Virus pathogène Flashcards
Quel sont les effets de la maladie du Panama?
Digère les pectines au niveau des vaisseaux conducteurs, forme un gel bloquant les vaisseaux, alors les divers organes ne peuvent communiquer entre eux = perte des feuilles = dimunution de la photosynthèse = problème
Que fait la polygalacturonase (PG)? Quelle protéine inhibe la PG?
- digère les pectines (fait dans un premier temps des oligo puis des monomères)
- PGIP, inhibe au niveau de former des monomères.
Quelles modifications un pathogène peut faire pour limiter l’action d’un fongicide?
- muter la cible
- surexprimer la cible
- dégrader le fongicide
- pompe à afflux (yeet le fongide)
Quelle réplicase à ARN, ARN dépendante est utiliser par les plantes? et pourquoi?
Réplicase RdRp, permet de former ARNdb à partir d’un virus. Cet ARNdb va être clivé par ARNi.
Quelles sont les deux structures qui contrôlent les plasmodesmes?
- callose (béta-glucane)
- protéine (PDLP)
Que fait la MP?
lie l’ARN et augmente la limite d’exclusion des plasmodesmes
Que fait la HCPRO?
augmente la limite d’exclusion des plasmodesmes et est un suppresseur de l’ARNi
Comment se fait le mouvement d’un virus sur une longue distance?
Utilise les vaisseaux de la plante
Quels sont les divers types de transfert vertical d’un virus?
par le pollen, la graine et végétatif
Quels sont les divers types de transfert horizontal d’un virus?
mécanique (inoculation artificielle via une blessure), par greffe et par un vecteurs
Quelles sont les variables à prendre en compte lorsqu’on utilise les insectes comme vecteur de transfert horizontal?
temps nécessaire à l’acquisition, période de latence, temps d’inoculation, période de rétention.
Rappel, relation compatible = maladie et incompatible = pas de maladie
Rappel, relation compatible = maladie et incompatible = pas de maladie
Quelles sont les 3 niveaux sur lesquels une plante peut agir par rapport à la rx incompatible?
non-pénétration, arrêt, arrêt après la pénétration
Quels sont les deux composantes de la défense inné de la plante?
- Défense constitutive (métabolites)
- Barrières physiques (trichome et paroi)
Donner un exemple de métabolite utiliser par la défense constitutive.
Saporines, (comme la tomatine), se lie aux stérols (donc contre champignons) de la membrane des patho = pores dans la membrane
Quelles sont les deux stratégies contre les saporines?
- modifier la molécule (métabolite)
2. diminuer la quantité de stérols au niveau de la membrane
Quelles sont les deux types de résistance aux niveaux des mécanisme de défense de la plante?
- Résistance basale
- Résistance hautement spécifique (ETI)
Quels sont les divers types de promoteur utilisé sur le plasmide Ti lors d’expérience sur une plante?
- Constitutif
- Tissu spécifique
- Inductible
Quelles sont les étapes de la formation d’une plante transgénique stable?
- Co-culture d’un tissu avec agrobacterium avec le plasmide désiré sur un milieu sélectif
- après 24h - 48h, on met un antibiotique tuant Agrobacterium (RIP)
- callogénèse + antibiotique
- régénération des bourgeons + antibiotique
- élongation des bourgeons + antibiotique
- VOILÀ
Quelles sont les différences entre une plante transgénique stable et transitoire?
stable : modifier à jamais (plasmide Ti)
transitoire : après une semaine perd la modification génétique
Revois le test de la plante transgénique pour savoir si homozygote, hétérozygote ou WT
Il a dit que c’était important
Quelles sont les deux composantes de la résistance basale?
Reconnaissance des éliciteurs de type PAMPs (PTI) et extinction génétique
Expliquer le système zig-zag.
au départ on a une plante sensible. Défense = reconnait un PAMPs (PTI) Contre-défense = le patho supprime le PTI, en éliminant un effecteur Contre-contre-défense = plante crée ETI fin?
Quelles sont les deux types d’extinction génétique?
post-transcriptionnel (ARN scannent le transcrit et bloquent / clivent)
transcriptionnel (ARN méthyle ADN = compacte)
Quel est le nom de l’hypothèse propre à la reconnaissance spécifique?
relation gènes pour gène
Qu’implique l’hypothèse de la relation gènes pour gène?
qu’un gène de résistance de la plante (R) a un récepteur qui reconnait le gène d’avirulence (Av) du patho. Une fois que la plante a senti Av, transmet un signal activant la transcription de gènes de défense.
