UELU1SV001 Bio - Th C&arbre Du V - 1/2 Flashcards

1
Q

Donner une Définition du Vivant

A

Et, vivant, au système circonscrit (delimité ex/membrane), autonome, & capable de se reproduire + pourvus de capacité évolutive

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Q

Quelles sont les quatre caractéristiques qui définissent le vivant ?

A
  • Circonscrit (cellule delimité par une membrane)
  • Se reproduit
  • Est autonome
  • capable d’évoluer
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3
Q

Donner un point commun entre toutes les cellules

A

La membrane plasmique à la même organisation pour toutes les cellules, c’est-à-dire en bi-couche

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4
Q

Ça veut dire quoi catabolique ?

A

C’est la dégradation des molécules issue de la nutrition

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5
Q

Ça veut dire quoi anabolique ?

A

Réaction de synthèse dans une cellule

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6
Q

Donner une définition générale du vivant

A

Vivant = diversité des formes
Tout organisme/système constitué d’une ou plusieurs cellules
-> «théorise cellulaire»

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7
Q

Quel type d’organisme peut-on trouver ?

A
  • organisme unicellulaire
  • organisme pluricellulaire
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8
Q

Est-ce que les virus font partie du vivant ?

A

Non :
- Métabolisme non-autonome & reproduction ⇒ dépend de son hôte
Oui :
- circonscrit & évolue très bien

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9
Q

Est-ce que je peux avoir trois exemples de virus ?

A
  • mosaïque, tabac
  • bactériophage
  • VIH
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10
Q

De quoi est composé un arbre phylogénétique ?

A
  • racine
  • branches
  • taxons
  • noeuds
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11
Q

C’est quoi la phylogénétique ?

A

Science qui classifie les organismes, traite des modification génétique au cours du temps - de l’évolution des caractères

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12
Q

Quel est le but de la phylogénétique ? Comment procede-t-on ?

A

Trouver les liens de parenté dans l’évolution
Entre les organismes/especes
Comment ? - en rassemblant un groupe monophyletique

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13
Q

C’est quoi la racine et les branches ?

A

Racine = branche initiale qui oriente l’arbre
Branches = indique les liens de parenté entre les différents taxons

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14
Q

C’est quoi un taxon ?

A

C’est un ensemble d’organisme (une «famille», un groupe) regroupé en tant qu’unité formelle
(Actuel/fossile)

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15
Q

Que représente un noeud ?

A

Il représente l’ancêtre commun hypothétique

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16
Q

Def Caractère

A

attributs d’organismes
par lesquels ces derniers diffèrent ou bien se ressemblent,
et sur lesquels on formuler une hypothèse d’ homologie (critère morpho-anatomique ou moléculaire)

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17
Q

Def Caractères homologues

A

sont homologues des structures qui sont héritées d’un ancêtre commun. L’opposé de l’homologie est l’homoplasie (=juste des caractère qui se ressemblent)

Caractère homologue= caractère dérivé hérité d’un ancêtre commun

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18
Q

Donner deux exemples d’hypothèse d’homologie

A
  • mandibule fenestré homologue chez les oiseaux et les crocodiles (grenouille = mandibule non fenestré)
  • radius homologue (plan d’organisation de l’os est tjrs le même) chez les chauves souris, opossum, dauphin
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19
Q

Quels sont les différents état des caractères ? Comment on parle de caractères ?

A

Un caractère existe sous deux 2 états :
- derivé
- ancestral (Cara initial)

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20
Q

C’est quoi les intra/extragroupes ?

A

INTRAGROUPE = organisme représentatif du groupe d’intérêt qu’on veut étudier / ensemble des espèces que l’on désire classer.
EXTRAGROUPE = espèce/taxon/groupe supposé à l’extérieur de l’intragroupe (pas trop eloingé non plus), placé à la racine car il ne partage pas d’ancêtre commun, il a une évolution différente

21
Q

À quoi sert l’extra groupe ?

