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Biomol > VIb. Genóma estructural > Flashcards

VIb. Genóma estructural Flashcards

1
Q

Principales objetivos de la genómica estructural

A
  1. Identificación y estudio de la secuencia del genoma y sus variantes, polimorfismos, mutaciones, repeticiones, inserciones
  2. Localización y construcción de mapas
  3. Identificar y predecir la conformación tridimencional y funciones de proteínas codificadas
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2
Q

V o F. Los sujetos que forman una especie muestran un mismo grupo de genes con la diferencia de diferentes alelos

A

Verdadero

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3
Q

Contenido único de información genética

A

Genoma

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4
Q

El __________________ ___________________ de _______________ es conciderado el centro de los procesos que concierne a los ácidos nucleicos

A

Apareamiento complementario de bases

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5
Q

¿Qué es la temperatura de fusión?

A

Temperatura a la cual una doble cadena de DNA se desnaturaliza

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6
Q

A mayor _____________ mayor Tm

A

GC

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7
Q

La Tm depende de:

A

Longitud de la cadena
Proporción de G-C

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8
Q

Fenómeno por el que el que las 2 hebras de DNA reconstruyen la doble hélice

A

Renaturalización

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8
Q

V o F. La renatularización aparece cuando dos hebras de fueron separadas por la desnaturalización

A

Verdadero

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9
Q

La disminución radual de temperatura es una característica en la _____________

A

Renaturalización

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10
Q

V o F. La hibridación se da cuando los ácidos nucleicos provienen de la misma fuente

A

Falso, provienen de fuentes diferentes

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11
Q

V o F. En la hibridación, los ácidos nucleicos no estaban formando previamente una doble cadena

A

Verdadero

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12
Q

La temperatura de fusión (Tm), corresponde a la ___________ del incremento de la __________

A

Mitad
absorbancia

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13
Q

Una secuencia de alto contenido de ______ exhibe un _________ de Tm

A

CG
Aumento

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14
Q

Factor que brinda la información de la complejidad de los genomas

A

Cinética de renaturalización

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15
Q

Para ver la cinética de renaturalización, primero el genoma se ___________

A

Fragmenta

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16
Q

Al fragmentar el genoma para la cinética de renaturalización, cuando ___________ sea el tamaño del genoma, _________ es el numero de genomas en un peso partícular de ______

A

menor
mayor
DNA

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17
Q

Una solución con ___________ incubada por breve tiempo tiene la misma Cot que una de _________ incubada en un mayor lapso de tiempo

A

Elevada DNA
Baja DNA

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18
Q

V o F. Los genomas eucariotas son más complejos que los virales o bacterianos

A

Verdadero

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19
Q

V o F. Los fragmentos de DNA procariota se renaturalizan a diversas velocidades

A

Falso, es el eucariota

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20
Q

En una preparación de fragmentos de ______________, las secuencias de nucleótidos se encuentran presentes en concentraciones ___________

A

DNA eucariota
variables

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21
Q

V o F. El DNA de la bacteria posee una organización más compleja que el DNA eucariota

A

Falso, el dna eucariota es más complejo

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22
Q

¿Cuáles son las fracciones de la renaturalizaión?

A

Muy repetida
Moderadamente repetida
No repetida

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23
Q

Fracción de la renaturalización que presenta hasta el 10% del DNA total

A

Fracción muy repetida

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24
Q

¿Dónde se encuentran las fracciones muy repetidas de la renaturalización?

A

Centromeros y heterocromatina

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25
Q

Las fracciones muy repetidas estan en ________ ___ ___________

A

Repetición en tandem

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26
Q

Tipos de repeticiones en tandem que se generan en las fracciones de renaturalización

A

Satélites
Minisatélites
Microsatélites

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27
Q

Tipo de repeticiones en tandem que a partir de secuencias cortas (5-pocos cientos pb) forma segmentos muy largos

A

Satélite

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28
Q

Las secuencas minisatélite tienen una lóngitud de __________ en segmentos de unas ____________ repeticiones

A

10-100 pb
3000

29
Q

V o F. La longitud del locus minisatélite específico es muy variable en la población

A

Verdadero

30
Q

En le repetición de minisatélite, el numero de repetidos __________ o ___________de una generación a otra dependiendo del resultado de __________________ _____________________ durante la __________

A

Aumenta
disminuye
Entrecruzamiento desigual
meiosis

31
Q

¿Cuántas regiones repetidas de microsatélie hay e el genoma humano?

