zellbiologie_ss-17_erster-termin Flashcards
Zellbio
Unterstreichen Sie in den geschweiften Klammern alle richtigen Aussagen. 1) Welche der nachfolgenden Modifikationen finden nicht bzw. nur selten im Zytoplasma der Eukaryonten statt, sind aber häufig bei Prokaryonten anzutreffen? {Deformylierung des Startmethionins | Phosphorylierung von Histidinen | O-Glycosylierung von Serinen} 2) Mit „molecular crowding“ wird die Eigenschaft des Zytoplasmas beschrieben, {eine hohe Konzentration an Ionen aufzuweisen | viele intrinsisch nicht gefaltete Proteine zu beherbergen | freie Fettsäuren zu enthalten}. 3) Molekulare Chaperone {definieren die Raumstruktur eines Proteins | stabilisieren instabile Konformere eines Proteins | führen immer zu einer beschleunigten Faltung eines Proteins}. 4) Der „trigger factor“ {ist ein exit site chaperone | benötigt ATP für seine Aktivität | besitzt eine „protein disulfid isomerase“ Aktivität}.
1) Deformylierung des Startmethionins, Phosphorylierung von Histidinen 2) viele intrinsische nicht gefaltete Proteine zu beherbergen 3) stabilisieren instabile Konformere eines Proteins 4) ist ein exit site chaperone
Welche Aussagen sind richtig? Ja/Nein 1) Alle Organellen haben biologische Membranen. 2) Gap junctions blockieren den parazellulären Transport in Epithelien. 3) Zellen mit einer cönocytischen Organisation besitzen mehrere Zellkerne.
1) Nein 2) Nein 3) Ja
Welche Aussagen sind richtig? Ja/Nein 1) Ubiquitin entsteht durch schrittweise Modifikation eines Proteins mit Aminosäuren. 2) Ubiquitinylierung erfolgt in der Regel an der OH-Gruppe von Serinen. 3) Neben Ubiquitinylierung gibt es andere Formen der Proteinmodifikation mit Peptiden, die nicht dem Proteinabbau dienen. 4) Der durch das E3-Enzym katalysierte Schritt der Ubiquitinylierung ist eine ATP-abhängige Reaktion.
1) Nein 2) Nein 3) Ja 4) Nein
a) Unterstreichen Sie in den geschweiften Klammern alle richtigen Antworten. 1) Der transmembrane Transport von Proteinen durch die Lipiddoppelschicht des endoplasmatischen Retikulums erfolgt generell {nur co-translational | nur post-translational | co- oder post-translational, d.h. beide Formen sind möglich}. 2) Dieser Proteintransport verwendet {immer | nicht immer} den Riboproteinpartikel SRP und benötigt {immer | nicht immer} den durch Sec61 gebildeten proteinleitenden Kanal. b) Während bzw. kurz nach dem Transport können bei Vorliegen entsprechender Primärstrukturen die transportierten Proteine modifiziert werden. Nennen Sie vier mögliche Modifikationen.
a) 1) co- oder post-translational, d.h. beide Formen sind möglich 2) nicht immer ; nicht immer b) 1) Acetlyling 2) Hydroxylierung 3) Phosphorylierung 4) Glykosylierung (Geändert: Quelle: Torbens Altklausuren)
Welche Aussagen sind richtig? Ja/Nein 1) In allen eukaryontischen Zellen erfolgt die Mitose als offene Mitose. 2) Alle Proteine mit einer Länge größer als 30 Aminosäuren können in der Regel nur GTP-abhängig in den Zellkern transportiert werden. 3) Importfaktoren des „klassischen“ Proteinimportes in den Zellkern werden in einer inaktiven Konformation aus dem Kern exportiert. 4) Vorstufen der Spliceosomen passieren während ihrer Biogenese die Kernmembran dreimal. 5) Das für den Proteinexport aus dem Zellkern notwendige NES ist reich an basischen Aminosäuren. 6) Die für den Kerntransport notwendige GTPase Ran wird im Zellkern mit GTP beladen.
1) Nein (nur meisten) 2) Nein 3) Ja 4) Nein 5) Nein 6) Ja
Erläutern Sie den Begriff „Chaperonin“ und nennen Sie ein Beispiel.