A

EXTRAGROUPE = espèce/taxon/groupe supposé à l’extérieur de l’intragroupe (pas trop eloingé non plus), il ne partage pas d’ancêtre commun, il a une évolution différente
=> comprendre quel est le caractère derivé/ancestral

L’extra-groupe va permettre d’enraciner l’arbre, c’est-à-dire de l’orienter en fonction du temps, en permettant d’établir pour chaque caractère quel est l’état ancestral et l’état dérivé.

22
Q

Comment reconnaître le caractère ancestral/derivé ?

A

Ancestral = caractère retrouvé chez l’organisme de l’extragroupe et
chez certains organismes du groupe d’intérêt

23
Q

Def synapomorphie :

A

caractère dérivé partagé

24
Q

Comment est défini un groupe monophyletique ?

A

Il est défini par au moins une synapomorphie (=caractère dérivé partagé)

un ancêtre commun hypothétique et l’ensemble de ses descendants

25
Q

C’est quoi un groupes-frères ?

A

(groupes monophylétiques qui ensemble constituent un groupe monophylétique)

Deux groupes frères partagent un même ancêtre commun, direct et exclusif

26
Q

Que ce passe-t-il si un des descendants est absent ?

A

Il existe des groupes non monophyletique - ce sont les groupes paraphyletique (= absence de l’un des descendant)

27
Q

Quels sont les étapes pour construire un arbre phylogénétique ?

A
  • Etape 1 : définition du problème phylogénétique
  • Etape 2 : choix d’un échantillon d’organismes à
  • Etape 3 : choix des caractères
  • Etape 4 : codage et construction de la matrice
  • Etape 5 : exploration des trois arbres phylogénétiques possibles
  • Etape 6 : évaluation de chacun des arbres au regard de la matrice
  • Etape 7 : choix d’un arbre phylogénétique
  • Etape 8 : utilisation des données de l’arbre phylogénétique
28
Q

Ça veut dire quoi formuler une hypothèse d’homologie ?

A

Observer les caractères - si il y a ressemblance (basé sur critères morpho-anatomiques/moléculaires) ⇒ formuler une hypothèse d’homologie → voir su les deux groupes ont hérité d’un caracrtère via un ancêtre commun

29
Q

La cladistique

A

Methode basée sur la notion d’homologie
ou cladisme, est une méthode de classification biologique qui exprime la phylogénie, c’est-à-dire les relations de parenté existant entre les êtres vivants. Elle repose sur le partage de caractères hérités d’une ascendance commune (ancêtre commun).

30
Q

C’est quoi un groupe monophyletique ?

A

Se dit des groupes zoologiques ou botaniques que l’on considère comme dérivés d’une seule espèce primordiale, d’un ancêtre commun.

31
Q

Comment donne-t- on le nom d’un organisme ?

A

Nom d’un organisme = nom de genre + nom d’espèce (le tout en latin)
-Homo sapiens : l’homme “intelligent”

32
Q

Quels sont les niveaux de classifications successifs ?

A

De l’int (particulier) vers l’ext (générale)
Espèce
Genre
Famille
Ordre
Classe
Embranchement
Règne

33
Q

Quels sont les trois domaines du vivant ? Est ce qu’on connaît la place de la racine de l’arbre du vivant ?

A

Eucaryote,
Archées
bactéries

Non, la place de la racine de l’arbre du vivant est encore inconnu

34
Q

Quels sont les points communs dans l’organisation cellulaire des bactéries et des archées ?

A
  • absence de noyau
  • absence d’organites
  • cytoplasme sans cytosquelette
35
Q

Quelles sont les spécificités de l’organisation cellulaire des eucaryotes ?

A
  • présence d’un noyau
  • présence d’organites
  • cytoplasme avec cytosquelette
36
Q

Quel est l’organisation du génome et le mode de division cellulaire, des bactéries et des archées ?

A
  • un chromosome circulaire
  • division par scissiparité
37
Q

Quel est l’organisation du génome et le mode de division cellulaire des eucaryotes ?

