Virologie Flashcards
Vrai ou faux: tous les organismes peuvent être affectés par les virus
Vrai
Pourquoi est-ce qu’il y a encore un débat savoir si les virus sont vivants on non?
Parce que:
- À l’extérieur d’un cellule, les virus sont inertes et n’ont pas de métabolisme. C’est un amat de molécules organiques
- À l’intérieur d’une cellule, il produisent des molécules et font des réactions qui sont propres au vivant
Qu’elle est l’unité infectieuse de base?
Le virion
Quel est le but de virus lorsqu’ils infectent une cellule?
Produire des particules virales en monopolisant les activités cellulaires
Quels sont les consituants de base de la structure des virions?
- Acide nucéique
- Capside
- Enveloppe (fréquente, mais pas chez tous les virus)
Quelles sont les différences entre les acides nucléiques des cellules et ceux des virus?
Cellule: ADN:2 et ARN
Virus: ADN OU ARN (jamais les deux), double brin, simple brin, circulaire, linéaire, unique ou multiple
Quelles sont les molécules qu’un virus possède et qui sont absentes de la cellule infectée?
ADN:1 ou ARN:2
Gènes codants pour des enzymes virales impliquées dans la réplication de ses acides nucléiques
Quel est le type d’acide nucléique retrouvé chez Sars-Cov-2?
ARN monocaténaire (ARN:1)
Combien de gènes possède le virus Covid-19?
Environ 30, puisque la taille de son génome est de 30kb et qu’un gène est environ 1kb
Vrai ou faux: les virus ont des chromosomes
Faux, ils ont plutôt un génome fragmenté.
Les virus sont
a) Haploïdes
b) Diploïdes
a) Haploïdes
Quel sont les rôles de la capside et quelle est la sous-unité de base?
- Rôles: protège les acides nuléiques, donne la forme au virion et attachement à la cellule cible
- Sous-unité: capsomères, formés de protomères
Quels sont les types de symétries de la caspide?
- Polyédrale
- Hélicoïdale
- Binaire (mixte)
Nomme un type de capside polyédrale
L’icosaèdre, formé de 20 triangles (20 faces)
Quels sont les avantages de la capside polyédrale?
- Offre un rapport surface/volume élevé
- Les virus ayant cette forme de capside sont de tailles variées
Combien de types de capsomères ont les capsides polyédrales et hélicoïdales?
- Polyédrale: 3 types (face, arrête et sommet)
- Hélicoïdale: 1 seul type
La capside hélioïdale forme un tube __.
Creux (acide nuléique)
Nomme 2 virus qui ont une capside hélicoïdale
- Mosaïque du tabac
- Sars-Cov-2
Défini la capside binaire
Composée de 2 types de symétrie:
- Tête: polyédrale
- Queue: hélicoïdale
Propre aux bactériophages
Vrai ou faux: l’enveloppe n’est pas synthétisée par le virus lui-même
Vrai, elle est dérivée de la membrane cyto. ou nucléaire de l’hôte lors de la sortie du virus
De quoi est composée l’enveloppe?
- Phosholipides
- Protéines cellulaires
- Glycoprotéines virales (péplomères)
Nomme des exemples de péplomères
Virus de l’influenza
- Hémagglutinine (H) : agglutine les globules rouges
- Neuraminidase (N) : digère l’acide neuraminique et facilite la libération des nouveau virus
Nomme 2 utilités aux péplomères H et N
- Identification des virus de l’influenza
- Cibles des vaccins contre la grippe
Le virus de la covid-19
A) est enveloppé
B) n’est pas enveloppé
et a une capside
C) polyédrale
D) hélicoïdale
E) binaire
Est enveloppé et a une capside hélicoïdale
Qu’est-ce que le vaccin contre la covid-19 vise?
Ses cibles sont les glycoprotéines spicules (péplomères) de l’enveloppe
Quels sont les rôles de l’enveloppe?
- Protection contre le système immunitaire (ex: hémagglutinine)
- Reconnaissance des récepteurs de la cellule hôte
- Pénétration/sortie de la cellule
Quels sont les rôles des nucléoprotéines (protéines internes de la capside)?
- Empaquetage acides nucléiques viraux
- Réplication et lecture des acides nucléiques viraux
> Elles sont absentes de la cellule infectée
Quelle est la taille moyenne du virion?
10 à 400 nm
Mimivirus (géant): 1000nm
Vrai ou faux: réplication est synonyme de reproduction
Faux
Réplication = production de copies virales
Quelles sont les 5 étapes du cycle viral?