Große Multidomäne-Proteine, die einen geschützten Faltungsraum für Proteine schaffen und zwar ATP-Abhängig. Beispiel: GroES und GroEL
a) Unterstreichen Sie in den geschweiften Klammern alle richtigen Antworten. Zu den Hauptbestandteilen der eukaryontischen Plasmamembran gehören {Phosphatidylcholin | Phythanylglycerolether | Cholesterol | Sphingomyelin | Cardiolipin}. b) Nennen Sie drei grundsätzliche Bewegungsmöglichkeiten von Lipiden innerhalb einer Lipid-Bilayer! Welche dieser Bewegungsmöglichkeiten werden in der Regel durch ein Protein katalysiert?
a) Phosphatidylcholin, Cholesterol, Sphingomyelin b) 1. Rotationale Diffusion 2. Laterale Diffusion 3. Transversale Diffusion “Flip-Flop” Transversale Diffusion durch Flipasen
Nennen Sie die drei Hauptwege, durch die zelluläre Proteine zum Abbau in Lysosomen gelangen:
1) Mikroautophagie 2) Makroautophagie 3) Chaperon-vermittelte Autophagie
Unterstreichen Sie in den geschweiften Klammern alle richtigen Aussagen. 1) Calnexin ist ein ER-spezifisches Chaperon, das seine Substrate hauptsächlich über {das Vorhandensein einer Disulfidbrücke | die Struktur eines Asparagin-verknüpften Oligosaccharides | die Struktur eines Serin-verknüpften Oligosaccharides} erkennt. 2) Die Aktivität der Proteindisulfidisomerase (PDI) im ER {verknüpft nur Cysteinpaare „korrekter“ Konformere | erzeugt als Nebenprodukt eine Belastung der Zelle mit reaktiven Sauerstoffspezies | erzeugt als Zwischenprodukt kovalent verbundene Addukte aus Enzym und Substrat}. 3) Der Abbau falsch gefalteter löslicher luminaler Proteine des ER {erfolgt im Zytoplasma und erfordert die Ubiquitinylierung des Substrates im Lumen des ER vor seinem Export | erfolgt im Zytoplasma und erfordert die Ubiquitinylierung des Substrates im Zytoplasma nach seinem Export | erfolgt in der Regel im ER oder im Lysosom ohne diese Modifikation}. 4) Die unfolded protein response (UPR) blockiert den Proteinimport in das ER {über die Phosphorylierung des Sec61-Komplexes | die Spaltung der SRP-RNA | den Abbau membrangebundener Ribosomen}.
1) die Struktur eines Asparagin-verknüpften Oligosaccharides 2) erzeugt als Nebenprodukt eine Belastung der Zelle mit reaktiven Sauerstoffspezies, erzeugt als Zwischenprodukt kovalent verbundene Addukte aus Enzym und Substrat 3) erfolgt im Zytoplasma und erfordert die Ubiquitinylierung des Substrates im Lumen des ER vor seinem Export 4) alles falsch
Füllen Sie die Tabelle aus. Zu jeder Frage sind 3 Felder auszufüllen. 1 Feld Aktinsystem, 2 Feld Tubilinssystem, Intermediärfilamentsystem. 1) Welche kovalenten Bindungen verknüpfen die Untereinheiten zum Filament? 2) Können häufiger Verzweigungen der Filamente vorkommen? 3) Welche Nukleotidtriphosphate können durch die Untereinheiten der Polymere gebunden werden? 4) Welche Klassen von Motorproteinen interagieren mit den Filamenten? 5) Welche Strukturen werden in jedem Zellkern einer Säugerzelle durch die Systeme gebildet?
