицистронната иРНК на прокариоти, транлация протича още преди края на транскрипцията?

A
  • Рибозомата може да заобиколи терминиращ кодон без отделяне от иРНК и от следващ АУГ-кодон да започне изграждане на нов полипептид върху същата матрица;
  • Рибозомата да се отделя и отново присъединява към иРНК при всеки терминиращ кодон;
  • Да се отдели от иРНК само 50S субединицата, а 30S да остане в контакт с нея.
43
Q

С каква скорост протича транслацията? Какцо се случва с клетката при повишена нужда от даден белтък?

A

Средна скорост 15 АК/сек. При повишена нужда на клетката от даден белтък той може да транслира върху полирибозомен к-с от 3 до 40 и повече рибозоми. Те се движат през около 80 нуклеотида една от друга и транслират едновременно повече копия на белтъка върху една молекула иРНК.

44
Q

Коя е първата трабслирана АК при еукариотите и кой е кодонът ѝ в иРНК?

A

Метионин, тъй като в еукариотите липсва ензима трансформилаза. Кодонът за метионина в иРНК също е АУГ

45
Q

Как се получава белтъчния комплекс в стадия на инициация при транслацията на еукариотните организми?

A

Най-напред метионин-тРНК се свързва с малката рибозомна субединица 40S при участие на фактора IF2 и след това към този к-с се присъединява иРНК със своя кодон АУГ в П-рибозомния участък.

46
Q

Какво е значението на нуклеотидната последователност на Козак: ГЦЦА/ГЦЦАУГГ, в процеса на транслация при еукариоти?

A

В близост до 5’-края ѝ се намира стартовият АУГ-кодон.

47
Q

Колко са иницииращите и терминиращите белтъчни фактори при еукариотната транслация?

A

Иницииращитефактори са повече от 10 на брой.
Само един терминиращ белтъчен фактор eRF, който разпознава терминиращите кодони и съдейства за освобождаването на синтезирания полипептид от рибозомната повърхност;

48
Q

Как може да се осъществи модифицирането на белтъците?

A
  • Отстраняване на метионина/формилметионина от началния азотен край;
  • Обратимно присъединяване на хим.групи;
  • Необратимо свързване с някои коензими и транспортни групи;
  • Регулаторно активиране на протеолитични ензими и хромони;
  • Нагъване на протеина при участие на други белтъци;
49
Q

Какво са шаперони? Какво е значението им?

A

Това са група белтъци, които способстват за правилното пространствено огъване на новосинтезираните полипептидни вериги. Те осигуряват стабулна и адекватна за условията белтъчна конформация. изискват енергия;