Unité 2: réactions métaboliques Unité 3: La génétique (revue pour l'examen) Flashcards
l’acronyme ATP signifie:
Adénosine Tri-Phosphate
l’ATP est quel type de macromolécule?
acide nucléique (elle est un nucléotide)
Qu’est-ce qu’un phosphate inorganique?
groupement phosphate séparé d’un ATP
C’est quoi la différence entre un ATP, ADP et AMP
ATP: 3 phosphates. ADP 2 phosphates. AMP: 1 phosphate.
Comment l’ATP fournit de l’énergie?
les liaisons phosphates ont de très hauts potentiel d’énergie (à vérifier)
Comment l’ATP facilite certaines réactions? Donne un exemple (optionnel).
Il peut céder un groupement fonctionnel de phosphate inorganique à une molécule pour augmenter sa polarité et donc sa réactivité. Exemple: Glycolyse 1: l’ATP se lie au glucose dans la phase d’investissement.
Nomme les 2 types de respiration anaérobie.
lactique et alcoolique
Produit de la fermentation lactique:
2 Lactates
Produit de la fermentation alcoolique:
2 Éthanols (alcool)
Les réaction de fermentations ont 2 étapes: glycolyse et ___
régénération du NAD+ afin de recommencer la glycolyse (cycle)
Qu’et-ce un PS
photosystème: protéine complexe formé de deux complexes de collecte de la lumière et d’un centre réactionnel
Qu’a t’il dans les complexes de collecte de la lumière?
des pigments (ex.: chlorophylle a et b)
Qu’a t’il dans le centre réactionnel d’un PS?
dimère de chlorophylle a et un accepteur primaire d’électrons
longueurs d’ondes absorbés par le PS II
inférieur ou égale à 680 nm (P680)
longueurs d’ondes absorbés par le PS I
inférieur ou égale à 700 nm (P700)
Quelles sont les limitations de cette révision pour l’unité 2?
La respiration cellulaire et la photosynthèse s’apprennent mieux par des dessins, donc ils ne sont majoritairement pas inclus dans cette révision.
Explique brièvement la photorespiration.
L’oxygène se lie plus facilement que le CO2 au Rubisco, ce qui déclenche la photorespiration où de l’énergie est utilisé et aucun glucose n’est produit.
Les complexes dans la chaîne de transport d’électrons de la respiration cellulaire sont quelle macromolécule?
protéine
Quel est le facteur limitant dans la respiration cellulaire aérobie?
oxygène pour accepter les électrons et se combiner avec des H+ pour former de l’eau
Quand un transporteur d’électron perd des électrons (ex.: NADH + H+ devient NAD+), on dit qu’il a subit un réaction de _____
oxydoréduction, il a été réduit
(incertain)
Contraire d’oxydoréduction:
oxydation, une molécule qui s’est fait oxydé a gagné un/plusieurs électron(s)
(incertain)
Unité 3 commence ici
n/a
Type d’organisme qui n’a pas de noyau
Procaryotes (P = pas de noyau)
Type d’organisme avec un noyau:
Eucaryotes
Pour les Procaryotes, la réplication d’ADN se fait dans le ___
cytoplasme
Pour les Eucaryotes, la réplication d’ADN se fait dans le ___
noyau
Nombre d’ORI (origine de réplication) pour procaryotes vs eucaryotes:
Eucaryotes = plusieurs. Procaryotes = 1
Quel organisme est le plus complexe est contient le plus de matériel génétique entre Eucaryotes et Procaryote
Eucaryote
Forme de l’ADN (Eucaryote vs Procaryote)
Eucaryote = linéaire. Procaryote = circulaire. (mais l’ADN est un double hélice)
Enzyme qui défait la forme spirale de l’ADN:
ADN Gyrase
Enzyme qui sépare les deux brins de l’ADN:
Hélicase
Rôle des protéines SSB
Ils s’attachent aux brins détachés afin de prévenir la réformation des liaisons d’hydrogène entre les bases azotées.
