Traces Biologiques chap 3c Flashcards

1
Q

Que sont les traces riches en ADN ?

A
  • le sang liquide
  • le sang séché
  • le sperme
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Q

De quoi est composé le sang (periphérique et menstruel) ?

A
  • 55% - plasma sanguin (eau, glucose, protéines lipides)
  • 45% - globules rouges (99%), globules blancs et plaquettes

5000-10000 globules blancs / ml de sang

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3
Q

De quoi est composé le sperme ?

A
  • liquide séminal
  • éléments cellulaires (spermatozoïdes, cellules épithéliales, macrophages, nutriments, oligoéléments)

20-200 millions de spermatozoïdes / ml de sperme

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4
Q

De quoi est composé la salive ?

A

sécrétée par les glandes salivaires (99% eau, protéines, électrolytes) + cellules buccales

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5
Q

De quoi est composé les traces de contactes ?

A
  • composés endogènes
  • composés (semi-) éxogènes
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6
Q

Quels types d’ADN sont exploitables avec des cheveux ou poils ?

A

s’il y’a une racine:
- ADN nucléaire (10%< de succès d’obtentation d’un profil)
pas de racine:
- ADN mitochondrial ( 75% de succès d’obtentation d’un profil)

un cheveu tombé: n’a pas de racine
un cheveu arraché: peu avoir une racine

informe sur l’activité

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7
Q

Que sont de traces pauvres en ADN ?

A
  • La salive
  • Les traces de contact
  • les sécretions vaginales
  • l’urine
  • les os/dents
  • les cheveux/poils
  • les ongles
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8
Q

Que sont les étapes de l’obtention du matériel génétique des traces ?

A
  • Extraction
  • Quantification: quelle trace
  • Amplification: PCR (polymerase chain reaction) = copie des fragments d’intérêt (ex. STR), avec 32 cycles est crée 1 milliard de copies
  • Électrophorèse capillaire
  • Détermination des allèles
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9
Q

Comment déteminer la nature du fluide biologique retrouvé ?

A

Avec des tests d’orientation

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10
Q

La nature du fluide et son placement peut informé quoi ?

A

peut informé sur l’activité

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11
Q

Que sont les trois types principaux de tests d’orientation ?

A
  • l’observation visuelle
  • test chimiques chromophoriques (activité catalytique)
  • tests immunochromatographiques (reconnaissance moléculaire)
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12
Q

Qu’est l’utilité de la lumière blanche pour la détection de traces de sang ?

A
  • tentative de localisation possible
  • caractéristiques de traces: couleur, uniformité, viscosité apparente, texture. etc
  • caractéristiques du support
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13
Q

A quoi ressemble les traces de sang sous UV et infrarouge ?

A

une couleur noir/foncé

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14
Q

Quelle molécule est ciblé pour les tests chromophoriques de traces de sang ?

A

l’hémoglobine

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15
Q

Que sont des indicateurs utilisés pour les test chromphoriques de traces de sang ?

A
  • phénolphtaléine (=Kastle-Meyer)
  • tétraméthyle benzidine (=Hémastix)
  • luminol (=Bluestar)
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16
Q

Qu’est la spécificité des tests chromophoriques de traces de sang ?

A

L’homme et les animaux. Il n’y a aucune distinction entre le sang humain et animal

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17
Q

Que sont les faux positifs des tests chromophoriques de traces de sang ?

A

Les substances contenant des péroxydases ou agents oxydants (ex: certains fruits/légumes, rouille, eau de Javel)

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18
Q

Qu’est le cas célèbre de faux positif pour les tests chromophoriques de traces de sang ?

A

Dingo Case in AU

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19
Q

Que sont les deux molécules ciblés pour les tests immunochromatographiques pour les traces de sang ?

A
  • l’hémoglobine
  • la glycophorine A
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20
Q

Que sont les indicateurs commerciaux pour les tests immunochromatographiques pour les traces de sang ?

A
  • l’Hexagon OBTI
  • SERACTEC HemDirect
  • RSID blood
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21
Q

Quelle molécule est ciblée par l’Hexagon OBTI (immunochromatographiques) ?