- Adsorption à la surface de la cell. hôte
- Pénétration de la cellule
- Réplication des constituants viraux
- Assemblage des constituants
- Sortie des virus
Explique la 1e étape du cycle viral
Adsorption: en 2 phases
1. Reconnaissance (réversible): collisions au hasard
2. Attachement (irréversible): dépend de la complémentarité virus-récepteurs (pas de récepteur, pas d’infection) et détermine la spécificité du virus
Est-ce que tous les virus ont besoin d’un récepteur pour infecter les cellules?
Non, les virus des plantes n’utilisent pas de récepteurs. Ils pénètrent par des abrasions
Explique la deuxième étape du cycle viral pour les bactériophages
Pénétration
- L’acide nucléique seulement pénètre à l’intérieur, alors que la capside reste à l’extérieur
- Injection spontanée grâce aux différences de pression osmotique (cytoplasme vs intérieur de la cellule)
Explique la deuxième étape du cycle viral pour les virus animaux
Pénétration, 2 mécanismes
- Certains virus enveloppés: fusion directe de la membrane et de l’enveloppe et formation d’un endosome
- Capside nue et virus enveloppés: endocytose (viropexie)
Que se passe-t-il une fois que le virus a fusionné/été phagocyté?
- Libération de la nucléocapside dans le cytoplasme, puis décapsidation = libération des acides nucléiques
- Début de la phase d’éclipse: on ne voit plus le virus au microscope électronique
Explique la 3e étape du cycle viral
Réplication des constituants viraux
1. Évènements précoces: cellule forcée de produire les enzymes de réplication et de lecture de l’acide nucléique
- La qté d’acides nucléiques augmente
- Coupure/dégradation du chromosome bactérien pour éliminer la compétition
2. Évènements tardifs: production des protéines de structure (capsomères, péplomères, enzymes de lyse, protéines de queue)
Explique la 4e étape du cycle viral pour les capsides polyèdrales
Assemblage des constituants
ENCAPSIDATION
- Interaction acides nucléiques - capsomères = fermeture capside
Peut avoir une erreur d’encapsidation due à la transduction généralisée
Explique la 4e étape du cycle viral pour les capsides hélicoïdales
ENCAPSIDATION
- Interaction acides nuc. - capsomères = empilement hélicoïdal = bâtonnet creux
SARS-COV-2: protéine N et ARN:1
Explique la 4e étape du cycle viral pour les capsides binaires
ENCAPSIDATION
La queue et la tête on des assemblages indépendants, complexe
Sera assemblé
À quel moment la phase d’éclipse se termine-t-elle?
À la 4e étape du cycle, soit l’assemblage des constituants
Entre les virus animaux et les phages, lesquelles ont la phase d’éclipse la plus courte?
Les phages: quelques minutes
Virus animaux: 1 à 10 heures
Explique la 5e étape du cycle cellulaire selon les types de virus et le devenir de la cellule hôte
SORTIE DES VIRUS
- Virus nu: lyse cellulaire (mort)
- Virus enveloppés: bourgeonnement (survie)
- Virus à réplication nucléaire: canaux cellulaire (survie)
Combien de virus sont produits par cellule environ?
- Virus animaux: 10^3 à 10^6
- Phages T-pair: 10^2 à 10^3
Comment peut-on identifier un virus enveloppé VS un virus à capside nue?
Avec un traitement au chloroforme
- Capside nue: capacité à infecter inchangée
- Enveloppé: sensible au chloroforme et perd sa capacité à infecter
Quels sont les critères de classification des virus?
- Type d’acide nucléique (ARN, ADN, :1 ou :2)
- Présence d’une enveloppe?
- Processus de réplication des acides nucléiques
- Taille seulement visible au ME
- Propriétés immunologiques
- Nombre de capsomères
- Nombre de gènes
- Site de réplication (cyto ou noyau), tissus ou hôte
Quel type de nomenclature utilise-t-on pour les virus?
Nomenclature linnéenne
- Ordre: Virales
- Famille: Viridae
Les cultures de cellules servant à isoler les virus doivent être des cellules __.
Vivantes
Dans quelles conditions de culture peut-on isoler les bactériophages?
- Culture: cellules bactériennes vivantes, sensibles aux phages et qui sont métaboliquement actives pour fournir des précurseurs pour la réplication
- Si infection = plages de lyse de laquelle on peut récolter et isoler les virus qui ont formé cette plage
Peut-on visualiser une infection de bactériophages dans une culture liquide?
Oui, si la culture liquide contient des bactéries en suspension et qu’elles sont infectées par les bactériophages, il y aura une baisse de la densité optique (DO). Celle-ci pourra être mesurée à l’aide d’un spectrophotomètre.
