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MMD 1042 Module 3 > Transcription > Flashcards

Transcription Flashcards

1
Q

Facteur de transcription présent seulement chez les procaryotes ?

A

Terminateur

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Q

Dans quel sens le brin matrice d’ADN est-il lu ?

A

3’ –> 5’

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3
Q

Dans quel sens l’ARN polymérase synthéthise l’ARN ?

A

5’ –> 3’

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4
Q

Ce qui permet a l’ARN d’avoir une structure secondaire et tertiaire ?

A

Intéractions entre ses bases

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5
Q

Appariement de bases entre deux régions simples-brin de boucles ?

A

Pseudoknot

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6
Q

Courte région d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement

A

Hétéroduplex

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7
Q

V/F : L’ARN polymérase nécessite une amorce ?

A

FAUX

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8
Q

V/F : La transcription est aussi précise que la réplication ?

A

FAUX ; est moins précise car durée de vie plus courte donc moins d’impact

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9
Q

Type de lien crée par l’ARN polymérase entre les nucléotides et son site actif ?

A

Phosphodiester

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10
Q

Séquence qui indique la fin de la transcription aka site de terminaison ?

A

Terminateur

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11
Q

Séquence qui indique le début de la transcription aka site d’initiation ?

A

Promoteur

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12
Q

Forment le complexe d’initiation de la transcription chez les procaryotes ?

A

facteurs sigma + ARN polymérase

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13
Q

Endroit où l’ARN polymérase est recrutée avec le facteur sigma chez les procaryotes ?

A

Promoteur

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14
Q

Emplacement des composantes du promoteur chez les procaryotes ?

A

TTGACAT –> -35
TATA Box –> -10

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15
Q

Emplacement du premier nucléotides transcrit chez les procaryotes ?

A

+1

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16
Q

V/F : Le complexe d’initiation de la transcription est formée avant de se lier au promoteur ?

A

VRAI

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17
Q

Que dicte la position de la séquence consensus ?

A

Brin à utilisé et sens de la transcription

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18
Q

Qu’arrive t-il si la séquence consensus (idéale) et similaire à la séquence du promoteur

A

Affinité facteur sigma augmente
Promoteur plus fort

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19
Q

Pts de repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription ?

A

Séquence TATAAT (-10)

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20
Q

Quel est le rôle et la particularité de la séquence en tige-boucle (hairpin) chez les procaryotes ?

A

Cause la terminaison de la transcription
riche en U

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21
Q

Rôle et nom du produits de l’ARN polymérase II (Eucaryotes) ?

A

ARNm
Codent pour les protéines

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22
Q

Rôle et nom du produits de l’ARN polymérase I (Eucaryotes) ?

A

ARNr
Composent les ribosomes

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23
Q

Rôle et nom du produits de l’ARN polymérase III (Eucaryotes) ?

A

ARNt
Servent d’adapteur lors de la synthèse protéique
(produit aussi petits ARN)

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24
Q

Emplacement et rôle de la TATA box chez les eucaryotes ?

A

-25
Pts de repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription

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25
Q

Se lient a la TATA box pour former le complexe d’initiation de la transcription avec l’ARN pol II (Eucaryotes) ?

A

Facteurs généraux de transcription

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26
Q

GTF qui reconnait la TATA box

A

Sous unité TBP des TFIID

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27
Q

Rôle de sous-unité TAF

A

GTF qui reconnait des séquences d’ADN près du pts de départ de transcription
Régule le DNA-binding par TBP

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28
Q

Rôle des TFIIB

A

Reconnait les élément BRE dans les promoteurs
Positionne adéquatement les ARN polymérases au début du site de transcription

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29
Q

Rôle des TFIIF

A

Stabilise les intéractions des ARN polymérases avec les TBP / TFIIB\
Aide à attiré TFIIE / TFIIH

30
Q

Rôle de TFIIE

A

Attire et régule TFIIH

31
Q

Rôle de TFIIH

A

Démêle l’ADN au pts de départ de la transcription
Phosphoryle Ser5 des ARN polymérase CTD
Relache ARN polymérase du promoteur

32
Q

Rôle et emplacement des CAAT box et GC box

A

-80 CAAT bot
-100 GC box
Augmentent efficacité du promoteur basal
Régulation de la transcription des gènes
Liées par facteurs activateurs spécifiques

33
Q

Facteur spécifique d’activation se liant au promoteur ?

A

Enhancer**

34
Q

facteur spécifique de répression se liant au promoteur ?

A

Silencers

35
Q

Ce qui forme le complexe d’initiation de la transcription chez les eucaryotes ?

A

GTF + ARN pol II

36
Q

Ce qui caractérise la boite TATA chez les eucaryotes ?

A

Promoteur situé en -25

37
Q

Ce qui s’associe en premier à l’ADN du promoteur chez les eucaryotes ?

A

TFIID (first) + TFIIB (second)

38
Q

V/F : L’ARN pol reconnaît directement le promoteur chez les eucaryotes ?

A

FAUX ! elle nécessite les TFII pour se fixer à la TATA box

39
Q

Étape d’assemblage du complexe d’initiation de la transcription au promoteur chez les eucaryotes ?

A

1 - Reconnaissance de la TATA box (-25) par TFIID
2- Recrutement de TFIIB par TFIID qui est lié à l’ADN
3- Recrutement de ARN pol II
4- Recrutement de TFIIF + TFIIE +TFIIH

40
Q

Caractéristiques de la terminaison chez les eucaryotes ?

