Unité 7 Flashcards

1
Q

Systématique

  • définti
  • Sous-groupes
A

discipline dont l’objectif est de classifier les organismes et d’établir leurs liens évolutifs (leur lien parienté avec d’autres organismes). Il y a deux sous groupes
→ Taxonomie
→ Phylogenèse

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

→ Taxonomie

A

discipline qui désigne et qui classifie les organismes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

→ Phylogenèse

A

discipline qui étudie l’histoire de l’évolution d’une espèce ou d’un groupe d’espèces apparentées. Les étapes évolutives qui ont survenue pour faire en sorte qu’une espèce a l’air a se qu’elle a l’air aujourd’hui

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Arbre phylogénétique déf

A

diagramme arborescent hypothétique qui rend compte de l’histoire évolutive d’un groupe d’organismes et dans lequel chaque nœud représente l’ancêtre commun de ses descendants.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

La taxonomie/classification:

A

→ Le système linnéen groupe les espèces au sein d’une hiérarchie de catégories de plus en plus inclusives, qui sont basées sur des caractères communs

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

→Taxon déf

A

unité de classification; rang taxonomique identifié d’un groupe partageant un certain nombre de caractères, quel que soit le niveau hiérarchique de ce groupe (p. ex: espèce, genre, famille, ordre, etc.)
⇒ Les différents taxons ne sont pas nécessairement comparables (p. ex: les différences génétiques parmi les familles d’escargots sont substantiellement plus grandes que parmi les familles de mammifères)
→Un aspect clé du système linnéen est l’utilisation de la nomenclature binomiale

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

La nomenclature binomiale

A

→Ex: Tilleul d’Amérique (Tilia americana L.)
→ Premier mot première lettre majuscule, l’autre est minuscule
→ Nom scientifique: en Latin et en italique ou souligné
→ Nom du genre (premier mot) + espèce scientifique (deuxième mot) (+ auteur)
→ Ex. genre Tilia + espèce americana (+ auteur) Linnaeus = L.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

La taxonomie/classification

A

→Linné a élaboré cette classification en se basant sur les similarités morphologiques/structurales des organismes (rassemblent dans le même taxon)
→ Ces similarités sont souvent dues à un ancêtre commun. On les appelle alors structures homologues (homologie) Membres antérieur similaire mais fonction différent mais sont classé dans le même taxon:
→ Mais l’évolution convergente peut donner lieu à des traits analogues (analogie), et les espèces peuvent perdre secondairement un trait clé partagé avec des espèces apparentés (p. ex: les poils des baleines) Les baleines descendre d’un ancêtre terrestre poilu; ils ont perdu les poils pour être plus aérodynamique. Même si c’est un trait commun des mammifères cela ne veut pas dire qu’il n’est pas un mammifère
→ Regrouper en n’utilisant que quelques traits partagés spécifiques peut donc mener à des classifications linnéenes qui ne reflètent pas la phylogénie des organismes
→Depuis l’acceptation généralisée de l’évolution suivant la publication de l’Origine des espèces, il est généralement accepté que les classifications devraient refléter l’histoire évolutive des organismes (c.-à-d. leur phylogénie), une approche appelée cladistique.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Comprendre les arbres phylogénétiques

  • Déf de phylogénie
  • Comment on fait les arbres aujourd’hui vs le temps de linnée
A

Phylogénie déf: Étude des liens existant entre espèces apparentées
→Initialement, la phylogénie était faite à l’aide de similarités morphologiques (et c’est encore le cas pour les fossiles)
→ Aujourd’hui l’approche standard compare des séquences moléculaires (c.-àd. ADN, ARN, protéines)
→ Les résultats sont représentés sous la forme d’arbres phylogénétiques – des diagrammes arborescents hypothétiques qui rend compte de l’histoire évolutive d’un groupe d’organismes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Explique l’emplacement ou le format des arbres phylogénétiques

A

→ Le même arbre peut être représenté de différentes façons: (Peuvent etre horizontale, diagonale ou verticale)
→ Les arbres peuvent être tournés autour de leur axe; la proximité physique des taxons aux extrémités n’indiquent une proche parenté:
→Aucun taxon n’est “plus haut” ou “plus bas”, ou plus ou moins avancé qu’un autre:
→Les taxons ne sont pas plus ou moins “évolués”; toutes les espèces actuellement existantes partagent un ancêtre commun (ayant vécu il y a >3.5 B d’années) et donc ne diffèrent pas en termes de la longueur de leur histoire évolutive:
→ Les espèces aux extrémités n’ont pas de relation ancêtre/descendant; elles sont plutôt des espèces apparentées: (les humains ne sont pas les decendant des singes mais ont plutot toute les 2 un ancetre en commun)
→ Attention: les arbres peuvent paraître différents à cause de parties émondées et/ou englobantes:
(Si tu ajoute plus d’espèce spécialisé de pommes par exemples)
→ Ou bien parce que les taxons éteints ont été inclus ou exclus:

