Traces Biologiques chap 3c Flashcards
Que sont les traces riches en ADN ?
- le sang liquide
- le sang séché
- le sperme
De quoi est composé le sang (periphérique et menstruel) ?
- 55% - plasma sanguin (eau, glucose, protéines lipides)
- 45% - globules rouges (99%), globules blancs et plaquettes
5000-10000 globules blancs / ml de sang
De quoi est composé le sperme ?
- liquide séminal
- éléments cellulaires (spermatozoïdes, cellules épithéliales, macrophages, nutriments, oligoéléments)
20-200 millions de spermatozoïdes / ml de sperme
De quoi est composé la salive ?
sécrétée par les glandes salivaires (99% eau, protéines, électrolytes) + cellules buccales
De quoi est composé les traces de contactes ?
- composés endogènes
- composés (semi-) éxogènes
Quels types d’ADN sont exploitables avec des cheveux ou poils ?
s’il y’a une racine:
- ADN nucléaire (10%< de succès d’obtentation d’un profil)
pas de racine:
- ADN mitochondrial ( 75% de succès d’obtentation d’un profil)
un cheveu tombé: n’a pas de racine
un cheveu arraché: peu avoir une racine
informe sur l’activité
Que sont de traces pauvres en ADN ?
- La salive
- Les traces de contact
- les sécretions vaginales
- l’urine
- les os/dents
- les cheveux/poils
- les ongles
Que sont les étapes de l’obtention du matériel génétique des traces ?
- Extraction
- Quantification: quelle trace
- Amplification: PCR (polymerase chain reaction) = copie des fragments d’intérêt (ex. STR), avec 32 cycles est crée 1 milliard de copies
- Électrophorèse capillaire
- Détermination des allèles
Comment déteminer la nature du fluide biologique retrouvé ?
Avec des tests d’orientation
La nature du fluide et son placement peut informé quoi ?
peut informé sur l’activité
Que sont les trois types principaux de tests d’orientation ?
- l’observation visuelle
- test chimiques chromophoriques (activité catalytique)
- tests immunochromatographiques (reconnaissance moléculaire)
Qu’est l’utilité de la lumière blanche pour la détection de traces de sang ?
- tentative de localisation possible
- caractéristiques de traces: couleur, uniformité, viscosité apparente, texture. etc
- caractéristiques du support
A quoi ressemble les traces de sang sous UV et infrarouge ?
une couleur noir/foncé
Quelle molécule est ciblé pour les tests chromophoriques de traces de sang ?
l’hémoglobine
Que sont des indicateurs utilisés pour les test chromphoriques de traces de sang ?
- phénolphtaléine (=Kastle-Meyer)
- tétraméthyle benzidine (=Hémastix)
- luminol (=Bluestar)
Qu’est la spécificité des tests chromophoriques de traces de sang ?
L’homme et les animaux. Il n’y a aucune distinction entre le sang humain et animal
Que sont les faux positifs des tests chromophoriques de traces de sang ?
Les substances contenant des péroxydases ou agents oxydants (ex: certains fruits/légumes, rouille, eau de Javel)
Qu’est le cas célèbre de faux positif pour les tests chromophoriques de traces de sang ?
Dingo Case in AU
Que sont les deux molécules ciblés pour les tests immunochromatographiques pour les traces de sang ?
- l’hémoglobine
- la glycophorine A
Que sont les indicateurs commerciaux pour les tests immunochromatographiques pour les traces de sang ?
- l’Hexagon OBTI
- SERACTEC HemDirect
- RSID blood
Quelle molécule est ciblée par l’Hexagon OBTI (immunochromatographiques) ?
l’hémoglobine
Qu’est la spécificité de l’Hexagon OBTI ?
sang / immunochromatographique
les hommes, les primates, le blaireau, la belette, le lapin (faux positifs) + liquides acides/ jus d’orange
Quelle molécule est ciblée par le SERATEC HemDirect (immunochromatographiques) ?
l’hémoglobine
Qu’est la spécificité du SERATEC HemDirect ?
sang / immunochromatographique
les hommes, les primates, le furet (faux positifs)
Quelle molécule est ciblée par le RSID blood (immunochromatographiques) ?
la glycophorine A
Qu’est la spécificité du RSID blood (immunochromatographiques) ?
juste les hommes (pas de faux positifs)
Quelle molécule est ciblée pour déterminer si la trace de sang est du sang menstruel ?
les D-dimères= produits de dégradation de la fibrine
Qu’est l’indicateur pour les traces de sang menstruel (immunochromatographiques) ?
le SERATEC PMB
Qu’est la spécificité du SERATEC PMB (immunochromatographiques) ?
les hommes, les primates et le furet (faux positifs)
Qu’est l’utilité de la lumière blanche pour la détection de traces de sperme ?
