transkription

Question 1

initiering i bakterier

Answer 1

haloenzym binder till -35 och -10 konsensussekvenser dvs promotorregionen. en konformationsändring av polymeraset leder till klyvning av dna strängarna. konsensussekvenserna bestämmer var transkriptionen startar och vilken sträng som används som templat. en rNTA vars bas passar med templatet vid +1 sätts på och bildar mRNA 5´ände. två fosfatgrupper klyvs från NTP för att bilda bindningarna i mRNA.

Question 2

elongering bakterier

Answer 2

konformationsförändring i polymeras gör att det släpper från promotorn och elongeringen tar vid

Question 3

terminering bakterier

Answer 3

inverted repeats skrivs in i mRNA och bildar ne hårnålsstruktur vilket gör att polymeraset pausar. A-U bindningar bryts och polymeras och mRNA separerar.

Question 4

initiering eukaryota

Answer 4

regulatoriska proteiner binder vid promotorn och ändrar kromatinstruktur. initierinskomplexet börjar byggas upp på core promotor. består av RNA polymeras 2, TF och mediator (proteinkomplex).

Question 5

varför transkription?

Answer 5

innebär omskrivningen av DNA till mRNA för att genens proteiner ska kunna bildas. DNA är mall till mRNA och innehåller därmed samma information som genen gör. transkriptionen är selektiv vilket innebär att bara vissa delar av DNA skrivs om till RNA.

Question 6

vad avgör i hur stor utsträckning ett protein bildas?

Answer 6

hur ofta en gen transkriberas bestäms till stor del av hur hög affiniteten är mellan promotorn och RNA-polymeraset. en promotor som är väldigt lik konsensussekvensen har lätt att binda till polymeraset. därmed kommer den genen ofta att skrivas om till mRNA och bilda det protein som kodas.

Question 7

konsensussekvenser

Answer 7

ett mönster av nukleotider som promotorregionen följer. inte exakt samma nukleotidsekvens i alla promotorer men de är väldigt lika. i bakterier finns en sådan sekvens vid -10 och -35.

Question 8

RNA egenskaper

Answer 8

oftast enkelsträngat men kan baspara internt vilket ger upphov till en sekundär struktur. nukleotidsekvensen bestämmer hur sekundärstrukturen ser ut vilket gör att RNA kan bilda massa strukturer med olika funktion i cellen.
rna är mer instabilt än DNA eftersom dess sockergrupp har en fri OH-grupp. kvävebasen i RNA är uracil istället för tymin.

Question 9

ribozym

Answer 9

RNA som är katalytiskt aktiva

Question 10

olika typer av RNA polymeras

Answer 10

i bakterier består RNA polymeraset av ett coreenzym i form av fem proteiner där andra funktionella grupper kan binda in vid olika steg i transkriptionen. i eukaryoter finns det ett polymeras för varje typ av RNA. polymeras 2 transkriberar DNA till mRNA.

Question 11

operon

Answer 11

flera gener som transkriberas i samma mRNA. kallas att de ko-transkriberas. finns endast i bakterier.

Question 12

corepromotor

Answer 12

promotor i eukaryota som kan bestå av en eller flera konsensussekvenser.

Question 13

TATA-box

Answer 13

en av de vanligaste konsensussekvenserna i corepromotorn. finns på -25.

Question 14

regulatoriska proteiner

Answer 14

binder till DNA nära promotorn och modifierar kromatinet så att det blir tillgängligt för transkription. efter det är klart börjar de bygga pre-initieringskomplexet

Question 15

transkriptionsfaktorer

Answer 15

känner igen corepromotorn och binder till den. finns massa olika som ingår i pre-initieringskomplexet tillsammans med RNA polymeras 2.

Question 16

pre-initieringskomplex

Answer 16

består av TF, RNA polymeras och mediator komplex. sammanlagt ca 50 polypeptider