A

1- est couplé à la polyadénylation
2- Le terminateur est une séquence dans le pré-ARNm transcrit qui est aussi le signe de polyadénylation
3- Le pré-ARNm est clivé et polyadénylé
4- La polymérase de détache

41
Q

Séquence de Polyadénylation

A

AAUAAA

42
Q

Comment la régulation et l’abondance de l’ARN dans la cellule est elle assuré ?

A

Constante synthétisation et dégradation d’ARN

43
Q

Déf de demi-vie ?

A

Temps pour arriver à 50% de la quantité initiale

44
Q

Demi-vie moyenne de la plupart des ARNm chez C humaine ?

A

4.8 minutes

45
Q

Que permet la régulation et la transcription ?

A

L’expression d’un gène au “bon moment”

46
Q

Impact de l’efficacité de la transcription ?

A

Quantité d’ARN produit
Quantité de protéine traduite

47
Q

Où est régulé le taux de transcription d’un gène ?

A

Au niveau de l’initiation
Par la séquence du promoteur + facteurs de transcriptions spécifiques

48
Q

V/F : La vitesse d’élongation de la transcription est variable

A

FAUX ! Elle est constante

49
Q

Protéines qui empêchent l’assemblage des facteurs généraux de transcription ?

A

Répresseurs
Se lient aux séquences Silencers

50
Q

Protéines qui facilitent l’assemblage des facteurs généraux de transcription ?

A

Activateurs
Se lient aux séquences Enhancers

51
Q

Séquences qui activent la transcription

A

Enhancers

52
Q

Séquences qui inhibent la transcription

A

Silencers

53
Q

Qu’influencent les enhancers et silencers ?

A

L’assemblage de l’ARN polymérase

54
Q

Que font les facteurs d’activation pour stimulé la transcription ?

A

1 - Recruteur des facteurs généraux de la transcription et l’ARN pol II (GTF)
2 - Attirer des complexes du remodelage de la chromatine, qui vont décondenser les chromatine
3 - Attirer des modificateurs de chromatines

55
Q

Que comprennent les facteurs spécifiques de transcription ?

A

1 - Un domaine de liaison à l’ADN (DBD)
2 - Un domaine d’activation (TAD; proteine d’activation) et un domaine de répression (protéine de réprission)

56
Q

Que favorise la production de glucocorticoïdes ?

A

Transformation du glycogène en glucose par l’enzyme convertisant le glycogène.

57
Q

V/F : L’enzyme convertissant le glycogène est synthéthisé seulement au besoin, modulé par la présence de glucocorticoïde ?

A

VRAI !

58
Q

Les facteurs de transcription et complexes protéiques spécifiques se liant aux régions régulatrice des gènes sont dans des _________ ?

A

Combinaisons spécifiques pour chaque gène

59
Q

Quelle est la structure de l’ARN et les bases qui la compose ?

A

Simple brin avec des ribonucléotides
Uracile remplace la Thymine

60
Q

Quelle est la polarité de la transcription ?

A

5’ –> 3’

61
Q

Quelles sont les caractéristiques des ARN pol. ?

A
  • Synthétise l’ARN en copiant un brin matrice d’ADN
  • Ne nécéssite PAS d’amorce
  • Créée des liens phosphodiester entre les nucléotides au site actif
  • Pas aussi précis que réplication
62
Q

Qu’est-ce qu’une séquence consensus ?

A

Ordre calculé des nucléotides (ou AA) trouvés à chq position dans un alignement de séquences
Ex : ATG en +1
TTGACAT en -35
TATAAT en -10

63
Q

Définition promoteur (Procaryote) ?

A

Signal d’initiation de la transcription
Endroit où est recruté l’ARN pol.
Se lie au facteur sigma pour former
ARN pol se lie à facteur sigma AVANT de se lier au promoteur

64
Q

Définition terminateur (procaryote)?

A

Signal l’arrêt de la transcription
À l’extrémité 3’ de l’ARN néosynthéthisée
Tige-boucle créée une contrainte qui favorise le détachement de ARN pol.

65
Q

Définition promoteur (eucaryote) ?

A

Implique la TATA box
Situé environ à -25
Des facteurs généraux de transcription (GTF) s’associent à boite TATA
GTF + ARN pol. II forment complexe d’initiation de la transcription

66
Q

Définition terminateur (eucaryote) ?

A

Couplée a la polyadénylation
Est une séquence dans le pré-ARNm transcrit qui est aussi le signal de polyadénylation : AAUAAA
Pré-ARNm est clivé et polyadénylé
Polymérase se détache

67
Q

Qu’est-ce qui détermine le niveau (taux) d’expression d’un gène ?

A

Le taux de transcription–> L’initiation

68
Q

Quelles sont les régions de régulation des gènes ?

A

Enhancers
Silencers

69
Q

Facteurs protéiques impliqués dans la régulation des gènes ?

A

Activateurs
Répresseurs

70
Q

Comment l’expression des gènes est modulée ?

A

Régulé par la transcription, donc au niveau de l’INITIATION

71
Q

Principale caractéristique de la séquence tige-boucle ?

A

Riche en G-C suivi d’une série de U

MMD 1042 Module 3 (8 decks)

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