Genreglering och epigenetik Flashcards
Hur kan RNApolymeras hitta den gen som ska transkriberas?
Med hjälp av en promotor vilket är en sekvens som trankriptionsfaktorer kan binda till, faktorerna flaggar för polymeraset som hittar genen och kan påbörja transkriptionen. Ex. på promotorer: TATA, BRE- box
Vad har transkriptionsfaktorer för syfte?
Det finns 4 stycken faktorer vid TATA och BRE-box som flaggar för polymeras vart den ska binda in. TF2H fosforylerar polymeras vilket gör att den släpper vid bindingsite och kan fortsätta längs DNAsträngen
Hur kan en gens aktivitet regleras?
Med hjälp av activators vilket också är transkriptionsfaktorer så regleras aktivieten utav genen. Den kan både aktivera och blockera aktivitet för de andra transkriptionsfaktorerna
Vad gör en enhancer?
En enhancer kan sitta väldigt långt ifrån genen men stabiliserar komplexet med transkriptionsmaskineriet
Vad är transcription factor response element?
Detta är sekvenser till vilka transkriptionsfaktorer kan binda till och bestämma aktiviteten för genen.
Vilka är transkriptionsfaktorerna och hur sitter de?
TF2B, TF2D, TF2H, TF2E. TF2D och B binder först till TATA och BRE, till vilka E och H kan binda till sen.
På vilka sätt måste premRNA modifieras innan de lämnar cellkärnan?
5’ kåpa bestående av Guanin och metylgrupp
3’ polyAsvans- adenin
Splitsning där intronerna klipps bort
Hur genomförs splitsningen?
Den utförs av spliceosom vilket är SR proteiner som binder till intronerna och snRP som klipper bort intronerna
Varför har eukaryota DNA-molekyler introner?
För att kunna genomgå alternativ splitsning, där vissa exoner kan klippas bort och introner inkluderas i transkriptionen, detta resulterar i att det kan bilads flera olika proteiner från samma gen.
Hur veckas proteiner efter translationen?
Med hjälp av chaperones
Hur packas DNA?
DNA packas runt histoner, detta hjälps utav att DNA är negativt laddat och histoner positivt laddade. Dessa bildar sedan kromatin vilket kromosomer består av
Beskriv histonstrukturen
En histon består av 4 olika histonproteiner: H2a, H2b, H3 och H4. H1 sitter ovanpå komplexen och behåller strukturen
Hur kan kromatin uppackas så att replikation och transkription kan ske?
Genom att tillsätta acetylgrupper på histonerna, detta förändrar deras nettoladdning till att bli mindre positivt laddat vilket gör att DNA inte packas lika hårt runt histonerna.
Hur påverkas histonerna av metylation?
Metylgrupperna kan binda in repressorer, kromatinet förblir packat och gener kan ej skrivas av
Hur regleras metylation?
Mha HMTs och KDMs. HMT katalysrar addition av en metylgrupp medans KDM katalyserar deletion av metylgrupp.
Hur regleras acetylation?
HATs katalyserar addition av acetylgrupp medans HDACs katalyserar deletion av acetylgrupp
Vad händer om DNA blir metylerat?
Cytosin kan bli metylerat, dessa finns ofta i promotorregioner (BRE-box) vilket gör att transkriptionsfaktorer ej kan binda in och då kommer polymeras ej kunna känna igen området vilket gör att genen “stängs av”
Hur påverkas stamceller av metylering?
Stamceller som är pluripotenta är metylerade, när de sedan blir demetylerade så triggar det så att stamcellen måste specialisera sig. En promotor kommer då att bli aktiv så att gener kan transkriberas.
Vad händer med histonerna vid replikationen?
Histonerna tas bort vid replikationsgaffeln och sätts sedan dit igen när DNAt syntetiserats. Det finns då 50% nya och 50% gamla histoner.
Har samma modifikationer som de gamla
Vad är epigenetik?
Epigenetik är hur gener uttrycks dvs. fenotypen. Detta påverkas av miljö, hormoner, gifter, dieter. Det finns ärftliga metyleringar och acetyleringar av histoner och DNA-> olika gener uttrycks
Vad finns det för typer av RNA?
miRNA: stabiliserar mRNA snRNA: del av spliceosomen mRNA: produkt av transkriptionen, innehåller information för att göra proteiner tRNA: Bär specifik aminosyra rRNA: katalytisk komponent i ribosomen