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

→Cladistique déf

A

méthode relevant de la systématique dont le principal critère de classification est l’ancêtre commun (c.-à-d. l’homologie)
→Implications:
⇒La taxonomie (c.-à-d. la classification) devrait réfléter l’histoire évolutive des organismes
⇒La phylogénie: les organismes devraient être organisés en séries de groupes imbriqués monophylétiques (c.-à-d. en clades) qui reflètent leur histoire évolutive
→L’évidence de l’ascendance partagée vient de l’étude de caractères dérivés communs

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Clade défintion

A

Groupe incluant une espèce ancestrale et tous ses descendants (vivants et éteints). Par définition, les clades sont monophylétiques:
-pas un clade si exclut un ou plusieurs espèces du groupe monophylétique
→Les clades sont imbriqués les uns dans les autres:
Un grand clade contient des plus petit clades

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

La construction de phylogénies

A

→Les phylogénies peuvent être construites à partir de données morphologiques ou moléculaires
→ L’évidence d’ascendance partagée vient de caractères homologues (c.-à-d. la similarité due à un ancêtre commun)
→ Les caractères analogues (c-à-d. qui sont similaires à cause d’un autre facteur, comme l’évolution convergente) peuvent être trompeurs
→ Les caractères homologues peuvent être aussi divisés en caractères ancestraux vs. dérivés:

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

⇒Caractère ancestral commun déf

A

caractère partagé par les membres d’un clade particulier, mais provenant d’un ancêtre qui n’est pas membre de ce clade. Ex: Colonne vertébrale chez les mammifères

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

⇒ Caractère dérivé commun déf

A

Innovation apparue au cours de l’évolution qui relève exclusivement d’un clade particulier. Ex: Poils chez les mammifères (Poils unique chez les mammifères)
→Les phylogénies sont inférées en formant des clades basés sur les caractères dérivés communs

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Explique comment les systématiciens utilse l’information des espèces pour crée la biburfication de l’arbre

A

→Les caractères dérivés communs sont, par définition, uniques à un groupe et ont été transmis de l’ancêtre commun duquel ils sont initialement apparus
→ Les espèces à l’extérieur de ce clade ne présentent pas le trait, donc en échantillonnage des espèces, incluant un groupe extérieur (une ou quelques espèces à hors du groupe à l’étude), on peut inférer les relations évolutives
→ Les systématiciens comparent les espèces du groupe à l’étude entre elles et avec le groupe extérieur pour différencier caractères dérivés communs et caractères ancestraux communs, en regroupant les espèces avec des traits dérivés communs, déterminant de cette façon quels caractères ont été dérivés à différents points de bifurcation de l’arbre
→Groupe extérieur utilisé pour distinguer les caractères dérivés des caractères ancestraux

17
Q

→ Principe de parcimonie maximale déf

A

l’arbre le plus probable est celui qui implique le plus petit nombre d’événements évolutifs (p. ex: le gain ou la perte d’un trait)

18
Q

→Deux types d’arbres:

Nomme les et définit les

A

⇒Cladogramme déf: ne montre que le patron d’embranchement sans information sur le temps ou l’ampleur du changement (c.-à-d. que la longueur des branches est arbitraire)
⇒Phylogramme déf: montre les patrons d’embranchement ET la longueur des branches est proportionnelle soit à l’ampleur du changement génétique, soit au temps des différents points de bifurcation

19
Q

La datation

A

Peut être faite avec:
→ Les fossiles, en combinaison avec la datation radiométrique et/ou la stratigraphie (l’étude des couches minérales)
→ Les horloges moléculaires: assument que le taux de substitutions de nucléotides par unité de temps est constant pour un gène donné

20
Q

Les horloges moléculaires

A

→ Les horloges moléculaires sont calibrées à l’aide de branches dont les dates sont connues grâce au registre de fossiles
→ La génétique des populations démontre que si la plupart des changements évolutifs dans les gènes n’ont aucun changement sur l’aptitude, alors le taux de changement moléculaire devrait être plutôt constant, comme une horloge
→ Les différences des taux pour les différents gènes sont fonction de l’importante du gène (c.-à-d. contraintes sélectives)

21
Q

Les utilités des analyses phylogénétiques

Nomme les

A

a) l’inférence phylogénétique
b) La phylogéographie
c) Les applications pratiques

22
Q

a) l’inférence phylogénétique

A

→Peut prédire des traits d’organismes éteints en se basant sur des caractères partagés par de multiples espèces existantes qui partagent toutes les même ancêtre:
soit les dinausaurs en se basant sur les traits des crocodiles et des oiseaux

23
Q

b) La phylogéographie

A

est l’étude des principes et processus qui gouvernent la distribution des lignées généalogiques, spécialement celle de niveau intraspécifique.
définition de google
→ Comprendre l’origine des maladies humaines; p ex, le VIH a évolué plusieurs fois du virus de l’immunodéficience simienne (VIS):

24
Q

Les applications pratiques

A

→ Une 6e extinction de masse est actuellement en cours. Comment assigner nos ressources limitées pour la conservation?
⇒ Les arbres phylogénétiques peuvent être utilisés pour identifier des taxon avec un risque d’extinction accru
⇒ Les arbres phylogénétiques peuvent être utilisés pour identifier les taxons qui sont uniques d’un point de vue évolutif