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VIb. Genóma estructural Flashcards

1
Q

Principales objetivos de la genómica estructural

A
  1. Identificación y estudio de la secuencia del genoma y sus variantes, polimorfismos, mutaciones, repeticiones, inserciones
  2. Localización y construcción de mapas
  3. Identificar y predecir la conformación tridimencional y funciones de proteínas codificadas
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Q

V o F. Los sujetos que forman una especie muestran un mismo grupo de genes con la diferencia de diferentes alelos

A

Verdadero

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3
Q

Contenido único de información genética

A

Genoma

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4
Q

El __________________ ___________________ de _______________ es conciderado el centro de los procesos que concierne a los ácidos nucleicos

A

Apareamiento complementario de bases

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5
Q

¿Qué es la temperatura de fusión?

A

Temperatura a la cual una doble cadena de DNA se desnaturaliza

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6
Q

A mayor _____________ mayor Tm

A

GC

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7
Q

La Tm depende de:

A

Longitud de la cadena
Proporción de G-C

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8
Q

Fenómeno por el que el que las 2 hebras de DNA reconstruyen la doble hélice

A

Renaturalización

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8
Q

V o F. La renatularización aparece cuando dos hebras de fueron separadas por la desnaturalización

A

Verdadero

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9
Q

La disminución radual de temperatura es una característica en la _____________

A

Renaturalización

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10
Q

V o F. La hibridación se da cuando los ácidos nucleicos provienen de la misma fuente

A

Falso, provienen de fuentes diferentes

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11
Q

V o F. En la hibridación, los ácidos nucleicos no estaban formando previamente una doble cadena

A

Verdadero

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12
Q

La temperatura de fusión (Tm), corresponde a la ___________ del incremento de la __________

A

Mitad
absorbancia

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13
Q

Una secuencia de alto contenido de ______ exhibe un _________ de Tm

A

CG
Aumento

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14
Q

Factor que brinda la información de la complejidad de los genomas

A

Cinética de renaturalización

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15
Q

Para ver la cinética de renaturalización, primero el genoma se ___________

A

Fragmenta

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16
Q

Al fragmentar el genoma para la cinética de renaturalización, cuando ___________ sea el tamaño del genoma, _________ es el numero de genomas en un peso partícular de ______

A

menor
mayor
DNA

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17
Q

Una solución con ___________ incubada por breve tiempo tiene la misma Cot que una de _________ incubada en un mayor lapso de tiempo

A

Elevada DNA
Baja DNA

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18
Q

V o F. Los genomas eucariotas son más complejos que los virales o bacterianos

A

Verdadero

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19
Q

V o F. Los fragmentos de DNA procariota se renaturalizan a diversas velocidades

A

Falso, es el eucariota

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20
Q

En una preparación de fragmentos de ______________, las secuencias de nucleótidos se encuentran presentes en concentraciones ___________

A

DNA eucariota
variables

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21
Q

V o F. El DNA de la bacteria posee una organización más compleja que el DNA eucariota

A

Falso, el dna eucariota es más complejo

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22
Q

¿Cuáles son las fracciones de la renaturalizaión?

