La Structure Secondaire Des Protéines Flashcards
Les interactions non covalentes sont responsables de structures:
Secondaires, tertiaires et quaternaires
Quelles sont les différentes interactions et leur niveau d’énergie ?
C-C covalent: 343 kJ mol-1
Hydrophobes: < 40 kJ mol-1
Liaisons ioniques 20
Liaison -H 12-30
De quoi sont responsables les liaisons non covalentes ?
Du repliement ( folding)
Les liaisons ioniques
Les interactions ioniques sont fortes mais ne stabilisent pas fortement les protéines
Les liaisons hydrogènes
2 atomes electronegatifs O ou N sont en compétition pour le même hydrogène
Une liaison hydrogène est plus forte quand elle est linéaire que quand elle est coudée
Par quoi peut être dénaturé la liaison de pont disulfure?
Par des facteurs physiques ou chimiques: Chaleur pH très acide ou alcalin ( très basique) Concentration élevée en ions Certains détergents
Par quoi est stabilisé la structure secondaire?
Des liaisons hydrogènes établies entre les groupements c-_ o et H-N des maisons peptidiques
Quel est le degré de rotation entre 2 AA d’une hélice alpha
100°
Distance entre 2 AA d’une hélice alpha
1,5 Ang ou 0,15 nm
Nbr d’aa par tours d’hélice alpha
3,6
Pas d’une hélice alpha
5,4 Angst
Cbn d’aa chez une hélice alpha situé dans le cœur des protéines globulaires
Env 10 aa
Cbn d’aa dans une hélice alpha d’un segment transmembranaire de protéine membranaire
Env 20 AA hydrophobes
Ou se situent les hélices alpha hydrophobes
Dans le cœur hydrophobe d’une protéine ou dans une membrane
Ou se situent les hélices alpha hydrophiles
Complètement exposé à la périphérie d’une protéine
Qu’est ce qu’une hélice alpha amphiphatique
Une de ses faces est riches en chaînes latérales hydrophile et l’autre en chaîne laterale hydrophobe
Qu’est ce qui forme les feuillets beta
+sieurs brins beta forment un feuillet
Les brins geta sont reliés latéralement pas 2 ou 2 liaisons hydrogènes
Ou trouve t on principalement Les feuillets bêta
Surtout dans les protéines fibreuses
Dans quel type de protéines trouve t on Les hélices alpha
Principalement dans les globulaires
Qui est plus stable entre le feuillet beta parallèle et le feuillet beta anti parallèle
L’antipatalelle ( atomes engagés dans les liaisons H sont mieux alignés)
Que sont les coudes et les boucles
Zones de jonction qui relient entre elles les hélices alpha et beta
Entraînent changement de sens
Résidu globalement hydrophile
En général peu d’aa
Coudes ( + court que les boucles) -> petits coudes appelé-> épingles à cheveux
Boucles ( longue): pas de régularité de confirmation, exposées, stabilisé par des liaisons faibles et permettent aux polymères de se replier
Qu’est ce que le motif alpha-alpha
2 hélices alpha anti parallèle
Qu’est ce que le motif beta - alpha - beta
Alpha/beta: feuillets beta // et une alpha entre
Alpha+beta: a-a-b-b ou a-b-a-b ( pas forcément parallèle)
Quels sont les 2 différents agencements de feuillets
Méandre ( comme une vague)
A la grecque (4e et 1e a côté en anti//)
