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Bibitte 1 > Virologie > Flashcards

Virologie Flashcards

1
Q

Pourquoi on étudie la virologie ?

A

Médiacaments antiviraux

Vaccins

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Q

Virus sont très petits

A

300 nm

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3
Q

Transfert horizontal des gènes

A

Quand un organisme intègre le matériel génétique d’un autre organisme sans en être le descendant

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4
Q

Virus ont une grand … et sont …

A

Diversité génétique

Mutés rapidement

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5
Q

1er virus animal identifié

A

Virus de la fièvre aphteuse

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6
Q

Mimivirus

A

Mimicking Microbe Virus

« Virus géant »

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7
Q

Spoutnik

A

Appelé virophage par analogie avec bactériophage

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8
Q

5 critères pour différencier virus d’un autre organisme vivant

A

1) 1 seul type d’acide nucléique (ADN vs ARN)
2) Se reproduit à partir de son seul acide nucléique
3) Incapable de croitre et de subir des divisions binaires
4) Contient aucune information génétique concernant les enzymes du métabolisme intermédiaire producteur d’énergie
5) Pour se multiplier, a besoin des structures de la cellule hôte (surtout ribosomes) –> parasite intracellulaire obligatoire

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9
Q

Définition biologique d’un virus

A

1) Intracellulaire variable

2) Extracellulaire: le virion

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10
Q

C’est quoi le virion

A
  • contient l’acide nucléique
  • c’est la particule virale complète
  • représente l’unité structuale du virus
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11
Q

Qu’est-ce que la partie la + externe du virion détermine ?

A

infectiosité

tropisme

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12
Q

3 types de symétrie + exemples

A

1) Hélicoïdale (grippe + mosaïque du tabac)
2) Icosaédrique (adénovirus + polyomavirus)
3) Complexe (poxvirus + bactériophage)

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13
Q

Le nom donné aux + grands virus des animaux ?

A

Poxvirus

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14
Q

Capside constituée de …

A

Capsomères (= unités protéiques identiques entre elles) qui sont reliées de façon non covalente = protomères

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15
Q

Phages caudés ont …

A

T2, T4, T6

Symétrie binaire: tête icosaédrique + queue hélicoïdale

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16
Q

5 formes de base des particules virales ?

A
  • icosaédrique nu
  • icosaédrique enveloppé
  • hélicoïdale nu
  • hélicoïdale enveloppé
  • complexe
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17
Q

Enveloppe/péplos formée de …

A

combinaison de protéines + glucides + lipides

Dérive des membranes cellulaires d’origine plasmique, nucléaire ou d’autres organites

Glycoprotéines virales (spicules ou péplomères)
- spicules = anti-R viraux

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18
Q

Fonctions de l’enveloppe

A 
Hémagglutinante
Enzymatique
Morphologique
Antigénique
Site d'attachement
Fusion
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19
Q

Fonction des spicules

A

Fixation
Fusion
Activités enzymatiques

Une même spicule peut faire fixation + fusion

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20
Q

Quels virus sont + fragiles, nus ou enveloppés ?

A

Enveloppés

Nus résistent mieux dans le milieu extérieur et n’ont pas de prédominance saisonnière particulière (vs virus enveloppés qui sont surtout transmis pendant les saisons froides)

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21
Q

L’information génétique est proportionnelle …

A

à la taille du virus

à la taille du génome viral

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22
Q

types de génomes viraux

A

ADN simple brin = monocaténaire
ADN double brin = bicaténaire
ARN simple brin
ARN double brin

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23
Q

ARN + ou sens

A

peut être directement traduit en protéine

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24
Q

ARN - ou antisens

A

Doit d’abord être traduit en ARN + pour ensuite pouvoir être traduit en protéine

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25
Q

Caractéristiques virus à ADN

A

Stable biochimiquement
Stable génétiquement
Taux de mutations sont très faibles
Servent directement de matrice à la réplication + formation de l’ARNm

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26
Q

Caractéristiques virus à ARN

A

Peu stable biochimiquement
Peu stable génétiquement
Taux de mutations sont très élevés
Jouent un double rôle de matrice pour la formation d’ARNm + ARN