A

l’hémoglobine

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22
Q

Qu’est la spécificité de l’Hexagon OBTI ?

sang / immunochromatographique

A

les hommes, les primates, le blaireau, la belette, le lapin (faux positifs) + liquides acides/ jus d’orange

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23
Q

Quelle molécule est ciblée par le SERATEC HemDirect (immunochromatographiques) ?

A

l’hémoglobine

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24
Q

Qu’est la spécificité du SERATEC HemDirect ?

sang / immunochromatographique

A

les hommes, les primates, le furet (faux positifs)

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25
Q

Quelle molécule est ciblée par le RSID blood (immunochromatographiques) ?

A

la glycophorine A

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26
Q

Qu’est la spécificité du RSID blood (immunochromatographiques) ?

A

juste les hommes (pas de faux positifs)

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27
Q

Quelle molécule est ciblée pour déterminer si la trace de sang est du sang menstruel ?

A

les D-dimères= produits de dégradation de la fibrine

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28
Q

Qu’est l’indicateur pour les traces de sang menstruel (immunochromatographiques) ?

A

le SERATEC PMB

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29
Q

Qu’est la spécificité du SERATEC PMB (immunochromatographiques) ?

A

les hommes, les primates et le furet (faux positifs)

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30
Q

Qu’est l’utilité de la lumière blanche pour la détection de traces de sperme ?

A
  • tentative de localisation possible mais peu détectable a l’œil nu
  • caractéristiques de traces: couleur, uniformité, viscosité apparente, texture
  • caractéristiques du support: texture, matière, couleur
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31
Q

A quoi ressemble les traces de sperme sous UV ?

A

une forte luminescense

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32
Q

Quelle molécule est ciblé pour les tests chromophoriques de traces de sperme ?

A

la phosphatase acide (pas spécifique au sperme mais est en forte concentration)

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33
Q

Que sont des indicateurs utilisés pour les test chromphoriques de traces de sperme ?

A
  • la naphthylphosphate + Fast Blue B
  • le bromochloroindolylphosphate
  • le méthylumbelliferylphosphate
  • le Phosphatesmo KM
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34
Q

Qu’est la spécificité des tests chromophoriques de traces de sperme ?

A

les humains et les animaux (pas de différence entre hommes et animaux)

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35
Q

Que sont les faux positifs des tests chromophoriques de traces de sperme ?

A
  • les jus de fruit frais
  • les fluides contenant de la phosphatase acide (ex: sécrétions vaginales)
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36
Q

Que sont les deux molécules ciblés pour les tests immunochromatographiques pour les traces de sperme ?

A
  • la prostate-specific antigen (PSA) (enzyme ayant fonction de dégrader la séménogéline)
  • la séménogéline (protéine responsable de la viscosité du sperme)
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37
Q

Que sont les indicateurs commerciaux pour les tests immunochromatographiques pour les traces de sperme ?

A
  • SERATEC PSA
  • RSID semen
38
Q

Quelle molécule est ciblée par le SERATEC PSA (immunochromatographiques) ?

A

Prostate-specific-antigen

39
Q

Qu’est la spécificité de la SERATEC PSA ?

sperme / immunochromatographiques

A

les humains, les primates possiblement (faux positifs=urine)

40
Q

Quelle molécule est ciblée par le RSID semen (immunochromatographiques) ?

A

la séménogéline

41
Q

Qu’est la spécificité de la RSID semen (immunochromatographiques) ?

A

les humains

42
Q

Qu’est la coloration Christmas tree ?

A
  • Nuclear Fast Red: tête du spermatozoïde colorée en rouge
  • picroindigocarmine: la queue du spermatozoïde colorée en vert
43
Q

Quelles sont les raisons qu’une absence de coloration peut être un faux négatif pour la présence de spermatozoïdes avec la coloration christmas tree ?

A
  • azoospermie: aucun spermatozoïde dans le sperme
  • oligospermie: peu de spermatozoïdes dans le sperme
44
Q

Qu’est l’utilité de la lumière blanche pour la détection de traces de salive ?