A

Muy repetida
Moderadamente repetida
No repetida

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23
Q

Fracción de la renaturalización que presenta hasta el 10% del DNA total

A

Fracción muy repetida

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24
¿Dónde se encuentran las fracciones muy repetidas de la renaturalización?
Centromeros y heterocromatina
25
Las fracciones muy repetidas estan en ________ ___ ___________
Repetición en tandem
26
Tipos de repeticiones en tandem que se generan en las fracciones de renaturalización
Satélites Minisatélites Microsatélites
27
Tipo de repeticiones en tandem que a partir de secuencias cortas (5-pocos cientos pb) forma segmentos muy largos
Satélite
28
Las secuencas minisatélite tienen una lóngitud de __________ en segmentos de unas ____________ repeticiones
10-100 pb 3000
29
V o F. La longitud del locus minisatélite específico es muy variable en la población
Verdadero
30
En le repetición de minisatélite, el numero de repetidos __________ o ___________de una generación a otra dependiendo del resultado de __________________ _____________________ durante la __________
Aumenta disminuye Entrecruzamiento desigual meiosis
31
¿Cuántas regiones repetidas de microsatélie hay e el genoma humano?
>100,000
32
Repetición en tandem, donde las secuencias son muy cortas y en pequeños segmentos de 10-40 pb
Microsatélite
33
V o F. Las fracciones de repetición en tandem de microsatélites es muy uniforme en todo el DNA
Verdadero
34
Tipos de fracciones de renaturalización que tiene funciones codificantes y no codificantes en diversas regiones
Moderadamente repetida
35
¿Dónde se encuentran las fracciones moderadamente repetidas con funciones codificantes?
Histonas
36
¿Dónde se encuentran las fracciones moderadamente repetidas sin funciones codificantes?
rRNA, tRNA
37
Fracciones de renaturalización que representa solo el 1.5% del genoma humano
No repetidas
38
V o F. Las fracciones de renaturalización no repetidas se encuentra en todas las proteínas excepto en las histonas
Veradero
39
Tipo más común de variación genética en humanos
Single Nucleotide Polymorphisms
40
El SNP, son las variaciones en un ________ nucleótido presente en el ____ de la población
único 1%
41
En la mayoria de los SNP existen 2 ___________ __________
Alelos alternos
42
V o F. Los SNPs pueden o no estar en la región codificante del gen
Verdadero
43
Lugar donde el SNP esta relacionada con una enfermedad y tiene más impacto sobre la función de una proteína
Región codificante
44
V o F. Solo los SNP relacionados con la región codificante pueden estar relacionados con enfermedades
Falso, puede ser con cualquier
45
Los SNPs, pueden no estar involucrados en una ____________, pero si están asociados a los _________ relacionados a ella se usan como _____________ __________
enfermedad genes marcadores moleculares
46
Es el conjunto de variaciones del DNA o polimorfismos que tienden a ser heredados juntos por su cercania en el mismo cromosoma
Haplotipos
47
Los haplotipos estan formados por la combinación con ______ o conjunto de ______
Alelos SNPs
48
V o F. Entre los haplotipos se forma el quiasma de recombinación
Falso, no se forma
49
V o F. Los haplotios tienen un número determinado de variantes
Verdadero
50
Cada variente de haplotipos se caracteriza por un grupo específico de _________ o ____ que se encuentran _________ en una combinación específica en cada _________ de diferentes miembros poblacionales
Alelos SNPs juntos Cromosoma
51
Mapas de baja resolución
Mapas genéticos
52
Mapas de alta resolución
Mapas físicos
53
En los mapas ____________, se encuentra la distancia real entre _________ basadas en ______________ de ________
Físicos marcadores Pares de bases
54
Son diagramas que muestran la posición relativa de una secuencia o gen específico a lo largo del cromosoma
Mapa genético
55
V o F. Dos locis juntos en una misma hebra de DNA, tienen una baja frecuencia de recombinarse en la mitosis
Falso, tienen una baja frecuencia de recombinarse en la meiosis
56
¿Cuál es el porcentaJe de máxima frecuencia de recombinación de dos locis?
50%
57
Como se le conoce cuando los locis se encuentran cerca o lejos para poder o no recombinarse entre ellos
Frecuencia de recombinación
58
Porcentaje de que los locis queden en cromosomas separados
50%
59
¿Cuál es la unidad del mapa genético de ligamiento?
Centimorgan
60
¿A qué equivale un Centimorgan?
1% de frecuencia de recombinación= 1 unidad de mapa
61
El tamaño de los fragmentos producidos por la _________ con la _____________________________ se puede incrementar terminando la reacción antes de que se complete el __________ en todos los sitios de _____________
digestión Enzima de restricción corte reconocimiento
62
Grupo de segmentos translapantes de DNA que forman una región conseso de DNA
Contig
63
Porcentaje de redundancia de contigs que se obtiene
5-10%
64
Las bibliotecas genómicas la utilizamos para la...
Secuenciación del genoma
65
V o F. A la hora de ensamblar los contigs en orden correcto es necesario que esten conectados por secuencias contiguas
Falso, no es necesario
66
El alineamiento de contigs ensambla___________ ___________ y aumenta la exactitud de la ____________ creando un consenso
Clones contiguos Secuencia
67
El orden correcto de los contigs puede estar interrumpido por los...
Gaps
68
Pasos del Gap Filling Proyect
1- Diseño de primers 2- PCR 3- Secuenciación
69
Proceso de añadir capas de análisis e interpretacion necesaria para extraer el significado biológico de las secuencias genómicas y ponerla en el contexto biológico
Anotación del genóma

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