eukaryota genom Flashcards
andel exoner
1-2%
andel introner
25%
LTR retrotransposon
retrotransposon med långa direct repeats på vardera sida om transposonen. reapetsen är flera hundra bp långa. utgör ca 8% av mänskligt genom. skillnaden mellan non-LTR är att repeatsen är direkya coh har en annan funktion vid duplicering
SINEs
retrotransposoner som är non-LTR. inverterade repetetiva sekvenser av ca 300 bp runtom en ickefungerande gen vilket gör att SINEs är icke-autosomala. de behöver reverse transkriptas utifrån för att kunna duplikeras. utgör 13% av genom
LINEs
non-LTR men längre inverterade repeats än SINEs, ursprunligen på ca 7000 bp. autosomala. 21% av genom
satellit DNA
tandemrepeterade sekvenser. i centromeren och heterokromatin. består av 100-400 bp och repeteras mellan 100-10 000 ggr.
minisatellit
tandemrepeats av 10-60 bp och 10 000 repeats
microsatellit
små repeats som består av 2-7 bp. DNA-fingeravtryck i skillnaden av hur många repeats som finns, alltså hur lång den tandemrepeterande regionen är. repeteras ofta mellan 5-50 gånger och finns på 600 000 olika ställen i kromosomer.
pseudogen
gener som förlorat sin förmåga att koda för ett protein.
genfamilj
flera liknande gener osm bildas genom duplikation av en prginalgen. ofta har de liknande biokemisk finktion. tex genfamiljen för hemoglobin
genduplikation
kan antingen ske genom vid rekombination (ÖK) eller via transposabla element
transposabla element andel
45%, både retrotransposoner och DNA transposoner
DNA transposoner
transposas klipper ut DNA och inserterar det på annan plats. ej via RNA. fotavtryck av repeats vid insertion. 3% av genom