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27
Q

Arbovirus

A

Virus qui se transmet d’un vertébré à un vertébré par un arthropode hématophage qui joue le rôle de vecteur

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28
Q

Système universel de classification

A

1) nature de l’acide nucléique
2) symétrie de la nucléocapside
3) présence / absence enveloppe
4) nb de capsomères pour les virus à nucléocapside icosaédrique ou diamètre de la nucléocapside pour les virus hélicoïdaux

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29
Q

Classifcation de Baltimore

A

7 groupes

selon particularités du génome

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30
Q

Agents infectieux plus simples que des virus

A

Viroïdes

  • ARN simple brin
  • sans capside

Virusoïdes
- VHD ne code pas pour sa propre protéine de fixation

Prions

  • agent infectieux de nature protéine: c’est une glycoprotéine dont les chaines sont repliées incorrectement
  • ni un virus ni une bactérie
  • absence de matériel génétique
  • impliqué dans des maladies du cerveau: encéphalopathie spongiforme
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31
Q

Agents infectieux peuvent-ils exister sans génome ?

A

oui

= protéines infectieuses (ex. prions)

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32
Q

Étapes de la réplication virale

A

Précoces

  • fixation = glycoprotéine (spicule/péplomère) - Rcell ou protéines (capsomère/protomères) - Rcell
  • pénétration
  • décapsidation

Stade de synthèse
- réplication, transcription, traduction

Tardives

  • assemblage et maturation
  • libération
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33
Q

Voies de pénétration (dans le cycle de la réplication virale)

A

1) injection (pour virus nus + bactériophages)
2) endocytose
3) fusion (pour tous les virus enveloppés)

Fusion peut se faire:

  • directement à la membrane plasmique après l’attachement du virus au R cell (ex. VIH)
  • après l’internalisation du virus par endocytose (ex. virus de l’influenza)
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34
Q

Où se fait l’étape d’assemblage + maturation (dans le cycle de réplication virale) ?

A

Virus à ADN : dans le noyau

Virus à ARN : cytoplasme

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35
Q

Comment se fait la libération (dernière étape cycle de réplication virale)

A

1) lyse cellulaire
2) bourgeonnement cytoplasmique
3) bourgeonnement nucléaire (pour virus enveloppés)

Cellule infectée produit 100-1000 particules virales mais ne sont pas nécessairement infectieuses

36
Q

4 types d’interaction virus-cellule

A

1) interaction abortive: le virus, une fois dans la cellule, ne peut pas se répliquer
2) interaction productive: virus entraine la destruction de la cellule infectée
3) interaction persistante: cellule résiste à l’infection et produit un virus sans être lysée
4) transformation maligne des cellules

37
Q

Qu’est-ce qu’un oncogène

A

Gène responsable des cancers

Capable de former des tumeurs par la transformation cellulaire

38
Q

Qu’est-ce qu’un oncovirus

A

Virus capable de causer des cancers (ex. polyomavirus)

39
Q

Qu’est-ce que le tropisme d’hôte

A

gamme d’hôtes

40
Q

Exemples zoonose

A

maladie de lyme
ebola
rage

41
Q

Concept de l’iceberg

A

Plusieurs virus nous infectent sans qu’on s’en rende compte. On voit seulement une faible proportion des virus (la point de l’iceberg) = virus pathogènes connus

42
Q

Facteurs qui déterminent si les virus sont à risque (capable de causer infection)

A

Pathogénicité
Gamme d’hôtes
Mode de transmission
Dose infectieuse

43
Q

Virus des groupes 2, 3 et 4 …

A

sont considérés comme des agents biologiques pathogènes

44
Q

types cellulaires possibles lors d’une infection virale

A

Cellule résistante = ne possède par de R permettant l’entrée du virus ( ou ne permet pas la réplication virale)

Cellule susceptible = possède 1 ou plusieurs R, mais le virus ne va pas nécessairement pouvoir se répliquer

Cellule permissive = permet la réplication du virus

45
Q

Qu’est-ce qui influence les modes de transmission

A

Humidité relative
Température
Infectivité des virus
Intensité de production de virus

46
Q

Conséquences transmission verticale ?