Qu’est-ce un amorce?
Morceaux d’ARN qui indique à l’ARN polymérase où commencer et où arrêter
Nomme l’enzyme qui place l’amorce.
primase
Direction de réplication sur le brin fille (copié)
5’3’
le brin 3’ à 5’ de droite à gauche s’appelle:
brin continu
le brin discontinu va de
5’ à 3’ (quand la direction de réplication est vers la gauche) (à vérifier)
Sur quel brin sont les fragments et comment appelle ces fragments
fragments d’Okazaki sur le brin discontinu
Nomme l’enzyme qui fait un copie du matériel génétique.
ADN polymérase III
Nomme l’enzyme qui remplace les amorces par des nucléotides.
L’ADN polymérase I
Nomme l’enzyme qui reforme les liaisons phosphodiester entre les nucléotides placés par l’ADN polymérase I.
ADN Ligase
Enzyme étudié qui peut relire et corriger des mutations (erreurs d’appariements de nucléotides).
ADN polymérase III
Après que la réplication d’ADN est fini, qu’arrive t’il?
Les protéines SSB s’enlève et les brins copié forme des spirales avec les brins originales, formant deux doubles hélices.
C’est quoi une erreur d’appariement?
Quand le mauvais base azotée a été copié par l’ADN polymérase III (exemple: A copié devient un G).
Qu’est-ce qui est utilse pour protèger contre la taille raptissant de l’ADN due à des overhangs?
télomères
C’est quoi les télomères?
ils sont de l’ADN non-codant aux extrémités des chromosomes
Qu’est-ce qui produit les télomères
télomérase (un enzyme qui est facilement dénaturé par des radicaux libre)
Qu’est-ce qu’un ER
enzyme de restriction: coupe à un endroit spécifique sur l’ADN
De quelle organisme provient les ER?
bactéries
C’est quoi l’utilité des ER pour les bactéries?
protection contre matériel génétique des virus (il coupe)
Qu’est-ce qui protège les bactéries de leur propre ER?
méthyls qui s’attache à l’ADN font en sorte que l’ADN n’est pas complémentaire au site actif des ER
Endroit spécifique où un ER se pose:
site de restriction
pb signifie:
paire de base (entre autre nombre de nucléotides)
kb signifie:
mille paire de base
Limitations pour l’unité 3:
Il faut se pratiquer davantage à convertir des ADN matrice/codant en ARNm et ensuite polypetide. Aussi, il se peut que plus d’étude soit requise pour maîtriser le concept de 3’5’
Nomme les 4 étapes pour l’analyse d’ADN sur une scène de crime:
1: extraction de l’ADN à partir de la collecte de cellules. 2: RPC. 3: ajouter les ER. 4: Électrophorèse sur gel.
Le RPC se passe dans quelle machine?
thermocycleur
Matériels dans le thermocycleur
l’échantillon d’ADN à répliquer, amorces, nucléotides (d’ADN), Taq polymérase et solution tampon
Pourquoi le thermocycleur change de température?
augmente afin de défaire les liaisons d’hydrogènes entre les nucléotides pour séparer les brins, ensuite descend pour match la température optimal du taq polymérase
Pour un 4+: trois étapes d’un cycle dans le thermocycleur, leur température et ce qui se passe
Séparation: liaisons d’H se défont entre b.a. donc les 2 brins se séparent (96°C). Hybridation: ajout d’amorce d’ADN (55°C). Polymérisation: ajout de nucléotides par le Taq polymérase (72°C)
Pourquoi ajoute-on des ER pour l’analyse d’ADN sur une scène de crime?
afin de créer des fragments à comparer
Composantes de l’électrophorèse sur gel:
gel, solution tampon, courant électrique (donc cathode (-) et anode(+)) fragments d’ADN.
Info supplémentaire: pourquoi le cathode est négative pour l’electrophorèse?
C’est une pile électrolyte. Pour les piles galvaniques c’est le contraire.
Les fragments d’ADN sont attirés vers quel borne et pourquoi?
