Transcription des gènes et contrôle Flashcards
Polarité des brins sens de lecture
3’ vers 5’
sens de polymérisation (écriture)
5’ vers 3’
ARN polymérase 1 (fonction)
Fait les ARNr
ARN polymérase 2 (fonction)
ARNm
ARN polymérase 3
fonction
Fait les ARNt et un peu d’ARNr
ARN polymérase 4 et 5 (fonction)
Fait les ARN interférents
Initiation de la transcription via ARN Polymérase 2
- TBP se lie a l’ADN au site promoteur (boite TATA). Il induit une courbure a l’ADN pour changer la forme 3D et ainsi le décondenser
- TFIIB s’associe a TBP et a l’ADN. le N term va s’étendre vers le site +1
- TFIIF est associée a la l’ARN pol 2 qui est associée au DCT. Il se fixe au site +1 et facilite l’ouverture de la bulle.
- TFIIE se fixe au promoteur (boite TATA) maintient la bulle ouverte.
- TFIIH se fixe sur TFIIE. Il renferme l’hélicase qui déroule l’ADN. Il renferme l’ATPase qui vient phosporyler le DCT permettant le début de l’élongation
tout ce détache sauf TBP qui peut etre utilisé plusieurs fois.
Initiation a la transcription via ARN polymérase 1
- UAF
- TBP + facteur central
- ARN pol 1 + Rrn3P
pas de DCT
Initiation a la transcription via ARN polymérase 3
- TFIIIB Contient TBP
- TFIIIA attire TFIIIC
pas de DCT
pas de boite TATA
fait ARNr et ARNt
Mono vs poly cistronique
ARNm polycistronique:
1 ARNm peut coder plusieurs protéines
ARNm monocistronique:
1 ARNm peut coder une seule protéine.
Action avec la topoisomérase
enzyme associée a l’hélicase.
lorsqu’il y a un surrenroulement de l’ADN, la topoisomérase vient couper soit 1 brin, décroise, puis rescinde (type 1)
ou elle coupe 2 brin, décroise et rescinde (type 2)
Motif des facteurs de transcription : le doigt de zinc
lie l’ADN par des liaisons non covalentes
la forme compacte peut venir s’encastrer dans le petit sillion d’ADN.
liaison des 9 doigts de zinc de TFIIIA au promoteur au promoteur du gène de l’ARNr 5s
2 cystéines et 2 histidines s’enroulent autour du zinc, cause un repli en domaine compact qui peut entrer dans l’ADN
Motif des facteurs de transcription : la glissière a leucines
s’insère dans l’hélice alpha
nécessaires a la dimérisation du facteur. (dimère insère le facteur) comme un zipper
dimérisation: 2 facteurs qui s’associent l’un a l’autre.
répresseur
domaines qui régulent négativement la transcription.
inhibe l’Expression des gènes
Séquences de régulation de la transcription
répresseurs ou amplificateurs
contrôle le niveau de’expression des gènes.
font partie de la région non-codante de l’ADN.
Amplificateurs (activateurs)
recrutent d’Autres amplificateur pour amplifier l’expression des gènes.
Éléments proches.
il y a des régions régulatrices courtes, près du promoteur
contient les séquences de régulations les plus importantes
l’expression des gènes est modulé par:
- la régulation des facteurs de transcription (séquences codantes juxtaposées a des séquences de régulation)
- interaction d’activateurs avec coactivateurs ou inverse, qui modifient la structure de la chromatine (hétérochromatine/euchromatine)
- interaction d’activateurs avec co activateurs qui intéragissent avec la polymérase ou les facteurs (complexe médiateur)
niveau de condensation de l’ADN
Hétérochromatine: tres condensé, pas beaucoup d’expression de gène
Euchromatine: moins condensé, beaucoup d’expression de gène.
Complexe de remodelage SWI-SNF et CBP induit
- glissement d’octamère d’histone vers un autre site
- changment de conformation du nucléosome
- modification de la composition des histones
- déplacement complet des histones
Histones acétylés
permet le remodelage de la chromatine.
+ acétylés -> euchromatine
désacétylé -> hétérochromatine
HAT
recrutés par les activateurs.
acétylases
neutralise la charge de la lysine, ce qui annule les interactions avec les nucléosomes voisins et le squelette négatif de l’ADN.
moins d’intéraction donc moins condensé = euchromatine
HDAC
répresseurs + co represseurs = complexe qui contient une activité désacétylase (HDAC
élimine les groupements acétyle des queues des histones.
contraire de HAT, permet interaction avec nucléosome voisin et squelette négatif de l’ADN.
donc devient plus tight = hétérochromatine
Histones méthylés
represseur - corepresseur
+ méthylation -> hétérochromatine
