W2 Flashcards
Ile genów koduje rRNA? Na jakich chromosomach się znajdują? Gdzie są zlokalizowane
200 genów, chromosomy 13, 14, 15, 21 i 22 - są akrocentryczne; zlokalizowane w jąderku
która polimeraza RNA transkrybuje geny 28S, 18S 5,8S rRNA?
polimeraza RNA III
która polimeraza RNA transkrybuje geny 5S rRNA?
polimeraza RNA I
Jakie cząsteczki uczestniczą w obróbce pre-rRNA? Co się dzieje podczas tej obróbki?
snoRNP; przyłączanie białek rybosomalnych, modyfikacje nukleotydów
budowa tRNA - jakie ma charakterystyczne elementy?
rysunek, pętla D, pętla psi, pętla antykodonu, ramie akceptorowe z CCA, ramie dodatkowe
obróbka tRNA
odcięcie sekwencji liderowej przez rybonukleazę P, dodanie CCA do 3’ końca, wycięcia intronu, modyfikacje nukleotydów, dihydroksyurydyna w pętli D, pseudouracyl w pętli psi
cechy kodu genetycznego (7)
jednoznaczny, uniwersalny, trójkowy, czteroliterowy bezprzecinkowy, niezachodzący i zdegenerowany
rozszyfrowywanie kodu genetycznego
matryce typu poli(U), matryce z nukleotydami w różnych proporcjach - jakie prawdopodobieństwo wystąpeinia takiego kodonu vs ilość aminokwasu w białku
czy jest zależność między częstotliwością występowania aa w białku a liczbą kodujących je kodonów?
otóż nie
a czy jest zależność między liczbą tRNA oddziałujących z danymi aminokwasami a częstotliwością występowania aminokwasu w białku?
otóż tak
ile jest tRNA o różnych antykodonach?
nie 61 (tyle ile kodonów kodujących aminokwasy) ani nie 20 (tyle ile aminokwasów)
teoria chwiejności zasad (podstawowa)
rysunek!, Dla każdych dwóch kodonów różniących się tylko puryną lub tylko pirymidyną na ostatniej pozycji wystarczy jeden tRNA.
quenina - jaki enzym ją wstawia? u kogo występuje ta modyfikacja i skąd bierze się queozyna?
enzym TGT (tRNA guanin transglucosylase) - wycina guaninę, wstawie queuinę - u Eukariota, z pożywienia i syntetyzowana przez bakterie jelitowe
ewolucja kodu genetycznego
na początku wszystkie kodony kodowały glicyne bo nie było więcej aminokwasów, jak pojawiły się inne aminokwasy to musiały podzielić się istniejącymi już kodonami - w oparciu o 1 lub 3 pozycje
wykorzystywanie kodonów - E.coli
bardzo rzadko wykorzystuje AGA i AGG do kodowania Arg - możliwe, że te kodony przestaną kodować ten aminokwas. E.coli Rosetta- ma dodatkowe tRNA które rozpoznaje rzadkie kodony
kod genetyczny w mitochondraich
rysunek, różni się od uniwersalnego, reguła chwiejności zasad jest tam mniej restrykcyjna
Jak dowiedziono że tRNA decyduje o tym, jaki aminokwas zostanie wbudowany do łańcucha białkowego?
Po modyfikacji cysteinylo-tRNAcys do alanylo-tRNAcys wbudowywana była alanina – o tym, jaki aminokwas znajdzie się w danym miejscu w białku decyduje tRNA.
reakcja katalizowana przez syntetazy aminoacylo-tRNA
Aminokwas + ATP + tRNA + H2O -> aminoacylo-tRNA + AMP + PPi
jaka jest rola reakcji katalizowanej przez syntetazy aminoacylo-tRNA?
dopasowanie aminokwasu do właściwego tRNA, zaktywowanie aminokwasu