A

> 100,000

32
Q

Repetición en tandem, donde las secuencias son muy cortas y en pequeños segmentos de 10-40 pb

A

Microsatélite

33
Q

V o F. Las fracciones de repetición en tandem de microsatélites es muy uniforme en todo el DNA

A

Verdadero

34
Q

Tipos de fracciones de renaturalización que tiene funciones codificantes y no codificantes en diversas regiones

A

Moderadamente repetida

35
Q

¿Dónde se encuentran las fracciones moderadamente repetidas con funciones codificantes?

A

Histonas

36
Q

¿Dónde se encuentran las fracciones moderadamente repetidas sin funciones codificantes?

A

rRNA, tRNA

37
Q

Fracciones de renaturalización que representa solo el 1.5% del genoma humano

A

No repetidas

38
Q

V o F. Las fracciones de renaturalización no repetidas se encuentra en todas las proteínas excepto en las histonas

A

Veradero

39
Q

Tipo más común de variación genética en humanos

A

Single Nucleotide Polymorphisms

40
Q

El SNP, son las variaciones en un ________ nucleótido presente en el ____ de la población

A

único
1%

41
Q

En la mayoria de los SNP existen 2 ___________ __________

A

Alelos alternos

42
Q

V o F. Los SNPs pueden o no estar en la región codificante del gen

A

Verdadero

43
Q

Lugar donde el SNP esta relacionada con una enfermedad y tiene más impacto sobre la función de una proteína

A

Región codificante

44
Q

V o F. Solo los SNP relacionados con la región codificante pueden estar relacionados con enfermedades

A

Falso, puede ser con cualquier

45
Q

Los SNPs, pueden no estar involucrados en una ____________, pero si están asociados a los _________ relacionados a ella se usan como _____________ __________

A

enfermedad
genes
marcadores moleculares

46
Q

Es el conjunto de variaciones del DNA o polimorfismos que tienden a ser heredados juntos por su cercania en el mismo cromosoma

A

Haplotipos

47
Q

Los haplotipos estan formados por la combinación con ______ o conjunto de ______

A

Alelos
SNPs

48
Q

V o F. Entre los haplotipos se forma el quiasma de recombinación

A

Falso, no se forma

49
Q

V o F. Los haplotios tienen un número determinado de variantes

A

Verdadero

50
Q

Cada variente de haplotipos se caracteriza por un grupo específico de _________ o ____ que se encuentran _________ en una combinación específica en cada _________ de diferentes miembros poblacionales

A

Alelos
SNPs
juntos
Cromosoma

51
Q

Mapas de baja resolución

A

Mapas genéticos

52
Q

Mapas de alta resolución

A

Mapas físicos

53
Q

En los mapas ____________, se encuentra la distancia real entre _________ basadas en ______________ de ________

A

Físicos
marcadores
Pares de bases

54
Q

Son diagramas que muestran la posición relativa de una secuencia o gen específico a lo largo del cromosoma

A

Mapa genético

55
Q

V o F. Dos locis juntos en una misma hebra de DNA, tienen una baja frecuencia de recombinarse en la mitosis

A

Falso, tienen una baja frecuencia de recombinarse en la meiosis

56
Q

¿Cuál es el porcentaJe de máxima frecuencia de recombinación de dos locis?

A

50%

57
Q

Como se le conoce cuando los locis se encuentran cerca o lejos para poder o no recombinarse entre ellos

A

Frecuencia de recombinación

58
Q

Porcentaje de que los locis queden en cromosomas separados

A

50%

59
Q

¿Cuál es la unidad del mapa genético de ligamiento?

A

Centimorgan

60
Q

¿A qué equivale un Centimorgan?

A

1% de frecuencia de recombinación= 1 unidad de mapa

61
Q

El tamaño de los fragmentos producidos por la _________ con la _____________________________ se puede incrementar terminando la reacción antes de que se complete el __________ en todos los sitios de _____________

A

digestión
Enzima de restricción
corte
reconocimiento

62
Q

Grupo de segmentos translapantes de DNA que forman una región conseso de DNA

A

Contig

63
Q

Porcentaje de redundancia de contigs que se obtiene

A

5-10%

64
Q

Las bibliotecas genómicas la utilizamos para la…

A

Secuenciación del genoma

65
Q

V o F. A la hora de ensamblar los contigs en orden correcto es necesario que esten conectados por secuencias contiguas

A

Falso, no es necesario

66
Q

El alineamiento de contigs ensambla___________ ___________ y aumenta la exactitud de la ____________ creando un consenso

A

Clones contiguos
Secuencia

67
Q

El orden correcto de los contigs puede estar interrumpido por los…

A

Gaps

68
Q

Pasos del Gap Filling Proyect

A

1- Diseño de primers
2- PCR
3- Secuenciación

69
Q

Proceso de añadir capas de análisis e interpretacion necesaria para extraer el significado biológico de las secuencias genómicas y ponerla en el contexto biológico

A

Anotación del genóma

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