Quelles sont les manières d’isoler des virus animaux?
- Oeufs embryonnés de poulet: permet d’obtenir une grande qté de virions et d’identifier les virus en analysant les glycoprotéines (péplomères) de l’enveloppe.
Exemple de virus: Influenza
- On identifie le virus en identifiant l’hémagglutinine (H) et la neuraminidase (N) - Culture de tissus: permet la réplication de virus plus exigeants. Produit des effets cytopathiques caractéristiques:
- Cellules arrondies
- Changer de volume
- Agrégation ou corps d’inclusion
- Syncitia (grosses cellules multinucléées du à la fusion de cellules)
- Lyse
Quelles sont les manières d’identifier un virus?
- Microscope électronique: capside, enveloppe, site de réplication
- Réaction avec anticorps marqués: immunofluorescence
- Infections expérimentales
- Séquence de l’acide nucléique
Que veut-on dire par « ADN égoïstes » ?
Cela signifie que les virus proviennent d’ADN spécialisés dans l’autopropagation. La transcription/traduction de ces gènes produit des protéines qui servent juste à sa propre réplication.
Ces ADN ont aussi acquis des gènes codant pour des capsides.
Pourquoi les virus ont-ils une évolution aussi rapide?
Cela est dû au grand nombre d’erreurs commises par les polymérases. Cela introduit des mutations qui peuvent conférer des avantages aux virus, comme la capacité d’infecter des nouvelles cellules ou une résistance au traitement.
Ex: il y a des variations du VIH dans un même patient
Vrai ou faux: les virus sont les entités biologiques qui représentent la plus grande portion de la biomasse
Faux, ils représentent la plus grande portion de l’abondance.
Les Archaea et les Bacteria sont la plus grande proportion de la biomasse.
Vrai ou faux: les virus ont un rôle essentiel dans les écosystèmes
Vrai
- Participent aux cyles du C et de l’azote (N) et constituent une source de nutriments pour les protistes
- Contrôle des populations (ex: algues rouges)
- Court-circuit (viral shunt) des cycles de la matière en libérant de la matière organique dans l’environnement
Quel type d’agent infectieux acellulaire est reponsable des tubercules en fuseau de la pomme de terre?
Viroïdes (phytopathogènes)
- ARN:1 circulaire qui ne code pour AUCUNE protéine
- Sans capside ni enveloppe
- Trèès petit
Comment le fait d’avoir de l’ADN de rétrovirus endogène dans notre génome affecte le développement?
Chez les primates, cela peut changer le temps de gestation, car le virus s’est inséré en amont de la séquence de l’hormone qui régule ce temps.
Comment les viroïdes font pour se propager s’ils sont seulement constitués d’ARN:1, ce qui est très instable.
Ils se propagent de cellule en cellule, via le pollen et entrent dans une cellule de plante lors d’une abrasion.
Quel type d’agent infectieux nécessite la présence d’un autre virus dans la cellule?
Virusoïde: besoin d’un virus auxiliaire pour acéquirir la capside et/ou l’enveloppe
Ex: virusoïde hépatite D qui a besoin du virus de l’hépatite B
- Son ARN:1 circulaire possède une activité ribozyme, qui lui permet de s’auto-cliver et se circulariser
Nomme 2 différences entre les viroïdes et les virusoïdes
- Les virusoïdes codent pour une protéine: delta
- Les virusoïdes se répliquent dans le cytoplasme alors que les viroïdes dans le noyau
Quel est le mécanisme d’action des virophages et donne un exemple de virophage.
Mécanisme d’action: infecte les mégavirus, utilisent leurs enzymes pour se répliquer, s’intègre à leur génome et diminue leur efficacité.
Exemple: Sputnik (Mimi et Mamavirus)
Qu’est-ce qu’un prion?
Protéine infectieuse, sans capside ni acides nucléiques
- Très petit: 100x plus petit que le plus petit virus
- Se propage en convertissant une protéine normale (PrPc) en protéine anormale (PrPsc)
- Accumulation de PrPsc = agrégats fibreux
- Cause des pathologies chez les animaux et des maladies neurodégénératives chez l’humain
Pourquoi est-ce difficile d’éliminer les prions et comment peut-on les éliminer?
- Difficile, car extrêment résistants aux rayonsUV, protéases et autoclave
- Mettre dans l’autoclave à 134°C pendant 18min
Pourquoi est-il impossible de fabriquer un vaccin contre la maladie à prion?
Parce que la protéine affectée, PrPc, est une protéine du soi. Cela signifie qu’elle ne déclenche pas de réponse immunitaire puisque nos cellules la reconnaissent.
