Transcription Flashcards
Facteur de transcription présent seulement chez les procaryotes ?
Terminateur
Dans quel sens le brin matrice d’ADN est-il lu ?
3’ –> 5’
Dans quel sens l’ARN polymérase synthéthise l’ARN ?
5’ –> 3’
Ce qui permet a l’ARN d’avoir une structure secondaire et tertiaire ?
Intéractions entre ses bases
Appariement de bases entre deux régions simples-brin de boucles ?
Pseudoknot
Courte région d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement
Hétéroduplex
V/F : L’ARN polymérase nécessite une amorce ?
FAUX
V/F : La transcription est aussi précise que la réplication ?
FAUX ; est moins précise car durée de vie plus courte donc moins d’impact
Type de lien crée par l’ARN polymérase entre les nucléotides et son site actif ?
Phosphodiester
Séquence qui indique la fin de la transcription aka site de terminaison ?
Terminateur
Séquence qui indique le début de la transcription aka site d’initiation ?
Promoteur
Forment le complexe d’initiation de la transcription chez les procaryotes ?
facteurs sigma + ARN polymérase
Endroit où l’ARN polymérase est recrutée avec le facteur sigma chez les procaryotes ?
Promoteur
Emplacement des composantes du promoteur chez les procaryotes ?
TTGACAT –> -35
TATA Box –> -10
Emplacement du premier nucléotides transcrit chez les procaryotes ?
+1
V/F : Le complexe d’initiation de la transcription est formée avant de se lier au promoteur ?
VRAI
Que dicte la position de la séquence consensus ?
Brin à utilisé et sens de la transcription
Qu’arrive t-il si la séquence consensus (idéale) et similaire à la séquence du promoteur
Affinité facteur sigma augmente
Promoteur plus fort
Pts de repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription ?
Séquence TATAAT (-10)
Quel est le rôle et la particularité de la séquence en tige-boucle (hairpin) chez les procaryotes ?
Cause la terminaison de la transcription
riche en U
Rôle et nom du produits de l’ARN polymérase II (Eucaryotes) ?
ARNm
Codent pour les protéines
Rôle et nom du produits de l’ARN polymérase I (Eucaryotes) ?
ARNr
Composent les ribosomes
Rôle et nom du produits de l’ARN polymérase III (Eucaryotes) ?
ARNt
Servent d’adapteur lors de la synthèse protéique
(produit aussi petits ARN)
Emplacement et rôle de la TATA box chez les eucaryotes ?
-25
Pts de repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription
Se lient a la TATA box pour former le complexe d’initiation de la transcription avec l’ARN pol II (Eucaryotes) ?
Facteurs généraux de transcription
GTF qui reconnait la TATA box
Sous unité TBP des TFIID
Rôle de sous-unité TAF
GTF qui reconnait des séquences d’ADN près du pts de départ de transcription
Régule le DNA-binding par TBP
Rôle des TFIIB
Reconnait les élément BRE dans les promoteurs
Positionne adéquatement les ARN polymérases au début du site de transcription
Rôle des TFIIF
Stabilise les intéractions des ARN polymérases avec les TBP / TFIIB\
Aide à attiré TFIIE / TFIIH
Rôle de TFIIE
Attire et régule TFIIH
Rôle de TFIIH
Démêle l’ADN au pts de départ de la transcription
Phosphoryle Ser5 des ARN polymérase CTD
Relache ARN polymérase du promoteur
Rôle et emplacement des CAAT box et GC box
-80 CAAT bot
-100 GC box
Augmentent efficacité du promoteur basal
Régulation de la transcription des gènes
Liées par facteurs activateurs spécifiques
Facteur spécifique d’activation se liant au promoteur ?
Enhancer**
facteur spécifique de répression se liant au promoteur ?
Silencers
Ce qui forme le complexe d’initiation de la transcription chez les eucaryotes ?
GTF + ARN pol II
Ce qui caractérise la boite TATA chez les eucaryotes ?
Promoteur situé en -25
Ce qui s’associe en premier à l’ADN du promoteur chez les eucaryotes ?
TFIID (first) + TFIIB (second)
V/F : L’ARN pol reconnaît directement le promoteur chez les eucaryotes ?
FAUX ! elle nécessite les TFII pour se fixer à la TATA box
Étape d’assemblage du complexe d’initiation de la transcription au promoteur chez les eucaryotes ?
1 - Reconnaissance de la TATA box (-25) par TFIID
2- Recrutement de TFIIB par TFIID qui est lié à l’ADN
3- Recrutement de ARN pol II
4- Recrutement de TFIIF + TFIIE +TFIIH
Caractéristiques de la terminaison chez les eucaryotes ?