1) Aktinsystem: Keine Tubulinsystem: Keine Intermediärfilamentsystem: Keine 2) Aktinsystem: Ja Tubulinsystem: Nein Intermediärfilamentsystem: Nein 3) Aktinsystem: ATP Tubulinsystem: GTP Intermediärfilamentsystem: / 4) Aktinsystem: Myosin Tubulinsystem: Kinesine, Dynein Intermediärfilamentsystem: / 5) Aktinsystem: Keine Tubulinsystem: Mikrotubuli (eigentlich müsste die Kernmembran in der Anaphase schon aufgelöst sein, damit ist es ja nicht mehr so richtig im Kern) Intermediärfilamentsystem: Kernhülle
a) Nennen Sie drei Organellen, die nicht dem Endomembransystem des sekretorischen Weges zugeordnet werden. b) Nennen Sie eine Organelle des sekretorischen Weges, die aus mehreren Kompartimenten besteht.
a) 1. Mitochondrium 2. Centrosom 3. Plastiden b) Golgi-Apparat
Unterstreichen Sie in den geschweiften Klammern alle richtigen Aussagen. 1) Die Bildung von COPII coated Vesiklen benötigt {die Aktivität von Sar1p | Inositol-4,5- diphosphat | Rab29}. 2) Der Clathrin-Coat kommt {nur an der Plasmamembran | auch am ER | auch an Endosomen} vor. 3) Das docking der Vesikel an die Zielmembran {beinhaltet die Formierung eines SNARE-Bündels aus zwei SNARE-Domänen | wird in der Regel durch Rab-Proteine reguliert | erfolgt erst nach dem uncoating der Vesikel}.
1) die Aktivität von Sar1p 2) auch an Endosomen 3) wird in der Regel durch RAB-Proteine reguliert, erfolgt erst nach dem uncoating der Vesikel ( geändert: Folie 44 (Docking/Fusion), Folie 40(QM Control in trafficking and RAB proteins) + Torbens Altklausur)
a) Unterstreichen Sie in den geschweiften Klammern alle richtigen Aussagen. 1) TGF-β {hemmt das Zellwachstum | steigert die Mitoserate | ist ein Transkriptionsfaktor}. 2) Der aktivierte TGF-β-Rezeptor {phosphoryliert | ubiquitinyliert | proteolysiert} das Protein Smad. 3) Smad wirkt als {Kinase | Ubiquitinligase | Transkriptionsfaktor}. 4) Janus-Kinasen (JAK) {sind membranständige Rezeptoren, die durch Cytokine aktiviert werden können | katalysieren u.a. die Phosphorylierung von STAT-Proteinen | wirken im Zellkern als Transkriptionsfaktoren}. b) Nennen Sie drei prinzipielle Signalwege (Namen der Schlüsselenzyme) , die durch Rezeptor-Tyrosinkinasen aktiviert werden können.
1) hemmt das Zellwachstum 2) phosphoryliert 3) Transkriptionsfaktor 4) katalysieren u.a. die Phosphorylierung von STAT-Proteinen b) 1. MAP-Kinase 2. PI3-Kinase 3. Phospholipase C
Unterstreichen Sie in den geschweiften Klammern alle richtigen Antworten. 1) Effektor-Caspasen besitzen Domänen, die als {DED | CARD | RING} bezeichnet werden. 2) Das für die Aktivierung der Procaspase-9 erforderliche Apoptosom enthält {Cytochrom c | Bcl-2 | Apaf-1 | Fas-Ligand}. 3) Caspasen haben im aktiven Zentrum ein {Serin | Cystein | Methionin}. 4) Die Umwandlung einer Procaspase in eine Caspase ist unter physiologischen Bedingungen ein {vollständig | teilweise | nicht} reversibler Prozess.
1) Alles falsch 2) Cytochrom C, Apaf-1 3) Cystein 4) nicht
Der M-Cdk-Komplex (MPF) ist für das Durchlaufen der M-Phase von essentieller Bedeutung. Welche Aussagen sind richtig? 1) Der M-Cdk-Komplex kann durch Phosphorylierung aktiviert werden 2) Der M-Cdk-Komplex kann durch Phosphorylierung inaktiviert werden 3) Der M-Cdk-Komplex kann durch Dephosphorylierung aktiviert werden 4) Der M-Cdk-Komplex kann durch Dephosphorylierung inaktiviert werden 5) Der M-Cdk-Komplex aktiviert Myosin für die Zytokinese
1) Ja 2) Ja 3) Ja 4) Nein (wird gehemmt und nicht inaktiviert) VL2 Folie31 5) Nein