Transcriptomics Flashcards
1
Q
Was ist Phenotypic Plasticity?
A
Phänotypische Plasticität ist die Unterschiedliche Entwicklung trotzt gleichem Genotyps, zb bei Bienen (Metamorphose)
2
Q
Was sind Vorteile des RNA-Sequencing?
A
- Ursprungssequenz nicht benötigt
- günstig
- größere dynamische Range
3
Q
Was sind Bowtie, Tophat und Cufflinks?
A
Bowtie macht aus fasta File ein referenz Genom, Tophat alignt daraus die RNA-Seq reads und Cufflink macht statistische Analyse
4
Q
Was ist MiRNA?
A
MicroRNA, noncoding RNA genes
5
Q
Was ist Gen Ontology?
A
Ein großer Teil der Bioinformatik, welcher die Representation von Genen standartisieren will
6
Q
Wie sind die 4 Schritte um von RNA-Seq identifizierte Gene zu analysieren?
A
- Gene Ontology
- Orthology and Database Searches
- Genetic Pathways Analysis
- Statistical Analysis