virus géants Flashcards
qu’estc-ce qu’un virion
forme extracellulaire d’un virus
qu’est-ce que la phase d’éclipse
le moment de la réplication ou l’on ne peut plus voir les capsides : on peut l’utiliser pour caractériser les virus
caractérisez le mimivirus
750nm, plus grand que certaines bactéries (500 sans le capside)
1,2 Mb
dans quelles cellules se répliquent les mimivirus
celles d’amibes acanthamoeba
quel est le cycle de réplication de mimivirus
entrée, éclipse, usine, sortie
que signifie pangénome ou noyau essentiel de gènes
pangénome : gène partagés par de nombreuses souches
noyau essentiel de gènes : gènes spécifiques d’une souche ou de quelques souches
quels sont les differents grands groupes de gènes chez les virus
core genes : gènes conservés chez les proches voisins
gènes dupliqués (20% des gènes chez mimvirus)
gènes transférés latéralement : 20% du génôme de mimvirus ; très fréquent dans le monde vivant (8% du génome humain)
ORFan genes : 39% du mimivirus
comment évolue mimivirus en absence de pathogènes en compétition
perd 16% de son génome : ce qui n’est pas nécéssaire à sa réplication dans les cellules d’amibes
décrivez le premier viropahage
on a découvert un mimivirus plus gros (mamavirus) en fait un mimivirus associé à d’autres virus (sputnik) ne pouvant se reproduire qu’en présence de mimivirus et lui déformant sa morphologie ; il pénètre la cellule associé aux fibres
comment mimivirus se defend contre sputnik
mécanisme analogue à CRISPR
qu’est-ce que le marseillevirus
mimiviridiae divergent du mimivirus, plus petit (400kb)
décrivez les idfferents virus géants
- pandarovirus : 2,5Mb, pas de capside
- pitovirus sibéricum : retrouvé dans le permafrost et les égoûts de la ciotat
- mollivirus sibericum : permafrost, 500nm, 1Mb
- Faustovirus : découvert sur autre espèce d’amibe (vermaemoba vermiformis)
- tupanvirus : mimiviridé, 2,3µm, gènes de l’appareil de traduction
quelles caractéristiques définissent les virus géants
taille > 200nm et 300kb
complexe : >100 protéine , ADN et ARN
composants impliqués dans la traduction
mobilome
monophylie : gène commun permettant de les comparer entre eux
gènes archaïque : on peut les comparer à des gènes d’organismes intracellulaires, précurseurs des eucaryotes
large spectre d’hôte
quels critères classiques de définition d’un virus sont ou pas remis en question par la découverte des virus géants
oui : taille, un type d’AN, presence de capside (pandarovirus)
non : mécanisme de replication, apparei lde réplication (gènes mais pas l’appareil), parasitisme intracellulaire obligatoire, absence de production d’énergie,
que dire de la présence des virus géants
mimivirus a été découvert lors de la recherche de l’origine d’une épidémie de pneumopathie : présence d’AC anti mimivirus
on a montré in vitro qu’il peut persiter dans les macrophages