La Structure Secondaire Des Protéines

Question 1

Les interactions non covalentes sont responsables de structures:

Answer 1

Secondaires, tertiaires et quaternaires

Question 2

Quelles sont les différentes interactions et leur niveau d’énergie ?

Answer 2

C-C covalent: 343 kJ mol-1
Hydrophobes: < 40 kJ mol-1
Liaisons ioniques 20
Liaison -H 12-30

Question 3

De quoi sont responsables les liaisons non covalentes ?

Answer 3

Du repliement ( folding)

Question 4

Les liaisons ioniques

Answer 4

Les interactions ioniques sont fortes mais ne stabilisent pas fortement les protéines

Question 5

Les liaisons hydrogènes

Answer 5

2 atomes electronegatifs O ou N sont en compétition pour le même hydrogène
Une liaison hydrogène est plus forte quand elle est linéaire que quand elle est coudée

Question 6

Par quoi peut être dénaturé la liaison de pont disulfure?

Answer 6

Par des facteurs physiques ou chimiques:
Chaleur 
pH très acide ou alcalin ( très basique)
Concentration élevée en ions 
Certains détergents

Question 7

Par quoi est stabilisé la structure secondaire?

Answer 7

Des liaisons hydrogènes établies entre les groupements c-_ o et H-N des maisons peptidiques

Question 8

Quel est le degré de rotation entre 2 AA d’une hélice alpha

Answer 8

100°

Question 9

Distance entre 2 AA d’une hélice alpha

Answer 9

1,5 Ang ou 0,15 nm

Question 10

Nbr d’aa par tours d’hélice alpha

Answer 10

3,6

Question 11

Pas d’une hélice alpha

Answer 11

5,4 Angst

Question 12

Cbn d’aa chez une hélice alpha situé dans le cœur des protéines globulaires

Answer 12

Env 10 aa

Question 13

Cbn d’aa dans une hélice alpha d’un segment transmembranaire de protéine membranaire

Answer 13

Env 20 AA hydrophobes

Question 14

Ou se situent les hélices alpha hydrophobes

Answer 14

Dans le cœur hydrophobe d’une protéine ou dans une membrane

Question 15

Ou se situent les hélices alpha hydrophiles

Answer 15

Complètement exposé à la périphérie d’une protéine

Question 16

Qu’est ce qu’une hélice alpha amphiphatique

Answer 16

Une de ses faces est riches en chaînes latérales hydrophile et l’autre en chaîne laterale hydrophobe

Question 17

Qu’est ce qui forme les feuillets beta

Answer 17

+sieurs brins beta forment un feuillet

Les brins geta sont reliés latéralement pas 2 ou 2 liaisons hydrogènes

Question 18

Ou trouve t on principalement Les feuillets bêta

Answer 18

Surtout dans les protéines fibreuses

Question 19

Dans quel type de protéines trouve t on Les hélices alpha

Answer 19

Principalement dans les globulaires

Question 20

Qui est plus stable entre le feuillet beta parallèle et le feuillet beta anti parallèle

Answer 20

L’antipatalelle ( atomes engagés dans les liaisons H sont mieux alignés)

Question 21

Que sont les coudes et les boucles

Answer 21

Zones de jonction qui relient entre elles les hélices alpha et beta
Entraînent changement de sens
Résidu globalement hydrophile
En général peu d’aa
Coudes ( + court que les boucles) -> petits coudes appelé-> épingles à cheveux
Boucles ( longue): pas de régularité de confirmation, exposées, stabilisé par des liaisons faibles et permettent aux polymères de se replier

Question 22

Qu’est ce que le motif alpha-alpha

Answer 22

2 hélices alpha anti parallèle

Question 23

Qu’est ce que le motif beta - alpha - beta

Answer 23

Alpha/beta: feuillets beta // et une alpha entre

Alpha+beta: a-a-b-b ou a-b-a-b ( pas forcément parallèle)

Question 24

Quels sont les 2 différents agencements de feuillets

Answer 24

Méandre ( comme une vague)

A la grecque (4e et 1e a côté en anti//)