- tentative de localisation possible mais peu détectable a l’œil nu
- caractéristiques de traces: couleur, uniformité, viscosité apparente, texture
- caractéristiques du support: texture, matière, couleur
A quoi ressemble les traces de sperme sous UV ?
une forte luminescense
Quelle molécule est ciblé pour les tests chromophoriques de traces de sperme ?
la phosphatase acide (pas spécifique au sperme mais est en forte concentration)
Que sont des indicateurs utilisés pour les test chromphoriques de traces de sperme ?
- la naphthylphosphate + Fast Blue B
- le bromochloroindolylphosphate
- le méthylumbelliferylphosphate
- le Phosphatesmo KM
Qu’est la spécificité des tests chromophoriques de traces de sperme ?
les humains et les animaux (pas de différence entre hommes et animaux)
Que sont les faux positifs des tests chromophoriques de traces de sperme ?
- les jus de fruit frais
- les fluides contenant de la phosphatase acide (ex: sécrétions vaginales)
Que sont les deux molécules ciblés pour les tests immunochromatographiques pour les traces de sperme ?
- la prostate-specific antigen (PSA) (enzyme ayant fonction de dégrader la séménogéline)
- la séménogéline (protéine responsable de la viscosité du sperme)
Que sont les indicateurs commerciaux pour les tests immunochromatographiques pour les traces de sperme ?
- SERATEC PSA
- RSID semen
Quelle molécule est ciblée par le SERATEC PSA (immunochromatographiques) ?
Prostate-specific-antigen
Qu’est la spécificité de la SERATEC PSA ?
sperme / immunochromatographiques
les humains, les primates possiblement (faux positifs=urine)
Quelle molécule est ciblée par le RSID semen (immunochromatographiques) ?
la séménogéline
Qu’est la spécificité de la RSID semen (immunochromatographiques) ?
les humains
Qu’est la coloration Christmas tree ?
- Nuclear Fast Red: tête du spermatozoïde colorée en rouge
- picroindigocarmine: la queue du spermatozoïde colorée en vert
Quelles sont les raisons qu’une absence de coloration peut être un faux négatif pour la présence de spermatozoïdes avec la coloration christmas tree ?
- azoospermie: aucun spermatozoïde dans le sperme
- oligospermie: peu de spermatozoïdes dans le sperme
Qu’est l’utilité de la lumière blanche pour la détection de traces de salive ?
- tentative de localisation mais peu détectable
- caractéristiques de traces
- caractéristiques de support
A quoi ressemble les traces de salive sous UV ?
- peut luminescer faiblement sous ondes UVs
Quelle molécule est ciblé pour les tests chromophoriques de traces de salive ?
-alpha-amylase
Qu’est un indicateur utilisé pour les test chromphoriques de traces de salive ?
Phadebas
Qu’est la spécificité des tests chromophoriques de traces de salive ?
les humains et animaux (pas de différences entre humains et animaux)
Que sont les faux positifs des tests chromophoriques de traces de salive ?
certains aliments et les excrements
Qu’est la molécule ciblé pour les tests immunochromatographiques pour les traces de salive ?
l’alpha-amylase
Que sont les indicateurs commerciaux pour les tests immunochromatographiques pour les traces de salive ?
- SERATEC amylase
- RSID saliva
Qu’est la spécificité de la RSID saliva + faux positifs (immunochromatographiques) ?
les humains et les gorilles (faux positif=lait maternel et matières fécales)
Qu’est la spécificité de le SERATEC amylase (immunochromatographiques) ?
les humains et les primates possiblement (faux positif)
Qu’est la molécule ciblé pour les tests immunochromatographiques pour les traces d’urine ?
Uromoduline
Qu’est un indicateur utilisé pour les test immunochromatographiques de traces d’urine ?
RSID urine
Qu’est la spécificité du RSID urine (immunochromatographiques) ?
les humains, les chiens, les gorilles, les chevaux, les rats (faux positifs)
Que sont les critères qui affectent l’exploitabilité des marqueurs polymorphes ?
- stabilité au cours de la vie de l’individu
- sensibilité de la technique d’analyse
- résistance à la dégradation
- coûts d’analyse
- pouvoir discriminant (polymorphisme, combinaison de marqueurs)
Que sont les bases d’ADN ?
- Adénine
- Thymine
- Guanine
- Cytosine
Que sont les deux moyens de comparaison de l’ADN ?
- polymorphisme de séquence: lire la séquence et comparer
- polymorphisme de longueur: comparer la longueur de fragments spécifiques
Quels types d’ADN sont utilisés dans le polymorphisme de séquence ?
- ADN mitochondrial
- ADN nucléaire (phénotypage)
Quelles types d’ADN sont utilisé dans la comparaion de longueur (polymorphisme) ?