Quels sont les 5 principaux domaines des gènes de résistance?
LRR : spécificité du récepteur
Ser / Thr kinase : impliqué dans la transduction du signal
NBS : site de fixation et hydrolyse de ATP et GTP
LZ : homodimérisation et hétérodimérisation des prot.
TLR : signalisation de la cellule
Quelles sont les deux principales famille de gène de résistance?
CNL (Cc + NBS + LRR)
TNL (TLR + NBS + LRR)
Quel sont les 3 niveaux de l’interaction plantes-pathogène?
- reconnaissance - messager chimique primaire (éliciteurs)
- transduction des signaux - production de messagers chimiques secondaires
- réponse de défense
Expliquer la reconnaissance de flg22.
FLS2 reconnait flg22, BAK1 vient former un complexe avec FLS2, en découle la défense qui cause un arrêt de croissance.
Expliquer l’expérience du double hybride.
on lie chacune des protéines (celles qu’on doute qui interagissent ensemble) à une protéine GAL4 de levure. Si les protéines étudiées interagissent, vont se lier et permettre la transcription du gène lacZ. En faisant croitre la levure sur un milieu avec comme seule source de C une substance dégrader par galactosidase, on déduit que les prot. intergissent ensemble.
Quel test doit être réalisé pour confirmer le test des double hybride et pourquoi?
COIP (co-immunoprécipitation), parce que les conditions dans la levure diffère grandement des conditions dans la plante
Je ressens pas le besoin d’expliquer le test COIP pcq j’ai eu immuno donc c’est évident, mais a revoir si tu n’es pas familière
Mon café goute mauvais
Qu’est-ce que l’hypothèse de garde?
Une protéine de garde, lié à la protéine de résistance, va être modifiée par un effecteur, Cette modification est reconnu par la protéine de résistance qui va faire signaux = rx immunitaire
Quels sont les divers types de messagers chimiques secondaire?
burst oxydatif (EAO), AS, AJ
Savoir le test du luminol
luminol + peroxydase, quand entre en contact avec péroxyde = lumière mesurée par luminomètre
Quelles enzymes forment des EAO?
NADPH oxydase (principale) oxalate oxydase
Savoir qu’il y a des gènes de résistance, de défense et de protection
de résistance : identifie patho
de défense : défend plante
de protection : protège plante
Comment est formé AS?
À partir de phénylalamine, avec enzyme ICS1.
Quels sont les effets du gène NAHG?
gène bactérien dégradant AS = réprime réponse immunitaire
Comment est formé AJ?
Provient de phospholipides, LOX (lipoxygénase) = HPOT = AJ
Pourquoi pseudomonas utilise un déviré de AJ pour activé la voie de l’AJ?
Car pseudomonas est sensible à la voie de AS, comme les deux voies ont une action antagoniste, elle réprime la voie AS
Quelles sont les différentes réponses de défense?
- Rx d’hypersensibilité
- Renforcement de la paroi
- Accumulation des PRs protéines
- Phytoalexines
Quels sont les effets de la réponse induite par AS?
NPR1 sont à la base liés entre eux par des ponts disulfures, AS va causer un changement rédox = libération des NPR1. NPR1 va aller dans le noyau se lier au complexe TGA = transcription
Quels sont les effets de la réponse induite par AJ?
Lie récepteur COI1 qui va activer E3 ligase (SCF), ce qui permet la dégradation du répresseur (protéine JAZ). Ainsi ERF1 peut se lier à la région promotrice GCC et permettre la transcription
Quelles est la différence entre les gènes de protection et les gènes de défense?
Protection : protège plante contre patho ou sa propre réponse immunitaire
Défense : attaque le patho
Kamal m’a expliqué qqch que j’explique ici, par rapport aux protéines de garde. Seules peuvent induire la réponse basale (PTI). Si clivé, activent protéines de gène de résistance, ce qui active le ETI
The more you know
Est-ce que la résistance basale et l’immunité innée sont la même chose? Si non, pourquoi?
C’est la même chose
