Transkriptionen Flashcards
Hur är DNA uppbyggt?
DNA är en dubbelhelix som består av 4 stycken kvävebaser (ATGC) som har en fosfatgrupp och deoxiribos. Fosfatgruppen och sockergruppen står för ryggraden av DNA och hålls ihop med vätebindningar mellan kvävebaserna där det finns två stycken vätebindningar mellan A-T och 3 stycken mellan G-C.
Varför kan endast A och T samt G och C binda till varandra?
A och G består utav två ringar av kväve och kol medans T och C endast består utav en kol- och kvävering. Detta betyder att om AG skulle binda till varandra så kommer det bli för klumpigt och helixstrukturen blir förstörd. Om C och T binder till varandra så blir strukturen för liten så att helixen kommer att kollapsa. A och C kan ej binda till varandra
I vilken ände binder polymeras och varför?
Den binder 3’ änden eftersom den har en OH-grupp som enzymet kan binda till, i 5’ sitter en fosfatgrupp.
Vad är replication origins?
Det är de platserna i kromosomerna där DNA-replikationen påbörjas
Vad gör cyklin E+ CDK 2 i replikationen?
Dessa fosforylerar initiator proteiner som binder till replication origins
Vad gör cyklin A+ CDK 2 i replikationen?
Aktiviteten av Cyklin A+CDK 2 triggar igång replikationsgaffeln
Hur ser cellen till att DNA inte replikeras mer än en gång?
Genom att både cyklin A och E behöver CDK 2. När cyklin A blir aktivt så kommer cyklin E fosforyleras- alltså så kommer replication origins ej att vara aktiva så att replikationen inte kan sätta igång igen.
Vad gör helikas?
Helikas börjar i replication origins med att bryta vätebindningarna mellan kvävebaserna- DNA går från att vara dubbel till enkelsträngad
Vad innebär leading och lagging strand?
Leading strand kommer att replikeras utav DNA polymeras i ett svep från 3’ till 5’. Lagging strand går fårn 5’ till 3’ vilket gör att polymeras inte kan gå i den riktningen i ett svep. Istället så kommer det att bli flera fragment, så kallade okazakifragment som sedan med hjälp av ligas binds ihop till en lång kedja. Primas gör flera RNA-strängar som polymeras kan binda till och replikera i 3’ till 5’
Vad gör topoisomeras?
Topoisomeras klyver DNA så att det inte buntar ihop sig framför replikationsgaffeln. Om det buntar ihop sig så är det lättare för DNA att gå sönder.
Vad händer om polymeras skulle sätta dit fel kvävebas?
Om det skulle hända så märker polymeras förändringen och kan då gå tillbaka, ta bort den felaktiga kvävebasen och sedan sätta dit den riktiga.
Vilka olika sätt finns det för att reparera DNA om polymeras inte upptäcker det?
Mismatch repair
Non homologous end joining
Homologous recombonation
Vad händer vid mismatch repair?
Mut proteiner känner av förändring i DNAs ryggrad och rekryterar polymeras, ligas, PCNA och helikas för att byta ut och sätta dit den rätta nukleotiden
Vad händer vid Non homologous end joining?
Proteiner märker av en DNAskada där det finns fria 3’ och 5’ ändar, nukleas kommer och klipper av DNA på längden, ligas kommer sedan att binda ihop de båda strängarna. Detta kan medföra att nukleotider förloras.
Vad häder vid Homologous recombination?
Detta kan endast ske efter S-fasen då det finns en systerkromatid som kan fungera som en mall för den skadade DNAsträngen. Polymeras, ligas och helikas reparerar DNA, BRCA är involverat i denna process och markerar vart DNAskadan är