ADN nucléaire (Les STR)
Historiquement quel méthode était utilisé pour l’analyse d’ADN ?
Le southern blotting
Par qui était développé le southern blotting et quand ?
Par Alec Jeffreys en 1984
Quel était la première utilisation du DNA Fingerprinting ?
l’affaire Pitchfork en 1987
Que sont les limities du DNA Fingerprinting ?
- pauvre sensibilité
- fastidieux
- faible succès avec des échantillons dégradés
Qu’est un STR ?
Éléments répétitifs localisés majoritairement dans les régions non codantes de l’ADN
Combien de STR sont dans l’ADN humain ?
50000 STR
Que caractérise un marqueur polymorphe d’intérêt ?
- localisables (locus)
- mesurables (PCR + électrophorèse capillaire)
- variables entre individus (le nombre de répétitions)
- comparables
Qu’est le nom de l’approche de l’analyse de 16 marqueurs de type STR ?
l’approche multiplex
Qu’est analysé pour déterminer le sexe de la trace ADN ?
l’amélogénine
la suite alpha-numérique de STR permet quoi ?
de facilement comparer des profils génétique dans les BDD
Ex: [12 15/ 14 16/ 09 11/…/X Y]
Qu’affecte le choix des STR retenus ?
Fuckin weird Q
Sont que retenus dans les zones non-codantes de l’ADN:
- aucune info en lien avec l’aspect physique/morphologique
- aucune info sur l’état de santé
- aucun intérêt pour un employeur, assureur, médecin
Comment choisir les STR parmis les 50000 ?
- résistance à la dégradation: STR a segment court < 500pb, motifs répétitifs courts
- maximiser la discrimination: STR polymorphes / variation maximale, STR non corrélés entre eux
Que sont les différents standards mondiaux de STR ?
- Expanded Combined DNA Index System (CODIS): 20 loci + amélogénine
- Interpol Standard Set of Loci: 12 loci + amélogénine
- European Standard Set of Loci: 12 loci + amélogénine
- France: 23 loci incluant ceux d’Interpol
Interpol and EU Loci are the same
The CODIS Loci include the ones for Interpol and EU
Que sont des difficultés liées aux traces d’ADN ?
- Des profils partiels: ADN dégradé ou faible quantité, baisse de la valeur probante, risque accru de correspondante fortuite
- Des profils de mélange: plus courant quand la sensibilité augmente, interpretation complexe, ADN mineur pas toujours détecté
- Erreurs humaines: contaminations, stockage inapproprié, inversion d’échantillons, erreur d’analyse/ lecture
Que utilise-t-on pour lire le profil génétique d’une trace ?
un électrophorégramme
Comment identifier un profil de mélange ?
qu’il y a plus que 2 nombre de répétitions pour un STR sur l’électrophorégramme
Quels profils sont dans des bases de données ?
- des traces non identifiées
- des profils de référence d’individus condamnés
Que sont des caractéristiques du caractère stricte des bases légales sur les bases de données ?
- des critères d’introduction explicités
- des durées de conservation des profils explicitées
- des procédures d’effacement explicitées
Quand a été mis en vigueur la banque de donnés d’ADN en Suisse ?
en 2005
Combien de profils sont dans la banque de données en Suisse ?
177’508
Qu’est le nom de la banque de données au UK ?
National DNA Database (NDNAD). 1er BDD ADN nationale au monde
Quand a été crée la NDNAD au UK ?
en 1995 par le UK Home Office
Combien de profils sont contenus dans le NDNAD en 2020 ?
environ 5,5 million
Quand a été crée la NDIS au US ?
- En 1998: Lancement de NDIS dans 9 états
- En 2004: Implémentation dans les 50 états de CODIS
En 1994 le DNA Identification Act est entré en viguer ce qui à authorisé le FBI de créer une BDD nationale
Combien de profils sont contenus dans la banque de données au US ?
15 million
Quand a été crée la banque de données en Chine ?
en 2005
Combien de profils sont dans la base de données en Chine ?
70 million en 2019
Qu’est le projet actuel pour la banque de données d’ADN en Chine ?
cherche à alimenter la banque de données avec tous les profils génétiques de la population mâle
Que sont les risques et dérives de la banque de données en Chine ?
- origines ethniques
- liens de parenté
- correspondances fortuites
Que sont les risques liés aux BDD ADN ?
- Correspondance fortuite
- Utilisation de traces non pertinentes
- Négligence d’éléments d’enquête
- Manipulation de traces
- Sécurité de la BDD
Que sont les risques du Phénotypage ?
- Efficacité discutable: traits physiques impliquant plusieurs gènes, apparence physique génétique vs réelle
- Modèles prédictifs perfectibles: pas de certitude, à considerer comme éléments d’enquête