Vers l’anode (+) car l’ADN est de charge opposé (les groupements phosphates ont des anions d’oxygènes).
Quelles sont les utilités de l’electrophorèse?
(acronyme: DCSP) DEGRÉ de parenté, verifier si l’ER a bien COUPÉ, analyser un SCÈNE de crime (où on compare des fragments), test de PATERNITÉ.
C’est quoi le dogme central?
Essentiellement le processus de la synthèse des protéines
2 étapes de la synthèse des protéines:
transcription et traduction
location de transcription:
dans le noyau
location de traduction:
dans le cytoplasme, plus spécifiquement dans des les ribosomes des RER (réticulume endoplasmique rugueux)
Direction en ‘prime’ du ADN codant:
5’ 3’
brin 3’ 5’ s’appelle
ADN matrice
lequel des brins est utilisé pour la transcription?
ADN matrice
quel est le produit de la transcription?
ARN pré m qui devient de l’ARN méssager
Convertit cette séquence d’ADN codant 5’ 3’ en ARNm: AAGGTCATG
1e étape: convertir l’ADN codant en matrice:
3’ TTCCAGTAC 5’
2e étape: convertir l’ADN matrice en ARNm:
5’ AAGGUCAUG 3’
C’est quoi un codon?
groupe de trois nucléotides (ex.: TGG)
Qu’est-ce qu’un codon d’initiation?
traduction commence ici, séquence: AUG, code pour un méthionine (a.a.)
Qu’est-ce qu’un STOP
codon de terminaison, séquence: UAA, UAG ou UGA
Premier contrôle de la transcription:
contrôle pré-transcriptionnel
C’est quoi l’acétylation?
l’ADN se déroule (donc il se détache des histones)
C’est quoi un histone?
Protéine sur laquelle l’ADN s’enrouleD
Contraire de acétylation:
désacétylation
Enzyme responsable de synthétisé l’ARN pré m à partir de l’ADN matrice:
ARN polymérase II
Décrit le contrôle pré-transcriptionnel.
L’ARN polymérase II peut reconnaître le promoteur les gènes qui ont subit l’acétylation (transcription activé), alors qu’il ne peut pas reconnaître le promoteur des gènes qui ont subit la désacétylation car ils sont trop condensés.
Site ou l’ARN polymérase II se pose s’appelle le ___
promoteur
Les activateurs dans la transcription se pose sur ___
la zone amplificatrice
Quelle enzyme replie l’ADN afin d’aligner la zone amplificatrice avec le promoteur?
DNA bending-protein
Nomme les deux enzymes qui forment le complexe d’initiation de transcription afin d’assurer le placement correcte de l’ARN polymérase II.
protéines médiatrices et facteurs de transcriptions
Est-ce que l’ARN polymérase a une méthode de relire et corriger les mutations (fautes d’appariements) ?
non
Explique le contrôle transcriptionnel.
si des répresseurs se lient à la zone amplificatrice, la transcription n’a pas lieu (prévient l’attachement du complexe d’initiation de transcription par liaisons intermoléculaires)
Comment appelle t-on les sections d’ADN qui ne peuvent pas coder pour un protéine (non-codant)
gène muet
contraire de gène muet:
gène actif
L’ARN polymérase II copie quelle type de gène (muet ou actif) ?
actif
C’est quoi un exon?
région codant de l’ARN pré m
C’est quoi un intron?
région non-codant de l’ARN pré m
Nomme les trois contrôles post-transcriptionnel.
Coiffe 5’, Queue poly-A et Épissage
Qu’est-ce qui se passe si un des trois contrôles post-transcriptionnels n’a pas lieu?
La traduction n’aura pas lieu.
C’est quoi la coiffe 5’ et quel sont ses rôles?
séquence répétitif de G (GGG); il sert à protéger l’ARN des enzymes dans le cytoplasme et il sert de point d’attachement pour le ribosome
C’est quoi la queue poly A et quel est son rôle?
séquence répétitif de A (AAA…); il sert à protéger l’ARN des enzymes dans le cytoplasme
C’est quoi l’épissage?
retirement des introns
Explique l’épissage alternatif.
