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Biochimie Luisa > ZOOM sur les protéines > Flashcards

ZOOM sur les protéines Flashcards

1
Q

Protides

A

Famille de biomolecules:
Peptides + protéines
Assemblage d’aa

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Q

Cbn d’aa chez les Peptides

A

Nb d’aa< 50

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3
Q

Cbn d’aa chez les protéines

A

> 50

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4
Q

Qu’est ce que la structure primaire

A

L’enchaînement des acides aminés dans un ordre précis

1e niveau d’organisation protéique

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5
Q

Cbn de protéines

A

20

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6
Q

Comment appelle t on Les AA qui participent à la synthèse peptidique ?

A

AA protéinogènes

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7
Q

AA essentiels

A

Provenant de l’alimentation

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8
Q

AA non essentiels

A

Produits par la cellule

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9
Q

Quelle est la masse moyenne d’un AA?

A

110 Dalton

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10
Q

Qu’est ce que le Carbonne alpha

A

Le C sur lequel est fixé le grpmt amine -NH2 et le groupement acide carboxylique -COOH

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11
Q

Que signifie : caractère amphotère

A

Un AA est amphotère c’est a dire qu’il a à la fois une fonction basique ( NH2) et une fonction acide ( cooH)

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12
Q

Que ce passe-t-il a l’Aa quand le pH est acide

A

Fonction COOH n’est pas ionisée

La fonction NH2 est ionisée (+)

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13
Q

Que ce passe-t-il a l’Aa a pH basique

A

Fonction COOH est ionisée (-)

Fonction NH2 pas ionisée

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14
Q

Que ce passe t il a pH neutre pour l’Aa

A

Les 2 groupement sont ionisés
NH3+
COO-

Au lieu de NH2 et cooH

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15
Q

Comment nommer la structure primaire d’une protéine ?

A

Écrire séquence d’aa de l’extrémité Nter a Cter

AA+suffixe -yl sauf pour le dernier dont le nom est en entier

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16
Q

Comment classifier les AA

A

En fonction de

  • l’encombrement stérique ( dépend de la taille de R)
  • le caractère polaire ou apolaire de R
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17
Q

Qu’est ce qu’un AA apolaire non ionisable

A

Ne peut pas interagir avec les molécules d’eau
Les AA apolaires non ionisables se regroupent entre eux quand ils sont en solution
Interactions hydrophobes-> lien avec architecture des protéines

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18
Q

Quelles sont les 2 types de chaînes chez les AA apolaires?

A

Aliphatique

Aromatique

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19
Q

Nommer Les AA apolaires à chaînes latérales aliphatiques

A 
Faible hydrophobicité :
Glycine 
Alanine 
Forte hydrophobicité:
Valine 
Leucine
Isoleucine
Méthionine ( Relativement hydrophobe) 
Proline
20
Q

AA apolaires a chaîne laterale aromatique

A

Phénylalanine ( très hydrophobe)

Tryptophane ( pas très hydrophobe)

21
Q

Caractère des AA polaires

A

Ionisables
Caractère hydrophile

AA polaires chargé - ( acides)
AA polaires chargés + ( basiques)
AA polaires non chargés ( neutres)

22
Q

Nommer les AA polaires neutres

A 
(Chaîne lateral A fonction alcool)
Sérine 
Thréonine 
Tyrosine 
(Chaîne laterale soufrée)
Cystéine 
(Chaîne laterale a fonction amide)
Asparagine 
Glutamine
23
Q

AA polaires ionisables

A 
Chaîne laterale à fonction acide
Aspartate 
Glutamate
A fonction basique 
Histidine 
Lysine 
Arginine
24
Q

Le pHi=

A

pH de l’Aa auquel sa charge est nulle ( AA électroniquement neutre)

25
Q

pHi=

A

(pKa + pKb)/2

26
Q

Si pH ( di milieu) < pHi ( de l’Aa)

A

Alors AA est chargé+

27
Q

Si pH > pHi de l’Aa

A

Alors l’Aa est chargé-

28
Q

Si pH = pHi

A

Alors AA neutre

29
Q

Isomères:

A

Molécules de composition identique mais d’organisation différente

30
Q

Enantiomeres

A

Molécules qui sont images l’une à l’autre dans un miroir plan mais pas superposables
Même propriété physique mais par rotatoire différents

31
Q

Domaine d’absorption des AA aromatiques

A

Absorbent UV entre 260 et 280 nm

32
Q

Ordre d’absorption des AA aromatiques

A

Tryptophane> Tyrosine> Phenylalanine

(280->260)nm

33
Q

Classement par hydrophobicité des AA

A

Hydrophobes:
Valine leucine isoleucine phénylalanine
Neutres
Cystéine Méthionine Glycine Alanine
Hydrophiles:
Aspartate glutamate lysine arginine histidine
Tryptophane sérine thréonine tyrosine asparagine et glutamine

34
Q

Qui fait de la glycosylation

A

Asparagine

35
Q

Qui fait de la phosphorylation

A

Sérine tyrosine et thréonine

Au bar on sert tire et trinque

36
Q

Qui fait de l’iodation

A

Tyrosine

37
Q

Qu’est ce que le pont disulfure

A

Liaison covalente entre 2 atomes de soufre et 2 cysteines

38
Q

Ou se trouve l’angle phy ( o)

A

Entre C alpha et N

39
Q

Où se trouve L’angle psy ( Y)

A

Entre Calpha et C

40
Q

Angle entre C et N

A

1,33 Angst

41
Q

Angle entre N et Calpha

A

1,45 Ang

42
Q

Angle entre C et O

A

1, 23 Angst

43
Q

Torsion autour d’une liaison C N

A

Soit 0° ( CIS)
Soit 180° ( trans)
Généralement on est en trans car plus stable ( pas d’encombrement)

44
Q

Endopeptidase:

A

coupe au milieu de la chaîne d’AA

45
Q

Exopeptidase

A

Coupe en n ter ou en c ter

46
Q

Structure primaire basée sur quel type de liaisons?

A

Covalentes

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