A
  • tentative de localisation mais peu détectable
  • caractéristiques de traces
  • caractéristiques de support
45
Q

A quoi ressemble les traces de salive sous UV ?

A
  • peut luminescer faiblement sous ondes UVs
46
Q

Quelle molécule est ciblé pour les tests chromophoriques de traces de salive ?

A

-alpha-amylase

47
Q

Qu’est un indicateur utilisé pour les test chromphoriques de traces de salive ?

A

Phadebas

48
Q

Qu’est la spécificité des tests chromophoriques de traces de salive ?

A

les humains et animaux (pas de différences entre humains et animaux)

49
Q

Que sont les faux positifs des tests chromophoriques de traces de salive ?

A

certains aliments et les excrements

50
Q

Qu’est la molécule ciblé pour les tests immunochromatographiques pour les traces de salive ?

A

l’alpha-amylase

51
Q

Que sont les indicateurs commerciaux pour les tests immunochromatographiques pour les traces de salive ?

A
  • SERATEC amylase
  • RSID saliva
52
Q

Qu’est la spécificité de la RSID saliva + faux positifs (immunochromatographiques) ?

A

les humains et les gorilles (faux positif=lait maternel et matières fécales)

53
Q

Qu’est la spécificité de le SERATEC amylase (immunochromatographiques) ?

A

les humains et les primates possiblement (faux positif)

54
Q

Qu’est la molécule ciblé pour les tests immunochromatographiques pour les traces d’urine ?

A

Uromoduline

55
Q

Qu’est un indicateur utilisé pour les test immunochromatographiques de traces d’urine ?

A

RSID urine

56
Q

Qu’est la spécificité du RSID urine (immunochromatographiques) ?

A

les humains, les chiens, les gorilles, les chevaux, les rats (faux positifs)

57
Q

Que sont les critères qui affectent l’exploitabilité des marqueurs polymorphes ?

A
  • stabilité au cours de la vie de l’individu
  • sensibilité de la technique d’analyse
  • résistance à la dégradation
  • coûts d’analyse
  • pouvoir discriminant (polymorphisme, combinaison de marqueurs)
58
Q

Que sont les bases d’ADN ?

A
  • Adénine
  • Thymine
  • Guanine
  • Cytosine
59
Q

Que sont les deux moyens de comparaison de l’ADN ?

A
  • polymorphisme de séquence: lire la séquence et comparer
  • polymorphisme de longueur: comparer la longueur de fragments spécifiques
60
Q

Quels types d’ADN sont utilisés dans le polymorphisme de séquence ?

A
  • ADN mitochondrial
  • ADN nucléaire (phénotypage)
61
Q

Quelles types d’ADN sont utilisé dans la comparaion de longueur (polymorphisme) ?

A

ADN nucléaire (Les STR)

62
Q

Historiquement quel méthode était utilisé pour l’analyse d’ADN ?

A

Le southern blotting

63
Q

Par qui était développé le southern blotting et quand ?

A

Par Alec Jeffreys en 1984

64
Q

Quel était la première utilisation du DNA Fingerprinting ?

A

l’affaire Pitchfork en 1987

65
Q

Que sont les limities du DNA Fingerprinting ?

A
  • pauvre sensibilité
  • fastidieux
  • faible succès avec des échantillons dégradés
66
Q

Qu’est un STR ?

A

Éléments répétitifs localisés majoritairement dans les régions non codantes de l’ADN

67
Q

Combien de STR sont dans l’ADN humain ?

A

50000 STR

68
Q

Que caractérise un marqueur polymorphe d’intérêt ?

A
  • localisables (locus)
  • mesurables (PCR + électrophorèse capillaire)
  • variables entre individus (le nombre de répétitions)
  • comparables
69
Q

Qu’est le nom de l’approche de l’analyse de 16 marqueurs de type STR ?

A

l’approche multiplex

70
Q

Qu’est analysé pour déterminer le sexe de la trace ADN ?

A

l’amélogénine

71
Q

la suite alpha-numérique de STR permet quoi ?