A

Plusieurs chromosomes linéaires
Division par mitose

38
Q

Def caractère primitif

A

un caractère est dit plésiomorphe (ou ancestral ou primitif) s’il s’agit de l’état ancestral de ce caractère. Il n’a donc pas subi de mutation le menant à un caractère dérivé (ou apomorphe).

39
Q

Homologie

A

une homologie désigne un lien évolutif entre deux traits (en général anatomiques) observés chez deux espèces différentes, qui est dû au fait que toutes deux l’ont hérité d’un ancêtre commun. Ces traits sont alors dits homologues.

40
Q

Pylotomie def

A

Nœud d’une phylogénie où plus de deux lignées descendent d’une seule lignée ancestrale. Une polytomie peut indiquer soit que nous ne savons pas comment les lignées descendantes sont liées, soit que nous pensons que les lignées descendantes se sont spécifiées simultanément .

Une polytomie est, en biologie, une section d’arbre phylogénétique ne comprenant pas uniquement des ramifications dichotomiques, et donc présentant des embranchements semblant apparaître simultanément

41
Q

Expliquer pourquoi les reptiles et les poissions n’existent pas dans la classification actuelle ?

A

Une polytomie est, en biologie, une section d’arbre phylogénétique ne comprenant pas uniquement des ramifications dichotomiques, et donc présentant des embranchements semblant apparaître simultanément Une autre illustration d’un rejet d’un nom de groupe dans les classifications actuelles est celle des Poissons avec la nageoire versus membre des tétrapodes. Si les membres des tétrapodes constituent bien une synapomorphie, ce n’est pas le cas des membres en forme de nageoire !
Donc dans la classification actuelle, Reptiles et Poissons n’existent pas. Mais ce sont des noms pratiques qui restent utilisés dans la langue française

42
Q

Ex bacteries pathogènes

A

Vibrio cholerae, responsable du choléra (contamination alimentaire)
- Streptococcus pyogenes, agent des angines
- Helicobacter pylori, responsable des ulcères gastro-duodénaux
- Clostridium tetani, responsable du tétanos
(toxine inhibitrice du trafic vésiculaire dans les cellules eucaryotes )

43
Q

Quelle es l’importance économique et industrielle des bacteries ?

A

Production des yaourts et des fromages par fermentation lactique (ex: Streptococcus thermophilus, Lactobacillus bulgaricus)

Production de vinaigre par fermentation alcoolique
Acetobacter aceti

Production de molécules d’intérêt industriel
- Taq polymérase de Thermus aquaticus (pour la PCR)
- enzymes : cellulases, amylases, protéases,…
- acides aminés
- vitamines

44
Q

Où sont les cyanobacteries ? + ex de cyanobacteries

A

Elles sont présentes en milieu terrestre, en milieu aquatique, (eau douce et marine)

  • nostoc
  • Oscillatoria Nostoc
  • Prochlorococcus
45
Q

Description bactérie

A

Organismes unicellulaires, solitaires ou formant des colonies
Forme : coque, bâtonnet, spiralée
Métabolisme : très varié
Ecologie : présentes dans tous les milieux
Rôle : actrices majeures dans les cycles biogéochimiques

Impacts sur la santé publique
De nombreuses eubactéries sont des agents pathogènes, productrices de toxines

46
Q

Def d’une cellule

A

Unité structural et fonctionnelle des plantes et des animaux
Unité du vivant (subvient à ses besoins et peut se diviser)
Elle représente l’unité structurale et fonctionnelle du monde vivant

47
Q

Exemple d’organites membranaires

A

Noyau, réticulum, endoplasmique, granuleux ou lisse, appareil de Golgi, vésicule, Lisa et vacuole, endos, Otome, mitochondrie, chloroplastes, etc…

48
Q

Qu’est ce qui est à l’origine de l’enrichissement en O2 de l’atmosphère ? Et pourquoi ?

A

Les bactéries sont à l’origine de l’investissement en eau de l’atmosphère terrestre
Les cyanobacteries sont capables de réaliser la réaction des photosynthèse :
6CO2 + 6H2O + lum -> C6H1206 + 6O2