Terminologi (blandad) Flashcards
Acetylkolin
Viktig signalmolekyl
Adipocyt
Fettcell
Affinitet
Grad av kompatibilitet för bindning
Agrin
Proteoglykan
Aktin
Beståndsdel i aktinfilament (även kallade mikrofilament)
Aminosyrasekvens
Påverkar proteinets tredimensionella struktur
Aminosyrasekvens
Påverkar proteiners tredimensionella struktur och funktion
Amyloid fibrils
Fibrösa aggregat bestående av olösliga felveckade proteiner
Anchoring fibrils
Transmembranösa element som bidrar till sammanlänkandet av olika strukturer i…
Angiogenes
Bildande av blodkärl, både under fosterutvecklingen men även postnatalt i vävnader beroende på miljömässiga faktorer.
Antigen
Mål för antikropp
AP2
Adaptorprotein 2
Applikation: ?
Apikobasal polaritet
Cellers orientering och väsentliga skillnad i förhållande till omgivande vävnader.
Apoptos
Programmerad celldöd
Apoptosom
Består av:
- Apaf1
- Cytokrom C
- Prokaspas 9
Apoptotic bodies
Bollar som bildas vid nedbrytning av cell under apoptosen
Apposition
Minns ej
Argonaut
?
Autofagi
Självnedbrytning?
Autofagosom
“Kroppen”/organellen som bildas vid autofagi?
Basallamina
Basalmembran
Består av: Kollagen IV, Laminin, …
Bindväv
Connective tissue (eng.)
Till stor del vad som utgör ECM (extracellulärt matrix)
Biotin
Minns ej
Cadherin
Subtyper:
- alfa-cadherin
- beta-cadherin
- E-caherin
- m-cadherin
- N-cadherin
Calbindin
Minns ej
Calcineurin
Frisätter calcium?
Calmodulin
Minns ej
Calretinin
Minns ej
Cellcykelns steg
Princip
X
Steg för steg
G0
G1
S
M
Centriol
Minns ej
Centromer
Minns ej
Centromeric chromatin
Hmmm…
Centrosom
Hmm
COPI
En av två vesikulära coatomerer (proteinkomplex)
COPI deltar (i samverkan med andra nödvändiga proteiner) i retrograd transport av proteiner från cis-Golgi till ER. Efter avslutad transport demonteras höljet och beståndsdelarna återanvänds i nästa vesikel.
Består av fem subenheter (Sar1, Sec23, Sec24, Sec13, Sec31) och kan bilda heterodimerer och heterotetramerer.
COPII
Coatomer protein coat-complex II
En av två vesikulära coatomerer (proteinkomplex)
COPII deltar (i samverkan med andra nödvändiga proteiner) i anterograd transport av proteiner från sträva ER till cis-Golgi. Efter avslutad transport demonteras höljet och beståndsdelarna återanvänds i nästa vesikel.
Består av fem subenheter (Sar1, Sec23, Sec24, Sec13, Sec31) och kan bilda heterodimerer och heterotetramerer.
Determinering
Princip
Stamcell → Progenitorcell
Exempel
Differentiering
Princip
Progenitorcell → Specialicerad cell
Exempel
Fyll i detta senare
ELISA
- Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay*
- Princip*
- Användningsområde*
Enhancer
En av flera olika typer av CREs = Cis regulatory elements eller CRMs = Cis regulatory modules
Kort (50 - 1500 baspar lång) region av DNA till vilken transkriptionsfaktorer kan binda för att öka sannolikheten att en viss gen transkriberas. Genen i fråga kan befinna sig upp till 1 Mbp från enhancern, uppströms eller nedströms.
Exocytos
Sekretion av molekyler ut ur cell via vesiklar
FRR
Familjär relativ risk
Sannolikhet att utveckla en viss genetiskt betingad sjukdom om förstagradssläkting är sjuk.
Förstagradssläkting (förälder, helsyskon, barn)
G-protein
Guanine nucleotide-binding protein
Princip
Deltar i intracellulär signalering via GPCR och fungerar som “strömbrytare”.
Består av tre subenheter:
Alpha, beta & gamma
Alpha-subenheten kan vara:
(s) stimulerande, (i) inhiberande & (q) fosfolipas C-aktiverande
GAP
GTPase-activating protein
Regulatoriska protein som binder till aktiverat G-protein och stimulerar dess GTPas-aktivitet, vilket leder till inaktivering av signaleringskaskaden.
GEF
Guanine nucleotide exchange factor
Princip
Proteiner eller proteindomäner som stimulerar små monomera GTPaser genom att frigöra GDP, och därmed möjliggöra bindning av GTP. Laddar m.a.o. om med ny kula i pipan efter avlossning.
Glykosylering
Märkning av protein med sockerkedja. Styr transport och öde. Sker i sträva ER.
GPCR
G-protein coupled receptor
Grb2
Growth factor receptor-bound protein 2
Adaptorprotein involverat i cellsignalering via EGFR (epidermal growth factor receptor) som är en RTK (receptor tysosine kinase).
