UA2 Flashcards
dans un contexte medical, pq on fait analyses de labo
- pour diagnostic
- SUIVI DE THERAPIE
- evaluer severité de pathologie
- depistage
dans contexte etude clinique, pq on fait analyses labo?
- criblage des sujets
- protection des sujets de recherche
- POUR CONNAITRE INFOS SUR RX (EFFICACITÉ, TOXICITÉ, INNOCUITÉ, POSOLOGIE, OBSERVANCE)
C quoi les 3 phases dans l’éxecution d’une analyse de lab
- preanalytique
- analytique
- post-analytique
c quoi la phase pre-analytique
= quand le clinicien PENSE à prescrire une analyse (tout jusqu’au ACTUAL PRELEVEMENT inclusivement)
c quoi la phase analytique
= quand les biochimistes analysent the sample, note down les resultats observés
c quoi la phase post-analytique
INTERPRETATION des resultats, CHANGEMENTS apportés par le clinicien au tx du patient, TRANSMISSION des resutlats
Quelles variations prévisibles peuvent survenir avant le prelevement d’une analyse labo?
VARIATIONS CYCLIQUES
1) ultradienne = cycle court <20h (plusieurs fois en 1 jour, EPISODIQUE)
2) circadienne = cyclique sur 1 jour
3) infradienne = 3+jours (mesntruations)
4) circannuelle = sur 1 an +/- 2 mois
Quelles variations IMPREVISIBLES survenir avant le prelevement d’une analyse labo?
variations biologiques,
intra-indiv ou inter-indiv
Quelles autres variations (pas biologiques ou cycliques) peuvent survenir avant le prelevement d’une analyse labo?
- exercice
- alimentation
- stress
- posture
pq on n’inclut plus le fer dans les bilan martiaux
pcq dep trop de l’état inflammatoire
=> on mesure plutot ferritine = reserve en fer
comment alimentaiton pourrait affecter resultat de lab?
aug:
- triglycerides
- glucose
- gastrine
- GH
- insuline
- Ca
- pH sang et urine
dim:
- Cl
- PO3-
- K+
comment posture pourrait affecter analyse lab
couché vs debout:
grosses molecules qui passe pas bien memb pourrait avoir dificulté à entrer/sortir du sang
quels sont les 3 sources de variation dans PENDANT le prelevement (phase preanalytique)
- type d’echantillon
- contenants et additifs
- technique
c quoi la diff entre sang total, plasma, et serum
sang total = no modification apres prelevement MAIS AJOUT D’ANTICOAGULANT
plasma = centrifugation de sang total + anticoagulant (PARTIE LIQUIDE SLMT)
contient prot de coag
serum = PAS DE ANTICOAGULANT + CENTRIFUGATION
partie liquide n’a PAS de prot de coag, stuck in partie solide
quel additif est important a ajouter dans un echantillon sang pour glycemie
inhibiteur de glycolyse (NaF)
(préservatif)
quel additif est important a ajouter dans echantillon plasma ou sang total?
anticoagulant (ex: EDTA, heparine Na citrate Na)
a quoi sert un gel separateur (additif)
preserve separation de phase durant transport (Ex: partie liquide de plasma sample des cellules)
**si transport pas long, gel peut etre assez pour EMPECHER GLYCOLYSE pour echantillon de glycemie.
quelle est la bonne technique de prelevement? (etapes)
1- GANTS
2- choisir grosse veine
3- garrot
4- DÉSINFECTER (et laisser alcool secher)
5- piquer
6- DESSERRER GARROT <1MIN
7- remplir tubes AVEC BONNE QTÉ (risque dilution)
8- IDENTIFICATION TUBES
what happens si mauvais ordre de remplissage des tubes
contamination croisée par K-EDTA:
Donc si on voit pat a K super elevé, Ca = 0 , on a probablement fait erreur dans l’ordre des tubes de prelevement
- aug [K+]
- dim [Ca2+, Mg2+, Fe2+]
- dim phosphatase alcaline, creatine kinase
pq on rec pas de pomper le poing, et quoi faire a la place?
Pomper le poing cause turbulence = cause HEMOLYSE (destruction des RBC qui relache K+ dans sang = **fausse valeur ÉLEVÉE)
Donc il faut faire la prise de sang immediatement apres mise du garrot (bande qui serre le bras), ne pas pomper le poing ou attendre >1min
what happens durant hemolyse
1- relache contenu des rbc: K+, Mg, lactate, AST, fer, phosphate, NH3
2- AUG cholesterol, triglyerides creatine kinase (interference in vitro)
3- DIM bilirubine, carotene, insuline, albumine (interference in vitro)
quelles 3 sources de variation APRES LE PRELEVEMENT de sample? (phase pre-analytique)
- transport
- pretraitement
- entreposage
quest-ce qu’un délai ou une mauvaise temp peut causer dans un sample
- dim de glucose (glycolyse)
- dim O2 (used by cells)
- aug CO2
- dim pH (car aug co2)
- aug Ca2+ (fu aug car pH dim)
- aug lactate (car glycolyse)
quand est-ce qu’on veut basse T et quand non pour transport des samples?
lab biochimie: veut garder C const = cold
lab hematologie: veut voir cells vivantes et non deformées = T normale
c quoi le pretraitement? (exemples)
- centrifug
- separation
- aliquote
- extraction
- precipitation
quelle erreur pourrait arriver a l’étape de la centrifugation
use mauvaise force ou temperature
selon la longeur de la periode d’entrposage, quelle temp on doit utiliser?
