Transcriptomics Flashcards

1
Q

Was ist Phenotypic Plasticity?

A

Phänotypische Plasticität ist die Unterschiedliche Entwicklung trotzt gleichem Genotyps, zb bei Bienen (Metamorphose)

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2
Q

Was sind Vorteile des RNA-Sequencing?

A
  • Ursprungssequenz nicht benötigt
  • günstig
  • größere dynamische Range
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3
Q

Was sind Bowtie, Tophat und Cufflinks?

A

Bowtie macht aus fasta File ein referenz Genom, Tophat alignt daraus die RNA-Seq reads und Cufflink macht statistische Analyse

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4
Q

Was ist MiRNA?

A

MicroRNA, noncoding RNA genes

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5
Q

Was ist Gen Ontology?

A

Ein großer Teil der Bioinformatik, welcher die Representation von Genen standartisieren will

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6
Q

Wie sind die 4 Schritte um von RNA-Seq identifizierte Gene zu analysieren?

A
  1. Gene Ontology
  2. Orthology and Database Searches
  3. Genetic Pathways Analysis
  4. Statistical Analysis
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