Består av en SH2-domän och två SH3-domäner.
N-terminala SH3-domänen binder till prolinrika-sekvenser som exempelvis Ras-GEF:n SOS (Son of Sevenless)
Helikas
Enzym som separerar dubbelsträngat DNA, templatsträng från kodande sträng.
HIF1alpha
Hypoxia-inducible factor 1-alpha
Transkriptrionsfaktor för VEGF.
Binds vid normal syresättning till OH-grupp vilket möjliggör igenkänning av tumour supressor-proteinet VHL som binder in vilket hämmar uttrycket av VEGF. Vid hypoxi kan inte OH-grupp binda vilket gör att HIF1alpha kan verka uppreglerande för transkription av VEGF-genen.
Histonmodifieringar
Acetylering
Bidrar till en mer öpppen kromatinstruktur
Metylering
Mono-, di- och trimetylering förekommer.
Fosforylering
Inte helt klart vad detta har för effekt på kromatinets struktur, men förekomsten av modifieringen kan inte förnekas.
In situ hybridization
ISH
Integrinaktivering
Sker vid inflammatorisk respons i vävnaden
Mitogen
Peptid eller litet protein som inducerar celldelning (mitos)
Morfogen
Signalämne som styr embryonal utveckling
Multifaktoriell sjukdom
Sjukdom som inte kan förklaras med en enskild allel. Finns en genetisk komponent men bidrar inte till komplett orsakssamband.
NLS
Nomenklatur
Nuclear localization signal eller sequence
Princip
Aminosyrasekvens som märker ett protein för nukleär transport och import till cellkärnan.
Uppbyggnad
Typiskt bestående av en eller flera korta, på proteinytan exponerade sekvenser positivt laddat arginin eller lysin.
Ödem
Uppstår vid inflammation, temporär såväl som kronisk. Beror på att ECM inte kan balansera vätskeretentionen. Orsaker till detta kan vara cirkulatoriska problem (ex. hypertoni, hjärtsvikt) eller på grund av felaktiga kollagener.
Okazakifragment
Kortare fragment bestående av:
Replikationsgaffeln
P-selektin
CAM (cell adhesion molecule) på ytan av aktiverade endotelceller i blodkärl.
PCR
Polymerase chain reaction
Ran
Nomenklatur
- Ras-related nuclear protein* eller
- GTP-binding nuclear protein Ran*
Princip
Small G-protein, involverat i transport in och ut ur cellkärnans porkomplex under interfas och mitos.
Uppbyggnad
Restriction point
I slutet av cellcykelns G1-fas nås restriction point. I detta vägskäl tvingas cellen till “commitment” i cellcykeln eller apoptos. Passeras denna punkt krävs därefter inga extracellulära signaler för fortsatt proccess.
För framgångsrik passage krävs:
- DNA-skada förekommer inte.
*
Sädesblåsans histologiska uppbyggnad
Vesicula seminalis
Fyll i detta senare
Sekretoriska vägen
Princip
Protein syntetiseras och transporteras ut ur cellen
Steg för steg
Genuttryck - Transkription - Translation - Klyvning av propeptid - Veckning - Selektiv transport - Inbindning till adaptorprotein (om exit-signal finns) - Sekretion till Golgi via vesiklar
Silencer
En av flera olika typer av CREs = Cis regulatory elements eller CRMs = Cis regulatory modules
Region av DNA till vilken repressorer kan binda för att minska sannolikheten att en viss gen transkriberas. Genen i fråga kan befinna sig mellan -20 och -200bp uppströms ifrån genen.
SNARE
SNAP REceptor
Protein som medierar vesikelfusion med målmembranet
(V-SNARE, V = Vesicle), eller som stabiliserande subkomplex (T-SNARE, T = Target)
Spermiogenes
Spermiens utveckling
4 faser:
- Golgi
- Cap
- Akrosom
- Mognad
TGFβ-receptor
Nomenklatur
Transforming growth factor beta receptor
Princip
Single pass serine/threonine kinase receptor
Flertalet isoformer och förekommer både som homodimerer och heterodimerer. Antalet möjliga ligander överstiger vida antalet kända receptorer i familjen.
Uppbyggnad
Transienta embryonala strukturer
Övergående och tillfälliga strukturer under den embryonala utvecklingen
Exempel:
- Somiter
- Primitivstrimman
- Dermamyotom
Ubiquitin-ligaskomplexet
E1-E2-E3
VEGF
Vascular endothelial growth factor
VHL
Protein klassificierat som en tumour supressor.
WP-bodies
Weibel-Palade bodies
Topologiskt ekvivalenta
Sekretoriska och endocytotiska vägen. Två områden i cellen topologiskt ekvivalenta om de kan kommunicera med varandra på så sätt att molekyler kan röra sig utan att korsa ett membran. Ex. sant vid vesikeltransport då “cargo molecule” inte korsar membran tack vare membranfusion.