Le premier et dernier exon doit être maintenu, mais les exons peuvent être retiré donnant des différentes combinaison d’exons (ex.: exon 1 et 3 ou exon 1, 2 et 3).
C’est quoi le produit de l’épissage?
ARNm (ARN méssager)
Nomme les deux parties du ribosome.
Petite sous-unité ribosomique et grande sous-unité ribosomique.
Qu’est-ce qui arrive si une protéine régulatrice se pose sur la coiffe 5’ avant la traduction?
la petite sous-unité ne pourra pas se lier au coiffe (point d’attachement) et la traduction n’aura pas lieu
Nomme les trois sites de la grande sous-unité ribosomique.
E, P, et A
À part de l’ARNm, qu’est-ce qui se pose dans les sites E, P et A?
ARN de transfert
Décrit la structure de l’ARN t.
anticodon sur le bas et un acide aminé s’attache en haut sur l’extrémité 3’. (image)
Décrit chaque site.
E: exit (à la gauche). P: premier ARN t vient se poser ici (au milieu). A: deuxième ARN t vient se placer ici (à la droite) (image)
dessine la traduction.
(image)
Quand et comment est-ce que la traduction s’arrête?
Un facteur de terminaison se lie à un STOP et utilise un H20 afin de libérer la chaîne polypeptide du ARNt. Ensuite, tout se sépare. (image)
lors de la traduction, la protéine connecté au ARNt est de stage ___
primaire. après la traduction, elle peut se replier et devenir stage 2,3,4
Quelle protéine est impliqué dans le contrôle post-traductionnel?
protéines régulatrices (juge si la protéine formé est fonctionnel ou non)
Si une protéine est jugé fonctionnel…
elle est envoyé ailleurs pour être utiliser
Si une protéine est jugé non-fonctionnel…
elle est étiquetté par les protéines réuglatrice et ensuite digéré (détruit)
Les mutations sont des erreurs génétique ___ (acronyme RAPS)
rare, aléatoire, permanent, spontané
Comment appelle-t’on des choses qui provoquent des mutations?
agents mutagènes
2 types de mutagènes:
Radiation et Produit chimique
Explique l’Agent mutagène de radiation: UV
l’UV est absorbé par les T et C ce qui change les liaisons entre les nucléotides menant a un mutation (formation d’une liaison qui « compremet l’activité des ADN polymérases ») (image)
Explique l’Agent mutagène de radiation: rayon X et rayon gamma.
ils produisent des radicaux libre ce qui cause une perte de base azotée ou une rupture dans un brin (image)
Explique les agents mutagènes chimique
ils peuvent changer l’ordre des nucléotides ou ils peuvent agir d’un nucléotide (analogue de base)
Vrai ou faux, Les mutations somatique son transmis.
Faux, les mutations germinales sont transmis
Nomme les 2 grandes types de mutations.
Mutation de substitution (1 nucléotide est remplacé pour un autre) et de décalage de trame.
Nomme les trois types de mutations de substitution.
contresens, non-sens, silencieux
Explique mutation contre-sens
1 a.a. affecté, impacte + ou -
Explique mutation non-sens
création d’un STOP, traduction incomplète, protéine beaucoup trop courte, gros impacte -
Explique mutation silencieux
différent nucléotide mais il code pour le même a.a. (position WOBBLE), aucun impacte
Nomme et explique les 2 types de décalage de trames.
Insertion: insertion d’un nucléotide (réversible). Délétion: délétion d’un nucléotide (irréversible).
Explique décalage de trame: insertion
Un nucléotide est ajouté changeant tous les a.a. dans la traduction, réversible
Explique décalage de trame: délétion
Un nucléotide retiré, changeant tous les a.a. dans la traduction, irréversible
« (image) » signifie___
qu’afin de mieux comprendre, il faut regarder l’image approprié