A

Avortements, malformations, immunotolérance envers le virus

47
Q

Transmission horizontale peut se faire comment ?

A

Directe:

  • contact physique
  • transmission sexuelle

Indirecte:

  • objets contaminés
  • sol
  • aliments et boissons
  • insectes et vecteurs piqueurs
48
Q

Excrétion virale se fait a/n …

A 
Voie digestive
Tractus uro-génital
Tractus GI
Système nerveux
Sang
Peau et muqueuses
49
Q

Infection localisée

A

réplication virale reste localisée près du site d’entrée du virus (ex. peau, système GI, système respiratoire)

localisation de l’organe cible: porte d’entrée

durée de l’incubation : quelques jours

50
Q

Infection généralisée (systémique)

A

Virémie primaire: propagation à d’autres organes sensibles (foie, rate) par circulation sanguine

Virémie secondaire: multiplication du virus à des sites secondaiers

**Virémie = présence du virus dans le sang

localisation organe cible: à distance de la porte d’entrée

durée de l’incubation: plusieurs semaines

51
Q

Site de réplication primiare =

A

site a/n duquel le virus se réplique au début de l’infection

52
Q

types d’infection virale ?

A

1) infection abortive: échec, élimination

2) infection aiguë : majorité des infection virales
- rapide et autolimant: production rapide de virus et élimination de l’infection

3) infection persistante : quand les défenses de l’hôte sont modulées ou contournées
- latente = version extrême d’infection persistante
- chronique = réplication virale en continue
- chronique lente

53
Q

En quoi consiste une infection latente (dans la catégorie d’infection persistante)

A

Pas une grande production de virions
Présence du génome viral intact
Virus latents peuvent se réactiver
Réponse immunitaire réduite/absente

54
Q

Système de défense de l’hôte

A

Barrières anatomiques, chimiques ou physiques
Défense intrinsèque
Immunité innée
Imunnité acquise

55
Q

Types d’infection
Type d’interactions virus-cellule
Type de cellules lors d’infection

A

interaction:
- abortive
- aiguë
- persistante

interaction:

  • abortive
  • productive
  • persistante
  • TMC

cellules:

  • résistante
  • susceptible
  • permissive
56
Q

Définition symptôme

A

signe clinique qui représente une maladie, tel qu’exprimé et ressenti par le patient

57
Q

Période d’incubation

A

temps entre l’entrée d’un agent pathogène et l’apparition de signes/symptômes

58
Q

Virulence virale
quels types de trait
dépend de ?

A

trait quantitatif: représente l’étendue de la pathologie

Peut aussi être un trait relatif: différences dans le degré de pathologie causé par les souches du même pathogène

**Vs pathogénicité = trait qualitatif

Dépende de :

  • capacité à entrer dans la cellule
  • capacité à croitre dans la cellule
  • capacité à combattre les mécanismes de défense de l’hôte
  • capacité à produire des dommages temporaires ou permanents chez l’hôte
59
Q

Transmissibilité

A

efficacité avec laquelle un pathogène est transmis à un hôte sain

60
Q

Défenses intrinsèques de l’hôte

A
  • Absence d’expression d’un R
  • Autophagie
  • Apoptose
  • Protéines antivirales
61
Q

Où sont localisés NLRs, TLRs et RLRs ?

A

TLRs = membranaire

RLRs + NLRs = cytosolique

62
Q

Mécanismes d’action des Ac neutralisants

A

1) Vont inhiber l’attachement du virus au R cell
2) Blocage de l’internalisation de la particule virale dans la cellule
3) Inhiber la décapsidation ou localiser les virus dans les endosomes incompétents pour la décapsidation
4) bloquer la réplication virale
5) agrégations de particules virales

63
Q

ADE avec virus de la Dengue

A

ADE = antibody-disease enhancement (anticorps facilitant)

