Week 3: Kanker op chromosomaal niveau

Question 1

Wat komt vaak voor bij CML?

Answer 1

Translocatie (9;22)

Question 2

Wat is het gevolg vaak van t(9;22)

Answer 2

Fusiegen BCR-ABL, ook wel Philadelphia chromosoom

Question 3

Hoe kan je CML behandelen?

Answer 3

Imatinib, desatinib, stamceltransplantatie

Question 4

Wat is AML?

Answer 4

Ophoping van onrijpe, niet-functioneel cellen veroorzaakt door mutaties in het DNA

Question 5

Welke chromosomale afwijkingen zijn er?

Answer 5

• Structurele afwijkingen: deleties, translocaties, dicentrische chromosomen (gehele cyclus)
• Numerieke afwijkingen: chromosoomverlies, chromosoomduplicatie (metafase in mitose)

Question 6

Waardoor worden oncogenen geactiveerd?

Answer 6

Translocatie, verdubbeling chromosoom, genamplificatie

Question 7

Waardoor worden tumorsuppressorgenen geïnactiveerd?

Answer 7

Deletie, verlies van chromosomen

Question 8

Wat is de functie van telomeren?

Answer 8

Ze beschermen DNA-uiteinden, waardoor ze niet zichtbaar zijn voor cellen. Ze beperken de groei van cellen en zorgen dat er geen genomische instabiliteit ontstaat

Question 9

Wat verandert er bij telomeren met een tumor?

Answer 9

Tumorcellen activeren telomerase en dus is er geen groeilimiet.

Telomeraseremmers kunnen dus de tumorgroei verminderen

Question 10

Wat is FISH?

Answer 10

Fluorescence In Situ Hybridization;

Methode om mutaties zichtbaar te maken.
DNA wordt gesmolten, stukje enkelstrengs DNA wordt eroverheen gewassen, en hecht aan gesmolten DNA.

Je vindt wel alleen wat je zoekt

Question 11

Wat is SNP?

Answer 11

Single Nucleotide Polymorphism;

Genoom breed en dus ook fouten vinden met kleine resoluties

Question 12

Wat is het verschil tussen FISH en SNP?

Answer 12

Translocatie kan alleen bij FISH en verlies heterozygotie alleen bij SNP

Question 13

Hoe blijft cyclus van het lichaam gelijk met ritme van de dag?

Answer 13

Door licht, dat wordt waargenomen door fotoreceptoren in oog en SCN bevatten de ‘klok’

Question 14

Wat doen CRY1 en CRY2?

Answer 14

CRY1 laat klok langzamer tikken
CRY2 laat klok sneller tikken

Question 15

Hoe zit het met de klok van ochtend- en avondmensen?

Answer 15

Ochtend: snelle klok
Avond: langzame klok

Question 16

Wat is verband tussen Circadiane klok en kanker?

Answer 16

Circadiane verstoring is risicofactor voor borstkanker

Question 17

Hoe wordt sequentie bepaald?

Answer 17

1. Isoleren DNA
2. Kloneren DNA
3. Delen van DNA ordenen op plek van chromosoom
4. Specifiek deel van DNA in stukjes knippen
5. Sequencen kleine stukjes DNA

Question 18

Wat is Proteomics?

Answer 18

Eiwitten van een cel

Question 19

Wat doet massaspectrometrie?

Answer 19

Eiwitidentificatie, eiwitkwantificatie, bindende eiwitten identificatie, eiwitmodificatie identificatie

Question 20

Wat is Metabolomics?

Answer 20

Metabolieten in een cel

Question 21

Welke genen spelen een rol in celcyclus?

Answer 21

• Cyclines
• Cycline afhankelijke kinases (CDK’s)
• Cycline afhankelijke kinase remmers (CDKI’s)

Question 22

Wat zijn cyclines?

Answer 22

Gedurende bepaalde stadia actief; controleren voortgang celcyclus

D = G1
E = G1-S
A = S
B = G2

Question 23

Wat zijn cycline afhankelijke kinases?

Answer 23

Continu aanwezig; actief bij binding

CDK4 = bindt cycline D
CDK2 = bindt cycline E + A

Question 24

Wat zijn cycline afhankelijke kinase remmers?

Answer 24

Remmen kinase activiteit

CDKI-p16ink4a = remt cycline D/CDK4
CDKI-p21 = remt cycline A/CDK2

Question 25

Waarom zijn er checkpoints in de celcyclus?

Answer 25

Omdat DNA alleen gerepliceerd mag worden als er geen DNA-beschadigingen zijn

Question 26

Waar zitten de checkpoints in de celcyclus?

Answer 26

G1/S → p53 (schade?)
S → ATM (schade?)
G2/M → - (replicatie volledig?)
Anafase → BUB-1 (chromosomen gerangschikt?)
Restrictiepunt → RB (wel of niet delen?)

Question 27

Welke manieren van DNA-analyse zijn er?

Answer 27

FISH, PCR, cDNA-microarray, DNA-sequencing