A

de facilement comparer des profils génétique dans les BDD

Ex: [12 15/ 14 16/ 09 11/…/X Y]

72
Q

Qu’affecte le choix des STR retenus ?

Fuckin weird Q

A

Sont que retenus dans les zones non-codantes de l’ADN:
- aucune info en lien avec l’aspect physique/morphologique
- aucune info sur l’état de santé
- aucun intérêt pour un employeur, assureur, médecin

73
Q

Comment choisir les STR parmis les 50000 ?

A
  • résistance à la dégradation: STR a segment court < 500pb, motifs répétitifs courts
  • maximiser la discrimination: STR polymorphes / variation maximale, STR non corrélés entre eux
74
Q

Que sont les différents standards mondiaux de STR ?

A
  • Expanded Combined DNA Index System (CODIS): 20 loci + amélogénine
  • Interpol Standard Set of Loci: 12 loci + amélogénine
  • European Standard Set of Loci: 12 loci + amélogénine
  • France: 23 loci incluant ceux d’Interpol

Interpol and EU Loci are the same
The CODIS Loci include the ones for Interpol and EU

75
Q

Que sont des difficultés liées aux traces d’ADN ?

A
  • Des profils partiels: ADN dégradé ou faible quantité, baisse de la valeur probante, risque accru de correspondante fortuite
  • Des profils de mélange: plus courant quand la sensibilité augmente, interpretation complexe, ADN mineur pas toujours détecté
  • Erreurs humaines: contaminations, stockage inapproprié, inversion d’échantillons, erreur d’analyse/ lecture
76
Q

Que utilise-t-on pour lire le profil génétique d’une trace ?

A

un électrophorégramme

77
Q

Comment identifier un profil de mélange ?

A

qu’il y a plus que 2 nombre de répétitions pour un STR sur l’électrophorégramme

78
Q

Quels profils sont dans des bases de données ?

A
  • des traces non identifiées
  • des profils de référence d’individus condamnés
79
Q

Que sont des caractéristiques du caractère stricte des bases légales sur les bases de données ?

A
  • des critères d’introduction explicités
  • des durées de conservation des profils explicitées
  • des procédures d’effacement explicitées
80
Q

Quand a été mis en vigueur la banque de donnés d’ADN en Suisse ?

A

en 2005

81
Q

Combien de profils sont dans la banque de données en Suisse ?

A

177’508

81
Q

Qu’est le nom de la banque de données au UK ?

A

National DNA Database (NDNAD). 1er BDD ADN nationale au monde

82
Q

Quand a été crée la NDNAD au UK ?

A

en 1995 par le UK Home Office

83
Q

Combien de profils sont contenus dans le NDNAD en 2020 ?

A

environ 5,5 million

84
Q

Quand a été crée la NDIS au US ?

A
  • En 1998: Lancement de NDIS dans 9 états
  • En 2004: Implémentation dans les 50 états de CODIS

En 1994 le DNA Identification Act est entré en viguer ce qui à authorisé le FBI de créer une BDD nationale

85
Q

Combien de profils sont contenus dans la banque de données au US ?

A

15 million

86
Q

Quand a été crée la banque de données en Chine ?

A

en 2005

87
Q

Combien de profils sont dans la base de données en Chine ?

A

70 million en 2019

88
Q

Qu’est le projet actuel pour la banque de données d’ADN en Chine ?

A

cherche à alimenter la banque de données avec tous les profils génétiques de la population mâle

89
Q

Que sont les risques et dérives de la banque de données en Chine ?

A
  • origines ethniques
  • liens de parenté
  • correspondances fortuites
90
Q

Que sont les risques liés aux BDD ADN ?

A
  • Correspondance fortuite
  • Utilisation de traces non pertinentes
  • Négligence d’éléments d’enquête
  • Manipulation de traces
  • Sécurité de la BDD
91
Q

Que sont les risques du Phénotypage ?

A
  • Efficacité discutable: traits physiques impliquant plusieurs gènes, apparence physique génétique vs réelle
  • Modèles prédictifs perfectibles: pas de certitude, à considerer comme éléments d’enquête