1- court terme
2- moyen terme
3- long terme
1- T amb 20-24C
2- frigo 2-8C
3- congelation -20 - -80C
c quoi les 2 sources de variation dans la phase ANALYTIQUE de test labo&
- erreur analytique (= exactitude + precision)
- interferences analytiques
def erreur analytique
erreur INHERENTE avec mesure d’une valeur (PAS ERREUR HUMAINE)
*a cause de:
- precision de appareil
- calibrage appareil (exactitude)
c quoi exemple d’INEXACTITUDE
diff entre valeur mesurée et valeur vraie d’un echantillon qu’on connait la vraie valeur
c quoi IMPRECISION
grande variation (ECART-TYPE) entre resultats de multiples essais sur un meme echantillon
explique les 2 types d’interfernece analytique (in vivo vs in vitro)
in vivo = subs/facteur PRE-ANALYTIQUE modifie C in vivo de l’analyte (ex: aug de cholesterol in vitro quand hemolyse)
in vitro = subs PERTURBE METHODE ANALYIQUE et donne faux resultat
exemples d’interferences in vivo:
- tabac
- rx
- drogues/alcool
- alimentation
- menstruation
- hemolyse
exemples interferences in vitro:
- spectrophotometrique (hemolyse, lipemie, ictere ++bilirubine)
- chimiques
- immunologiques (immunoessais)
- chromatographiques (co-migration de subs interferente avec subs analysée)
quelle est la source de variation dans phase POST-ANALYTIQUE
- interpretation des resultats selon VALEURS DE REFERENE
c quoi les 3 facons d’établir les valeurs de ref
1) hard way = recrute 120 pers selon criteres inclusion/exclusion, etudes clinique
2) soft way = utiliser resultats deja dispo dans bases de données
**suppose que peu de resultats anormaux meme chez pers malades, & peu de pers malades vs saines
3) no way = Etablies par sociétés savantes (ex: 7mmol/L pour diagnostiquer diabete) ALEATOIREMENT…
OU simplement pas d’établissement de valeurs de ref = cherche absence de sx = 0
pour savoir si un test est utile, quelles 2 caracteristiques INTRINSQUE AU TEST peuvent etre étudiées:
- sensibilité
- specificité
pour savoir si un test est utile, quelles 2 caracteristiques TENANT COMPTE DE LA PREVALENCE DE LA MALADIE DANS POPULATION peuvent etre étudiées:
- valeur predictive positive et negative
c quoi PREVALENCE
nb de cas dans pop totale à moment donné
= VP+FN sur pop totale
c quoi EFFICACITÉ dun test
pourcentage de bons classements
= VP +VN sur pop totale
c quoi SENSIBILITÉ dun test
proportion de VP chez personnes malades (VP+FN)
Out of everyone who is sick, how many can we detect?
Se = VP/ (VP+FN)
c quoi SPECIFICITÉ
proportion de VN chez non-malades (VN+FP)
out of everyone who are not sick, how many did we detect
Sp = VN / (VN+FP)
c quoi la VPP
quand on get un test positif, quelle probabilité qu’on a bien dianostiqué?
VPP = VP / (VP + FP) = Se * P / P(test positifs)
c quoi prevalence S+
prevalence des test positifs (VP +FP)
= (VP + FP) / pop totale
c quoi la VPN
si test neg, probabilité que diagnostic est bon
VPN = VN / (VN+FN) = Sp * (1-P) / (1 - P s+)
c quoi le rapport de vraisemblance positif (likelihood ratio+, L+)?
- formule
- valeur ideale?
- valeur inutile?
accroissement de la prob que pers soit actually malade apres avoir eu un test positif
= Se / (1 - Sp)
**ideal = infini (want Sp = VN sur VN+FP = 1, donc aucun FP)
**inutile = 1 (VN=0, all FP)
c quoi le rapport de vraisemblance negatif (likelihood ratio-, L-)?
- formule
- valeur ideale?
- inutile?
accroissement de prob que pers avec test neg soit actually non-malade
= (1 - Se) / Sp
** ideal = 0 (want Se = VP/(VP+FN) = 1, donc aucun FN)
**inutile = 1
c quoi un odds ratio
prob qu’un event arrive dans gr A plutot que gr B
ex: 90% to watch hockey chez gars, 20% cehz filles
OR = (90% / 10%) / (20% / 80%) = 9/0,25 = 36
–> 36x plus de chances qu’un gars watch hockey qu’une fille
que signifie un OR proche/=1, mais >1
autant que chances d’arriver dans both gr
que signifie OR <1
moins frequent dans gr A que B
pq on veut haute Se pour test DEPISTAGE
se= qté de VP qu’on peut detecter sur toute les pers malades (accent sur les chances qu’on soit MALADE)
pq on veut haute SP pour test qui sert a CONFIRMER DIAGNOSTIC
sp = qté de VN qu’on peut detecter sur toutes les pers non-malades (accent sur les chances qu’on ne soit PAS MALADE)
une courbe ROC est une courbe en fct de quoi?
taux des VP (Se) vs. taux des FP (1 - Sp)
de quoi a l’air le graph courbe ROC d’un test inutile?
diagonale, auc = 50% du graph
comment trouvert la valeur seuil optimale sur courbe ROC
pt plus eloigné de diagonale de test nul (perpendiculaire)
quels sont 3 moyens de savoir si diff CLINIQUEMENT SIGNIFICATIVE entre 2 resultats de lab
1- jugement professionnel
2- si valeur > Reference change value (RCV)
3- si valeur > Significant change limit (SCL)
formule de RCV
RCV = 2,77 * sqrt (CVa² + CVb²)
formule de SCL
SCL = 3 ETu