1- est couplé à la polyadénylation
2- Le terminateur est une séquence dans le pré-ARNm transcrit qui est aussi le signe de polyadénylation
3- Le pré-ARNm est clivé et polyadénylé
4- La polymérase de détache
Séquence de Polyadénylation
AAUAAA
Comment la régulation et l’abondance de l’ARN dans la cellule est elle assuré ?
Constante synthétisation et dégradation d’ARN
Déf de demi-vie ?
Temps pour arriver à 50% de la quantité initiale
Demi-vie moyenne de la plupart des ARNm chez C humaine ?
4.8 minutes
Que permet la régulation et la transcription ?
L’expression d’un gène au “bon moment”
Impact de l’efficacité de la transcription ?
Quantité d’ARN produit
Quantité de protéine traduite
Où est régulé le taux de transcription d’un gène ?
Au niveau de l’initiation
Par la séquence du promoteur + facteurs de transcriptions spécifiques
V/F : La vitesse d’élongation de la transcription est variable
FAUX ! Elle est constante
Protéines qui empêchent l’assemblage des facteurs généraux de transcription ?
Répresseurs
Se lient aux séquences Silencers
Protéines qui facilitent l’assemblage des facteurs généraux de transcription ?
Activateurs
Se lient aux séquences Enhancers
Séquences qui activent la transcription
Enhancers
Séquences qui inhibent la transcription
Silencers
Qu’influencent les enhancers et silencers ?
L’assemblage de l’ARN polymérase
Que font les facteurs d’activation pour stimulé la transcription ?
1 - Recruteur des facteurs généraux de la transcription et l’ARN pol II (GTF)
2 - Attirer des complexes du remodelage de la chromatine, qui vont décondenser les chromatine
3 - Attirer des modificateurs de chromatines
Que comprennent les facteurs spécifiques de transcription ?
1 - Un domaine de liaison à l’ADN (DBD)
2 - Un domaine d’activation (TAD; proteine d’activation) et un domaine de répression (protéine de réprission)
Que favorise la production de glucocorticoïdes ?
Transformation du glycogène en glucose par l’enzyme convertisant le glycogène.
V/F : L’enzyme convertissant le glycogène est synthéthisé seulement au besoin, modulé par la présence de glucocorticoïde ?
VRAI !
Les facteurs de transcription et complexes protéiques spécifiques se liant aux régions régulatrice des gènes sont dans des _________ ?
Combinaisons spécifiques pour chaque gène
Quelle est la structure de l’ARN et les bases qui la compose ?
Simple brin avec des ribonucléotides
Uracile remplace la Thymine
Quelle est la polarité de la transcription ?
5’ –> 3’
Quelles sont les caractéristiques des ARN pol. ?
- Synthétise l’ARN en copiant un brin matrice d’ADN
- Ne nécéssite PAS d’amorce
- Créée des liens phosphodiester entre les nucléotides au site actif
- Pas aussi précis que réplication
Qu’est-ce qu’une séquence consensus ?
Ordre calculé des nucléotides (ou AA) trouvés à chq position dans un alignement de séquences
Ex : ATG en +1
TTGACAT en -35
TATAAT en -10
Définition promoteur (Procaryote) ?
Signal d’initiation de la transcription
Endroit où est recruté l’ARN pol.
Se lie au facteur sigma pour former
ARN pol se lie à facteur sigma AVANT de se lier au promoteur
Définition terminateur (procaryote)?
Signal l’arrêt de la transcription
À l’extrémité 3’ de l’ARN néosynthéthisée
Tige-boucle créée une contrainte qui favorise le détachement de ARN pol.
Définition promoteur (eucaryote) ?
Implique la TATA box
Situé environ à -25
Des facteurs généraux de transcription (GTF) s’associent à boite TATA
GTF + ARN pol. II forment complexe d’initiation de la transcription
Définition terminateur (eucaryote) ?
Couplée a la polyadénylation
Est une séquence dans le pré-ARNm transcrit qui est aussi le signal de polyadénylation : AAUAAA
Pré-ARNm est clivé et polyadénylé
Polymérase se détache
Qu’est-ce qui détermine le niveau (taux) d’expression d’un gène ?
Le taux de transcription–> L’initiation
Quelles sont les régions de régulation des gènes ?
Enhancers
Silencers
Facteurs protéiques impliqués dans la régulation des gènes ?
Activateurs
Répresseurs
Comment l’expression des gènes est modulée ?
Régulé par la transcription, donc au niveau de l’INITIATION
Principale caractéristique de la séquence tige-boucle ?
Riche en G-C suivi d’une série de U