Les Ac dirigés contre le virus de la Dengue vont stimuler l’infection

64
Q

Stratégies virales pour éviter la réponse immunitaire

A
  • infection latente
  • mutation
  • cibler les cytokines de l’hôte
  • lyse des cellules immunitaires
  • inhiber le complément
  • inhiber la reconnaissance immunitaire
65
Q

Facteurs viraux et de l’hôte qui vont affecter la pathogenèse

A

hôte:

  • réponse immunitaire
  • stabilité

virus:

  • dosage
  • vitesse de réplication
  • voies d’entrée
  • virulence
66
Q

Qu’est-ce que la pathogenèse virale

A

mécanisme par lequel les virus vont endommager de petites ou grandes populations de cellules de divers organes menant aux signes/symptômes d’une maladie

67
Q

Mécanismes de la pathogenèse virale

A

1) Dérégulation du cycle cellulaire et de l’apoptose: inactivation des suppresseurs de tumeurs
2) Oncogène viral: virus exprime 1 ou +sieurs protéines perturbant la divsion cellulaire
3) Mutagenèse insertionnelle: intégration du génome viral dans le génome cellulaire est susceptible d’entrainer une prolifération incontrôlée de cellules

68
Q

2 types de variations génétiques (donc antigéniques)

A

saut antigénique

dérive antigénique

69
Q

Réassortiments sont à l’origine de …

A

nouveaux sous-types

70
Q

Définition dx direct + 4 approches possibles

A

mettre en évidence virus ou un de ses constituants

1) microscopie électronique (concentration crtitique de virions détectable = 10^6 par mL)
2) hybridation des acides nucléiques
3) isolement viral
4) hémagglutination

71
Q

Définition dx indirect

A

on recherche les immunoglobulines spécifiques dirigés contre un virus en particulier

72
Q

ELISA direct, indirect, sandwich

A

direct: rapide
indirect: +sensible
sandwich: antigène entre 2 Ac

73
Q

PCR avantage désavantage

A

Avantage:

  • spécifique et sensible
  • coût faible à moyen
  • rapide

Désavantage:
- contamination qui risque de donner des résultats faux positifs

74
Q

Bénéfices du test d’agglutination

A

rapide
précis
permet de déterminer la quantité relative de certains virus

75
Q

isolement viral et culture de cellules

A 
Culture sur animaux
Culture sur oeufs de poules embryonnés
Culture cellulaire:
 - primaire
 - diploïdes
 - d'organe
 - en lignée continue
76
Q

Définition effet cytopathogène ou cytopathique (ECP) et ça dépend de quoi

A

changements morphologiques visibles des cellules lors d’une multiplication virale

Dépend :

  • virus
  • nature de la cellule infectée
77
Q

Syncytia

A

Cellule géante polynucléaire

formée par la fusion de plusieurs cellules

78
Q

Seule méthode d’observation directe

A

ME

79
Q

Méthodes indirectes, séropositivité et séroconversion

A

ELISA, PCR, qPCR, RT-PCR, hémagglutination, détection ECP

Séropositivité: présence d’Ac
Séroconversion: apparition d’Ac sur 2 sérums successifs

80
Q

Quelles méthodes ne quantifient pas les particules infectieuses

A

ME, ELISA, agglutination

81
Q

Formule pour quantifier titre infectieux

A

UFP / mL

nb de plages de lyse x dilution) / Volume (en ml

82
Q

DICC50

A

Dose infectieuse en culture de cellules = dilution virale ayant un effet cytopathogène sur 50% des cellules en culture

83
Q

DL50

A

Dose létale = dilution limite à laquelle 50% des organismes hôtes sont détruits / morts

84
Q

Que permet de détecter un test de neutralisation ?

A

les Ac neutralisants spécifiques au virus dans l’échantillon

85
Q

Nouvelles opportunités environnements

A
  • augmentation des échanges internationaux
  • changements climatiques
  • augmentation migration + déplacements humains
  • urbanisation, augmentation de la densité de la population
  • invasion d’endroits où les humains ne sont jamais allés
86
Q

Quel type d’interaction virus-cellule est in vitro l’équivalent de l’ECP ?

A

interaction productive

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