Virologie végétale Flashcards
structure virus
- macromolécules infectieuses
- ARN simple brin majoritairement -> porte le génome viral
- capside constituée de protéines de structure (protéines capsidiales) entoure le génome
- virion/particule virale = ARN + capside
3 morphologie des virus
- isométrique
- globuleuse
- filamenteuse
Virus Geminiviridae
- rares virus à ADN
- se répliquent dans le noyau de la cellule végétale
- formés de 2 molécules d’ADN (jumeaux)
virus à ADN
- surtout en milieux tropicaux -> à cause de leurs vecteurs qui ne tolèrent pas les T froides (aleurodes et pucerons)
- touchent de nombreuses plantes horticoles
- Amérique du Nord et CAN = nouveau Geminiviridae dans l’industrie viticole = Grablovirus
4 stratégies utilisées par les virus ARN pour répliquer son génome?
- production de polyprotéines (ensuite clivée en morceaux)
- utilisation de multiples ARN génomiques
- production d’ARNs sous-génomiques
- traduction non canonique des ORFs
6 principales fonctions jouées par les protéines des phytovirus
- réplication (réplicase) et transcription du génome
- encapsidation (CP)
- protéines de mouvement (MP)
- surpression des défenses de la plante (VSR)
- interaction avec les vecteurs (parfois)
- protéases (parfois) (clivage)
2 types de mouvement des virus
- de cellule à cellule
- longue distance
comment se fait le mouvement de cellule à cellule
- via les plasmodesmes
- plusieurs protéines de mouvement (MP) interviennent (car le virus est sous forme d’acide nucléique) par la formation d’un complexe -> acide nucléique génomique + MP
comment se fait le mouvement sur longues distances?
- passif
- via le parenchyme phloémique et les cellules compagnes
- de la source vers les puits
propriétés des protéines de mouvement de cellule à cellule
- liaison de la MP à l’ARNsb pour le passage par les plasmodesmes
- augmentation de la limite d’exclusion des plasmodesmes
- activité hélicase (défaire l’hélice)
- liaison avec le cytosquelette de la cellule hôte
- liaison avec la membrane de la cellule hôte
2 types de transmission des virus
verticale ou horizontale
transmission verticale
- à la déscendance de la plante infectée
VERTICALE PAR LES GRAINES
- plus rare car virus infectent difficilement les semences
- embryon est infecté ou les téguments de la graine sont contaminés
VERTICALE VÉGÉTATIVE
- tous les organes de multiplication végétative (bouture, tubercule, bulbe…) peuvent entraîner l’infection de la descendance
* moyen de lutte = méristèmes, car majorité des virus sont exclus des méristèmes)
transmission horizontale
- à d’autres plantes de la même espèce ou à d’autres espèces
PAR LE POLLEN ET LES POLLINISATEURS
- exceptionnelle
- inoculation plante saine par du pollen infecté = graines virosées sur un plant mère sain
MÉCANIQUE
- outils et microblessures
- greffe, travailleurs
- vecteurs
moyens de lutte aux virus
- HYGIÈNE (eau de javel, moustiquaires, hygiène travailleurs, pas de cigarette…)
- SEMENCES PROPRES/DÉSINFECTÉES (virus souvent visuel)
- ÉLIMINATION DES VECTEURS (insecticides)
- RÉSISTANCE GÉNÉTIQUE (cultivars résistants)
talon d’achille des virus?
TRADUCTION -> aucune traduction = aucune protéine virale = aucune infection
virus sont 100% dépendants de la machinerie de l’hôte pour la traduction de leur bagage génétique en protéines
résistance génétique au virus
peut être:
- récessive
- dominante (relation gène pour gène, reconnaissance du gène AVR spécifique de l’Agent pathogène)
- polygénique
- basé sur ARNi
Résistance VS Tolérance VS Immunité
RÉSISTANCE = très peu d’accumulation de virus et réaction hypersensible
TOLÉRANCE = bon rendement, sans symptômes, malgré une forte accumulation de virus dans la plante
problématique pour l’industrie de la pdt
IMMUNITÉ = aucune réplication du virus
pourquoi la tolérance est problématique pour l’industrie de la pdt?
- cultivars tolérants agissent comme un réservoir de virus…
- sélection/certification visuelle des tubercules = évolution des souches du virus PVY
- cultivars avec feuillages asymptomatiques mènent à sous estimer les souches PVYn
- YUKON GOLD est tolérant au PVYn … mais les fermes à côté produisent des JEMSEG … virus vient avec vecteurs (insectes, vent) = nécroses +++ sur tubercules car Jemseg non tolérant = baisse revenus
- humains exercent une force sélective en essayant d’éviter les virus…
mécanismes de l’interférence de l’ARN (ARNi)
- mécanisme de résistance aux virus à ARN très efficace chez les plantes
- enzyme de la plante (ARN polymérase) synthétise un 2e brin à l’ARN viral
- on ne retrouve jamais d’ARNdb dans le cytosol des eucaryotes, alors il est immédiatement reconnu comme étrangé par l’ARNi
- ensuite, les endonucléases «DICER» font le clivage des ARNdb viraux en petits ARNs
- le complexe RISC dégrade les petits ARNs et cible l’ARNsb viral par homologie
- approche efficace chez la papaye transgénique (Hawaï)
stratégie chez les virus pour contrer l’interférence de l’ARNi
virus de plantes expriment des suppresseurs de silencing (VSR)
synergisme entre virus
chaque virus à son VSR… donc plus difficile à contrer pour la plante s’il y en a plus qu’un
rétablissement
plante peuvent récupérer ou se rétablir d’une infection mettant en jeux l’interférence de l’ARNi
plantes sont ensuite immunisées contre toute autre infection par le même virus
protection croisée
plantes sont immunisées ou très résistantes à une souche virulente de virus quand elles ont été préalablement inoculées avec une souche hyppovirulente ou latente
- majorité Du génome est identique donc il est reconnu quand même
